MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 43653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013223	TGTCC	2	10	295468	295477	0 %	40 %	20 %	40 %	258404371
4502	NC_013223	TCG	2	6	295530	295535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404371
4503	NC_013223	GGC	2	6	295543	295548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404371
4504	NC_013223	T	7	7	295575	295581	0 %	100 %	0 %	0 %	258404371
4505	NC_013223	TGT	2	6	295668	295673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404371
4506	NC_013223	GAA	2	6	295679	295684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404371
4507	NC_013223	GGC	2	6	295750	295755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404371
4508	NC_013223	TCA	2	6	295770	295775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404371
4509	NC_013223	G	6	6	295800	295805	0 %	0 %	100 %	0 %	258404371
4510	NC_013223	CGA	3	9	295828	295836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404371
4511	NC_013223	TGGCCA	2	12	295863	295874	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258404371
4512	NC_013223	CCA	2	6	296014	296019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404371
4513	NC_013223	CACC	2	8	296107	296114	25 %	0 %	0 %	75 %	258404371
4514	NC_013223	CCG	2	6	296121	296126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404371
4515	NC_013223	TCG	2	6	296489	296494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404372
4516	NC_013223	GAT	2	6	296563	296568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404372
4517	NC_013223	GCA	2	6	296585	296590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404372
4518	NC_013223	TGA	2	6	296652	296657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404372
4519	NC_013223	GCT	2	6	296658	296663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404372
4520	NC_013223	TCT	2	6	296682	296687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404372
4521	NC_013223	TGC	2	6	296765	296770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404372
4522	NC_013223	AGG	2	6	296801	296806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404372
4523	NC_013223	TGCT	2	8	296866	296873	0 %	50 %	25 %	25 %	258404372
4524	NC_013223	A	6	6	296903	296908	100 %	0 %	0 %	0 %	258404372
4525	NC_013223	CAA	2	6	296935	296940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404372
4526	NC_013223	TTG	2	6	296953	296958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404372
4527	NC_013223	GCCAA	2	10	296960	296969	40 %	0 %	20 %	40 %	258404372
4528	NC_013223	TG	3	6	296973	296978	0 %	50 %	50 %	0 %	258404372
4529	NC_013223	GGA	2	6	296988	296993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404372
4530	NC_013223	TGG	2	6	297006	297011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404372
4531	NC_013223	CTT	2	6	297142	297147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404373
4532	NC_013223	CT	3	6	297180	297185	0 %	50 %	0 %	50 %	258404373
4533	NC_013223	TTG	2	6	297186	297191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404373
4534	NC_013223	GGT	2	6	297208	297213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404373
4535	NC_013223	ACG	2	6	297248	297253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404373
4536	NC_013223	CAG	2	6	297263	297268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404373
4537	NC_013223	GAT	2	6	297337	297342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404373
4538	NC_013223	TGGCTG	2	12	297437	297448	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	258404373
4539	NC_013223	TTG	2	6	297596	297601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404373
4540	NC_013223	GGT	2	6	297637	297642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404373
4541	NC_013223	GCCG	2	8	297670	297677	0 %	0 %	50 %	50 %	258404373
4542	NC_013223	CAT	2	6	297751	297756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404373
4543	NC_013223	CGT	2	6	297799	297804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404373
4544	NC_013223	T	6	6	297825	297830	0 %	100 %	0 %	0 %	258404373
4545	NC_013223	AAC	2	6	297935	297940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404373
4546	NC_013223	AAG	2	6	298029	298034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404373
4547	NC_013223	AAT	2	6	298060	298065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404373
4548	NC_013223	CGC	2	6	298113	298118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404374
4549	NC_013223	TGGA	2	8	298127	298134	25 %	25 %	50 %	0 %	258404374
4550	NC_013223	GCT	2	6	298175	298180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404374
4551	NC_013223	GAC	2	6	298238	298243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404374
4552	NC_013223	CGCT	2	8	298310	298317	0 %	25 %	25 %	50 %	258404374
4553	NC_013223	CGTT	2	8	298339	298346	0 %	50 %	25 %	25 %	258404374
4554	NC_013223	T	6	6	298373	298378	0 %	100 %	0 %	0 %	258404374
4555	NC_013223	CGG	3	9	298381	298389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404374
4556	NC_013223	CG	3	6	298491	298496	0 %	0 %	50 %	50 %	258404374
4557	NC_013223	GTT	2	6	298560	298565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404374
4558	NC_013223	CCG	2	6	298593	298598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404374
4559	NC_013223	ATG	2	6	298607	298612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404374
4560	NC_013223	CTG	2	6	298622	298627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404374
4561	NC_013223	TGG	2	6	298632	298637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404374
4562	NC_013223	CATCAA	2	12	298639	298650	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	258404374
4563	NC_013223	ACC	2	6	298692	298697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404374
4564	NC_013223	C	6	6	298705	298710	0 %	0 %	0 %	100 %	258404374
4565	NC_013223	TCG	2	6	298728	298733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404374
4566	NC_013223	CGG	2	6	299029	299034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404374
4567	NC_013223	GCA	2	6	299197	299202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404374
4568	NC_013223	CTC	2	6	299288	299293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404374
4569	NC_013223	CAA	2	6	299326	299331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404374
4570	NC_013223	TGC	2	6	299375	299380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404374
4571	NC_013223	GGC	3	9	299381	299389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404374
4572	NC_013223	CGA	2	6	299404	299409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404374
4573	NC_013223	GCG	2	6	299430	299435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404374
4574	NC_013223	TGT	2	6	299490	299495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404374
4575	NC_013223	ATCG	2	8	299510	299517	25 %	25 %	25 %	25 %	258404374
4576	NC_013223	AAG	2	6	299615	299620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404374
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4578	NC_013223	ACG	2	6	299677	299682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404375
4579	NC_013223	TGA	2	6	299722	299727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404375
4580	NC_013223	CGC	2	6	299756	299761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404375
4581	NC_013223	GGA	2	6	299798	299803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404375
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4583	NC_013223	A	7	7	299881	299887	100 %	0 %	0 %	0 %	258404375
4584	NC_013223	CAC	2	6	299903	299908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404375
4585	NC_013223	CGG	3	9	299995	300003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404375
4586	NC_013223	CTG	2	6	300014	300019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404375
4587	NC_013223	AGC	2	6	300046	300051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404375
4588	NC_013223	AGG	2	6	300073	300078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404375
4589	NC_013223	GGC	2	6	300126	300131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404376
4590	NC_013223	CCT	2	6	300173	300178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404376
4591	NC_013223	CAA	2	6	300336	300341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404376
4592	NC_013223	GGAC	2	8	300359	300366	25 %	0 %	50 %	25 %	258404376
4593	NC_013223	TGT	3	9	300437	300445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404376
4594	NC_013223	TGA	2	6	300521	300526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404376
4595	NC_013223	CCCG	2	8	300643	300650	0 %	0 %	25 %	75 %	258404376
4596	NC_013223	GTG	2	6	300661	300666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404376
4597	NC_013223	ATC	2	6	300742	300747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404376
4598	NC_013223	CGA	2	6	300759	300764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404376
4599	NC_013223	AACC	2	8	300831	300838	50 %	0 %	0 %	50 %	258404376
4600	NC_013223	CTA	2	6	300846	300851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404376
4601	NC_013223	GATCGG	2	12	300939	300950	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258404377
4602	NC_013223	CGG	2	6	301067	301072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404377
4603	NC_013223	TAC	2	6	301090	301095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404377
4604	NC_013223	A	6	6	301108	301113	100 %	0 %	0 %	0 %	258404377
4605	NC_013223	TGA	2	6	301211	301216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404377
4606	NC_013223	CTT	2	6	301413	301418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404377
4607	NC_013223	GCCGG	2	10	301431	301440	0 %	0 %	60 %	40 %	258404377
4608	NC_013223	CG	3	6	301467	301472	0 %	0 %	50 %	50 %	258404377
4609	NC_013223	ATC	2	6	301588	301593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404377
4610	NC_013223	TTC	2	6	301621	301626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404377
4611	NC_013223	CGC	2	6	301676	301681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404377
4612	NC_013223	GTC	2	6	301744	301749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404377
4613	NC_013223	TGT	2	6	301755	301760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404377
4614	NC_013223	CCG	2	6	301780	301785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404377
4615	NC_013223	TTG	2	6	301807	301812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404377
4616	NC_013223	TCG	2	6	301871	301876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404377
4617	NC_013223	TAT	2	6	302388	302393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404378
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4619	NC_013223	GAA	2	6	302509	302514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404378
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4621	NC_013223	GAA	3	9	302569	302577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404378
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4743	NC_013223	GCA	2	6	311007	311012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404388
4744	NC_013223	AGG	2	6	311025	311030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404388
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4746	NC_013223	GCG	2	6	311207	311212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404388
4747	NC_013223	GA	3	6	311244	311249	50 %	0 %	50 %	0 %	258404388
4748	NC_013223	TCC	2	6	311253	311258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404388
4749	NC_013223	CGT	2	6	311287	311292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404388
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4752	NC_013223	TGA	2	6	311428	311433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404388
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4756	NC_013223	CCA	2	6	311651	311656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404388
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4844	NC_013223	CTGGA	2	10	317495	317504	20 %	20 %	40 %	20 %	258404391
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4854	NC_013223	GAAT	2	8	318356	318363	50 %	25 %	25 %	0 %	258404392
4855	NC_013223	CAT	2	6	318388	318393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404392
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4858	NC_013223	CGC	2	6	318632	318637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404393
4859	NC_013223	CCAG	2	8	318663	318670	25 %	0 %	25 %	50 %	258404393
4860	NC_013223	CGCA	2	8	318689	318696	25 %	0 %	25 %	50 %	258404393
4861	NC_013223	CAC	2	6	318739	318744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404393
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4864	NC_013223	GGC	2	6	318883	318888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404393
4865	NC_013223	CGG	2	6	318934	318939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404393
4866	NC_013223	CGA	2	6	318964	318969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404393
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4913	NC_013223	A	6	6	321685	321690	100 %	0 %	0 %	0 %	258404397
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4973	NC_013223	GC	4	8	325283	325290	0 %	0 %	50 %	50 %	258404401
4974	NC_013223	AAC	2	6	325304	325309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404401
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4978	NC_013223	TTGGC	2	10	325733	325742	0 %	40 %	40 %	20 %	258404402
4979	NC_013223	GGCC	2	8	325760	325767	0 %	0 %	50 %	50 %	258404402
4980	NC_013223	ACC	2	6	325882	325887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404402
4981	NC_013223	C	6	6	325899	325904	0 %	0 %	0 %	100 %	258404402
4982	NC_013223	GCT	2	6	326098	326103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404402
4983	NC_013223	GCCA	2	8	326112	326119	25 %	0 %	25 %	50 %	258404402
4984	NC_013223	CCT	2	6	326195	326200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404402
4985	NC_013223	TCG	2	6	326227	326232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404402
4986	NC_013223	CGA	2	6	326273	326278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404402
4987	NC_013223	GCC	2	6	326279	326284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404402
4988	NC_013223	GCG	2	6	326289	326294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404402
4989	NC_013223	GGC	2	6	326355	326360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404402
4990	NC_013223	GC	3	6	326359	326364	0 %	0 %	50 %	50 %	258404402
4991	NC_013223	TGA	2	6	326468	326473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404402
4992	NC_013223	GC	3	6	326514	326519	0 %	0 %	50 %	50 %	258404402
4993	NC_013223	GCC	2	6	326540	326545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404402
4994	NC_013223	TGA	2	6	326555	326560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404402
4995	NC_013223	AGC	2	6	326671	326676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404402
4996	NC_013223	CGGG	2	8	326693	326700	0 %	0 %	75 %	25 %	258404402
4997	NC_013223	CAGCG	2	10	326793	326802	20 %	0 %	40 %	40 %	258404402
4998	NC_013223	GAT	2	6	326841	326846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404402
4999	NC_013223	TGA	2	6	327347	327352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404403
5000	NC_013223	TTG	2	6	327359	327364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404403

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