MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI01

Total Repeats: 3329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009955	GCTTC	2	10	115272	115281	0 %	40 %	20 %	40 %	159046249
2002	NC_009955	ACG	2	6	115313	115318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046249
2003	NC_009955	CAG	2	6	115342	115347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046249
2004	NC_009955	CGG	2	6	115426	115431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046249
2005	NC_009955	GCCC	2	8	115449	115456	0 %	0 %	25 %	75 %	159046249
2006	NC_009955	CGG	3	9	115467	115475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046249
2007	NC_009955	ATG	2	6	115559	115564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046249
2008	NC_009955	CGC	2	6	115608	115613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046249
2009	NC_009955	GCC	2	6	115663	115668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046249
2010	NC_009955	TCA	2	6	115674	115679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046249
2011	NC_009955	CCA	2	6	115686	115691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046249
2012	NC_009955	CAG	2	6	115711	115716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046249
2013	NC_009955	TTG	2	6	115744	115749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046249
2014	NC_009955	CGT	2	6	115770	115775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046249
2015	NC_009955	ATC	2	6	115796	115801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046249
2016	NC_009955	CAG	3	9	115843	115851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046249
2017	NC_009955	GCC	2	6	115914	115919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046250
2018	NC_009955	GTT	2	6	115938	115943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046250
2019	NC_009955	AGCCAG	2	12	115987	115998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046250
2020	NC_009955	GTG	2	6	116017	116022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046250
2021	NC_009955	GC	4	8	116179	116186	0 %	0 %	50 %	50 %	159046250
2022	NC_009955	GCA	2	6	116198	116203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046250
2023	NC_009955	TGG	2	6	116239	116244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046250
2024	NC_009955	GCC	2	6	116248	116253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046250
2025	NC_009955	CGC	2	6	116292	116297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046250
2026	NC_009955	CGT	2	6	116361	116366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046250
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2028	NC_009955	GC	3	6	116522	116527	0 %	0 %	50 %	50 %	159046251
2029	NC_009955	CTT	2	6	116562	116567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046251
2030	NC_009955	CGTGA	2	10	116573	116582	20 %	20 %	40 %	20 %	159046251
2031	NC_009955	TTCGG	2	10	116651	116660	0 %	40 %	40 %	20 %	159046251
2032	NC_009955	CGCA	2	8	116695	116702	25 %	0 %	25 %	50 %	159046251
2033	NC_009955	TGGT	2	8	116789	116796	0 %	50 %	50 %	0 %	159046251
2034	NC_009955	CAG	2	6	116797	116802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046251
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2038	NC_009955	CAG	2	6	116932	116937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046251
2039	NC_009955	CAT	2	6	117025	117030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046251
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2044	NC_009955	CTG	2	6	117247	117252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046251
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2047	NC_009955	GCT	2	6	117455	117460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046251
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2050	NC_009955	CGA	2	6	117613	117618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046252
2051	NC_009955	CGA	2	6	117700	117705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046252
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2059	NC_009955	TCG	2	6	118092	118097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046252
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2120	NC_009955	GC	3	6	121192	121197	0 %	0 %	50 %	50 %	159046256
2121	NC_009955	TGC	3	9	121198	121206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046256
2122	NC_009955	ACC	2	6	121230	121235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046256
2123	NC_009955	GAT	2	6	121251	121256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046256
2124	NC_009955	CTGT	2	8	121292	121299	0 %	50 %	25 %	25 %	159046256
2125	NC_009955	CGA	2	6	121331	121336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046256
2126	NC_009955	GCC	2	6	121459	121464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046256
2127	NC_009955	TG	3	6	121536	121541	0 %	50 %	50 %	0 %	159046256
2128	NC_009955	TCG	2	6	121573	121578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046256
2129	NC_009955	GCG	2	6	121579	121584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046256
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2131	NC_009955	CGG	2	6	121685	121690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046256
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2133	NC_009955	TCG	3	9	121798	121806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046256
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2141	NC_009955	GCC	2	6	122264	122269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046257
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2152	NC_009955	GGTC	2	8	122746	122753	0 %	25 %	50 %	25 %	159046257
2153	NC_009955	CGATGT	2	12	122785	122796	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	159046257
2154	NC_009955	CGC	2	6	122845	122850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046257
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2227	NC_009955	CGGT	2	8	126755	126762	0 %	25 %	50 %	25 %	159046259
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2232	NC_009955	CCGCA	2	10	127139	127148	20 %	0 %	20 %	60 %	159046259
2233	NC_009955	CTG	2	6	127162	127167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046259
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2237	NC_009955	CGGA	2	8	127397	127404	25 %	0 %	50 %	25 %	159046259
2238	NC_009955	GGC	2	6	127408	127413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046259
2239	NC_009955	GCC	2	6	127438	127443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046259
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2241	NC_009955	GCT	2	6	127476	127481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046259
2242	NC_009955	TGC	2	6	127488	127493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046259
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2345	NC_009955	ACC	2	6	132365	132370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046264
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2350	NC_009955	GCC	2	6	132675	132680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046265
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2354	NC_009955	ATC	2	6	132852	132857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046265
2355	NC_009955	CGAC	2	8	132901	132908	25 %	0 %	25 %	50 %	159046265
2356	NC_009955	GCC	2	6	132960	132965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046265
2357	NC_009955	TCG	2	6	132985	132990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046265
2358	NC_009955	GC	3	6	133019	133024	0 %	0 %	50 %	50 %	159046265
2359	NC_009955	GGC	2	6	133046	133051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046265
2360	NC_009955	TGGCG	2	10	133100	133109	0 %	20 %	60 %	20 %	159046265
2361	NC_009955	GGCG	2	8	133121	133128	0 %	0 %	75 %	25 %	159046265
2362	NC_009955	TGC	2	6	133129	133134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046265
2363	NC_009955	TCG	2	6	133204	133209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046265
2364	NC_009955	TGGTGC	2	12	133327	133338	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	159046265
2365	NC_009955	CCGC	2	8	133346	133353	0 %	0 %	25 %	75 %	159046265
2366	NC_009955	GGA	2	6	133366	133371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046265
2367	NC_009955	CATG	2	8	133377	133384	25 %	25 %	25 %	25 %	159046265
2368	NC_009955	TCT	2	6	133418	133423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046266
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2370	NC_009955	TCG	2	6	133442	133447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046266
2371	NC_009955	CGT	2	6	133455	133460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046266
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2373	NC_009955	CGG	2	6	133521	133526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046266
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2379	NC_009955	TCG	2	6	133694	133699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046266
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2403	NC_009955	CGA	2	6	134783	134788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046267
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2469	NC_009955	CGA	2	6	139117	139122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046273
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2471	NC_009955	CGA	2	6	139136	139141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046273
2472	NC_009955	CCT	2	6	139156	139161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046273
2473	NC_009955	CTT	2	6	139205	139210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046273
2474	NC_009955	CGC	2	6	139226	139231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046273
2475	NC_009955	GATCTC	2	12	139265	139276	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159046273
2476	NC_009955	GCAT	2	8	139281	139288	25 %	25 %	25 %	25 %	159046273
2477	NC_009955	CG	3	6	139311	139316	0 %	0 %	50 %	50 %	159046273
2478	NC_009955	GTG	2	6	139329	139334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046273
2479	NC_009955	CGA	2	6	139351	139356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046273
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2481	NC_009955	CGC	2	6	139391	139396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046273
2482	NC_009955	CGG	2	6	139405	139410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046273
2483	NC_009955	GC	3	6	139411	139416	0 %	0 %	50 %	50 %	159046273
2484	NC_009955	CAT	2	6	139447	139452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046273
2485	NC_009955	GCC	3	9	139455	139463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046273
2486	NC_009955	CGAG	2	8	139471	139478	25 %	0 %	50 %	25 %	159046273
2487	NC_009955	TCG	2	6	139482	139487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046273
2488	NC_009955	CAGC	2	8	139672	139679	25 %	0 %	25 %	50 %	159046273
2489	NC_009955	CCT	2	6	139714	139719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046273
2490	NC_009955	GAG	2	6	139737	139742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046273
2491	NC_009955	CG	4	8	139744	139751	0 %	0 %	50 %	50 %	159046273
2492	NC_009955	ACG	2	6	139819	139824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046273
2493	NC_009955	CG	3	6	139839	139844	0 %	0 %	50 %	50 %	159046273
2494	NC_009955	CCT	2	6	139864	139869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046273
2495	NC_009955	CG	3	6	139876	139881	0 %	0 %	50 %	50 %	159046273
2496	NC_009955	CTC	2	6	139940	139945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046273
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2498	NC_009955	GATC	2	8	140020	140027	25 %	25 %	25 %	25 %	159046273
2499	NC_009955	CATCG	2	10	140081	140090	20 %	20 %	20 %	40 %	159046273
2500	NC_009955	CGG	3	9	140125	140133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046273

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