MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_013223	AGC	2	6	933721	933726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404913
14502	NC_013223	CGT	2	6	933745	933750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404913
14503	NC_013223	AGACGG	2	12	933760	933771	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	258404913
14504	NC_013223	GCG	2	6	933774	933779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404913
14505	NC_013223	GAA	2	6	933797	933802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404913
14506	NC_013223	CGA	2	6	933909	933914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404913
14507	NC_013223	TCCT	2	8	933925	933932	0 %	50 %	0 %	50 %	258404913
14508	NC_013223	ATTT	2	8	934360	934367	25 %	75 %	0 %	0 %	258404914
14509	NC_013223	T	6	6	934365	934370	0 %	100 %	0 %	0 %	258404914
14510	NC_013223	CCAG	2	8	934405	934412	25 %	0 %	25 %	50 %	258404914
14511	NC_013223	G	7	7	934449	934455	0 %	0 %	100 %	0 %	258404914
14512	NC_013223	AT	3	6	934537	934542	50 %	50 %	0 %	0 %	258404914
14513	NC_013223	GGT	2	6	934749	934754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404915
14514	NC_013223	ATG	2	6	934811	934816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404915
14515	NC_013223	TTGA	2	8	934931	934938	25 %	50 %	25 %	0 %	258404915
14516	NC_013223	TGG	2	6	935021	935026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404915
14517	NC_013223	ATT	2	6	935039	935044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404915
14518	NC_013223	GTC	2	6	935098	935103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404915
14519	NC_013223	GAA	2	6	935182	935187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404916
14520	NC_013223	CCG	2	6	935406	935411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404916
14521	NC_013223	TCC	2	6	935509	935514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404916
14522	NC_013223	GGT	2	6	935598	935603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404916
14523	NC_013223	GCC	2	6	935677	935682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404916
14524	NC_013223	CAGT	2	8	935718	935725	25 %	25 %	25 %	25 %	258404916
14525	NC_013223	GATG	2	8	935829	935836	25 %	25 %	50 %	0 %	258404916
14526	NC_013223	TGA	2	6	935850	935855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404916
14527	NC_013223	GAC	2	6	935926	935931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404916
14528	NC_013223	GCC	2	6	935956	935961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404916
14529	NC_013223	CTGA	2	8	936118	936125	25 %	25 %	25 %	25 %	258404916
14530	NC_013223	ACA	2	6	936176	936181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404916
14531	NC_013223	CGCCC	2	10	936199	936208	0 %	0 %	20 %	80 %	258404916
14532	NC_013223	TCG	2	6	936264	936269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404916
14533	NC_013223	GACC	2	8	936298	936305	25 %	0 %	25 %	50 %	258404916
14534	NC_013223	ACC	2	6	936446	936451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404916
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14536	NC_013223	GCCT	2	8	936502	936509	0 %	25 %	25 %	50 %	258404916
14537	NC_013223	GGC	2	6	936514	936519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404916
14538	NC_013223	A	7	7	936533	936539	100 %	0 %	0 %	0 %	258404916
14539	NC_013223	CGC	2	6	936544	936549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404916
14540	NC_013223	GAA	2	6	936589	936594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404916
14541	NC_013223	ACC	2	6	936830	936835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404916
14542	NC_013223	AGC	2	6	936892	936897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404916
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14544	NC_013223	GAT	2	6	936938	936943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404917
14545	NC_013223	GTC	2	6	936950	936955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404917
14546	NC_013223	CGT	2	6	936970	936975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404917
14547	NC_013223	ATGA	2	8	937013	937020	50 %	25 %	25 %	0 %	258404917
14548	NC_013223	GCG	2	6	937040	937045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404917
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14550	NC_013223	GTG	2	6	937212	937217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404917
14551	NC_013223	GTG	2	6	937334	937339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404917
14552	NC_013223	GAAA	2	8	937348	937355	75 %	0 %	25 %	0 %	258404917
14553	NC_013223	CCCT	2	8	937427	937434	0 %	25 %	0 %	75 %	258404918
14554	NC_013223	AAC	2	6	937538	937543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404918
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14557	NC_013223	AGGC	2	8	937748	937755	25 %	0 %	50 %	25 %	258404918
14558	NC_013223	CGAG	2	8	937765	937772	25 %	0 %	50 %	25 %	258404918
14559	NC_013223	ATG	2	6	937844	937849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404918
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14561	NC_013223	AGA	2	6	937929	937934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404918
14562	NC_013223	GAGC	2	8	937942	937949	25 %	0 %	50 %	25 %	258404918
14563	NC_013223	TGG	2	6	937987	937992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404918
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14565	NC_013223	TACA	2	8	938066	938073	50 %	25 %	0 %	25 %	258404918
14566	NC_013223	TTG	2	6	938091	938096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404918
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14572	NC_013223	TGG	2	6	938457	938462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404918
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14574	NC_013223	TAAAG	2	10	938513	938522	60 %	20 %	20 %	0 %	258404918
14575	NC_013223	A	6	6	938579	938584	100 %	0 %	0 %	0 %	258404918
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14588	NC_013223	GCC	2	6	939316	939321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404919
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14602	NC_013223	GTGG	2	8	940073	940080	0 %	25 %	75 %	0 %	258404919
14603	NC_013223	CAG	2	6	940089	940094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404919
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14605	NC_013223	AG	3	6	940108	940113	50 %	0 %	50 %	0 %	258404919
14606	NC_013223	CGA	2	6	940157	940162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404919
14607	NC_013223	CAG	2	6	940185	940190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404919
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14622	NC_013223	AAGG	2	8	942112	942119	50 %	0 %	50 %	0 %	258404921
14623	NC_013223	GAC	2	6	942124	942129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404921
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14742	NC_013223	CCA	2	6	950068	950073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404928
14743	NC_013223	TGC	2	6	950142	950147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404928
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14745	NC_013223	GTG	2	6	950276	950281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404928
14746	NC_013223	TGAC	2	8	950289	950296	25 %	25 %	25 %	25 %	258404928
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14761	NC_013223	GTG	2	6	951548	951553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404929
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14859	NC_013223	GGCC	2	8	958024	958031	0 %	0 %	50 %	50 %	258404936
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14982	NC_013223	T	6	6	966295	966300	0 %	100 %	0 %	0 %	258404945
14983	NC_013223	GGCT	2	8	966317	966324	0 %	25 %	50 %	25 %	258404945
14984	NC_013223	ATGCTC	2	12	966367	966378	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258404945
14985	NC_013223	CCG	2	6	966381	966386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404945
14986	NC_013223	TGCT	2	8	966407	966414	0 %	50 %	25 %	25 %	258404945
14987	NC_013223	GCTGTG	2	12	966430	966441	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	258404945
14988	NC_013223	GGCT	2	8	966610	966617	0 %	25 %	50 %	25 %	258404945
14989	NC_013223	CTG	2	6	966694	966699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404945
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14991	NC_013223	ACG	2	6	966718	966723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404945
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