MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfitobacterium hafniense DCB-2 chromosome

Total Repeats: 86466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011830	CCT	2	6	194	199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219666072
2	NC_011830	CAT	2	6	278	283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666072
3	NC_011830	ATCC	2	8	299	306	25 %	25 %	0 %	50 %	219666072
4	NC_011830	ACA	2	6	354	359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219666072
5	NC_011830	TCT	2	6	387	392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666072
6	NC_011830	GCC	3	9	486	494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219666072
7	NC_011830	TTAT	2	8	534	541	25 %	75 %	0 %	0 %	219666072
8	NC_011830	ATCC	2	8	668	675	25 %	25 %	0 %	50 %	219666072
9	NC_011830	TTGA	2	8	729	736	25 %	50 %	25 %	0 %	219666072
10	NC_011830	AAG	2	6	760	765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666072
11	NC_011830	AGG	2	6	772	777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666072
12	NC_011830	TTC	2	6	780	785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666072
13	NC_011830	ATG	2	6	805	810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666072
14	NC_011830	ATT	3	9	822	830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666072
15	NC_011830	TCC	2	6	831	836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219666072
16	NC_011830	TCC	2	6	842	847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219666072
17	NC_011830	CCG	2	6	918	923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219666072
18	NC_011830	A	7	7	953	959	100 %	0 %	0 %	0 %	219666072
19	NC_011830	AG	3	6	1032	1037	50 %	0 %	50 %	0 %	219666072
20	NC_011830	ATT	2	6	1128	1133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666072
21	NC_011830	TGA	2	6	1313	1318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666072
22	NC_011830	GGA	2	6	1323	1328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666072
23	NC_011830	ACC	2	6	1338	1343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219666072
24	NC_011830	GCC	2	6	1375	1380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219666072
25	NC_011830	CGT	2	6	1862	1867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666073
26	NC_011830	TTC	2	6	1900	1905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666073
27	NC_011830	T	6	6	1915	1920	0 %	100 %	0 %	0 %	219666073
28	NC_011830	CATT	2	8	1985	1992	25 %	50 %	0 %	25 %	219666073
29	NC_011830	GGA	2	6	2030	2035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666073
30	NC_011830	TTA	2	6	2043	2048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666073
31	NC_011830	CTG	2	6	2131	2136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666073
32	NC_011830	AG	3	6	2138	2143	50 %	0 %	50 %	0 %	219666073
33	NC_011830	CTGC	2	8	2162	2169	0 %	25 %	25 %	50 %	219666073
34	NC_011830	TAT	2	6	2273	2278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666073
35	NC_011830	GATGAG	2	12	2319	2330	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	219666073
36	NC_011830	TCTCC	2	10	2387	2396	0 %	40 %	0 %	60 %	219666073
37	NC_011830	TTGA	2	8	2400	2407	25 %	50 %	25 %	0 %	219666073
38	NC_011830	TAT	2	6	2464	2469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666073
39	NC_011830	CTT	2	6	2503	2508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666073
40	NC_011830	TAT	2	6	2537	2542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666073
41	NC_011830	AG	3	6	2561	2566	50 %	0 %	50 %	0 %	219666073
42	NC_011830	A	7	7	2621	2627	100 %	0 %	0 %	0 %	219666073
43	NC_011830	ATT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666073
44	NC_011830	CGA	2	6	2753	2758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666073
45	NC_011830	CTATCT	2	12	2765	2776	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219666073
46	NC_011830	ATCAGG	2	12	2856	2867	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219666074
47	NC_011830	TATT	2	8	2941	2948	25 %	75 %	0 %	0 %	219666074
48	NC_011830	GA	3	6	3006	3011	50 %	0 %	50 %	0 %	219666074
49	NC_011830	GCG	2	6	3046	3051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219666074
50	NC_011830	ATT	2	6	3092	3097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666074
51	NC_011830	ATCA	2	8	3101	3108	50 %	25 %	0 %	25 %	219666074
52	NC_011830	T	9	9	3156	3164	0 %	100 %	0 %	0 %	219666074
53	NC_011830	CAC	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219666074
54	NC_011830	A	7	7	3291	3297	100 %	0 %	0 %	0 %	219666074
55	NC_011830	CCT	2	6	3301	3306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219666074
56	NC_011830	ACAGGG	2	12	3310	3321	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	219666074
57	NC_011830	TCC	2	6	3369	3374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219666074
58	NC_011830	TTC	2	6	3457	3462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666074
59	NC_011830	AGA	2	6	3469	3474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666074
60	NC_011830	A	6	6	3502	3507	100 %	0 %	0 %	0 %	219666074
61	NC_011830	GGA	2	6	3514	3519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666074
62	NC_011830	TGGAAA	2	12	3564	3575	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	219666074
63	NC_011830	GAC	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666074
64	NC_011830	GCA	2	6	3661	3666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666074
65	NC_011830	GAT	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666074
66	NC_011830	GA	3	6	3781	3786	50 %	0 %	50 %	0 %	219666074
67	NC_011830	CTAT	2	8	3787	3794	25 %	50 %	0 %	25 %	219666074
68	NC_011830	GCA	2	6	3814	3819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666074
69	NC_011830	ATGACC	2	12	3827	3838	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219666074
70	NC_011830	GGA	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666074
71	NC_011830	AAT	2	6	3909	3914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666074
72	NC_011830	GGC	2	6	3932	3937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219666075
73	NC_011830	T	6	6	4015	4020	0 %	100 %	0 %	0 %	219666075
74	NC_011830	A	6	6	4041	4046	100 %	0 %	0 %	0 %	219666075
75	NC_011830	TA	3	6	4052	4057	50 %	50 %	0 %	0 %	219666075
76	NC_011830	ATT	2	6	4085	4090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666075
77	NC_011830	TCA	2	6	4121	4126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666075
78	NC_011830	TTA	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666075
79	NC_011830	ATC	2	6	4157	4162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666075
80	NC_011830	GAA	2	6	4166	4171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666075
81	NC_011830	CCAA	2	8	4359	4366	50 %	0 %	0 %	50 %	219666076
82	NC_011830	CAT	2	6	4464	4469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666076
83	NC_011830	ATA	2	6	4489	4494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666076
84	NC_011830	CGA	2	6	4499	4504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666076
85	NC_011830	GTG	2	6	4566	4571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219666076
86	NC_011830	GGA	2	6	4656	4661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666076
87	NC_011830	ATC	2	6	4777	4782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666076
88	NC_011830	ACC	2	6	4854	4859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219666076
89	NC_011830	CTTT	2	8	4938	4945	0 %	75 %	0 %	25 %	219666076
90	NC_011830	AGA	2	6	4985	4990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666076
91	NC_011830	AAGA	2	8	4992	4999	75 %	0 %	25 %	0 %	219666076
92	NC_011830	CGG	2	6	5015	5020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219666076
93	NC_011830	T	6	6	5155	5160	0 %	100 %	0 %	0 %	219666076
94	NC_011830	AAT	2	6	5169	5174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666076
95	NC_011830	CCG	2	6	5317	5322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219666076
96	NC_011830	ACCAAG	2	12	5364	5375	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	219666076
97	NC_011830	TTCG	2	8	5392	5399	0 %	50 %	25 %	25 %	219666076
98	NC_011830	T	6	6	5436	5441	0 %	100 %	0 %	0 %	219666076
99	NC_011830	CCCGGG	2	12	5494	5505	0 %	0 %	50 %	50 %	219666076
100	NC_011830	AGC	2	6	5507	5512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666076
101	NC_011830	AAG	2	6	5596	5601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666076
102	NC_011830	CAAG	2	8	5654	5661	50 %	0 %	25 %	25 %	219666076
103	NC_011830	TCG	2	6	5669	5674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666076
104	NC_011830	CCGATG	2	12	5845	5856	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219666076
105	NC_011830	CTT	3	9	5891	5899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666076
106	NC_011830	GAA	2	6	5966	5971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666076
107	NC_011830	AATG	2	8	6077	6084	50 %	25 %	25 %	0 %	219666076
108	NC_011830	TGG	2	6	6196	6201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219666076
109	NC_011830	GGA	2	6	6292	6297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666077
110	NC_011830	GGA	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666077
111	NC_011830	A	7	7	6330	6336	100 %	0 %	0 %	0 %	219666077
112	NC_011830	ATT	2	6	6347	6352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666077
113	NC_011830	CGC	2	6	6415	6420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219666077
114	NC_011830	TAA	2	6	6456	6461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666077
115	NC_011830	TCC	2	6	6526	6531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219666077
116	NC_011830	ATG	2	6	6536	6541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
117	NC_011830	GGT	2	6	6543	6548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219666077
118	NC_011830	AT	3	6	6675	6680	50 %	50 %	0 %	0 %	219666077
119	NC_011830	ATG	2	6	6725	6730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
120	NC_011830	CGG	2	6	6791	6796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219666077
121	NC_011830	TCCC	2	8	6824	6831	0 %	25 %	0 %	75 %	219666077
122	NC_011830	CGAGAT	2	12	6882	6893	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219666077
123	NC_011830	TGA	2	6	6902	6907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
124	NC_011830	ACCGG	2	10	6977	6986	20 %	0 %	40 %	40 %	219666077
125	NC_011830	GAG	2	6	7024	7029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666077
126	NC_011830	A	6	6	7103	7108	100 %	0 %	0 %	0 %	219666077
127	NC_011830	CGGAC	2	10	7166	7175	20 %	0 %	40 %	40 %	219666077
128	NC_011830	GAA	2	6	7258	7263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666077
129	NC_011830	TCAT	2	8	7328	7335	25 %	50 %	0 %	25 %	219666077
130	NC_011830	TAT	2	6	7464	7469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666077
131	NC_011830	TGA	2	6	7482	7487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
132	NC_011830	A	6	6	7613	7618	100 %	0 %	0 %	0 %	219666077
133	NC_011830	ATT	2	6	7678	7683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666077
134	NC_011830	GAT	2	6	7780	7785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
135	NC_011830	GAA	2	6	7786	7791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666077
136	NC_011830	TCA	2	6	7796	7801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666077
137	NC_011830	GCG	2	6	7857	7862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219666077
138	NC_011830	CATGG	2	10	7879	7888	20 %	20 %	40 %	20 %	219666077
139	NC_011830	ACC	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219666077
140	NC_011830	AT	3	6	7941	7946	50 %	50 %	0 %	0 %	219666077
141	NC_011830	TCT	2	6	7949	7954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666077
142	NC_011830	ACC	2	6	7957	7962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219666077
143	NC_011830	GAA	2	6	8062	8067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666077
144	NC_011830	CCG	2	6	8075	8080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219666077
145	NC_011830	AAG	2	6	8146	8151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666077
146	NC_011830	TGA	3	9	8214	8222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
147	NC_011830	TGA	2	6	8250	8255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
148	NC_011830	ATC	2	6	8260	8265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666077
149	NC_011830	GAA	2	6	8401	8406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666077
150	NC_011830	TC	3	6	8454	8459	0 %	50 %	0 %	50 %	219666077
151	NC_011830	GGC	2	6	8482	8487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219666077
152	NC_011830	CAT	2	6	8493	8498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666077
153	NC_011830	CCA	2	6	8501	8506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219666077
154	NC_011830	TGG	2	6	8531	8536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219666077
155	NC_011830	TGA	2	6	8546	8551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
156	NC_011830	ATG	2	6	8566	8571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
157	NC_011830	ATC	2	6	8572	8577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666077
158	NC_011830	ATT	2	6	8590	8595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666077
159	NC_011830	GTG	2	6	8677	8682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219666077
160	NC_011830	CGT	2	6	8691	8696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666077
161	NC_011830	AGA	2	6	8706	8711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666077
162	NC_011830	TAG	2	6	8735	8740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
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164	NC_011830	ATGA	2	8	8875	8882	50 %	25 %	25 %	0 %	219666078
165	NC_011830	TAT	2	6	8894	8899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666078
166	NC_011830	ACAGGC	3	18	9010	9027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666078
167	NC_011830	TATC	2	8	9223	9230	25 %	50 %	0 %	25 %	219666078
168	NC_011830	CGC	2	6	9251	9256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219666078
169	NC_011830	ATG	2	6	9272	9277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666078
170	NC_011830	GCTG	2	8	9363	9370	0 %	25 %	50 %	25 %	219666078
171	NC_011830	AACA	2	8	9386	9393	75 %	0 %	0 %	25 %	219666078
172	NC_011830	AGT	2	6	9513	9518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666079
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174	NC_011830	AAG	3	9	9575	9583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666079
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176	NC_011830	A	6	6	9661	9666	100 %	0 %	0 %	0 %	219666079
177	NC_011830	AGC	2	6	9683	9688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666079
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188	NC_011830	GAGCTT	2	12	10405	10416	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219666079
189	NC_011830	TACC	2	8	10506	10513	25 %	25 %	0 %	50 %	219666079
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212	NC_011830	AATG	2	8	13777	13784	50 %	25 %	25 %	0 %	219666082
213	NC_011830	TGA	2	6	13894	13899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666082
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225	NC_011830	ATC	2	6	14699	14704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666083
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243	NC_011830	TAT	2	6	16424	16429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666087
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245	NC_011830	TAT	2	6	16473	16478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666087
246	NC_011830	ATTA	2	8	16498	16505	50 %	50 %	0 %	0 %	219666087
247	NC_011830	TCTT	2	8	16590	16597	0 %	75 %	0 %	25 %	219666087
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249	NC_011830	T	6	6	16694	16699	0 %	100 %	0 %	0 %	219666087
250	NC_011830	C	6	6	16706	16711	0 %	0 %	0 %	100 %	219666087
251	NC_011830	TCA	2	6	16897	16902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666087
252	NC_011830	TGAT	2	8	16920	16927	25 %	50 %	25 %	0 %	219666087
253	NC_011830	A	6	6	17148	17153	100 %	0 %	0 %	0 %	219666087
254	NC_011830	A	7	7	17268	17274	100 %	0 %	0 %	0 %	219666087
255	NC_011830	CATC	2	8	17553	17560	25 %	25 %	0 %	50 %	219666088
256	NC_011830	CAG	2	6	17581	17586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666088
257	NC_011830	AAT	2	6	17600	17605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666088
258	NC_011830	TGA	2	6	17607	17612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666088
259	NC_011830	T	8	8	17639	17646	0 %	100 %	0 %	0 %	219666088
260	NC_011830	GTT	2	6	17843	17848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219666088
261	NC_011830	TTG	2	6	17927	17932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219666088
262	NC_011830	TTG	2	6	17942	17947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219666088
263	NC_011830	AACG	2	8	18006	18013	50 %	0 %	25 %	25 %	219666088
264	NC_011830	AT	3	6	18036	18041	50 %	50 %	0 %	0 %	219666088
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268	NC_011830	GCTT	2	8	18099	18106	0 %	50 %	25 %	25 %	219666088
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