MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013223	GAG	2	6	327385	327390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404403
5002	NC_013223	GT	3	6	327407	327412	0 %	50 %	50 %	0 %	258404403
5003	NC_013223	CGT	2	6	327415	327420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404403
5004	NC_013223	GCC	2	6	327448	327453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404403
5005	NC_013223	TGC	2	6	327569	327574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404403
5006	NC_013223	GGC	2	6	327660	327665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404403
5007	NC_013223	GAA	2	6	327667	327672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404403
5008	NC_013223	CAC	2	6	327679	327684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404403
5009	NC_013223	G	6	6	327724	327729	0 %	0 %	100 %	0 %	258404403
5010	NC_013223	CGG	2	6	327744	327749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404403
5011	NC_013223	CGGA	2	8	327768	327775	25 %	0 %	50 %	25 %	258404403
5012	NC_013223	CAAGGC	2	12	327807	327818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404403
5013	NC_013223	GCC	2	6	327862	327867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404403
5014	NC_013223	CGA	2	6	328014	328019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404403
5015	NC_013223	CAA	2	6	328020	328025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404403
5016	NC_013223	CCT	2	6	328106	328111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404403
5017	NC_013223	AAG	2	6	328129	328134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404403
5018	NC_013223	GTG	2	6	328137	328142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404403
5019	NC_013223	CAAA	2	8	328207	328214	75 %	0 %	0 %	25 %	258404403
5020	NC_013223	TA	3	6	328365	328370	50 %	50 %	0 %	0 %	258404404
5021	NC_013223	AGC	2	6	328421	328426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404404
5022	NC_013223	GAGGTC	2	12	328484	328495	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258404404
5023	NC_013223	GTT	2	6	328534	328539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404404
5024	NC_013223	GT	3	6	328611	328616	0 %	50 %	50 %	0 %	258404404
5025	NC_013223	ATC	2	6	328752	328757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404404
5026	NC_013223	CAA	2	6	328828	328833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404404
5027	NC_013223	TC	3	6	328836	328841	0 %	50 %	0 %	50 %	258404404
5028	NC_013223	CGG	2	6	328942	328947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404404
5029	NC_013223	CTA	2	6	328957	328962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404404
5030	NC_013223	CGG	2	6	329089	329094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404404
5031	NC_013223	ACA	2	6	329106	329111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404404
5032	NC_013223	GAA	2	6	329153	329158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404404
5033	NC_013223	TCG	2	6	329169	329174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404404
5034	NC_013223	CTG	2	6	329195	329200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404404
5035	NC_013223	CTA	2	6	329212	329217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404404
5036	NC_013223	GCA	2	6	329229	329234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404404
5037	NC_013223	GGC	2	6	329237	329242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404404
5038	NC_013223	GCC	2	6	329648	329653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404404
5039	NC_013223	ATCA	2	8	329699	329706	50 %	25 %	0 %	25 %	258404404
5040	NC_013223	CAA	2	6	329731	329736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404404
5041	NC_013223	CGG	2	6	329803	329808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404404
5042	NC_013223	TGG	2	6	329859	329864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404404
5043	NC_013223	GCG	2	6	329895	329900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404404
5044	NC_013223	GGT	2	6	329944	329949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404404
5045	NC_013223	CAA	2	6	330040	330045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404404
5046	NC_013223	CGG	2	6	330566	330571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404405
5047	NC_013223	TTG	2	6	330622	330627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404405
5048	NC_013223	GACC	2	8	330725	330732	25 %	0 %	25 %	50 %	258404405
5049	NC_013223	TGG	2	6	330733	330738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404405
5050	NC_013223	GGT	2	6	330782	330787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404405
5051	NC_013223	GCCC	2	8	330839	330846	0 %	0 %	25 %	75 %	258404405
5052	NC_013223	GGC	2	6	330848	330853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404405
5053	NC_013223	ATG	2	6	330864	330869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404405
5054	NC_013223	GAG	2	6	330882	330887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404405
5055	NC_013223	TG	3	6	330995	331000	0 %	50 %	50 %	0 %	258404406
5056	NC_013223	GGA	3	9	331049	331057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404406
5057	NC_013223	GTC	2	6	331173	331178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404406
5058	NC_013223	CGG	2	6	331348	331353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404407
5059	NC_013223	CCT	2	6	331387	331392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404407
5060	NC_013223	CAG	2	6	331436	331441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404407
5061	NC_013223	GGT	2	6	331486	331491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404407
5062	NC_013223	CAAT	2	8	331522	331529	50 %	25 %	0 %	25 %	258404407
5063	NC_013223	CTGC	2	8	331592	331599	0 %	25 %	25 %	50 %	258404407
5064	NC_013223	GGTT	2	8	331736	331743	0 %	50 %	50 %	0 %	258404407
5065	NC_013223	CGGCTA	2	12	331780	331791	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258404407
5066	NC_013223	TAT	2	6	331895	331900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404407
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5068	NC_013223	CTG	2	6	332010	332015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404407
5069	NC_013223	CAT	2	6	332053	332058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404407
5070	NC_013223	CGT	2	6	332164	332169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404407
5071	NC_013223	GGC	2	6	332222	332227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404407
5072	NC_013223	GGC	2	6	332233	332238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404407
5073	NC_013223	GGA	2	6	332248	332253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404407
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5075	NC_013223	GTG	2	6	332504	332509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404407
5076	NC_013223	AATC	2	8	332564	332571	50 %	25 %	0 %	25 %	258404407
5077	NC_013223	CAG	2	6	332589	332594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404407
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5079	NC_013223	GAC	2	6	332669	332674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404407
5080	NC_013223	GGA	2	6	332686	332691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404407
5081	NC_013223	AG	3	6	333110	333115	50 %	0 %	50 %	0 %	258404408
5082	NC_013223	GGC	2	6	333144	333149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404408
5083	NC_013223	TGG	2	6	333166	333171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404408
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5086	NC_013223	GT	3	6	333619	333624	0 %	50 %	50 %	0 %	258404408
5087	NC_013223	ATAA	2	8	333626	333633	75 %	25 %	0 %	0 %	258404408
5088	NC_013223	CCGTG	2	10	333718	333727	0 %	20 %	40 %	40 %	258404409
5089	NC_013223	CGA	2	6	333737	333742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404409
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5091	NC_013223	GGC	2	6	333868	333873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404409
5092	NC_013223	GATC	2	8	333920	333927	25 %	25 %	25 %	25 %	258404409
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5095	NC_013223	GCCCG	2	10	333961	333970	0 %	0 %	40 %	60 %	258404409
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5099	NC_013223	TAT	2	6	334446	334451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404409
5100	NC_013223	GCG	2	6	334549	334554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404409
5101	NC_013223	TTG	2	6	334575	334580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404409
5102	NC_013223	TGGC	2	8	334630	334637	0 %	25 %	50 %	25 %	258404409
5103	NC_013223	TCC	2	6	334684	334689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404409
5104	NC_013223	GGC	2	6	334710	334715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404409
5105	NC_013223	GCG	2	6	334775	334780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404409
5106	NC_013223	CTG	2	6	334842	334847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404409
5107	NC_013223	GAA	2	6	334887	334892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404409
5108	NC_013223	CGC	2	6	334984	334989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404409
5109	NC_013223	GAC	2	6	335007	335012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404409
5110	NC_013223	GGT	2	6	335063	335068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404409
5111	NC_013223	CGT	2	6	335102	335107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404409
5112	NC_013223	CGC	2	6	335111	335116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404409
5113	NC_013223	CAAGGC	3	18	335168	335185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404409
5114	NC_013223	GCA	2	6	335242	335247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404409
5115	NC_013223	CAGC	2	8	335250	335257	25 %	0 %	25 %	50 %	258404409
5116	NC_013223	CAG	2	6	335290	335295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404409
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5118	NC_013223	CGA	2	6	335411	335416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404409
5119	NC_013223	CGTC	2	8	335438	335445	0 %	25 %	25 %	50 %	258404409
5120	NC_013223	ACG	2	6	335462	335467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404409
5121	NC_013223	CAA	2	6	335609	335614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404409
5122	NC_013223	ACC	2	6	335746	335751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404410
5123	NC_013223	AAT	2	6	335835	335840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404410
5124	NC_013223	TGCA	2	8	335958	335965	25 %	25 %	25 %	25 %	258404410
5125	NC_013223	CGT	2	6	335977	335982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404410
5126	NC_013223	GAA	2	6	336021	336026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404410
5127	NC_013223	GGC	2	6	336027	336032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404410
5128	NC_013223	GTCA	2	8	336036	336043	25 %	25 %	25 %	25 %	258404410
5129	NC_013223	GGC	2	6	336080	336085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404410
5130	NC_013223	CG	3	6	336178	336183	0 %	0 %	50 %	50 %	258404410
5131	NC_013223	GGT	2	6	336185	336190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404410
5132	NC_013223	CCA	2	6	336209	336214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404410
5133	NC_013223	GCG	2	6	336222	336227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404410
5134	NC_013223	AAGG	2	8	336273	336280	50 %	0 %	50 %	0 %	258404410
5135	NC_013223	TAC	2	6	336429	336434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404410
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5138	NC_013223	CTGG	2	8	336572	336579	0 %	25 %	50 %	25 %	258404411
5139	NC_013223	CTT	2	6	336593	336598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404411
5140	NC_013223	CGC	2	6	336614	336619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404411
5141	NC_013223	TTCGGA	2	12	336669	336680	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258404411
5142	NC_013223	T	6	6	336728	336733	0 %	100 %	0 %	0 %	258404411
5143	NC_013223	TCG	2	6	336799	336804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404411
5144	NC_013223	ATT	2	6	336969	336974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404411
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5146	NC_013223	CCA	2	6	337082	337087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404411
5147	NC_013223	CT	3	6	337091	337096	0 %	50 %	0 %	50 %	258404411
5148	NC_013223	GGC	2	6	337098	337103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404411
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5150	NC_013223	GTTT	2	8	337130	337137	0 %	75 %	25 %	0 %	258404411
5151	NC_013223	T	6	6	337149	337154	0 %	100 %	0 %	0 %	258404411
5152	NC_013223	CTT	2	6	337169	337174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404411
5153	NC_013223	AAG	2	6	337254	337259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404411
5154	NC_013223	TTC	2	6	337326	337331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404411
5155	NC_013223	CCTGGG	2	12	337345	337356	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258404411
5156	NC_013223	CGA	2	6	337391	337396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404411
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5158	NC_013223	CGG	2	6	337462	337467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404411
5159	NC_013223	GCT	2	6	337505	337510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404411
5160	NC_013223	CGC	2	6	337517	337522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404411
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5167	NC_013223	CGG	2	6	338200	338205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404412
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5178	NC_013223	TGA	2	6	338785	338790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404413
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5183	NC_013223	CCGGG	2	10	339298	339307	0 %	0 %	60 %	40 %	258404414
5184	NC_013223	CGC	2	6	339313	339318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404414
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5186	NC_013223	TGC	2	6	339333	339338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404414
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5194	NC_013223	GCC	2	6	339695	339700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404414
5195	NC_013223	ATC	2	6	339737	339742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404414
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5197	NC_013223	TTCAT	2	10	339844	339853	20 %	60 %	0 %	20 %	258404414
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5205	NC_013223	CGA	2	6	340566	340571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404415
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5222	NC_013223	GCTGTG	2	12	341692	341703	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	258404416
5223	NC_013223	TGGGT	2	10	341750	341759	0 %	40 %	60 %	0 %	258404416
5224	NC_013223	GGGA	2	8	341802	341809	25 %	0 %	75 %	0 %	258404416
5225	NC_013223	GTT	2	6	341868	341873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404416
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5229	NC_013223	CTT	2	6	342010	342015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404416
5230	NC_013223	GCC	2	6	342019	342024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404416
5231	NC_013223	CGG	2	6	342131	342136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404416
5232	NC_013223	GCT	2	6	342144	342149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404416
5233	NC_013223	AGAGGA	2	12	342204	342215	50 %	0 %	50 %	0 %	258404416
5234	NC_013223	CCT	2	6	342218	342223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404416
5235	NC_013223	AAC	2	6	342376	342381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404417
5236	NC_013223	AG	3	6	342417	342422	50 %	0 %	50 %	0 %	258404417
5237	NC_013223	GGT	2	6	342437	342442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404417
5238	NC_013223	TGG	2	6	342448	342453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404417
5239	NC_013223	GGCCGA	2	12	342491	342502	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258404417
5240	NC_013223	CAG	2	6	342529	342534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404417
5241	NC_013223	TGC	2	6	342659	342664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404417
5242	NC_013223	ACTGG	2	10	342698	342707	20 %	20 %	40 %	20 %	258404417
5243	NC_013223	TCA	2	6	342727	342732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404417
5244	NC_013223	T	7	7	342746	342752	0 %	100 %	0 %	0 %	258404417
5245	NC_013223	TGA	2	6	342851	342856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404417
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5247	NC_013223	GCA	2	6	342985	342990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404417
5248	NC_013223	CGA	2	6	343052	343057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404417
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5267	NC_013223	CATG	2	8	344315	344322	25 %	25 %	25 %	25 %	258404418
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5273	NC_013223	CGA	2	6	344915	344920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404420
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5275	NC_013223	TAT	2	6	345070	345075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404420
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5489	NC_013223	CGA	2	6	357988	357993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404427
5490	NC_013223	GGA	2	6	358101	358106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404427
5491	NC_013223	GCG	3	9	358176	358184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404427
5492	NC_013223	T	6	6	358220	358225	0 %	100 %	0 %	0 %	258404427
5493	NC_013223	A	7	7	358264	358270	100 %	0 %	0 %	0 %	258404427
5494	NC_013223	CTTG	2	8	358300	358307	0 %	50 %	25 %	25 %	258404427
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5497	NC_013223	ACC	2	6	358383	358388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404427
5498	NC_013223	TGG	2	6	358393	358398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404427
5499	NC_013223	GAC	2	6	358469	358474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404427
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