MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_013223	AAG	2	6	1003935	1003940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404973
15503	NC_013223	TCAA	2	8	1004023	1004030	50 %	25 %	0 %	25 %	258404973
15504	NC_013223	TCAA	2	8	1004050	1004057	50 %	25 %	0 %	25 %	258404973
15505	NC_013223	GGA	2	6	1004169	1004174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404973
15506	NC_013223	CGG	2	6	1004189	1004194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404973
15507	NC_013223	ACC	2	6	1004199	1004204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404973
15508	NC_013223	GC	3	6	1004234	1004239	0 %	0 %	50 %	50 %	258404973
15509	NC_013223	GCA	2	6	1004300	1004305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404973
15510	NC_013223	TCG	3	9	1004332	1004340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404973
15511	NC_013223	TGT	2	6	1004356	1004361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404973
15512	NC_013223	ACCCTG	2	12	1004460	1004471	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258404973
15513	NC_013223	ATC	2	6	1004487	1004492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404973
15514	NC_013223	GAA	2	6	1004547	1004552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404973
15515	NC_013223	GCG	2	6	1004555	1004560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404973
15516	NC_013223	TGA	2	6	1004585	1004590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404973
15517	NC_013223	GAC	2	6	1004633	1004638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404973
15518	NC_013223	ATC	2	6	1004640	1004645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404973
15519	NC_013223	GCG	2	6	1004646	1004651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404973
15520	NC_013223	CAGC	2	8	1004784	1004791	25 %	0 %	25 %	50 %	258404973
15521	NC_013223	CTG	2	6	1004908	1004913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404974
15522	NC_013223	G	6	6	1004941	1004946	0 %	0 %	100 %	0 %	258404974
15523	NC_013223	AGC	2	6	1005027	1005032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404974
15524	NC_013223	CGG	2	6	1005041	1005046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404974
15525	NC_013223	G	6	6	1005084	1005089	0 %	0 %	100 %	0 %	258404974
15526	NC_013223	GGC	2	6	1005111	1005116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404974
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15528	NC_013223	GCTG	2	8	1005314	1005321	0 %	25 %	50 %	25 %	258404974
15529	NC_013223	CGG	2	6	1005339	1005344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404974
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15531	NC_013223	TTG	2	6	1005398	1005403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404974
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15533	NC_013223	GT	3	6	1005506	1005511	0 %	50 %	50 %	0 %	258404974
15534	NC_013223	CAA	2	6	1005522	1005527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404974
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15537	NC_013223	ACGAT	2	10	1005584	1005593	40 %	20 %	20 %	20 %	258404974
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15546	NC_013223	GTC	2	6	1006286	1006291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404975
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15616	NC_013223	GTT	2	6	1010179	1010184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404978
15617	NC_013223	GGC	2	6	1010273	1010278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404978
15618	NC_013223	GGCC	2	8	1010309	1010316	0 %	0 %	50 %	50 %	258404978
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15624	NC_013223	GCA	2	6	1010645	1010650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404978
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15631	NC_013223	CTG	2	6	1011317	1011322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404979
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15850	NC_013223	AGCCG	2	10	1027317	1027326	20 %	0 %	40 %	40 %	258404995
15851	NC_013223	CGA	2	6	1027334	1027339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404995
15852	NC_013223	TG	3	6	1027414	1027419	0 %	50 %	50 %	0 %	258404995
15853	NC_013223	TCG	2	6	1027486	1027491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404995
15854	NC_013223	TGA	2	6	1027505	1027510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404995
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15856	NC_013223	CGT	2	6	1027520	1027525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404995
15857	NC_013223	TGATCA	2	12	1027568	1027579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	258404995
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15962	NC_013223	TGT	2	6	1034006	1034011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258405003
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15964	NC_013223	CGG	2	6	1034189	1034194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405003
15965	NC_013223	ACC	2	6	1034218	1034223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258405003
15966	NC_013223	GCG	2	6	1034244	1034249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405003
15967	NC_013223	GTC	2	6	1034271	1034276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405003
15968	NC_013223	GGC	2	6	1034319	1034324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405003
15969	NC_013223	GTG	2	6	1034397	1034402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405003
15970	NC_013223	GCC	2	6	1034424	1034429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258405003
15971	NC_013223	GCG	2	6	1034449	1034454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405003
15972	NC_013223	ACG	2	6	1034475	1034480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405003
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15984	NC_013223	GGGC	2	8	1034976	1034983	0 %	0 %	75 %	25 %	258405004
15985	NC_013223	GGCAT	2	10	1035080	1035089	20 %	20 %	40 %	20 %	258405004
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15990	NC_013223	TGG	2	6	1035294	1035299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405004
15991	NC_013223	AGC	2	6	1035417	1035422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258405004
15992	NC_013223	GA	3	6	1035588	1035593	50 %	0 %	50 %	0 %	258405004
15993	NC_013223	GGC	2	6	1035605	1035610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258405004
15994	NC_013223	CGT	2	6	1035628	1035633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405004
15995	NC_013223	TCG	2	6	1035708	1035713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258405004
15996	NC_013223	GGA	2	6	1035790	1035795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258405004
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15998	NC_013223	TTC	2	6	1035893	1035898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405004
15999	NC_013223	GTG	2	6	1035906	1035911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258405004
16000	NC_013223	CTT	2	6	1035941	1035946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258405004

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