MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_013223	GGTCAC	2	12	616217	616228	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258404640
9502	NC_013223	A	6	6	616341	616346	100 %	0 %	0 %	0 %	258404640
9503	NC_013223	CGG	2	6	616385	616390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404640
9504	NC_013223	CGA	2	6	616458	616463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404641
9505	NC_013223	AGC	2	6	616568	616573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404641
9506	NC_013223	GCG	2	6	616575	616580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404641
9507	NC_013223	TTC	2	6	616720	616725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404641
9508	NC_013223	CGG	2	6	616746	616751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404641
9509	NC_013223	GAC	2	6	616857	616862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404641
9510	NC_013223	CCT	2	6	616899	616904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404641
9511	NC_013223	TCGC	2	8	616931	616938	0 %	25 %	25 %	50 %	258404641
9512	NC_013223	ACC	2	6	617045	617050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404642
9513	NC_013223	TGT	2	6	617101	617106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404642
9514	NC_013223	CCA	2	6	617268	617273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404642
9515	NC_013223	AGA	2	6	617424	617429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404642
9516	NC_013223	ATG	2	6	617502	617507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404642
9517	NC_013223	GCA	2	6	617569	617574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404642
9518	NC_013223	AGG	2	6	617655	617660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404642
9519	NC_013223	GGTCT	2	10	617684	617693	0 %	40 %	40 %	20 %	258404642
9520	NC_013223	GGA	2	6	617818	617823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404642
9521	NC_013223	TTC	2	6	617880	617885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404642
9522	NC_013223	CAA	2	6	618055	618060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404642
9523	NC_013223	CGG	2	6	618076	618081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404642
9524	NC_013223	GAC	2	6	618097	618102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404642
9525	NC_013223	AAG	2	6	618275	618280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404642
9526	NC_013223	TGG	2	6	618297	618302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404642
9527	NC_013223	GC	3	6	618349	618354	0 %	0 %	50 %	50 %	258404642
9528	NC_013223	T	6	6	618580	618585	0 %	100 %	0 %	0 %	258404642
9529	NC_013223	CCCGG	2	10	618604	618613	0 %	0 %	40 %	60 %	258404642
9530	NC_013223	ATC	2	6	618623	618628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404642
9531	NC_013223	CAG	2	6	618728	618733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404642
9532	NC_013223	GCA	2	6	618748	618753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404642
9533	NC_013223	TGA	2	6	618955	618960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404642
9534	NC_013223	TTG	2	6	619110	619115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404642
9535	NC_013223	GCA	2	6	619116	619121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404642
9536	NC_013223	AGA	2	6	619524	619529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404643
9537	NC_013223	ACGGTG	2	12	619532	619543	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258404643
9538	NC_013223	AGG	2	6	619551	619556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404643
9539	NC_013223	GGC	2	6	619573	619578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404643
9540	NC_013223	GCAAGG	2	12	619620	619631	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	258404643
9541	NC_013223	CCG	2	6	619998	620003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404643
9542	NC_013223	G	7	7	620027	620033	0 %	0 %	100 %	0 %	258404643
9543	NC_013223	GAG	2	6	620087	620092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404643
9544	NC_013223	AGC	2	6	620214	620219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404643
9545	NC_013223	CCG	2	6	620396	620401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404643
9546	NC_013223	CAG	2	6	620438	620443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404643
9547	NC_013223	GAG	2	6	620510	620515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404643
9548	NC_013223	CGC	2	6	620595	620600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404643
9549	NC_013223	AGG	2	6	620601	620606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404643
9550	NC_013223	AGC	2	6	620610	620615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404643
9551	NC_013223	CTT	2	6	620711	620716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404643
9552	NC_013223	TCC	2	6	620792	620797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404643
9553	NC_013223	AT	4	8	621107	621114	50 %	50 %	0 %	0 %	258404644
9554	NC_013223	CTT	2	6	621121	621126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404644
9555	NC_013223	ATC	2	6	621136	621141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404644
9556	NC_013223	CTG	2	6	621142	621147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404644
9557	NC_013223	CGA	2	6	621159	621164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404644
9558	NC_013223	ATCTG	2	10	621176	621185	20 %	40 %	20 %	20 %	258404644
9559	NC_013223	CTT	2	6	621193	621198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404644
9560	NC_013223	CTC	2	6	621358	621363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404644
9561	NC_013223	CCA	2	6	621417	621422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404644
9562	NC_013223	TGGG	2	8	621428	621435	0 %	25 %	75 %	0 %	258404644
9563	NC_013223	CGATAT	2	12	621453	621464	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	258404644
9564	NC_013223	GCC	2	6	621589	621594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404644
9565	NC_013223	CGG	2	6	621628	621633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404644
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9567	NC_013223	CGA	2	6	621825	621830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404645
9568	NC_013223	ATC	2	6	621853	621858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404645
9569	NC_013223	GAG	2	6	621886	621891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404645
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9571	NC_013223	TGGCCG	2	12	621971	621982	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258404645
9572	NC_013223	GGC	2	6	622015	622020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404645
9573	NC_013223	GACC	2	8	622064	622071	25 %	0 %	25 %	50 %	258404645
9574	NC_013223	CGA	2	6	622142	622147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404645
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9585	NC_013223	CAG	2	6	622483	622488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404645
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9587	NC_013223	GGT	2	6	622629	622634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404645
9588	NC_013223	AAC	2	6	622756	622761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404645
9589	NC_013223	A	6	6	622796	622801	100 %	0 %	0 %	0 %	258404645
9590	NC_013223	CAT	2	6	622836	622841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404645
9591	NC_013223	CCAT	2	8	622864	622871	25 %	25 %	0 %	50 %	258404645
9592	NC_013223	GT	3	6	622887	622892	0 %	50 %	50 %	0 %	258404645
9593	NC_013223	GGT	2	6	622905	622910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404645
9594	NC_013223	TCT	2	6	622934	622939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404645
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9599	NC_013223	TGG	2	6	623269	623274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404646
9600	NC_013223	AGAA	2	8	623278	623285	75 %	0 %	25 %	0 %	258404646
9601	NC_013223	GAC	2	6	623310	623315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404646
9602	NC_013223	GACGG	2	10	623367	623376	20 %	0 %	60 %	20 %	258404646
9603	NC_013223	TGC	2	6	623476	623481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404646
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9610	NC_013223	A	6	6	623955	623960	100 %	0 %	0 %	0 %	258404646
9611	NC_013223	GCC	2	6	623972	623977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404646
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9618	NC_013223	AG	3	6	624252	624257	50 %	0 %	50 %	0 %	258404646
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