MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dictyoglomus thermophilum H-6-12

Total Repeats: 44626

< Previous12...78798081828384858687888990Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_011297	ACT	2	6	1954318	1954323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206901846
44502	NC_011297	AGAAA	2	10	1954361	1954370	80 %	0 %	20 %	0 %	206901846
44503	NC_011297	ATG	2	6	1954384	1954389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206901846
44504	NC_011297	GA	3	6	1954437	1954442	50 %	0 %	50 %	0 %	206901846
44505	NC_011297	A	6	6	1954458	1954463	100 %	0 %	0 %	0 %	206901846
44506	NC_011297	AT	3	6	1954496	1954501	50 %	50 %	0 %	0 %	206901846
44507	NC_011297	CT	3	6	1954586	1954591	0 %	50 %	0 %	50 %	206901846
44508	NC_011297	GAG	2	6	1954654	1954659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206901846
44509	NC_011297	CCT	2	6	1954689	1954694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206901846
44510	NC_011297	AT	3	6	1954712	1954717	50 %	50 %	0 %	0 %	206901846
44511	NC_011297	AGA	2	6	1954719	1954724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206901846
44512	NC_011297	A	6	6	1954729	1954734	100 %	0 %	0 %	0 %	206901846
44513	NC_011297	AGA	3	9	1954740	1954748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206901846
44514	NC_011297	CTC	2	6	1954759	1954764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206901846
44515	NC_011297	GAA	2	6	1954771	1954776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206901846
44516	NC_011297	AAAT	3	12	1954782	1954793	75 %	25 %	0 %	0 %	206901846
44517	NC_011297	AGA	2	6	1954904	1954909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206901670
44518	NC_011297	AATA	2	8	1954925	1954932	75 %	25 %	0 %	0 %	206901670
44519	NC_011297	T	6	6	1954942	1954947	0 %	100 %	0 %	0 %	206901670
44520	NC_011297	AAG	2	6	1954958	1954963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206901670
44521	NC_011297	GTA	2	6	1955031	1955036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206901670
44522	NC_011297	TC	3	6	1955069	1955074	0 %	50 %	0 %	50 %	206901670
44523	NC_011297	A	6	6	1955079	1955084	100 %	0 %	0 %	0 %	206901670
44524	NC_011297	AGA	2	6	1955090	1955095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206901670
44525	NC_011297	AGA	2	6	1955108	1955113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206901670
44526	NC_011297	TAA	2	6	1955131	1955136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206901670
44527	NC_011297	AGT	2	6	1955148	1955153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206901670
44528	NC_011297	A	6	6	1955203	1955208	100 %	0 %	0 %	0 %	206901670
44529	NC_011297	AGA	3	9	1955213	1955221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206901670
44530	NC_011297	AGA	2	6	1955285	1955290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206901670
44531	NC_011297	AT	3	6	1955301	1955306	50 %	50 %	0 %	0 %	206901670
44532	NC_011297	GAA	2	6	1955307	1955312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206901670
44533	NC_011297	AGT	2	6	1955318	1955323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206901670
44534	NC_011297	GCA	2	6	1955355	1955360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206901670
44535	NC_011297	GAA	2	6	1955372	1955377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206901670
44536	NC_011297	CAAT	2	8	1955391	1955398	50 %	25 %	0 %	25 %	206901670
44537	NC_011297	TTCT	2	8	1955405	1955412	0 %	75 %	0 %	25 %	206901670
44538	NC_011297	AGG	2	6	1955525	1955530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206901670
44539	NC_011297	AAGA	2	8	1955633	1955640	75 %	0 %	25 %	0 %	206901670
44540	NC_011297	TCC	2	6	1955759	1955764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206901312
44541	NC_011297	ATA	2	6	1955765	1955770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206901312
44542	NC_011297	GCA	2	6	1955778	1955783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206901312
44543	NC_011297	AT	3	6	1955803	1955808	50 %	50 %	0 %	0 %	206901312
44544	NC_011297	ATAAG	2	10	1955876	1955885	60 %	20 %	20 %	0 %	206901312
44545	NC_011297	ATCC	2	8	1955953	1955960	25 %	25 %	0 %	50 %	206901312
44546	NC_011297	TCC	2	6	1956083	1956088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206901312
44547	NC_011297	TC	4	8	1956101	1956108	0 %	50 %	0 %	50 %	206901312
44548	NC_011297	TAA	2	6	1956174	1956179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206901312
44549	NC_011297	CTT	2	6	1956182	1956187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206901312
44550	NC_011297	TCA	3	9	1956240	1956248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206901312
44551	NC_011297	CTT	2	6	1956354	1956359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206901312
44552	NC_011297	CCA	2	6	1956363	1956368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206901312
44553	NC_011297	TA	3	6	1956374	1956379	50 %	50 %	0 %	0 %	206901312
44554	NC_011297	CAT	2	6	1956469	1956474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206901312
44555	NC_011297	T	6	6	1956533	1956538	0 %	100 %	0 %	0 %	206901312
44556	NC_011297	CTC	2	6	1956584	1956589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206901312
44557	NC_011297	A	7	7	1956632	1956638	100 %	0 %	0 %	0 %	206901312
44558	NC_011297	ATA	2	6	1956642	1956647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206901312
44559	NC_011297	TTA	2	6	1956684	1956689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206901255
44560	NC_011297	CT	3	6	1956775	1956780	0 %	50 %	0 %	50 %	206901255
44561	NC_011297	CAA	2	6	1956841	1956846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206901255
44562	NC_011297	ACT	2	6	1956918	1956923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206901255
44563	NC_011297	TCT	2	6	1956997	1957002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206901255
44564	NC_011297	TAAC	2	8	1957054	1957061	50 %	25 %	0 %	25 %	206901255
44565	NC_011297	CTACAT	2	12	1957111	1957122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206901255
44566	NC_011297	TCT	2	6	1957200	1957205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206901255
44567	NC_011297	TC	3	6	1957250	1957255	0 %	50 %	0 %	50 %	206901255
44568	NC_011297	CCT	2	6	1957384	1957389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206900193
44569	NC_011297	ATA	2	6	1957485	1957490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206900193
44570	NC_011297	TAC	2	6	1957559	1957564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206900193
44571	NC_011297	TAA	2	6	1957600	1957605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206900193
44572	NC_011297	AAC	2	6	1957622	1957627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206900193
44573	NC_011297	TC	3	6	1957715	1957720	0 %	50 %	0 %	50 %	206900193
44574	NC_011297	CAG	2	6	1957729	1957734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206900193
44575	NC_011297	TCC	3	9	1957775	1957783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206900193
44576	NC_011297	TTA	2	6	1957956	1957961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206900193
44577	NC_011297	CAATTA	2	12	1957990	1958001	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	206900193
44578	NC_011297	AGT	2	6	1958009	1958014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206900193
44579	NC_011297	GT	3	6	1958031	1958036	0 %	50 %	50 %	0 %	206900193
44580	NC_011297	AAAG	2	8	1958037	1958044	75 %	0 %	25 %	0 %	206900193
44581	NC_011297	TCC	2	6	1958102	1958107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206900193
44582	NC_011297	TAA	2	6	1958113	1958118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206900193
44583	NC_011297	AGA	2	6	1958250	1958255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206900193
44584	NC_011297	TAA	2	6	1958266	1958271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206900193
44585	NC_011297	A	6	6	1958276	1958281	100 %	0 %	0 %	0 %	206900193
44586	NC_011297	CAAAAA	2	12	1958305	1958316	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	206900193
44587	NC_011297	A	6	6	1958337	1958342	100 %	0 %	0 %	0 %	206900193
44588	NC_011297	TTC	2	6	1958410	1958415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206900193
44589	NC_011297	CAT	2	6	1958429	1958434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206900193
44590	NC_011297	CCA	2	6	1958463	1958468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206900193
44591	NC_011297	AAG	3	9	1958477	1958485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206900193
44592	NC_011297	CAA	2	6	1958533	1958538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206900193
44593	NC_011297	TAA	2	6	1958627	1958632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206900193
44594	NC_011297	AGTA	2	8	1958642	1958649	50 %	25 %	25 %	0 %	206900193
44595	NC_011297	GAA	2	6	1958672	1958677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206900193
44596	NC_011297	CTT	2	6	1958699	1958704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206900193
44597	NC_011297	ATTC	2	8	1958713	1958720	25 %	50 %	0 %	25 %	206900193
44598	NC_011297	TA	4	8	1958879	1958886	50 %	50 %	0 %	0 %	206900949
44599	NC_011297	ATT	2	6	1958924	1958929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206900949
44600	NC_011297	ACA	2	6	1958955	1958960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206900949
44601	NC_011297	TA	3	6	1958967	1958972	50 %	50 %	0 %	0 %	206900949
44602	NC_011297	TC	3	6	1958977	1958982	0 %	50 %	0 %	50 %	206900949
44603	NC_011297	ATA	2	6	1959037	1959042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206900949
44604	NC_011297	TAA	2	6	1959047	1959052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206900949
44605	NC_011297	ATA	2	6	1959100	1959105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206900949
44606	NC_011297	ATA	2	6	1959145	1959150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206900949
44607	NC_011297	A	6	6	1959150	1959155	100 %	0 %	0 %	0 %	206900949
44608	NC_011297	A	7	7	1959188	1959194	100 %	0 %	0 %	0 %	206900949
44609	NC_011297	TACC	2	8	1959220	1959227	25 %	25 %	0 %	50 %	206900949
44610	NC_011297	AGA	2	6	1959332	1959337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206900949
44611	NC_011297	AAT	2	6	1959363	1959368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206900949
44612	NC_011297	AT	3	6	1959373	1959378	50 %	50 %	0 %	0 %	206900949
44613	NC_011297	GA	3	6	1959424	1959429	50 %	0 %	50 %	0 %	206900949
44614	NC_011297	GGA	2	6	1959432	1959437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206900949
44615	NC_011297	AG	3	6	1959447	1959452	50 %	0 %	50 %	0 %	206900949
44616	NC_011297	AGG	2	6	1959464	1959469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206900949
44617	NC_011297	TACT	2	8	1959498	1959505	25 %	50 %	0 %	25 %	206900949
44618	NC_011297	TAAAAA	2	12	1959601	1959612	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	206900949
44619	NC_011297	GAA	2	6	1959648	1959653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206900949
44620	NC_011297	AT	4	8	1959663	1959670	50 %	50 %	0 %	0 %	206900949
44621	NC_011297	AAT	2	6	1959753	1959758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206900949
44622	NC_011297	ATA	2	6	1959786	1959791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206900949
44623	NC_011297	ACT	2	6	1959792	1959797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206900949
44624	NC_011297	T	6	6	1959844	1959849	0 %	100 %	0 %	0 %	206900949
44625	NC_011297	TCAA	2	8	1959885	1959892	50 %	25 %	0 %	25 %	206900949
44626	NC_011297	TA	3	6	1959932	1959937	50 %	50 %	0 %	0 %	206900949

< Previous12...78798081828384858687888990Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.