MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 chromosome

Total Repeats: 80154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
73501	NC_009952	CCCG	2	8	3460737	3460744	0 %	0 %	25 %	75 %	159045834
73502	NC_009952	TGC	2	6	3460774	3460779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045834
73503	NC_009952	CCGCG	2	10	3460803	3460812	0 %	0 %	40 %	60 %	159045834
73504	NC_009952	CGC	2	6	3460854	3460859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159045834
73505	NC_009952	TCG	2	6	3460894	3460899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045834
73506	NC_009952	CTT	2	6	3460950	3460955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159045834
73507	NC_009952	GC	3	6	3460958	3460963	0 %	0 %	50 %	50 %	159045834
73508	NC_009952	CGG	2	6	3461015	3461020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159045834
73509	NC_009952	GCCCTT	2	12	3461028	3461039	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	159045834
73510	NC_009952	GCT	2	6	3461108	3461113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045834
73511	NC_009952	CTC	2	6	3461157	3461162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159045834
73512	NC_009952	GCC	2	6	3461172	3461177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159045834
73513	NC_009952	GC	3	6	3461206	3461211	0 %	0 %	50 %	50 %	159045834
73514	NC_009952	CCT	2	6	3461219	3461224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159045834
73515	NC_009952	CGG	3	9	3461229	3461237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159045834
73516	NC_009952	CAG	2	6	3461238	3461243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159045834
73517	NC_009952	GGC	3	9	3461259	3461267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159045834
73518	NC_009952	GC	3	6	3461285	3461290	0 %	0 %	50 %	50 %	159045834
73519	NC_009952	GCG	2	6	3461333	3461338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159045834
73520	NC_009952	GTT	2	6	3461397	3461402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159045834
73521	NC_009952	GC	3	6	3461480	3461485	0 %	0 %	50 %	50 %	159045834
73522	NC_009952	GCG	2	6	3461518	3461523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159045834
73523	NC_009952	TCGAGG	2	12	3461528	3461539	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	159045834
73524	NC_009952	GCC	2	6	3461545	3461550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159045834
73525	NC_009952	CGC	2	6	3461632	3461637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159045834
73526	NC_009952	GAT	2	6	3461682	3461687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159045834
73527	NC_009952	CCA	2	6	3461735	3461740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159045834
73528	NC_009952	CCG	2	6	3461764	3461769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159045834
73529	NC_009952	CG	3	6	3461807	3461812	0 %	0 %	50 %	50 %	159045834
73530	NC_009952	GTC	2	6	3461850	3461855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045834
73531	NC_009952	CGC	2	6	3461996	3462001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159045835
73532	NC_009952	CCA	2	6	3462013	3462018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159045835
73533	NC_009952	GCC	3	9	3462021	3462029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159045835
73534	NC_009952	CGCGCC	2	12	3462030	3462041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159045835
73535	NC_009952	AAGGC	2	10	3462159	3462168	40 %	0 %	40 %	20 %	159045835
73536	NC_009952	CCG	2	6	3462185	3462190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159045835
73537	NC_009952	G	6	6	3462193	3462198	0 %	0 %	100 %	0 %	159045835
73538	NC_009952	CAG	2	6	3462215	3462220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159045835
73539	NC_009952	CGCC	2	8	3462223	3462230	0 %	0 %	25 %	75 %	159045835
73540	NC_009952	CCG	2	6	3462232	3462237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159045835
73541	NC_009952	GC	3	6	3462250	3462255	0 %	0 %	50 %	50 %	159045835
73542	NC_009952	TCG	2	6	3462285	3462290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045835
73543	NC_009952	G	6	6	3462298	3462303	0 %	0 %	100 %	0 %	159045835
73544	NC_009952	CCG	2	6	3462304	3462309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159045835
73545	NC_009952	CGC	2	6	3462353	3462358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159045835
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73547	NC_009952	TCG	2	6	3462408	3462413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045835
73548	NC_009952	TCA	2	6	3462531	3462536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159045835
73549	NC_009952	GCAG	2	8	3462543	3462550	25 %	0 %	50 %	25 %	159045835
73550	NC_009952	GTC	2	6	3462551	3462556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045835
73551	NC_009952	GGC	4	12	3462590	3462601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159045835
73552	NC_009952	CCGC	2	8	3462607	3462614	0 %	0 %	25 %	75 %	159045835
73553	NC_009952	CCAGCA	2	12	3462646	3462657	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	159045835
73554	NC_009952	GCC	2	6	3462674	3462679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159045835
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73558	NC_009952	GC	3	6	3462902	3462907	0 %	0 %	50 %	50 %	159045836
73559	NC_009952	GCGCC	2	10	3462913	3462922	0 %	0 %	40 %	60 %	159045836
73560	NC_009952	TCC	2	6	3462945	3462950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159045836
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73567	NC_009952	CGGG	2	8	3463341	3463348	0 %	0 %	75 %	25 %	159045837
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73569	NC_009952	TGG	2	6	3463421	3463426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159045837
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73574	NC_009952	GTG	2	6	3463525	3463530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159045837
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73582	NC_009952	GC	3	6	3463906	3463911	0 %	0 %	50 %	50 %	159045837
73583	NC_009952	GACA	2	8	3463946	3463953	50 %	0 %	25 %	25 %	159045837
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73585	NC_009952	CG	3	6	3464142	3464147	0 %	0 %	50 %	50 %	159045838
73586	NC_009952	GTC	2	6	3464152	3464157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045838
73587	NC_009952	GTGCTC	2	12	3464176	3464187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045838
73588	NC_009952	CGG	2	6	3464232	3464237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159045838
73589	NC_009952	GTC	2	6	3464287	3464292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045838
73590	NC_009952	ACCCTG	2	12	3464332	3464343	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	159045838
73591	NC_009952	CGA	3	9	3464352	3464360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159045838
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73597	NC_009952	GCCA	2	8	3464528	3464535	25 %	0 %	25 %	50 %	159045838
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73600	NC_009952	ATC	2	6	3464723	3464728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159045839
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73603	NC_009952	CGT	2	6	3464848	3464853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045839
73604	NC_009952	GCA	2	6	3464872	3464877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159045839
73605	NC_009952	GGGCC	2	10	3464882	3464891	0 %	0 %	60 %	40 %	159045839
73606	NC_009952	TCG	2	6	3464898	3464903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159045839
73607	NC_009952	GCA	2	6	3464920	3464925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159045839
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