MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfococcus oleovorans Hxd3 chromosome

Total Repeats: 75102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009943	A	6	6	65	70	100 %	0 %	0 %	0 %	158520018
2	NC_009943	AAC	2	6	104	109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158520018
3	NC_009943	ATG	2	6	113	118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520018
4	NC_009943	A	6	6	191	196	100 %	0 %	0 %	0 %	158520018
5	NC_009943	C	7	7	282	288	0 %	0 %	0 %	100 %	158520018
6	NC_009943	A	6	6	301	306	100 %	0 %	0 %	0 %	158520018
7	NC_009943	AC	4	8	347	354	50 %	0 %	0 %	50 %	158520018
8	NC_009943	GTG	2	6	446	451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520018
9	NC_009943	TC	3	6	529	534	0 %	50 %	0 %	50 %	158520018
10	NC_009943	CCGG	2	8	538	545	0 %	0 %	50 %	50 %	158520018
11	NC_009943	CCA	2	6	580	585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520018
12	NC_009943	AGCCC	2	10	595	604	20 %	0 %	20 %	60 %	158520018
13	NC_009943	GGA	2	6	631	636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158520018
14	NC_009943	ACC	2	6	665	670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520018
15	NC_009943	GCG	2	6	678	683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520018
16	NC_009943	AAG	2	6	692	697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158520018
17	NC_009943	TGC	2	6	717	722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520018
18	NC_009943	AGG	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158520018
19	NC_009943	TGG	3	9	780	788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520018
20	NC_009943	CCGA	2	8	804	811	25 %	0 %	25 %	50 %	158520018
21	NC_009943	TGC	2	6	830	835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520018
22	NC_009943	GCC	2	6	876	881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520018
23	NC_009943	CAC	2	6	898	903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520018
24	NC_009943	ACC	2	6	923	928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520018
25	NC_009943	CCTG	2	8	1065	1072	0 %	25 %	25 %	50 %	158520018
26	NC_009943	CAT	2	6	1108	1113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520018
27	NC_009943	GGT	2	6	1165	1170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520018
28	NC_009943	GCC	2	6	1190	1195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520018
29	NC_009943	TGC	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520018
30	NC_009943	TAT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158520018
31	NC_009943	A	6	6	1431	1436	100 %	0 %	0 %	0 %	158520018
32	NC_009943	C	6	6	1628	1633	0 %	0 %	0 %	100 %	158520019
33	NC_009943	CAC	2	6	1686	1691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520019
34	NC_009943	ACG	2	6	1721	1726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520019
35	NC_009943	CCG	3	9	1730	1738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520019
36	NC_009943	CTGC	2	8	1740	1747	0 %	25 %	25 %	50 %	158520019
37	NC_009943	GTG	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520019
38	NC_009943	GGGATC	2	12	1836	1847	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158520019
39	NC_009943	CGG	2	6	1857	1862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520019
40	NC_009943	TGG	2	6	1940	1945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520019
41	NC_009943	T	6	6	2006	2011	0 %	100 %	0 %	0 %	158520019
42	NC_009943	GCC	2	6	2032	2037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520019
43	NC_009943	GGC	2	6	2050	2055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520019
44	NC_009943	GCGG	2	8	2071	2078	0 %	0 %	75 %	25 %	158520019
45	NC_009943	CAG	2	6	2129	2134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520019
46	NC_009943	TGC	2	6	2135	2140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520019
47	NC_009943	ATT	2	6	2152	2157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158520019
48	NC_009943	ACC	2	6	2158	2163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520019
49	NC_009943	GAC	2	6	2308	2313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520019
50	NC_009943	GGC	2	6	2322	2327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520019
51	NC_009943	GC	3	6	2326	2331	0 %	0 %	50 %	50 %	158520019
52	NC_009943	ATT	2	6	2344	2349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158520019
53	NC_009943	A	6	6	2411	2416	100 %	0 %	0 %	0 %	158520019
54	NC_009943	CGG	3	9	2441	2449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520019
55	NC_009943	TGC	2	6	2453	2458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520019
56	NC_009943	GC	3	6	2474	2479	0 %	0 %	50 %	50 %	158520019
57	NC_009943	A	6	6	2504	2509	100 %	0 %	0 %	0 %	158520019
58	NC_009943	GCC	2	6	2512	2517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520019
59	NC_009943	GCC	2	6	2569	2574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520019
60	NC_009943	GTG	2	6	2653	2658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520019
61	NC_009943	TGG	2	6	2681	2686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520019
62	NC_009943	A	6	6	2782	2787	100 %	0 %	0 %	0 %	158520019
63	NC_009943	GGC	2	6	2854	2859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520019
64	NC_009943	CGGCAT	2	12	2877	2888	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158520019
65	NC_009943	GCGGA	2	10	2921	2930	20 %	0 %	60 %	20 %	158520019
66	NC_009943	GCTGAT	2	12	2931	2942	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158520019
67	NC_009943	GCG	2	6	2943	2948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520019
68	NC_009943	A	6	6	2952	2957	100 %	0 %	0 %	0 %	158520019
69	NC_009943	ATG	2	6	3101	3106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520020
70	NC_009943	GGC	2	6	3141	3146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520020
71	NC_009943	CCTG	2	8	3183	3190	0 %	25 %	25 %	50 %	158520020
72	NC_009943	AT	3	6	3204	3209	50 %	50 %	0 %	0 %	158520020
73	NC_009943	TGG	2	6	3275	3280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520021
74	NC_009943	CCGGC	2	10	3340	3349	0 %	0 %	40 %	60 %	158520021
75	NC_009943	CGG	2	6	3365	3370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520021
76	NC_009943	GGC	2	6	3477	3482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520021
77	NC_009943	CAG	2	6	3552	3557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520021
78	NC_009943	GC	3	6	3596	3601	0 %	0 %	50 %	50 %	158520021
79	NC_009943	TGG	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520021
80	NC_009943	T	6	6	3906	3911	0 %	100 %	0 %	0 %	158520021
81	NC_009943	A	6	6	3933	3938	100 %	0 %	0 %	0 %	158520021
82	NC_009943	GC	3	6	3940	3945	0 %	0 %	50 %	50 %	158520021
83	NC_009943	CGC	2	6	3966	3971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520021
84	NC_009943	AAT	2	6	4069	4074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158520022
85	NC_009943	CCG	2	6	4100	4105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520022
86	NC_009943	GGC	2	6	4166	4171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520022
87	NC_009943	TTG	2	6	4173	4178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158520022
88	NC_009943	CGC	2	6	4192	4197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520022
89	NC_009943	TTG	2	6	4248	4253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158520022
90	NC_009943	GA	3	6	4278	4283	50 %	0 %	50 %	0 %	158520022
91	NC_009943	GCC	2	6	4329	4334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520022
92	NC_009943	GGC	2	6	4340	4345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520022
93	NC_009943	CCA	2	6	4348	4353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520022
94	NC_009943	CCA	2	6	4405	4410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520022
95	NC_009943	GCCAC	2	10	4533	4542	20 %	0 %	20 %	60 %	158520022
96	NC_009943	CTG	2	6	4637	4642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520022
97	NC_009943	GCT	2	6	4648	4653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520022
98	NC_009943	GCT	2	6	4669	4674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520022
99	NC_009943	GCC	2	6	4754	4759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520022
100	NC_009943	TGAGC	2	10	4813	4822	20 %	20 %	40 %	20 %	158520022
101	NC_009943	CAG	2	6	4967	4972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520022
102	NC_009943	T	6	6	5049	5054	0 %	100 %	0 %	0 %	158520022
103	NC_009943	CTA	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520022
104	NC_009943	GCC	2	6	5097	5102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520022
105	NC_009943	G	6	6	5143	5148	0 %	0 %	100 %	0 %	158520022
106	NC_009943	TCC	2	6	5226	5231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158520022
107	NC_009943	ACG	2	6	5299	5304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520022
108	NC_009943	CGGA	2	8	5308	5315	25 %	0 %	50 %	25 %	158520022
109	NC_009943	GCA	2	6	5335	5340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520022
110	NC_009943	TTC	2	6	5372	5377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158520022
111	NC_009943	CCG	2	6	5382	5387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520022
112	NC_009943	CGG	2	6	5398	5403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520022
113	NC_009943	ATG	2	6	5406	5411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520022
114	NC_009943	GCA	2	6	5419	5424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520022
115	NC_009943	GTC	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520022
116	NC_009943	GGTG	2	8	5470	5477	0 %	25 %	75 %	0 %	158520022
117	NC_009943	GCCG	2	8	5500	5507	0 %	0 %	50 %	50 %	158520022
118	NC_009943	GCG	2	6	5508	5513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520022
119	NC_009943	CCA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520022
120	NC_009943	CAG	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520022
121	NC_009943	GAG	2	6	5673	5678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158520022
122	NC_009943	CGC	2	6	5709	5714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520022
123	NC_009943	GGT	2	6	5716	5721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520022
124	NC_009943	GCC	2	6	5732	5737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520022
125	NC_009943	T	7	7	5755	5761	0 %	100 %	0 %	0 %	158520022
126	NC_009943	GCT	2	6	5910	5915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520023
127	NC_009943	GAT	3	9	5920	5928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520023
128	NC_009943	TTG	2	6	5963	5968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158520023
129	NC_009943	CAC	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520023
130	NC_009943	TGG	2	6	6182	6187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520023
131	NC_009943	CCA	2	6	6213	6218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520023
132	NC_009943	ATC	2	6	6221	6226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520023
133	NC_009943	CGG	2	6	6408	6413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520023
134	NC_009943	AGC	2	6	6416	6421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520023
135	NC_009943	GCT	2	6	6432	6437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520023
136	NC_009943	GCC	2	6	6542	6547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520023
137	NC_009943	CGG	2	6	6576	6581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520023
138	NC_009943	GCTG	2	8	6672	6679	0 %	25 %	50 %	25 %	158520023
139	NC_009943	CG	3	6	6727	6732	0 %	0 %	50 %	50 %	158520023
140	NC_009943	AGC	2	6	6777	6782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520023
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163	NC_009943	C	6	6	7545	7550	0 %	0 %	0 %	100 %	158520024
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244	NC_009943	TCGTTC	2	12	11400	11411	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158520028
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246	NC_009943	TAG	2	6	11511	11516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520028
247	NC_009943	GTA	2	6	11579	11584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520028
248	NC_009943	GTCCAC	2	12	11594	11605	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158520028
249	NC_009943	ACGGCA	2	12	11619	11630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520028
250	NC_009943	CATG	2	8	11636	11643	25 %	25 %	25 %	25 %	158520028
251	NC_009943	GAT	2	6	12027	12032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520029
252	NC_009943	CAC	2	6	12044	12049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158520029
253	NC_009943	CGT	2	6	12094	12099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520029
254	NC_009943	CCAGGC	2	12	12166	12177	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158520029
255	NC_009943	TCCCA	2	10	12180	12189	20 %	20 %	0 %	60 %	158520029
256	NC_009943	TTG	2	6	12252	12257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158520029
257	NC_009943	GCCGTC	2	12	12281	12292	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158520029
258	NC_009943	CCCA	2	8	12300	12307	25 %	0 %	0 %	75 %	158520029
259	NC_009943	TGG	2	6	12361	12366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520029
260	NC_009943	GCC	2	6	12383	12388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520029
261	NC_009943	GTC	2	6	12452	12457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520029
262	NC_009943	GCC	2	6	12569	12574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520029
263	NC_009943	T	6	6	12629	12634	0 %	100 %	0 %	0 %	158520029
264	NC_009943	AGG	2	6	12730	12735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158520029
265	NC_009943	GGT	2	6	12746	12751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520029
266	NC_009943	TTG	2	6	12753	12758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158520029
267	NC_009943	GTT	2	6	12788	12793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158520029
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269	NC_009943	AGC	2	6	12909	12914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158520029
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272	NC_009943	CT	3	6	13059	13064	0 %	50 %	0 %	50 %	158520029
273	NC_009943	CCGG	2	8	13101	13108	0 %	0 %	50 %	50 %	158520029
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290	NC_009943	T	7	7	13819	13825	0 %	100 %	0 %	0 %	158520030
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374	NC_009943	CGG	2	6	18823	18828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520034
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379	NC_009943	GGGCCG	2	12	19077	19088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520034
380	NC_009943	GGT	2	6	19106	19111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520034
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382	NC_009943	CTG	2	6	19192	19197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158520034
383	NC_009943	C	8	8	19224	19231	0 %	0 %	0 %	100 %	158520034
384	NC_009943	CGG	2	6	19248	19253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520034
385	NC_009943	ATC	2	6	19289	19294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520034
386	NC_009943	TC	3	6	19409	19414	0 %	50 %	0 %	50 %	158520035
387	NC_009943	GTA	2	6	19447	19452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158520035
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390	NC_009943	TCC	2	6	19541	19546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158520035
391	NC_009943	CGC	2	6	19589	19594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520035
392	NC_009943	TCT	2	6	19617	19622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158520035
393	NC_009943	CACGTC	2	12	19672	19683	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158520035
394	NC_009943	GA	3	6	19697	19702	50 %	0 %	50 %	0 %	158520035
395	NC_009943	TGG	2	6	19803	19808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520035
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424	NC_009943	CGCCGG	2	12	21019	21030	0 %	0 %	50 %	50 %	158520037
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451	NC_009943	TGG	2	6	21946	21951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158520037
452	NC_009943	GCC	2	6	22053	22058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158520037
453	NC_009943	ATC	2	6	22074	22079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158520037
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499	NC_009943	ATCCAC	2	12	25124	25135	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	158520042
500	NC_009943	GGC	2	6	25190	25195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158520042

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