MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 chromosome

Total Repeats: 80154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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75002	NC_009952	GCC	2	6	3530638	3530643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159045897
75003	NC_009952	GGC	2	6	3530646	3530651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159045897
75004	NC_009952	CGA	2	6	3530777	3530782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159045897
75005	NC_009952	TGG	2	6	3530806	3530811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159045897
75006	NC_009952	CT	3	6	3530823	3530828	0 %	50 %	0 %	50 %	159045897
75007	NC_009952	CGT	2	6	3530837	3530842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045897
75008	NC_009952	TGG	2	6	3530887	3530892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159045897
75009	NC_009952	GGAAC	2	10	3530904	3530913	40 %	0 %	40 %	20 %	159045897
75010	NC_009952	TCG	2	6	3531001	3531006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045897
75011	NC_009952	GCA	2	6	3531095	3531100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159045897
75012	NC_009952	ACC	2	6	3531109	3531114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159045897
75013	NC_009952	CTCA	2	8	3531121	3531128	25 %	25 %	0 %	50 %	159045897
75014	NC_009952	AAG	2	6	3531165	3531170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159045897
75015	NC_009952	GC	3	6	3531182	3531187	0 %	0 %	50 %	50 %	159045897
75016	NC_009952	GCA	2	6	3531555	3531560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159045898
75017	NC_009952	CGAT	2	8	3531728	3531735	25 %	25 %	25 %	25 %	159045898
75018	NC_009952	GGGC	2	8	3531793	3531800	0 %	0 %	75 %	25 %	159045898
75019	NC_009952	TTC	2	6	3531916	3531921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159045898
75020	NC_009952	GAT	2	6	3531946	3531951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159045898
75021	NC_009952	CTG	2	6	3531970	3531975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045898
75022	NC_009952	GGC	2	6	3532057	3532062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159045898
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75024	NC_009952	GAA	2	6	3532099	3532104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159045898
75025	NC_009952	TTG	2	6	3532106	3532111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159045898
75026	NC_009952	GTT	2	6	3532176	3532181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159045898
75027	NC_009952	TCC	3	9	3532220	3532228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159045898
75028	NC_009952	CGA	2	6	3532229	3532234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159045898
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75030	NC_009952	ACC	2	6	3532306	3532311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159045898
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75032	NC_009952	TCT	2	6	3532363	3532368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159045899
75033	NC_009952	TCA	2	6	3532459	3532464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159045899
75034	NC_009952	GTT	2	6	3532484	3532489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159045899
75035	NC_009952	TCG	2	6	3532519	3532524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045899
75036	NC_009952	GA	3	6	3532540	3532545	50 %	0 %	50 %	0 %	159045899
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75039	NC_009952	TGA	2	6	3532640	3532645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159045899
75040	NC_009952	ACG	2	6	3532678	3532683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159045899
75041	NC_009952	GCA	2	6	3532740	3532745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159045900
75042	NC_009952	CT	3	6	3532747	3532752	0 %	50 %	0 %	50 %	159045900
75043	NC_009952	ATG	2	6	3532770	3532775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159045900
75044	NC_009952	TG	3	6	3532842	3532847	0 %	50 %	50 %	0 %	159045900
75045	NC_009952	TTG	2	6	3532893	3532898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159045900
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75047	NC_009952	TGCTC	2	10	3533038	3533047	0 %	40 %	20 %	40 %	159045900
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75049	NC_009952	GC	3	6	3533090	3533095	0 %	0 %	50 %	50 %	159045900
75050	NC_009952	CTG	3	9	3533236	3533244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045901
75051	NC_009952	GC	3	6	3533263	3533268	0 %	0 %	50 %	50 %	159045901
75052	NC_009952	GATCC	2	10	3533300	3533309	20 %	20 %	20 %	40 %	159045901
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75054	NC_009952	AGT	2	6	3533455	3533460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159045901
75055	NC_009952	CAT	2	6	3533547	3533552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159045901
75056	NC_009952	GATC	2	8	3533574	3533581	25 %	25 %	25 %	25 %	159045901
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75058	NC_009952	CGT	2	6	3533664	3533669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045901
75059	NC_009952	TTCA	2	8	3533740	3533747	25 %	50 %	0 %	25 %	159045901
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75077	NC_009952	TTGCG	2	10	3535068	3535077	0 %	40 %	40 %	20 %	159045902
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75351	NC_009952	CAGG	2	8	3551703	3551710	25 %	0 %	50 %	25 %	159045918
75352	NC_009952	GCT	2	6	3551753	3551758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045918
75353	NC_009952	CG	3	6	3551779	3551784	0 %	0 %	50 %	50 %	159045918
75354	NC_009952	GAC	2	6	3551827	3551832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159045918
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75450	NC_009952	TGG	3	9	3556784	3556792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159045922
75451	NC_009952	GC	3	6	3556807	3556812	0 %	0 %	50 %	50 %	159045922
75452	NC_009952	CG	3	6	3556827	3556832	0 %	0 %	50 %	50 %	159045922
75453	NC_009952	TTGC	2	8	3556960	3556967	0 %	50 %	25 %	25 %	159045922
75454	NC_009952	CGC	2	6	3556968	3556973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159045922
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75458	NC_009952	GAC	2	6	3557145	3557150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159045922
75459	NC_009952	CG	3	6	3557220	3557225	0 %	0 %	50 %	50 %	159045922
75460	NC_009952	ATG	2	6	3557312	3557317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159045922
75461	NC_009952	GGCG	2	8	3557319	3557326	0 %	0 %	75 %	25 %	159045922
75462	NC_009952	GGTCT	2	10	3557331	3557340	0 %	40 %	40 %	20 %	159045922
75463	NC_009952	TCAGC	2	10	3557457	3557466	20 %	20 %	20 %	40 %	159045922
75464	NC_009952	GTGG	2	8	3557473	3557480	0 %	25 %	75 %	0 %	159045922
75465	NC_009952	CGACC	2	10	3557493	3557502	20 %	0 %	20 %	60 %	159045922
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75467	NC_009952	GAC	2	6	3557836	3557841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159045922
75468	NC_009952	CTG	2	6	3557842	3557847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045922
75469	NC_009952	GA	3	6	3557972	3557977	50 %	0 %	50 %	0 %	159045922
75470	NC_009952	TCGA	2	8	3558121	3558128	25 %	25 %	25 %	25 %	159045922
75471	NC_009952	GTGG	2	8	3558169	3558176	0 %	25 %	75 %	0 %	159045922
75472	NC_009952	CT	3	6	3558183	3558188	0 %	50 %	0 %	50 %	159045922
75473	NC_009952	CG	4	8	3558306	3558313	0 %	0 %	50 %	50 %	159045922
75474	NC_009952	GGC	2	6	3558352	3558357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159045922
75475	NC_009952	CGG	2	6	3558432	3558437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159045922
75476	NC_009952	GTT	2	6	3558478	3558483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159045922
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75480	NC_009952	GCG	2	6	3558638	3558643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159045922
75481	NC_009952	CG	3	6	3558700	3558705	0 %	0 %	50 %	50 %	159045922
75482	NC_009952	ACC	2	6	3558726	3558731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159045922
75483	NC_009952	G	6	6	3558735	3558740	0 %	0 %	100 %	0 %	159045922
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75487	NC_009952	GAC	2	6	3558896	3558901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159045922
75488	NC_009952	CGA	2	6	3558999	3559004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159045922
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75490	NC_009952	GAT	2	6	3559039	3559044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159045922
75491	NC_009952	GC	3	6	3559096	3559101	0 %	0 %	50 %	50 %	159045922
75492	NC_009952	CTG	2	6	3559102	3559107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045922
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75495	NC_009952	CGA	2	6	3559251	3559256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159045922
75496	NC_009952	TCGGC	2	10	3559275	3559284	0 %	20 %	40 %	40 %	159045922
75497	NC_009952	CGGA	2	8	3559328	3559335	25 %	0 %	50 %	25 %	159045922
75498	NC_009952	CTGA	2	8	3559363	3559370	25 %	25 %	25 %	25 %	159045922
75499	NC_009952	CGG	2	6	3559391	3559396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159045922
75500	NC_009952	GGC	2	6	3559450	3559455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159045923

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