MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_013223	TTCGAC	2	12	810181	810192	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258404806
12502	NC_013223	CCG	2	6	810202	810207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404806
12503	NC_013223	T	6	6	810301	810306	0 %	100 %	0 %	0 %	258404806
12504	NC_013223	CGA	3	9	810330	810338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404806
12505	NC_013223	AT	3	6	810345	810350	50 %	50 %	0 %	0 %	258404806
12506	NC_013223	CGC	2	6	810362	810367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404806
12507	NC_013223	GCA	2	6	810372	810377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404806
12508	NC_013223	GT	3	6	810425	810430	0 %	50 %	50 %	0 %	258404807
12509	NC_013223	T	6	6	810475	810480	0 %	100 %	0 %	0 %	258404807
12510	NC_013223	CGG	2	6	810639	810644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404807
12511	NC_013223	ACC	2	6	810709	810714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404807
12512	NC_013223	GCG	2	6	810844	810849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404807
12513	NC_013223	GGA	2	6	810864	810869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404807
12514	NC_013223	GTGG	2	8	810888	810895	0 %	25 %	75 %	0 %	258404807
12515	NC_013223	AGA	2	6	811042	811047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404808
12516	NC_013223	TGACC	2	10	811213	811222	20 %	20 %	20 %	40 %	258404808
12517	NC_013223	ATT	2	6	811232	811237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404808
12518	NC_013223	CTC	2	6	811481	811486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404809
12519	NC_013223	TTC	2	6	811589	811594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404809
12520	NC_013223	TCC	2	6	811682	811687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404809
12521	NC_013223	TCC	2	6	811719	811724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404809
12522	NC_013223	GCG	2	6	811896	811901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404809
12523	NC_013223	CTTTTC	2	12	811954	811965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404809
12524	NC_013223	GCG	2	6	812081	812086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404810
12525	NC_013223	CCA	2	6	812171	812176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404810
12526	NC_013223	G	6	6	812216	812221	0 %	0 %	100 %	0 %	258404810
12527	NC_013223	CAG	2	6	812248	812253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404810
12528	NC_013223	GGC	2	6	812312	812317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404810
12529	NC_013223	CGTT	2	8	812386	812393	0 %	50 %	25 %	25 %	258404810
12530	NC_013223	GC	3	6	812394	812399	0 %	0 %	50 %	50 %	258404810
12531	NC_013223	TGT	2	6	812455	812460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404810
12532	NC_013223	GTG	2	6	812514	812519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404810
12533	NC_013223	GCA	2	6	812535	812540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404810
12534	NC_013223	CAATC	2	10	812565	812574	40 %	20 %	0 %	40 %	258404810
12535	NC_013223	GC	3	6	812577	812582	0 %	0 %	50 %	50 %	258404810
12536	NC_013223	T	6	6	812606	812611	0 %	100 %	0 %	0 %	258404810
12537	NC_013223	CTT	2	6	812667	812672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404810
12538	NC_013223	ACGC	2	8	812705	812712	25 %	0 %	25 %	50 %	258404811
12539	NC_013223	TCC	2	6	812789	812794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404811
12540	NC_013223	AGCC	2	8	812815	812822	25 %	0 %	25 %	50 %	258404811
12541	NC_013223	GAT	2	6	812881	812886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404811
12542	NC_013223	GC	3	6	812906	812911	0 %	0 %	50 %	50 %	258404811
12543	NC_013223	CTCGG	2	10	812917	812926	0 %	20 %	40 %	40 %	258404811
12544	NC_013223	GAC	2	6	812929	812934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404811
12545	NC_013223	TCC	2	6	812938	812943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404811
12546	NC_013223	CTT	2	6	812986	812991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404811
12547	NC_013223	AAG	2	6	813019	813024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404811
12548	NC_013223	TTG	2	6	813034	813039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404811
12549	NC_013223	CCA	2	6	813052	813057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404811
12550	NC_013223	ATG	2	6	813158	813163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404811
12551	NC_013223	CTG	2	6	813176	813181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404811
12552	NC_013223	AGT	2	6	813226	813231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404811
12553	NC_013223	CG	4	8	813704	813711	0 %	0 %	50 %	50 %	258404812
12554	NC_013223	GCT	2	6	813818	813823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404812
12555	NC_013223	TCGC	2	8	813834	813841	0 %	25 %	25 %	50 %	258404812
12556	NC_013223	GA	3	6	813854	813859	50 %	0 %	50 %	0 %	258404812
12557	NC_013223	CGT	2	6	813909	813914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404812
12558	NC_013223	A	6	6	813926	813931	100 %	0 %	0 %	0 %	258404812
12559	NC_013223	CG	3	6	813953	813958	0 %	0 %	50 %	50 %	258404812
12560	NC_013223	CTG	2	6	814538	814543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404813
12561	NC_013223	AGC	2	6	814566	814571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404813
12562	NC_013223	TGA	2	6	814605	814610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404813
12563	NC_013223	G	6	6	814673	814678	0 %	0 %	100 %	0 %	258404813
12564	NC_013223	CCA	2	6	814725	814730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404813
12565	NC_013223	GGT	2	6	814793	814798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404813
12566	NC_013223	CGC	2	6	814876	814881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404813
12567	NC_013223	TCGGCA	2	12	814884	814895	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258404813
12568	NC_013223	GTCCA	2	10	814901	814910	20 %	20 %	20 %	40 %	258404813
12569	NC_013223	GGT	2	6	814993	814998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404813
12570	NC_013223	CGG	2	6	815002	815007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404813
12571	NC_013223	ATT	2	6	815057	815062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404813
12572	NC_013223	GC	3	6	815250	815255	0 %	0 %	50 %	50 %	258404813
12573	NC_013223	CGC	3	9	815266	815274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404813
12574	NC_013223	TG	3	6	815341	815346	0 %	50 %	50 %	0 %	258404813
12575	NC_013223	GCG	2	6	815391	815396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404813
12576	NC_013223	GCCGGG	2	12	815440	815451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404813
12577	NC_013223	TTA	2	6	815512	815517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404813
12578	NC_013223	CTG	2	6	815585	815590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404813
12579	NC_013223	ATCTGG	2	12	815613	815624	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258404813
12580	NC_013223	TGA	2	6	815643	815648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404813
12581	NC_013223	TTG	2	6	815681	815686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404813
12582	NC_013223	CAG	2	6	815717	815722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404813
12583	NC_013223	CAA	2	6	815731	815736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404813
12584	NC_013223	TAG	2	6	816123	816128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404814
12585	NC_013223	T	7	7	816166	816172	0 %	100 %	0 %	0 %	258404814
12586	NC_013223	GGC	2	6	816233	816238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404814
12587	NC_013223	TGT	2	6	816246	816251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404814
12588	NC_013223	GCG	2	6	816269	816274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404814
12589	NC_013223	GCA	2	6	816280	816285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404814
12590	NC_013223	GCA	2	6	816290	816295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404814
12591	NC_013223	CCG	2	6	816326	816331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404814
12592	NC_013223	CAG	2	6	816388	816393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404814
12593	NC_013223	GTC	2	6	816432	816437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404814
12594	NC_013223	CGG	2	6	816550	816555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404814
12595	NC_013223	TTG	2	6	816581	816586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404814
12596	NC_013223	CGC	2	6	816606	816611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404814
12597	NC_013223	AAG	2	6	816618	816623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404814
12598	NC_013223	TGG	2	6	816657	816662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404814
12599	NC_013223	ACT	2	6	816663	816668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404814
12600	NC_013223	GTG	2	6	816683	816688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404814
12601	NC_013223	AAT	2	6	816708	816713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404814
12602	NC_013223	TTG	2	6	816951	816956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404815
12603	NC_013223	GAA	2	6	816979	816984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404815
12604	NC_013223	TGA	2	6	817089	817094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404815
12605	NC_013223	GGC	3	9	817126	817134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404815
12606	NC_013223	CGG	2	6	817149	817154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404815
12607	NC_013223	GCT	2	6	817157	817162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404815
12608	NC_013223	GCC	2	6	817388	817393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404816
12609	NC_013223	GAA	2	6	817396	817401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404816
12610	NC_013223	CGG	2	6	817482	817487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404816
12611	NC_013223	GGGC	2	8	817531	817538	0 %	0 %	75 %	25 %	258404816
12612	NC_013223	CAG	2	6	817695	817700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404816
12613	NC_013223	CGC	2	6	817705	817710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404816
12614	NC_013223	TGC	2	6	817721	817726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404816
12615	NC_013223	GCC	2	6	817878	817883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404816
12616	NC_013223	TTCC	2	8	817888	817895	0 %	50 %	0 %	50 %	258404816
12617	NC_013223	ACC	2	6	817973	817978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404816
12618	NC_013223	C	6	6	817977	817982	0 %	0 %	0 %	100 %	258404816
12619	NC_013223	G	6	6	818053	818058	0 %	0 %	100 %	0 %	258404816
12620	NC_013223	GAC	2	6	818191	818196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404816
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12622	NC_013223	TCT	2	6	818594	818599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404817
12623	NC_013223	GGA	2	6	818681	818686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404817
12624	NC_013223	GGT	2	6	818777	818782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404817
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12975	NC_013223	TGG	2	6	841288	841293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404834
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12977	NC_013223	CAT	2	6	841331	841336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404834
12978	NC_013223	GATA	2	8	841369	841376	50 %	25 %	25 %	0 %	258404834
12979	NC_013223	CGTC	2	8	841525	841532	0 %	25 %	25 %	50 %	258404834
12980	NC_013223	CCT	2	6	841579	841584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404834
12981	NC_013223	TCC	2	6	841590	841595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404834
12982	NC_013223	TGCG	2	8	841618	841625	0 %	25 %	50 %	25 %	258404834
12983	NC_013223	GCT	2	6	841635	841640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404834
12984	NC_013223	CGT	2	6	841711	841716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404834
12985	NC_013223	CCGG	2	8	841840	841847	0 %	0 %	50 %	50 %	258404834
12986	NC_013223	TGG	2	6	841849	841854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404834
12987	NC_013223	TGA	2	6	841858	841863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404834
12988	NC_013223	ACG	2	6	841866	841871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404834
12989	NC_013223	TCG	2	6	841932	841937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404834
12990	NC_013223	C	6	6	841940	841945	0 %	0 %	0 %	100 %	258404834
12991	NC_013223	GCC	2	6	841966	841971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404834
12992	NC_013223	TCG	2	6	841986	841991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404834
12993	NC_013223	AAT	2	6	841997	842002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404834
12994	NC_013223	CCT	2	6	842023	842028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404834
12995	NC_013223	GCCGAC	2	12	842054	842065	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258404834
12996	NC_013223	CGG	2	6	842159	842164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404834
12997	NC_013223	GCC	2	6	842195	842200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404834
12998	NC_013223	AAG	2	6	842229	842234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404834
12999	NC_013223	GAT	2	6	842237	842242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404834
13000	NC_013223	TTC	2	6	842300	842305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404834

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