MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 chromosome

Total Repeats: 80154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009952	TGC	2	6	484238	484243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043054
10002	NC_009952	GC	4	8	484247	484254	0 %	0 %	50 %	50 %	159043054
10003	NC_009952	GCT	2	6	484265	484270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043054
10004	NC_009952	GATGCC	2	12	484320	484331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	159043054
10005	NC_009952	GCT	2	6	484370	484375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043054
10006	NC_009952	TCGA	2	8	484386	484393	25 %	25 %	25 %	25 %	159043054
10007	NC_009952	GC	3	6	484511	484516	0 %	0 %	50 %	50 %	159043054
10008	NC_009952	GC	3	6	484541	484546	0 %	0 %	50 %	50 %	159043054
10009	NC_009952	CGA	2	6	484577	484582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043054
10010	NC_009952	ATG	2	6	484635	484640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159043054
10011	NC_009952	GC	4	8	484749	484756	0 %	0 %	50 %	50 %	159043054
10012	NC_009952	CTG	2	6	484794	484799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043054
10013	NC_009952	CGG	2	6	484831	484836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043054
10014	NC_009952	AGGC	2	8	484873	484880	25 %	0 %	50 %	25 %	159043054
10015	NC_009952	TCG	2	6	484930	484935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043054
10016	NC_009952	TGC	2	6	484972	484977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043054
10017	NC_009952	TCT	2	6	485003	485008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159043054
10018	NC_009952	GCA	2	6	485023	485028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043054
10019	NC_009952	CGA	2	6	485078	485083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043054
10020	NC_009952	GTG	2	6	485147	485152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159043055
10021	NC_009952	CCG	2	6	485165	485170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043055
10022	NC_009952	CAA	2	6	485173	485178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159043055
10023	NC_009952	GTG	2	6	485192	485197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159043055
10024	NC_009952	GCCC	2	8	485224	485231	0 %	0 %	25 %	75 %	159043055
10025	NC_009952	GC	3	6	485269	485274	0 %	0 %	50 %	50 %	159043055
10026	NC_009952	GC	3	6	485341	485346	0 %	0 %	50 %	50 %	159043055
10027	NC_009952	GGCGA	2	10	485417	485426	20 %	0 %	60 %	20 %	159043055
10028	NC_009952	GTC	2	6	485447	485452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043055
10029	NC_009952	GGT	2	6	485476	485481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159043055
10030	NC_009952	CAT	2	6	485510	485515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159043055
10031	NC_009952	GAG	2	6	485522	485527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159043055
10032	NC_009952	CAAGCG	2	12	485533	485544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043055
10033	NC_009952	CG	4	8	485571	485578	0 %	0 %	50 %	50 %	159043055
10034	NC_009952	GCC	2	6	485635	485640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043055
10035	NC_009952	CAG	2	6	485747	485752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043056
10036	NC_009952	GAG	2	6	485776	485781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159043056
10037	NC_009952	GAA	2	6	485877	485882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159043056
10038	NC_009952	CGG	2	6	485915	485920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043056
10039	NC_009952	CGG	2	6	485973	485978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043056
10040	NC_009952	GGC	3	9	485986	485994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043056
10041	NC_009952	CGA	2	6	486054	486059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043056
10042	NC_009952	GGA	2	6	486063	486068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159043056
10043	NC_009952	GAG	2	6	486094	486099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159043056
10044	NC_009952	TGCGG	2	10	486144	486153	0 %	20 %	60 %	20 %	159043056
10045	NC_009952	CGCGC	2	10	486195	486204	0 %	0 %	40 %	60 %	159043056
10046	NC_009952	GCC	2	6	486478	486483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043057
10047	NC_009952	GAC	2	6	486524	486529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043057
10048	NC_009952	GGC	2	6	486574	486579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043057
10049	NC_009952	CG	4	8	486595	486602	0 %	0 %	50 %	50 %	159043057
10050	NC_009952	TTC	2	6	486605	486610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159043057
10051	NC_009952	TCG	2	6	486618	486623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043057
10052	NC_009952	TGC	2	6	486642	486647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043057
10053	NC_009952	GAAC	2	8	486679	486686	50 %	0 %	25 %	25 %	159043057
10054	NC_009952	ATG	2	6	486719	486724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159043057
10055	NC_009952	GGC	2	6	486883	486888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043057
10056	NC_009952	TTC	2	6	486893	486898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159043057
10057	NC_009952	GAT	2	6	486899	486904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159043057
10058	NC_009952	GC	4	8	486921	486928	0 %	0 %	50 %	50 %	159043057
10059	NC_009952	AGC	2	6	487042	487047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043057
10060	NC_009952	ATA	2	6	487108	487113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159043058
10061	NC_009952	AG	3	6	487117	487122	50 %	0 %	50 %	0 %	159043058
10062	NC_009952	TTC	2	6	487146	487151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159043058
10063	NC_009952	CGC	3	9	487160	487168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043058
10064	NC_009952	CCT	2	6	487204	487209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159043058
10065	NC_009952	CG	3	6	487340	487345	0 %	0 %	50 %	50 %	159043059
10066	NC_009952	CCG	2	6	487397	487402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043059
10067	NC_009952	TCC	2	6	487416	487421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159043059
10068	NC_009952	GTGG	2	8	487431	487438	0 %	25 %	75 %	0 %	159043059
10069	NC_009952	GCG	2	6	487443	487448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043059
10070	NC_009952	CGGT	2	8	487456	487463	0 %	25 %	50 %	25 %	159043059
10071	NC_009952	ACG	2	6	487467	487472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043059
10072	NC_009952	CAGC	2	8	487505	487512	25 %	0 %	25 %	50 %	159043059
10073	NC_009952	GGTC	2	8	487592	487599	0 %	25 %	50 %	25 %	159043059
10074	NC_009952	CCG	2	6	487682	487687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043059
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10076	NC_009952	CGA	2	6	487751	487756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043059
10077	NC_009952	GCTCG	2	10	487814	487823	0 %	20 %	40 %	40 %	159043059
10078	NC_009952	CAA	2	6	487883	487888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159043059
10079	NC_009952	ACC	2	6	487894	487899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159043059
10080	NC_009952	ATC	2	6	488001	488006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159043059
10081	NC_009952	GCA	2	6	488048	488053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043059
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10083	NC_009952	AAC	2	6	488205	488210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159043059
10084	NC_009952	CCCG	2	8	488282	488289	0 %	0 %	25 %	75 %	159043059
10085	NC_009952	GCA	2	6	488396	488401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043059
10086	NC_009952	CTA	2	6	488555	488560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159043059
10087	NC_009952	GGC	2	6	488574	488579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043059
10088	NC_009952	GACTAC	2	12	488610	488621	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159043059
10089	NC_009952	GC	3	6	488628	488633	0 %	0 %	50 %	50 %	159043059
10090	NC_009952	CGA	2	6	488636	488641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043059
10091	NC_009952	GC	3	6	488667	488672	0 %	0 %	50 %	50 %	159043059
10092	NC_009952	ACC	2	6	488730	488735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159043059
10093	NC_009952	GGA	2	6	488744	488749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159043059
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10098	NC_009952	GTC	2	6	488859	488864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043059
10099	NC_009952	ACA	2	6	488911	488916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159043059
10100	NC_009952	GTC	2	6	489000	489005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043059
10101	NC_009952	GC	4	8	489251	489258	0 %	0 %	50 %	50 %	159043059
10102	NC_009952	GCCCTG	2	12	489299	489310	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	159043059
10103	NC_009952	GCG	2	6	489382	489387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043059
10104	NC_009952	TTG	2	6	489432	489437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159043059
10105	NC_009952	CCA	2	6	489550	489555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159043059
10106	NC_009952	CGG	2	6	489566	489571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043059
10107	NC_009952	CGG	2	6	489620	489625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043059
10108	NC_009952	CGTGG	2	10	489686	489695	0 %	20 %	60 %	20 %	159043059
10109	NC_009952	CCCGA	2	10	489702	489711	20 %	0 %	20 %	60 %	159043059
10110	NC_009952	CGC	2	6	489739	489744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043059
10111	NC_009952	ACCCG	2	10	489766	489775	20 %	0 %	20 %	60 %	159043059
10112	NC_009952	GAT	2	6	489777	489782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159043059
10113	NC_009952	GGT	2	6	489903	489908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159043059
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10115	NC_009952	GCA	2	6	489944	489949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043059
10116	NC_009952	CGG	2	6	489973	489978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043059
10117	NC_009952	CGG	2	6	490004	490009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043059
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10119	NC_009952	GCAT	2	8	490228	490235	25 %	25 %	25 %	25 %	159043059
10120	NC_009952	TG	3	6	490343	490348	0 %	50 %	50 %	0 %	159043060
10121	NC_009952	GA	3	6	490430	490435	50 %	0 %	50 %	0 %	159043060
10122	NC_009952	TGCA	2	8	490451	490458	25 %	25 %	25 %	25 %	159043060
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10231	NC_009952	CCTT	2	8	497401	497408	0 %	50 %	0 %	50 %	159043065
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10240	NC_009952	CCA	2	6	498471	498476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159043066
10241	NC_009952	CAT	2	6	498480	498485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159043066
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10243	NC_009952	GC	3	6	498532	498537	0 %	0 %	50 %	50 %	159043066
10244	NC_009952	GCAT	2	8	498565	498572	25 %	25 %	25 %	25 %	159043066
10245	NC_009952	TTGCG	2	10	498579	498588	0 %	40 %	40 %	20 %	159043066
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10247	NC_009952	CGC	2	6	498677	498682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043066
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10252	NC_009952	CGA	2	6	498905	498910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043067
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10269	NC_009952	CCGC	2	8	499639	499646	0 %	0 %	25 %	75 %	159043068
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10272	NC_009952	GAT	2	6	499727	499732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159043068
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10345	NC_009952	CGA	2	6	503271	503276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043072
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10350	NC_009952	TCG	2	6	503429	503434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043072
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10356	NC_009952	AC	3	6	503700	503705	50 %	0 %	0 %	50 %	159043072
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10358	NC_009952	AAC	2	6	503894	503899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159043072
10359	NC_009952	TG	3	6	503927	503932	0 %	50 %	50 %	0 %	159043072
10360	NC_009952	CGG	2	6	503988	503993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043072
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10362	NC_009952	GC	3	6	504122	504127	0 %	0 %	50 %	50 %	159043072
10363	NC_009952	TCG	2	6	504188	504193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043072
10364	NC_009952	GC	3	6	504210	504215	0 %	0 %	50 %	50 %	159043072
10365	NC_009952	GGCGAT	2	12	504229	504240	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	159043072
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10477	NC_009952	CGG	2	6	510648	510653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043079
10478	NC_009952	ACC	2	6	510659	510664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159043079
10479	NC_009952	TCC	2	6	510758	510763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159043079
10480	NC_009952	GC	3	6	510765	510770	0 %	0 %	50 %	50 %	159043079
10481	NC_009952	GCT	2	6	510785	510790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043079
10482	NC_009952	TGTC	2	8	510813	510820	0 %	50 %	25 %	25 %	159043079
10483	NC_009952	GCC	2	6	510859	510864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159043079
10484	NC_009952	CG	3	6	510897	510902	0 %	0 %	50 %	50 %	159043079
10485	NC_009952	CTG	2	6	510943	510948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043079
10486	NC_009952	GCG	2	6	510965	510970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043079
10487	NC_009952	TCA	2	6	510972	510977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159043079
10488	NC_009952	GAC	2	6	511004	511009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043079
10489	NC_009952	CAG	2	6	511042	511047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159043079
10490	NC_009952	CG	3	6	511093	511098	0 %	0 %	50 %	50 %	159043079
10491	NC_009952	ATCACC	2	12	511126	511137	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	159043079
10492	NC_009952	CGCC	2	8	511319	511326	0 %	0 %	25 %	75 %	159043080
10493	NC_009952	TGCG	2	8	511370	511377	0 %	25 %	50 %	25 %	159043080
10494	NC_009952	TTC	2	6	511425	511430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159043080
10495	NC_009952	CAT	2	6	511512	511517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159043080
10496	NC_009952	CGG	2	6	511535	511540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043080
10497	NC_009952	ATGCCC	2	12	511579	511590	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	159043080
10498	NC_009952	GGCA	2	8	511676	511683	25 %	0 %	50 %	25 %	159043080
10499	NC_009952	CGG	3	9	511736	511744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159043080
10500	NC_009952	CTG	2	6	511802	511807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159043080

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