MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfitobacterium hafniense DCB-2 chromosome

Total Repeats: 86466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011830	CTGCT	2	10	272576	272585	0 %	40 %	20 %	40 %	219666308
4502	NC_011830	GAT	2	6	272714	272719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666308
4503	NC_011830	TA	3	6	272729	272734	50 %	50 %	0 %	0 %	219666308
4504	NC_011830	ATT	2	6	272856	272861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666308
4505	NC_011830	GA	3	6	272998	273003	50 %	0 %	50 %	0 %	219666308
4506	NC_011830	ATA	2	6	273147	273152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666308
4507	NC_011830	A	7	7	273189	273195	100 %	0 %	0 %	0 %	219666308
4508	NC_011830	TAA	2	6	273296	273301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666309
4509	NC_011830	TGG	2	6	273464	273469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219666309
4510	NC_011830	ATGGT	2	10	273487	273496	20 %	40 %	40 %	0 %	219666309
4511	NC_011830	GAAA	2	8	273511	273518	75 %	0 %	25 %	0 %	219666309
4512	NC_011830	GAAT	2	8	273551	273558	50 %	25 %	25 %	0 %	219666309
4513	NC_011830	TTA	2	6	273625	273630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666309
4514	NC_011830	AC	3	6	273656	273661	50 %	0 %	0 %	50 %	219666309
4515	NC_011830	CAAG	2	8	273692	273699	50 %	0 %	25 %	25 %	219666309
4516	NC_011830	GTA	2	6	273717	273722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666309
4517	NC_011830	AG	3	6	273788	273793	50 %	0 %	50 %	0 %	219666309
4518	NC_011830	GAA	2	6	273822	273827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666309
4519	NC_011830	ATC	2	6	273843	273848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666309
4520	NC_011830	AAT	2	6	273864	273869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666309
4521	NC_011830	CAA	2	6	274004	274009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219666309
4522	NC_011830	ATT	2	6	274102	274107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666309
4523	NC_011830	A	6	6	274115	274120	100 %	0 %	0 %	0 %	219666309
4524	NC_011830	AAC	2	6	274265	274270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219666310
4525	NC_011830	GCCT	2	8	274315	274322	0 %	25 %	25 %	50 %	219666310
4526	NC_011830	AAGA	2	8	274335	274342	75 %	0 %	25 %	0 %	219666310
4527	NC_011830	AGGT	2	8	274361	274368	25 %	25 %	50 %	0 %	219666310
4528	NC_011830	TGG	2	6	274373	274378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219666310
4529	NC_011830	CTA	2	6	274416	274421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666310
4530	NC_011830	GAA	2	6	274432	274437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666310
4531	NC_011830	ATTTT	2	10	274483	274492	20 %	80 %	0 %	0 %	219666310
4532	NC_011830	T	6	6	274489	274494	0 %	100 %	0 %	0 %	219666310
4533	NC_011830	GAA	2	6	274537	274542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666310
4534	NC_011830	GAA	2	6	274549	274554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666310
4535	NC_011830	A	6	6	274553	274558	100 %	0 %	0 %	0 %	219666310
4536	NC_011830	CTT	2	6	274714	274719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666311
4537	NC_011830	TAA	2	6	274780	274785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666311
4538	NC_011830	TGC	2	6	274791	274796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666311
4539	NC_011830	CCTT	2	8	274809	274816	0 %	50 %	0 %	50 %	219666311
4540	NC_011830	CCA	2	6	274829	274834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219666311
4541	NC_011830	C	6	6	274842	274847	0 %	0 %	0 %	100 %	219666311
4542	NC_011830	C	6	6	274975	274980	0 %	0 %	0 %	100 %	219666311
4543	NC_011830	GAT	2	6	275036	275041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666311
4544	NC_011830	ATT	3	9	275294	275302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666312
4545	NC_011830	GCT	2	6	275323	275328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666312
4546	NC_011830	CTAT	2	8	275436	275443	25 %	50 %	0 %	25 %	219666312
4547	NC_011830	ACA	2	6	275456	275461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219666312
4548	NC_011830	ATG	3	9	275475	275483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666312
4549	NC_011830	AT	3	6	275569	275574	50 %	50 %	0 %	0 %	219666312
4550	NC_011830	AGG	3	9	275626	275634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666312
4551	NC_011830	GAA	2	6	275690	275695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666312
4552	NC_011830	GA	3	6	275737	275742	50 %	0 %	50 %	0 %	219666312
4553	NC_011830	TA	3	6	276088	276093	50 %	50 %	0 %	0 %	219666313
4554	NC_011830	TGA	2	6	276097	276102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666313
4555	NC_011830	AT	3	6	276121	276126	50 %	50 %	0 %	0 %	219666313
4556	NC_011830	ATG	2	6	276130	276135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666313
4557	NC_011830	ATTG	2	8	276138	276145	25 %	50 %	25 %	0 %	219666313
4558	NC_011830	TGC	2	6	276272	276277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666313
4559	NC_011830	TAA	2	6	276323	276328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666313
4560	NC_011830	CAT	2	6	276444	276449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666313
4561	NC_011830	GATGG	2	10	276454	276463	20 %	20 %	60 %	0 %	219666313
4562	NC_011830	GAA	2	6	276492	276497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666313
4563	NC_011830	ATT	2	6	276516	276521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666313
4564	NC_011830	GT	3	6	276525	276530	0 %	50 %	50 %	0 %	219666313
4565	NC_011830	ATA	2	6	276603	276608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666313
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4569	NC_011830	ATTA	2	8	276924	276931	50 %	50 %	0 %	0 %	219666314
4570	NC_011830	TA	3	6	277009	277014	50 %	50 %	0 %	0 %	219666314
4571	NC_011830	GTG	2	6	277059	277064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219666314
4572	NC_011830	ATG	2	6	277114	277119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666314
4573	NC_011830	GAT	2	6	277221	277226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666314
4574	NC_011830	TA	3	6	277230	277235	50 %	50 %	0 %	0 %	219666314
4575	NC_011830	GAT	2	6	277236	277241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666314
4576	NC_011830	GAGAA	2	10	277253	277262	60 %	0 %	40 %	0 %	219666314
4577	NC_011830	GCT	2	6	277265	277270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666314
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4583	NC_011830	TGC	2	6	277617	277622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666315
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4587	NC_011830	AGA	2	6	277840	277845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666316
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4591	NC_011830	ATA	2	6	278055	278060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666316
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4593	NC_011830	CTT	2	6	278137	278142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666316
4594	NC_011830	CAC	2	6	278200	278205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219666316
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4596	NC_011830	GA	3	6	278343	278348	50 %	0 %	50 %	0 %	219666316
4597	NC_011830	ACGGG	2	10	278361	278370	20 %	0 %	60 %	20 %	219666316
4598	NC_011830	AGC	2	6	278396	278401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666316
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4602	NC_011830	GAT	3	9	278537	278545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666316
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4604	NC_011830	ACG	2	6	278601	278606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666316
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4606	NC_011830	CTT	2	6	278641	278646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666316
4607	NC_011830	AAG	2	6	278670	278675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666316
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4609	NC_011830	GAT	2	6	278705	278710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666316
4610	NC_011830	AAT	2	6	278828	278833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666316
4611	NC_011830	T	7	7	278852	278858	0 %	100 %	0 %	0 %	219666316
4612	NC_011830	GTG	2	6	278889	278894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219666316
4613	NC_011830	TAA	2	6	278921	278926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666316
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4615	NC_011830	T	7	7	279107	279113	0 %	100 %	0 %	0 %	219666316
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4617	NC_011830	CT	3	6	280003	280008	0 %	50 %	0 %	50 %	219666317
4618	NC_011830	GGA	2	6	280096	280101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666317
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4623	NC_011830	TTCAC	2	10	280239	280248	20 %	40 %	0 %	40 %	219666317
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4631	NC_011830	TTG	2	6	280423	280428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219666317
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4745	NC_011830	GA	3	6	287017	287022	50 %	0 %	50 %	0 %	219666323
4746	NC_011830	A	6	6	287022	287027	100 %	0 %	0 %	0 %	219666323
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4754	NC_011830	TGA	2	6	287359	287364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666324
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4764	NC_011830	GGCAA	2	10	288026	288035	40 %	0 %	40 %	20 %	219666325
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4774	NC_011830	TA	3	6	288502	288507	50 %	50 %	0 %	0 %	219666325
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4869	NC_011830	AATATT	2	12	293800	293811	50 %	50 %	0 %	0 %	219666331
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4981	NC_011830	AAG	2	6	300824	300829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666336
4982	NC_011830	GAA	2	6	300833	300838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666336
4983	NC_011830	CCCCGT	2	12	300911	300922	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	219666336
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4987	NC_011830	GCT	2	6	301044	301049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666336
4988	NC_011830	CAT	2	6	301117	301122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666336
4989	NC_011830	CCT	2	6	301182	301187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219666336
4990	NC_011830	GAA	2	6	301280	301285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666336
4991	NC_011830	TGCC	2	8	301357	301364	0 %	25 %	25 %	50 %	219666336
4992	NC_011830	ATCA	2	8	301382	301389	50 %	25 %	0 %	25 %	219666336
4993	NC_011830	GTC	2	6	301403	301408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666336
4994	NC_011830	ATC	2	6	301682	301687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666337
4995	NC_011830	T	6	6	301702	301707	0 %	100 %	0 %	0 %	219666337
4996	NC_011830	CTG	2	6	301721	301726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666337
4997	NC_011830	CGG	2	6	301743	301748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219666337
4998	NC_011830	AG	3	6	301816	301821	50 %	0 %	50 %	0 %	219666337
4999	NC_011830	TGC	2	6	301881	301886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666337
5000	NC_011830	TCT	2	6	301896	301901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666337

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