MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_013223	CGGA	2	8	646209	646216	25 %	0 %	50 %	25 %	258404670
10003	NC_013223	GC	3	6	646239	646244	0 %	0 %	50 %	50 %	258404670
10004	NC_013223	CCT	2	6	646249	646254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404670
10005	NC_013223	ATC	2	6	646325	646330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404670
10006	NC_013223	GAG	2	6	646406	646411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404670
10007	NC_013223	C	6	6	646415	646420	0 %	0 %	0 %	100 %	258404670
10008	NC_013223	GTCTT	2	10	646440	646449	0 %	60 %	20 %	20 %	258404670
10009	NC_013223	TCG	2	6	646551	646556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404670
10010	NC_013223	TGC	2	6	646600	646605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404670
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10012	NC_013223	TAG	2	6	646749	646754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404670
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10014	NC_013223	GTG	2	6	646895	646900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404670
10015	NC_013223	C	6	6	646919	646924	0 %	0 %	0 %	100 %	258404670
10016	NC_013223	AGGC	2	8	646940	646947	25 %	0 %	50 %	25 %	258404670
10017	NC_013223	TCT	2	6	647070	647075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404670
10018	NC_013223	TTC	2	6	647078	647083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404670
10019	NC_013223	GGC	2	6	647315	647320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404670
10020	NC_013223	AT	3	6	647322	647327	50 %	50 %	0 %	0 %	258404670
10021	NC_013223	TGA	2	6	647374	647379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404670
10022	NC_013223	GTC	2	6	647384	647389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404670
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10026	NC_013223	CTT	2	6	647748	647753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404671
10027	NC_013223	CTT	2	6	647775	647780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404671
10028	NC_013223	AGT	2	6	647782	647787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404671
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10030	NC_013223	CTG	2	6	647960	647965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404671
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10034	NC_013223	CGG	2	6	648222	648227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404671
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10036	NC_013223	GAGG	2	8	648405	648412	25 %	0 %	75 %	0 %	258404671
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10040	NC_013223	CGT	2	6	648546	648551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404671
10041	NC_013223	CGG	2	6	648563	648568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404671
10042	NC_013223	CGGC	2	8	648573	648580	0 %	0 %	50 %	50 %	258404671
10043	NC_013223	AGCC	2	8	648586	648593	25 %	0 %	25 %	50 %	258404671
10044	NC_013223	GGC	2	6	648612	648617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404671
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10046	NC_013223	CACCG	2	10	648635	648644	20 %	0 %	20 %	60 %	258404671
10047	NC_013223	GC	5	10	648684	648693	0 %	0 %	50 %	50 %	258404671
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10100	NC_013223	GGC	2	6	652539	652544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404675
10101	NC_013223	CCGG	2	8	652552	652559	0 %	0 %	50 %	50 %	258404675
10102	NC_013223	T	6	6	652587	652592	0 %	100 %	0 %	0 %	258404675
10103	NC_013223	TA	3	6	652656	652661	50 %	50 %	0 %	0 %	258404676
10104	NC_013223	CTG	2	6	652678	652683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404676
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10106	NC_013223	CCAG	2	8	652720	652727	25 %	0 %	25 %	50 %	258404676
10107	NC_013223	AGA	2	6	652765	652770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404676
10108	NC_013223	GCTG	2	8	652786	652793	0 %	25 %	50 %	25 %	258404676
10109	NC_013223	TTG	2	6	652809	652814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404676
10110	NC_013223	GAGCCA	2	12	652817	652828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404676
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10118	NC_013223	CGCGG	2	10	653528	653537	0 %	0 %	60 %	40 %	258404677
10119	NC_013223	GCT	2	6	653542	653547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404677
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10121	NC_013223	TCC	2	6	653682	653687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404677
10122	NC_013223	TCGT	2	8	653738	653745	0 %	50 %	25 %	25 %	258404677
10123	NC_013223	G	6	6	653767	653772	0 %	0 %	100 %	0 %	258404677
10124	NC_013223	TGGCCT	2	12	653788	653799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404677
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10127	NC_013223	T	6	6	654094	654099	0 %	100 %	0 %	0 %	258404678
10128	NC_013223	G	6	6	654103	654108	0 %	0 %	100 %	0 %	258404678
10129	NC_013223	CCG	2	6	654194	654199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404678
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10133	NC_013223	GCAG	2	8	654506	654513	25 %	0 %	50 %	25 %	258404678
10134	NC_013223	GCGG	2	8	654601	654608	0 %	0 %	75 %	25 %	258404678
10135	NC_013223	ATG	2	6	654617	654622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404678
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10142	NC_013223	GCC	2	6	655011	655016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404678
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10152	NC_013223	GATT	2	8	655488	655495	25 %	50 %	25 %	0 %	258404678
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10160	NC_013223	C	6	6	655897	655902	0 %	0 %	0 %	100 %	258404678
10161	NC_013223	CGG	2	6	655930	655935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404678
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10215	NC_013223	GCACG	2	10	659415	659424	20 %	0 %	40 %	40 %	258404681
10216	NC_013223	CTTT	2	8	659482	659489	0 %	75 %	0 %	25 %	258404681
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10222	NC_013223	GATC	2	8	659634	659641	25 %	25 %	25 %	25 %	258404681
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10224	NC_013223	GCG	2	6	659675	659680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404681
10225	NC_013223	CGCT	2	8	659710	659717	0 %	25 %	25 %	50 %	258404681
10226	NC_013223	CGG	2	6	659731	659736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404681
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10229	NC_013223	TCC	2	6	659939	659944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404681
10230	NC_013223	ACAA	2	8	660013	660020	75 %	0 %	0 %	25 %	258404681
10231	NC_013223	TAC	2	6	660067	660072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404681
10232	NC_013223	GAT	2	6	660376	660381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404681
10233	NC_013223	T	6	6	660414	660419	0 %	100 %	0 %	0 %	258404681
10234	NC_013223	CCG	2	6	660461	660466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404681
10235	NC_013223	GGAGC	2	10	660480	660489	20 %	0 %	60 %	20 %	258404681
10236	NC_013223	CTGAT	2	10	660520	660529	20 %	40 %	20 %	20 %	258404681
10237	NC_013223	TGC	2	6	660856	660861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404682
10238	NC_013223	GCG	2	6	660878	660883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404682
10239	NC_013223	CGG	2	6	661006	661011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404682
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10241	NC_013223	CTG	2	6	661061	661066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404682
10242	NC_013223	GCA	2	6	661101	661106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404682
10243	NC_013223	GCC	2	6	661163	661168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404682
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10332	NC_013223	TGC	2	6	668306	668311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404689
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10354	NC_013223	CTGT	2	8	670663	670670	0 %	50 %	25 %	25 %	258404691
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10360	NC_013223	CCACGG	2	12	671231	671242	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258404692
10361	NC_013223	TCC	2	6	671340	671345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404692
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10364	NC_013223	CTG	2	6	671437	671442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404692
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10380	NC_013223	TGGT	2	8	672170	672177	0 %	50 %	50 %	0 %	258404692
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10481	NC_013223	AGT	2	6	679153	679158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404696
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