MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_013223	ATC	2	6	587925	587930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404615
9003	NC_013223	CAGG	2	8	587933	587940	25 %	0 %	50 %	25 %	258404615
9004	NC_013223	TCC	2	6	587964	587969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404615
9005	NC_013223	GTC	2	6	588029	588034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404615
9006	NC_013223	GCG	2	6	588108	588113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404615
9007	NC_013223	CGC	2	6	588166	588171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404615
9008	NC_013223	GAA	2	6	588220	588225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404615
9009	NC_013223	CAG	2	6	588330	588335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404616
9010	NC_013223	GCG	2	6	588365	588370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404616
9011	NC_013223	GGT	2	6	588374	588379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404616
9012	NC_013223	TCC	2	6	588400	588405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404616
9013	NC_013223	CGC	2	6	588459	588464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404616
9014	NC_013223	AAT	2	6	588467	588472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404616
9015	NC_013223	CGG	2	6	588596	588601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404616
9016	NC_013223	CGT	2	6	588677	588682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404616
9017	NC_013223	CAG	2	6	588683	588688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404616
9018	NC_013223	CGTTGC	2	12	588695	588706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404616
9019	NC_013223	TC	3	6	588748	588753	0 %	50 %	0 %	50 %	258404616
9020	NC_013223	GGC	2	6	588760	588765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404616
9021	NC_013223	GCG	2	6	588771	588776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404616
9022	NC_013223	GAC	3	9	588846	588854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404616
9023	NC_013223	CGC	3	9	588933	588941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404616
9024	NC_013223	GCA	2	6	588956	588961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404616
9025	NC_013223	TTG	2	6	588978	588983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404616
9026	NC_013223	TGC	2	6	589053	589058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404616
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9028	NC_013223	AGC	2	6	589222	589227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404616
9029	NC_013223	GAG	2	6	589266	589271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404616
9030	NC_013223	TGC	2	6	589388	589393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404617
9031	NC_013223	CGC	2	6	589432	589437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404617
9032	NC_013223	CTG	2	6	589473	589478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404617
9033	NC_013223	GCG	2	6	589485	589490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404617
9034	NC_013223	CTT	2	6	589523	589528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404617
9035	NC_013223	CGT	2	6	589585	589590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404617
9036	NC_013223	GTT	2	6	589679	589684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404617
9037	NC_013223	C	6	6	589755	589760	0 %	0 %	0 %	100 %	258404617
9038	NC_013223	ACA	2	6	589803	589808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404617
9039	NC_013223	CAG	2	6	589823	589828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404618
9040	NC_013223	GAGCAC	2	12	589942	589953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404618
9041	NC_013223	TGT	2	6	590084	590089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404618
9042	NC_013223	TCG	2	6	590138	590143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404618
9043	NC_013223	GCG	2	6	590157	590162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404618
9044	NC_013223	GGC	2	6	590200	590205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404618
9045	NC_013223	CGT	2	6	590214	590219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404618
9046	NC_013223	GTA	2	6	590227	590232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404618
9047	NC_013223	TC	3	6	590262	590267	0 %	50 %	0 %	50 %	258404618
9048	NC_013223	AG	3	6	590309	590314	50 %	0 %	50 %	0 %	258404618
9049	NC_013223	ATG	2	6	590330	590335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404618
9050	NC_013223	GGCG	2	8	590349	590356	0 %	0 %	75 %	25 %	258404618
9051	NC_013223	GAT	2	6	590395	590400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404618
9052	NC_013223	GTCGCC	2	12	590500	590511	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258404618
9053	NC_013223	ACGA	2	8	590542	590549	50 %	0 %	25 %	25 %	258404618
9054	NC_013223	CCT	2	6	590553	590558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404618
9055	NC_013223	GGC	2	6	590575	590580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404618
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9057	NC_013223	AAC	2	6	590638	590643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404618
9058	NC_013223	GCC	2	6	590698	590703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404618
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9064	NC_013223	CGTG	2	8	591099	591106	0 %	25 %	50 %	25 %	258404618
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9067	NC_013223	ATTGGG	2	12	591573	591584	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258404619
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9082	NC_013223	TACCG	2	10	592960	592969	20 %	20 %	20 %	40 %	258404620
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9085	NC_013223	GAG	2	6	593176	593181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404620
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9091	NC_013223	GTG	2	6	594132	594137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404621
9092	NC_013223	GGC	2	6	594140	594145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404621
9093	NC_013223	G	6	6	594162	594167	0 %	0 %	100 %	0 %	258404621
9094	NC_013223	CAG	2	6	594168	594173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404621
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9099	NC_013223	ATA	2	6	594414	594419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404621
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9101	NC_013223	GGC	2	6	594510	594515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404621
9102	NC_013223	GCCCG	2	10	594623	594632	0 %	0 %	40 %	60 %	258404621
9103	NC_013223	GGCCG	2	10	594639	594648	0 %	0 %	60 %	40 %	258404621
9104	NC_013223	CACTG	2	10	594732	594741	20 %	20 %	20 %	40 %	258404621
9105	NC_013223	CGGT	2	8	594749	594756	0 %	25 %	50 %	25 %	258404621
9106	NC_013223	CGG	2	6	594867	594872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404622
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9109	NC_013223	GCCTCC	2	12	594911	594922	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	258404622
9110	NC_013223	T	6	6	594929	594934	0 %	100 %	0 %	0 %	258404622
9111	NC_013223	GC	3	6	594947	594952	0 %	0 %	50 %	50 %	258404622
9112	NC_013223	GCG	2	6	594957	594962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404622
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9117	NC_013223	CAA	2	6	595124	595129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404622
9118	NC_013223	ATG	2	6	595173	595178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404622
9119	NC_013223	CTG	2	6	595262	595267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404622
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9121	NC_013223	GCC	2	6	595352	595357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404622
9122	NC_013223	CGA	2	6	595396	595401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404622
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9240	NC_013223	CGG	2	6	602254	602259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404628
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9242	NC_013223	GTC	2	6	602334	602339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404628
9243	NC_013223	TCC	2	6	602340	602345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404628
9244	NC_013223	CTC	2	6	602357	602362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404628
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9250	NC_013223	CTGGCT	2	12	602609	602620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404628
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9464	NC_013223	GGCCG	2	10	614297	614306	0 %	0 %	60 %	40 %	258404638
9465	NC_013223	CAG	2	6	614322	614327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404638
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9485	NC_013223	CTG	2	6	615404	615409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404639
9486	NC_013223	TGC	2	6	615478	615483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404639
9487	NC_013223	CGGGAT	2	12	615526	615537	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258404639
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9490	NC_013223	CAG	2	6	615705	615710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404639
9491	NC_013223	GCA	2	6	615726	615731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404639
9492	NC_013223	A	10	10	615832	615841	100 %	0 %	0 %	0 %	258404639
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9497	NC_013223	ATGA	2	8	616113	616120	50 %	25 %	25 %	0 %	258404640
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