MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 chromosome

Total Repeats: 80154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_009952	CGG	2	6	647201	647206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043199
13002	NC_009952	CGC	2	6	647297	647302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043199
13003	NC_009952	GGT	2	6	647349	647354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159043199
13004	NC_009952	GGC	2	6	647370	647375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043199
13005	NC_009952	GCCT	2	8	647446	647453	0 %	25 %	25 %	50 %	159043199
13006	NC_009952	GCT	3	9	647502	647510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043199
13007	NC_009952	CG	3	6	647833	647838	0 %	0 %	50 %	50 %	159043200
13008	NC_009952	CCCG	2	8	647840	647847	0 %	0 %	25 %	75 %	159043200
13009	NC_009952	CGC	2	6	647856	647861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043200
13010	NC_009952	CGG	2	6	647863	647868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043200
13011	NC_009952	GCC	2	6	647980	647985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043200
13012	NC_009952	CGC	2	6	647986	647991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043200
13013	NC_009952	TTC	2	6	648099	648104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159043200
13014	NC_009952	CGC	2	6	648119	648124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043200
13015	NC_009952	CGA	2	6	648134	648139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043200
13016	NC_009952	GCC	2	6	648144	648149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043200
13017	NC_009952	CGA	2	6	648179	648184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043200
13018	NC_009952	GCCTTC	2	12	648255	648266	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	159043200
13019	NC_009952	AC	3	6	648274	648279	50 %	0 %	0 %	50 %	159043200
13020	NC_009952	CGC	2	6	648319	648324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043200
13021	NC_009952	CGG	2	6	648326	648331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043200
13022	NC_009952	GGA	2	6	648347	648352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159043200
13023	NC_009952	TGA	2	6	648412	648417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159043200
13024	NC_009952	GCTGGT	2	12	648443	648454	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	159043200
13025	NC_009952	ACT	2	6	648460	648465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159043200
13026	NC_009952	GC	3	6	648478	648483	0 %	0 %	50 %	50 %	159043200
13027	NC_009952	CGG	2	6	648488	648493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043200
13028	NC_009952	CGC	2	6	648571	648576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043200
13029	NC_009952	TGG	2	6	648606	648611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159043200
13030	NC_009952	C	7	7	648712	648718	0 %	0 %	0 %	100 %	159043200
13031	NC_009952	GCTG	2	8	648763	648770	0 %	25 %	50 %	25 %	159043200
13032	NC_009952	GTC	2	6	648858	648863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043200
13033	NC_009952	CTG	2	6	648897	648902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043200
13034	NC_009952	CGGAG	2	10	648920	648929	20 %	0 %	60 %	20 %	159043200
13035	NC_009952	GCT	2	6	648965	648970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043200
13036	NC_009952	CTT	2	6	649031	649036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159043200
13037	NC_009952	GCGG	2	8	649056	649063	0 %	0 %	75 %	25 %	159043200
13038	NC_009952	GTG	2	6	649071	649076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159043200
13039	NC_009952	GC	3	6	649123	649128	0 %	0 %	50 %	50 %	159043200
13040	NC_009952	AGC	2	6	649222	649227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043200
13041	NC_009952	CG	3	6	649290	649295	0 %	0 %	50 %	50 %	159043200
13042	NC_009952	CGCC	2	8	649312	649319	0 %	0 %	25 %	75 %	159043200
13043	NC_009952	GAG	2	6	649335	649340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159043200
13044	NC_009952	GCC	2	6	649362	649367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043200
13045	NC_009952	CGG	2	6	649427	649432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043200
13046	NC_009952	GGACGG	2	12	649475	649486	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	159043200
13047	NC_009952	GCG	2	6	649644	649649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043200
13048	NC_009952	TGA	2	6	649684	649689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159043200
13049	NC_009952	GGCG	2	8	649698	649705	0 %	0 %	75 %	25 %	159043200
13050	NC_009952	GAA	2	6	649715	649720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159043200
13051	NC_009952	CGA	2	6	649739	649744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043200
13052	NC_009952	GAG	2	6	649794	649799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159043200
13053	NC_009952	CTG	2	6	649839	649844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043200
13054	NC_009952	CGTG	2	8	649871	649878	0 %	25 %	50 %	25 %	159043200
13055	NC_009952	GGGC	2	8	650015	650022	0 %	0 %	75 %	25 %	159043200
13056	NC_009952	ACC	2	6	650059	650064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159043200
13057	NC_009952	CGGA	2	8	650130	650137	25 %	0 %	50 %	25 %	159043200
13058	NC_009952	GGGC	2	8	650173	650180	0 %	0 %	75 %	25 %	159043200
13059	NC_009952	CTGGC	2	10	650208	650217	0 %	20 %	40 %	40 %	159043200
13060	NC_009952	GGT	2	6	650234	650239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159043200
13061	NC_009952	CGGGG	2	10	650279	650288	0 %	0 %	80 %	20 %	159043200
13062	NC_009952	GGC	2	6	650425	650430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043200
13063	NC_009952	GC	3	6	650675	650680	0 %	0 %	50 %	50 %	159043201
13064	NC_009952	CGT	2	6	650704	650709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043201
13065	NC_009952	CGC	2	6	650725	650730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043201
13066	NC_009952	GGT	2	6	650804	650809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159043201
13067	NC_009952	GAT	2	6	650840	650845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159043201
13068	NC_009952	CG	3	6	650867	650872	0 %	0 %	50 %	50 %	159043201
13069	NC_009952	GCC	2	6	650933	650938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043201
13070	NC_009952	CGCC	2	8	650965	650972	0 %	0 %	25 %	75 %	159043201
13071	NC_009952	CGG	2	6	651112	651117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043201
13072	NC_009952	GGC	2	6	651145	651150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043201
13073	NC_009952	CG	3	6	651176	651181	0 %	0 %	50 %	50 %	159043201
13074	NC_009952	TGGCGG	2	12	651467	651478	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	159043202
13075	NC_009952	CGC	2	6	651497	651502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043202
13076	NC_009952	ATG	2	6	651622	651627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159043202
13077	NC_009952	GTC	2	6	651646	651651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043203
13078	NC_009952	GGC	2	6	651697	651702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043203
13079	NC_009952	CCTTG	2	10	651742	651751	0 %	40 %	20 %	40 %	159043203
13080	NC_009952	GGC	2	6	651757	651762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043203
13081	NC_009952	CGG	2	6	651768	651773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043203
13082	NC_009952	GGT	2	6	651783	651788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159043203
13083	NC_009952	TGG	2	6	651840	651845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159043203
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13085	NC_009952	GGCG	2	8	651903	651910	0 %	0 %	75 %	25 %	159043203
13086	NC_009952	GGCG	2	8	651915	651922	0 %	0 %	75 %	25 %	159043203
13087	NC_009952	CG	3	6	651930	651935	0 %	0 %	50 %	50 %	159043203
13088	NC_009952	TCGG	2	8	651944	651951	0 %	25 %	50 %	25 %	159043203
13089	NC_009952	CCGG	2	8	651964	651971	0 %	0 %	50 %	50 %	159043203
13090	NC_009952	GGC	2	6	651979	651984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043203
13091	NC_009952	GCAG	2	8	651990	651997	25 %	0 %	50 %	25 %	159043203
13092	NC_009952	TCG	2	6	652055	652060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043203
13093	NC_009952	CCG	2	6	652063	652068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043203
13094	NC_009952	CGG	2	6	652119	652124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043203
13095	NC_009952	GC	3	6	652127	652132	0 %	0 %	50 %	50 %	159043203
13096	NC_009952	CCG	3	9	652136	652144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043203
13097	NC_009952	CG	3	6	652143	652148	0 %	0 %	50 %	50 %	159043203
13098	NC_009952	CG	4	8	652170	652177	0 %	0 %	50 %	50 %	159043203
13099	NC_009952	GCC	2	6	652195	652200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043203
13100	NC_009952	GCCGC	2	10	652205	652214	0 %	0 %	40 %	60 %	159043203
13101	NC_009952	GAT	2	6	652303	652308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159043203
13102	NC_009952	CGG	2	6	652317	652322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043203
13103	NC_009952	CAT	2	6	652324	652329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159043203
13104	NC_009952	CCT	2	6	652350	652355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159043203
13105	NC_009952	AGC	2	6	652367	652372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043203
13106	NC_009952	GC	3	6	652394	652399	0 %	0 %	50 %	50 %	159043203
13107	NC_009952	CCG	4	12	652410	652421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043203
13108	NC_009952	CGG	2	6	652464	652469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043203
13109	NC_009952	GCA	2	6	652524	652529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043203
13110	NC_009952	CGC	2	6	652585	652590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043203
13111	NC_009952	CGC	2	6	652593	652598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043203
13112	NC_009952	GC	3	6	652655	652660	0 %	0 %	50 %	50 %	159043203
13113	NC_009952	CGG	2	6	652668	652673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043203
13114	NC_009952	CAG	2	6	652708	652713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043203
13115	NC_009952	CGG	2	6	652740	652745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043203
13116	NC_009952	GC	3	6	652784	652789	0 %	0 %	50 %	50 %	159043203
13117	NC_009952	GCG	2	6	652804	652809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043203
13118	NC_009952	ATC	2	6	652820	652825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159043203
13119	NC_009952	GGT	2	6	652900	652905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159043203
13120	NC_009952	G	6	6	652930	652935	0 %	0 %	100 %	0 %	159043203
13121	NC_009952	AGC	2	6	652952	652957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043203
13122	NC_009952	TCG	2	6	652991	652996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043203
13123	NC_009952	ATG	2	6	652997	653002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159043203
13124	NC_009952	GC	3	6	653014	653019	0 %	0 %	50 %	50 %	159043203
13125	NC_009952	GTC	2	6	653065	653070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043203
13126	NC_009952	CTGG	2	8	653080	653087	0 %	25 %	50 %	25 %	159043203
13127	NC_009952	GCCC	2	8	653172	653179	0 %	0 %	25 %	75 %	159043203
13128	NC_009952	GAT	2	6	653215	653220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159043203
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13130	NC_009952	TCA	2	6	653259	653264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159043203
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13132	NC_009952	GC	3	6	653781	653786	0 %	0 %	50 %	50 %	159043204
13133	NC_009952	CGG	2	6	653837	653842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043204
13134	NC_009952	GGCG	2	8	653861	653868	0 %	0 %	75 %	25 %	159043204
13135	NC_009952	GGC	2	6	653928	653933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043204
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13141	NC_009952	TCA	2	6	654290	654295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159043204
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13147	NC_009952	TGA	2	6	654497	654502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159043204
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13152	NC_009952	GGT	2	6	654734	654739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159043205
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13242	NC_009952	ATG	2	6	659207	659212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159043209
13243	NC_009952	GA	3	6	659238	659243	50 %	0 %	50 %	0 %	159043209
13244	NC_009952	GTG	2	6	659264	659269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159043209
13245	NC_009952	ATC	2	6	659411	659416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159043209
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13353	NC_009952	GCG	2	6	664595	664600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043213
13354	NC_009952	CTG	2	6	664617	664622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043213
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13358	NC_009952	ACC	2	6	664737	664742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159043213
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13360	NC_009952	CGA	2	6	664778	664783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043213
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13479	NC_009952	CAA	2	6	670381	670386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159043218
13480	NC_009952	CGC	3	9	670435	670443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043218
13481	NC_009952	CCG	2	6	670494	670499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043218
13482	NC_009952	CG	3	6	670515	670520	0 %	0 %	50 %	50 %	159043218
13483	NC_009952	CG	3	6	670536	670541	0 %	0 %	50 %	50 %	159043218
13484	NC_009952	ACC	2	6	670560	670565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159043218
13485	NC_009952	GGA	2	6	670588	670593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159043218
13486	NC_009952	GC	3	6	670609	670614	0 %	0 %	50 %	50 %	159043218
13487	NC_009952	ATC	2	6	670723	670728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159043219
13488	NC_009952	GCCA	2	8	670801	670808	25 %	0 %	25 %	50 %	159043219
13489	NC_009952	ACC	2	6	670852	670857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159043219
13490	NC_009952	CGA	2	6	670869	670874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043219
13491	NC_009952	TGC	2	6	670880	670885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043219
13492	NC_009952	GC	3	6	670920	670925	0 %	0 %	50 %	50 %	159043219
13493	NC_009952	CGA	2	6	670968	670973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043219
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13495	NC_009952	GC	3	6	671133	671138	0 %	0 %	50 %	50 %	159043220
13496	NC_009952	GCCGC	2	10	671183	671192	0 %	0 %	40 %	60 %	159043220
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13498	NC_009952	CTG	2	6	671288	671293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043220
13499	NC_009952	CTG	2	6	671477	671482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043220
13500	NC_009952	ATG	2	6	671510	671515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159043220

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