MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus geothermalis DSM 11300 plasmid pDGEO02

Total Repeats: 4608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009939	GCT	2	6	199	204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421419
2	NC_009939	GGC	3	9	232	240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421419
3	NC_009939	ACCAGG	2	12	252	263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421419
4	NC_009939	CAG	2	6	344	349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421419
5	NC_009939	AGC	2	6	402	407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421419
6	NC_009939	CGG	2	6	417	422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421419
7	NC_009939	GC	3	6	563	568	0 %	0 %	50 %	50 %	158421420
8	NC_009939	CT	3	6	618	623	0 %	50 %	0 %	50 %	158421420
9	NC_009939	CAG	2	6	653	658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421420
10	NC_009939	GCC	2	6	702	707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421420
11	NC_009939	TGCCG	2	10	718	727	0 %	20 %	40 %	40 %	158421420
12	NC_009939	TGA	3	9	730	738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421420
13	NC_009939	CTC	2	6	743	748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421420
14	NC_009939	CAG	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421420
15	NC_009939	GGCT	2	8	1220	1227	0 %	25 %	50 %	25 %	158421421
16	NC_009939	CAGTT	2	10	1228	1237	20 %	40 %	20 %	20 %	158421421
17	NC_009939	GTC	2	6	1296	1301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421421
18	NC_009939	CTG	2	6	1308	1313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421421
19	NC_009939	CTCCA	2	10	1318	1327	20 %	20 %	0 %	60 %	158421421
20	NC_009939	GGC	2	6	1331	1336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421421
21	NC_009939	CGG	2	6	1362	1367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421421
22	NC_009939	GGT	2	6	1429	1434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421421
23	NC_009939	GCG	3	9	1470	1478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421421
24	NC_009939	CCT	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421421
25	NC_009939	GC	3	6	1575	1580	0 %	0 %	50 %	50 %	158421421
26	NC_009939	GCT	3	9	1586	1594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421421
27	NC_009939	GCCA	2	8	1597	1604	25 %	0 %	25 %	50 %	158421421
28	NC_009939	CGG	2	6	1625	1630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421421
29	NC_009939	AGT	2	6	1687	1692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421421
30	NC_009939	GCT	2	6	1720	1725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421422
31	NC_009939	TCC	2	6	1767	1772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421422
32	NC_009939	CTG	2	6	1835	1840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421422
33	NC_009939	CCA	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421422
34	NC_009939	TGCC	3	12	2021	2032	0 %	25 %	25 %	50 %	158421422
35	NC_009939	GTA	3	9	2081	2089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421422
36	NC_009939	C	7	7	2096	2102	0 %	0 %	0 %	100 %	158421422
37	NC_009939	CTG	2	6	2135	2140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421422
38	NC_009939	C	6	6	2152	2157	0 %	0 %	0 %	100 %	158421422
39	NC_009939	GC	4	8	2174	2181	0 %	0 %	50 %	50 %	158421422
40	NC_009939	TGC	2	6	2208	2213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421422
41	NC_009939	ACC	2	6	2268	2273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421422
42	NC_009939	CCT	2	6	2309	2314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421423
43	NC_009939	CCCG	2	8	2318	2325	0 %	0 %	25 %	75 %	158421423
44	NC_009939	CG	3	6	2333	2338	0 %	0 %	50 %	50 %	158421423
45	NC_009939	CCT	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421423
46	NC_009939	GC	3	6	2383	2388	0 %	0 %	50 %	50 %	158421423
47	NC_009939	C	6	6	2460	2465	0 %	0 %	0 %	100 %	158421423
48	NC_009939	CAG	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421423
49	NC_009939	CCT	2	6	2540	2545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421423
50	NC_009939	CGG	2	6	2597	2602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421423
51	NC_009939	CGG	2	6	2627	2632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421423
52	NC_009939	GCTG	2	8	2639	2646	0 %	25 %	50 %	25 %	158421423
53	NC_009939	CTC	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421423
54	NC_009939	CGGG	2	8	2695	2702	0 %	0 %	75 %	25 %	158421423
55	NC_009939	CGG	2	6	2716	2721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421423
56	NC_009939	GA	3	6	2783	2788	50 %	0 %	50 %	0 %	158421423
57	NC_009939	CCT	2	6	2810	2815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421423
58	NC_009939	CAG	2	6	2850	2855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421423
59	NC_009939	TCCG	2	8	2857	2864	0 %	25 %	25 %	50 %	158421423
60	NC_009939	AGA	2	6	2868	2873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421423
61	NC_009939	ACG	2	6	2932	2937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421423
62	NC_009939	GTG	2	6	2938	2943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421423
63	NC_009939	CGC	2	6	2954	2959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421423
64	NC_009939	CGG	2	6	2996	3001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421423
65	NC_009939	GCA	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421423
66	NC_009939	CTT	2	6	3063	3068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158421423
67	NC_009939	TCC	2	6	3091	3096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421423
68	NC_009939	TCT	3	9	3120	3128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158421423
69	NC_009939	TTC	2	6	3335	3340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158421424
70	NC_009939	CA	3	6	3374	3379	50 %	0 %	0 %	50 %	158421424
71	NC_009939	ACCGC	2	10	3383	3392	20 %	0 %	20 %	60 %	158421424
72	NC_009939	TGG	2	6	3416	3421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421424
73	NC_009939	CGC	2	6	3449	3454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421424
74	NC_009939	GCT	2	6	3480	3485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421424
75	NC_009939	C	6	6	3486	3491	0 %	0 %	0 %	100 %	158421424
76	NC_009939	CTG	2	6	3553	3558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421424
77	NC_009939	GTG	2	6	3583	3588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421424
78	NC_009939	CGG	2	6	3618	3623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421424
79	NC_009939	TGC	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421424
80	NC_009939	TGG	2	6	3653	3658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421424
81	NC_009939	CCCG	2	8	3679	3686	0 %	0 %	25 %	75 %	158421424
82	NC_009939	ATTCGG	2	12	3772	3783	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158421424
83	NC_009939	ACA	2	6	3900	3905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158421425
84	NC_009939	ACTGA	2	10	3934	3943	40 %	20 %	20 %	20 %	158421425
85	NC_009939	CAGG	2	8	4067	4074	25 %	0 %	50 %	25 %	158421425
86	NC_009939	GAT	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421425
87	NC_009939	GGT	2	6	4145	4150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421425
88	NC_009939	GAT	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421425
89	NC_009939	G	7	7	4349	4355	0 %	0 %	100 %	0 %	158421425
90	NC_009939	AGG	2	6	4414	4419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158421425
91	NC_009939	CTT	2	6	4736	4741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158421426
92	NC_009939	GCT	2	6	4753	4758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421426
93	NC_009939	CCGC	2	8	4762	4769	0 %	0 %	25 %	75 %	158421426
94	NC_009939	CAG	2	6	4808	4813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421426
95	NC_009939	GA	3	6	4825	4830	50 %	0 %	50 %	0 %	158421426
96	NC_009939	GGT	2	6	4925	4930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421426
97	NC_009939	G	6	6	4981	4986	0 %	0 %	100 %	0 %	158421426
98	NC_009939	ACC	2	6	4998	5003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421426
99	NC_009939	TCG	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421426
100	NC_009939	CCGAAT	2	12	5114	5125	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158421426
101	NC_009939	CGGG	2	8	5211	5218	0 %	0 %	75 %	25 %	158421426
102	NC_009939	CAG	2	6	5243	5248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421426
103	NC_009939	GCC	2	6	5273	5278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421426
104	NC_009939	CAG	2	6	5339	5344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421426
105	NC_009939	G	6	6	5406	5411	0 %	0 %	100 %	0 %	158421426
106	NC_009939	AGC	2	6	5412	5417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421426
107	NC_009939	GCG	2	6	5443	5448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421426
108	NC_009939	CCA	2	6	5476	5481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421426
109	NC_009939	GCGGT	2	10	5505	5514	0 %	20 %	60 %	20 %	158421426
110	NC_009939	TG	3	6	5518	5523	0 %	50 %	50 %	0 %	158421426
111	NC_009939	GAA	2	6	5557	5562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421426
112	NC_009939	CTG	2	6	5701	5706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421427
113	NC_009939	CAT	2	6	5741	5746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158421427
114	NC_009939	GAA	2	6	5799	5804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421427
115	NC_009939	TGC	2	6	5806	5811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421427
116	NC_009939	AGTC	2	8	5828	5835	25 %	25 %	25 %	25 %	158421427
117	NC_009939	CCA	2	6	5872	5877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421427
118	NC_009939	GAA	2	6	5891	5896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421427
119	NC_009939	TTC	2	6	6010	6015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158421427
120	NC_009939	GGC	2	6	6038	6043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421427
121	NC_009939	TTC	2	6	6051	6056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158421427
122	NC_009939	ACC	2	6	6087	6092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421427
123	NC_009939	AGC	2	6	6122	6127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421427
124	NC_009939	CAA	2	6	6191	6196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158421427
125	NC_009939	TTGA	2	8	6198	6205	25 %	50 %	25 %	0 %	158421427
126	NC_009939	ACCG	2	8	6214	6221	25 %	0 %	25 %	50 %	158421427
127	NC_009939	AC	3	6	6268	6273	50 %	0 %	0 %	50 %	158421427
128	NC_009939	CCA	2	6	6311	6316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421427
129	NC_009939	GCT	2	6	6395	6400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421427
130	NC_009939	CCG	2	6	6657	6662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421428
131	NC_009939	TG	3	6	6739	6744	0 %	50 %	50 %	0 %	158421428
132	NC_009939	AACC	2	8	6940	6947	50 %	0 %	0 %	50 %	158421428
133	NC_009939	GAA	2	6	6956	6961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421428
134	NC_009939	GCG	2	6	6962	6967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421428
135	NC_009939	CTG	2	6	7085	7090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421428
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259	NC_009939	TGA	2	6	11892	11897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421433
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262	NC_009939	CGC	2	6	11952	11957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421433
263	NC_009939	GCG	2	6	12002	12007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421433
264	NC_009939	GAA	2	6	12034	12039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421433
265	NC_009939	CCTTGT	2	12	12117	12128	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158421433
266	NC_009939	GCC	3	9	12182	12190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421433
267	NC_009939	CCCG	2	8	12214	12221	0 %	0 %	25 %	75 %	158421433
268	NC_009939	CTGCCA	2	12	12238	12249	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158421433
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271	NC_009939	AGA	2	6	12399	12404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421433
272	NC_009939	CTG	2	6	12439	12444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421433
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277	NC_009939	AGT	2	6	12735	12740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421433
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282	NC_009939	GGC	2	6	12923	12928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421434
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284	NC_009939	CGG	2	6	12979	12984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421434
285	NC_009939	ATC	2	6	12995	13000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158421434
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309	NC_009939	TCG	2	6	14884	14889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421435
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385	NC_009939	TGG	2	6	17863	17868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421437
386	NC_009939	AGG	2	6	17929	17934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158421437
387	NC_009939	C	6	6	18023	18028	0 %	0 %	0 %	100 %	158421437
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