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All Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI01

Total Repeats: 3329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009955	GGTCA	2	10	77	86	20 %	20 %	40 %	20 %	159046136
2	NC_009955	GCG	2	6	183	188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046136
3	NC_009955	TTCGC	2	10	374	383	0 %	40 %	20 %	40 %	159046136
4	NC_009955	GTC	2	6	467	472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046136
5	NC_009955	CG	3	6	487	492	0 %	0 %	50 %	50 %	159046136
6	NC_009955	ATG	2	6	522	527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046136
7	NC_009955	GTG	2	6	536	541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046136
8	NC_009955	GC	3	6	552	557	0 %	0 %	50 %	50 %	159046136
9	NC_009955	CCAG	2	8	595	602	25 %	0 %	25 %	50 %	159046136
10	NC_009955	CGC	2	6	608	613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046136
11	NC_009955	ACA	2	6	673	678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046136
12	NC_009955	AGA	2	6	748	753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046136
13	NC_009955	GAAC	2	8	787	794	50 %	0 %	25 %	25 %	159046136
14	NC_009955	ATC	2	6	816	821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046136
15	NC_009955	AGT	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046136
16	NC_009955	ACGAG	2	10	1036	1045	40 %	0 %	40 %	20 %	159046137
17	NC_009955	CGT	2	6	1147	1152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046137
18	NC_009955	CGT	2	6	1179	1184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046137
19	NC_009955	CGA	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046137
20	NC_009955	T	6	6	1194	1199	0 %	100 %	0 %	0 %	159046137
21	NC_009955	CGGGGT	2	12	1239	1250	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	159046137
22	NC_009955	GC	3	6	1291	1296	0 %	0 %	50 %	50 %	159046137
23	NC_009955	TGG	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046137
24	NC_009955	AACG	2	8	1323	1330	50 %	0 %	25 %	25 %	159046137
25	NC_009955	AAC	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046137
26	NC_009955	CG	3	6	1411	1416	0 %	0 %	50 %	50 %	159046137
27	NC_009955	GAAC	2	8	1466	1473	50 %	0 %	25 %	25 %	159046137
28	NC_009955	GC	3	6	1511	1516	0 %	0 %	50 %	50 %	159046137
29	NC_009955	GAG	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046137
30	NC_009955	GCTG	2	8	1742	1749	0 %	25 %	50 %	25 %	159046138
31	NC_009955	CAG	2	6	1762	1767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046138
32	NC_009955	AC	3	6	1770	1775	50 %	0 %	0 %	50 %	159046138
33	NC_009955	ACG	2	6	1822	1827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046138
34	NC_009955	GGT	2	6	1848	1853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046138
35	NC_009955	CCGC	2	8	1891	1898	0 %	0 %	25 %	75 %	159046138
36	NC_009955	GGA	2	6	1919	1924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046138
37	NC_009955	GGAT	2	8	1966	1973	25 %	25 %	50 %	0 %	159046138
38	NC_009955	CTCA	2	8	1986	1993	25 %	25 %	0 %	50 %	159046138
39	NC_009955	TCG	2	6	2119	2124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046138
40	NC_009955	GTT	2	6	2160	2165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046138
41	NC_009955	TTC	2	6	2169	2174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046138
42	NC_009955	ACG	2	6	2203	2208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046138
43	NC_009955	CGA	2	6	2498	2503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046138
44	NC_009955	GCCC	2	8	2603	2610	0 %	0 %	25 %	75 %	159046138
45	NC_009955	GCCT	2	8	2710	2717	0 %	25 %	25 %	50 %	159046138
46	NC_009955	CCG	2	6	2734	2739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046138
47	NC_009955	GAC	2	6	2747	2752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046138
48	NC_009955	CG	3	6	2753	2758	0 %	0 %	50 %	50 %	159046138
49	NC_009955	CCA	2	6	2810	2815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046138
50	NC_009955	GCG	2	6	2832	2837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046138
51	NC_009955	TCG	2	6	2899	2904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046138
52	NC_009955	TGC	2	6	2929	2934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046138
53	NC_009955	CCA	2	6	2951	2956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046138
54	NC_009955	TC	3	6	3125	3130	0 %	50 %	0 %	50 %	159046139
55	NC_009955	GCG	2	6	3140	3145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046139
56	NC_009955	GCC	2	6	3155	3160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046139
57	NC_009955	TGG	2	6	3368	3373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046139
58	NC_009955	CTT	2	6	3384	3389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046139
59	NC_009955	TGC	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046139
60	NC_009955	CTTG	2	8	3545	3552	0 %	50 %	25 %	25 %	159046139
61	NC_009955	TGGT	2	8	3557	3564	0 %	50 %	50 %	0 %	159046139
62	NC_009955	GAC	2	6	3672	3677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046140
63	NC_009955	AGC	2	6	3763	3768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046140
64	NC_009955	CGCC	2	8	3786	3793	0 %	0 %	25 %	75 %	159046140
65	NC_009955	CAA	2	6	3807	3812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046140
66	NC_009955	GCT	2	6	3838	3843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046140
67	NC_009955	CG	3	6	3904	3909	0 %	0 %	50 %	50 %	159046140
68	NC_009955	CCG	2	6	4003	4008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046140
69	NC_009955	CAA	2	6	4105	4110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046140
70	NC_009955	GCA	2	6	4119	4124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046140
71	NC_009955	TCG	2	6	4140	4145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046140
72	NC_009955	GCA	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046140
73	NC_009955	GGC	2	6	4199	4204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046140
74	NC_009955	TGCG	2	8	4220	4227	0 %	25 %	50 %	25 %	159046140
75	NC_009955	GTC	2	6	4455	4460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046141
76	NC_009955	A	6	6	4533	4538	100 %	0 %	0 %	0 %	159046141
77	NC_009955	GAC	2	6	4686	4691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046141
78	NC_009955	GCT	2	6	4842	4847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046141
79	NC_009955	TGT	2	6	4868	4873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046141
80	NC_009955	TGA	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046141
81	NC_009955	ATG	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
82	NC_009955	GGT	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046142
83	NC_009955	ATG	2	6	5503	5508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
84	NC_009955	ATG	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
85	NC_009955	ATG	2	6	5533	5538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
86	NC_009955	ATG	2	6	5557	5562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
87	NC_009955	ATG	2	6	5572	5577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
88	NC_009955	ATG	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
89	NC_009955	TGGC	2	8	5615	5622	0 %	25 %	50 %	25 %	159046142
90	NC_009955	ATG	2	6	5626	5631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
91	NC_009955	ACG	2	6	5662	5667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046142
92	NC_009955	GAA	2	6	5671	5676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046142
93	NC_009955	GAT	2	6	5769	5774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
94	NC_009955	ATG	2	6	5782	5787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
95	NC_009955	GAT	2	6	5880	5885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
96	NC_009955	ATG	2	6	5950	5955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046142
97	NC_009955	CTGA	2	8	6204	6211	25 %	25 %	25 %	25 %	159046143
98	NC_009955	CGA	2	6	6226	6231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046143
99	NC_009955	GCC	2	6	6257	6262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046143
100	NC_009955	ATCGAG	2	12	6309	6320	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159046143
101	NC_009955	TGC	2	6	6601	6606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046144
102	NC_009955	G	7	7	6660	6666	0 %	0 %	100 %	0 %	159046144
103	NC_009955	TGGC	2	8	6719	6726	0 %	25 %	50 %	25 %	159046144
104	NC_009955	CCG	2	6	6777	6782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046144
105	NC_009955	TCT	2	6	6806	6811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046144
106	NC_009955	ATC	3	9	6819	6827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046144
107	NC_009955	TGG	2	6	6839	6844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046144
108	NC_009955	GGC	2	6	6921	6926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046144
109	NC_009955	G	6	6	6939	6944	0 %	0 %	100 %	0 %	159046144
110	NC_009955	ACC	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046144
111	NC_009955	CAA	2	6	7073	7078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046144
112	NC_009955	GCTG	2	8	7255	7262	0 %	25 %	50 %	25 %	159046144
113	NC_009955	TGGC	2	8	7279	7286	0 %	25 %	50 %	25 %	159046144
114	NC_009955	TCG	2	6	7321	7326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046144
115	NC_009955	CAA	2	6	7347	7352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046144
116	NC_009955	CGG	2	6	7360	7365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046144
117	NC_009955	CGG	2	6	7473	7478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046144
118	NC_009955	CAG	2	6	7627	7632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046145
119	NC_009955	CTT	2	6	7633	7638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046145
120	NC_009955	ATC	2	6	7753	7758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046145
121	NC_009955	GCCG	2	8	7781	7788	0 %	0 %	50 %	50 %	159046145
122	NC_009955	ATG	2	6	7819	7824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046145
123	NC_009955	TGG	2	6	7951	7956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046145
124	NC_009955	CGG	2	6	7965	7970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046145
125	NC_009955	TCG	2	6	8026	8031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046145
126	NC_009955	T	7	7	8051	8057	0 %	100 %	0 %	0 %	159046145
127	NC_009955	CAC	2	6	8066	8071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046145
128	NC_009955	GGAT	2	8	8139	8146	25 %	25 %	50 %	0 %	159046145
129	NC_009955	GCC	2	6	8202	8207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046145
130	NC_009955	CGT	2	6	8219	8224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046145
131	NC_009955	GGC	3	9	8297	8305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046145
132	NC_009955	TGC	2	6	8323	8328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046145
133	NC_009955	CG	3	6	8379	8384	0 %	0 %	50 %	50 %	159046145
134	NC_009955	GGC	2	6	8396	8401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046145
135	NC_009955	CG	3	6	8408	8413	0 %	0 %	50 %	50 %	159046145
136	NC_009955	GAC	2	6	8424	8429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046145
137	NC_009955	GAG	2	6	8436	8441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046145
138	NC_009955	GGA	2	6	8453	8458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046145
139	NC_009955	CGA	2	6	8543	8548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046145
140	NC_009955	CGA	2	6	8611	8616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046145
141	NC_009955	CG	3	6	8713	8718	0 %	0 %	50 %	50 %	159046145
142	NC_009955	GTCCT	2	10	8784	8793	0 %	40 %	20 %	40 %	159046145
143	NC_009955	CGG	2	6	8848	8853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046145
144	NC_009955	ATC	2	6	8865	8870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046145
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146	NC_009955	TCG	2	6	9001	9006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046145
147	NC_009955	ACG	2	6	9070	9075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046145
148	NC_009955	CGC	2	6	9095	9100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046145
149	NC_009955	GGA	2	6	9155	9160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046145
150	NC_009955	GAT	2	6	9263	9268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046145
151	NC_009955	GGCG	2	8	9287	9294	0 %	0 %	75 %	25 %	159046145
152	NC_009955	CGC	2	6	9318	9323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046145
153	NC_009955	TCA	2	6	9451	9456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046145
154	NC_009955	AACG	2	8	9471	9478	50 %	0 %	25 %	25 %	159046145
155	NC_009955	TGC	2	6	9532	9537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046145
156	NC_009955	GGA	2	6	9539	9544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046145
157	NC_009955	ATC	2	6	9555	9560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046145
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159	NC_009955	CGTG	2	8	9725	9732	0 %	25 %	50 %	25 %	159046145
160	NC_009955	CGG	2	6	9735	9740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046145
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163	NC_009955	CTT	2	6	9839	9844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046145
164	NC_009955	TCA	2	6	9853	9858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046145
165	NC_009955	TGC	2	6	9869	9874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046145
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167	NC_009955	GGT	2	6	9902	9907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046145
168	NC_009955	TGA	2	6	10066	10071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046146
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185	NC_009955	TCG	2	6	11105	11110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046146
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189	NC_009955	GAT	2	6	11237	11242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046146
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192	NC_009955	GATGC	2	10	11354	11363	20 %	20 %	40 %	20 %	159046147
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243	NC_009955	GCG	2	6	14747	14752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046151
244	NC_009955	TGCCTA	2	12	14783	14794	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159046151
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246	NC_009955	TGG	3	9	14903	14911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046151
247	NC_009955	T	6	6	14941	14946	0 %	100 %	0 %	0 %	159046151
248	NC_009955	CTT	3	9	14964	14972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046151
249	NC_009955	TCGCTT	2	12	14974	14985	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	159046151
250	NC_009955	GGGC	2	8	15007	15014	0 %	0 %	75 %	25 %	159046151
251	NC_009955	CTC	2	6	15034	15039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046151
252	NC_009955	GCC	2	6	15048	15053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046151
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254	NC_009955	CGGCCG	2	12	15098	15109	0 %	0 %	50 %	50 %	159046151
255	NC_009955	GCG	3	9	15137	15145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046151
256	NC_009955	GC	3	6	15218	15223	0 %	0 %	50 %	50 %	159046151
257	NC_009955	CGA	2	6	15243	15248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046151
258	NC_009955	CGA	2	6	15296	15301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046151
259	NC_009955	GCC	2	6	15304	15309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046151
260	NC_009955	TGG	2	6	15341	15346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046151
261	NC_009955	ATGCCC	2	12	15350	15361	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	159046151
262	NC_009955	CG	3	6	15364	15369	0 %	0 %	50 %	50 %	159046151
263	NC_009955	GTGG	2	8	15381	15388	0 %	25 %	75 %	0 %	159046151
264	NC_009955	CG	3	6	15396	15401	0 %	0 %	50 %	50 %	159046151
265	NC_009955	AC	3	6	15407	15412	50 %	0 %	0 %	50 %	159046151
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281	NC_009955	AACG	2	8	16120	16127	50 %	0 %	25 %	25 %	159046151
282	NC_009955	CG	5	10	16131	16140	0 %	0 %	50 %	50 %	159046151
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374	NC_009955	CCCG	2	8	20119	20126	0 %	0 %	25 %	75 %	159046157
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380	NC_009955	GCC	2	6	20330	20335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046157
381	NC_009955	GAT	2	6	20383	20388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046157
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383	NC_009955	CGC	2	6	20422	20427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046157
384	NC_009955	AGC	2	6	20435	20440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046157
385	NC_009955	CG	3	6	20445	20450	0 %	0 %	50 %	50 %	159046157
386	NC_009955	CGGGA	2	10	20456	20465	20 %	0 %	60 %	20 %	159046157
387	NC_009955	CGG	2	6	20511	20516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046157
388	NC_009955	TCAG	2	8	20585	20592	25 %	25 %	25 %	25 %	159046158
389	NC_009955	GTC	2	6	20663	20668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046158
390	NC_009955	TCC	2	6	20736	20741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046158
391	NC_009955	GCC	2	6	20760	20765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046158
392	NC_009955	TCC	2	6	20864	20869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046158
393	NC_009955	CAGCCG	2	12	20934	20945	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	159046158
394	NC_009955	GTC	2	6	21063	21068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046159
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500	NC_009955	CTG	2	6	26847	26852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046167

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