MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus geothermalis DSM 11300 plasmid pDGEO02

Total Repeats: 4608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009939	CTG	2	6	23228	23233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421444
502	NC_009939	CCT	2	6	23248	23253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421445
503	NC_009939	CGA	2	6	23353	23358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421445
504	NC_009939	GTC	2	6	23462	23467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421445
505	NC_009939	GGC	2	6	23570	23575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421445
506	NC_009939	GAT	2	6	23585	23590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421445
507	NC_009939	CAG	2	6	23630	23635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421445
508	NC_009939	CAA	2	6	23656	23661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158421445
509	NC_009939	AGA	2	6	23725	23730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421445
510	NC_009939	GTC	2	6	23741	23746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421445
511	NC_009939	GTC	2	6	23777	23782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421445
512	NC_009939	GTA	2	6	23813	23818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421445
513	NC_009939	CCA	2	6	23827	23832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421445
514	NC_009939	TGC	2	6	23859	23864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421445
515	NC_009939	TTG	2	6	23880	23885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158421445
516	NC_009939	TCC	2	6	23964	23969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421445
517	NC_009939	GTC	2	6	23973	23978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421445
518	NC_009939	CTC	2	6	24154	24159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421446
519	NC_009939	CTT	2	6	24314	24319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158421446
520	NC_009939	GCT	2	6	24331	24336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421446
521	NC_009939	CCGC	2	8	24340	24347	0 %	0 %	25 %	75 %	158421446
522	NC_009939	CAG	2	6	24386	24391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421446
523	NC_009939	GA	3	6	24403	24408	50 %	0 %	50 %	0 %	158421446
524	NC_009939	GGT	2	6	24503	24508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421446
525	NC_009939	G	6	6	24559	24564	0 %	0 %	100 %	0 %	158421446
526	NC_009939	ACC	2	6	24576	24581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421446
527	NC_009939	TCG	2	6	24669	24674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421446
528	NC_009939	CCGAAT	2	12	24692	24703	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158421446
529	NC_009939	CGGG	2	8	24789	24796	0 %	0 %	75 %	25 %	158421446
530	NC_009939	CAG	2	6	24821	24826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421446
531	NC_009939	GCC	2	6	24851	24856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421446
532	NC_009939	CAG	2	6	24917	24922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421446
533	NC_009939	G	6	6	24984	24989	0 %	0 %	100 %	0 %	158421446
534	NC_009939	AGC	2	6	24990	24995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421446
535	NC_009939	GCG	2	6	25021	25026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421446
536	NC_009939	CCA	2	6	25054	25059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421446
537	NC_009939	GCGGT	2	10	25083	25092	0 %	20 %	60 %	20 %	158421446
538	NC_009939	TG	3	6	25096	25101	0 %	50 %	50 %	0 %	158421446
539	NC_009939	GAA	2	6	25135	25140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421446
540	NC_009939	CTG	2	6	25718	25723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421447
541	NC_009939	GCTG	2	8	25732	25739	0 %	25 %	50 %	25 %	158421447
542	NC_009939	ACA	2	6	25743	25748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158421447
543	NC_009939	TGCC	2	8	25787	25794	0 %	25 %	25 %	50 %	158421447
544	NC_009939	CAT	2	6	25797	25802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158421447
545	NC_009939	CAA	2	6	25817	25822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158421447
546	NC_009939	TCC	2	6	25830	25835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421447
547	NC_009939	GCCA	2	8	25986	25993	25 %	0 %	25 %	50 %	158421447
548	NC_009939	GCA	2	6	26031	26036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421447
549	NC_009939	TGT	2	6	26051	26056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158421447
550	NC_009939	CAA	2	6	26091	26096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158421447
551	NC_009939	ACC	3	9	26173	26181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421447
552	NC_009939	ACGT	2	8	26194	26201	25 %	25 %	25 %	25 %	158421447
553	NC_009939	CGC	2	6	26218	26223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421447
554	NC_009939	GCC	2	6	26236	26241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421447
555	NC_009939	TGA	2	6	26384	26389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421447
556	NC_009939	CGA	2	6	26406	26411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421447
557	NC_009939	TGG	2	6	26447	26452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421447
558	NC_009939	CAA	2	6	26460	26465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158421447
559	NC_009939	CAG	2	6	26466	26471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421447
560	NC_009939	CCA	2	6	26489	26494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421447
561	NC_009939	ATA	2	6	26513	26518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158421447
562	NC_009939	GAT	2	6	26569	26574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421447
563	NC_009939	TGG	2	6	26662	26667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421447
564	NC_009939	ATG	2	6	26708	26713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421447
565	NC_009939	GCT	2	6	26742	26747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421447
566	NC_009939	ACA	2	6	26753	26758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158421447
567	NC_009939	TGG	3	9	26800	26808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421447
568	NC_009939	TGG	2	6	26817	26822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421447
569	NC_009939	GGC	2	6	26835	26840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421447
570	NC_009939	CAT	2	6	26852	26857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158421447
571	NC_009939	GGCT	2	8	26858	26865	0 %	25 %	50 %	25 %	158421447
572	NC_009939	GAC	2	6	26917	26922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421447
573	NC_009939	TAT	2	6	26985	26990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158421447
574	NC_009939	CAG	2	6	27001	27006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421447
575	NC_009939	ACT	2	6	27050	27055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158421447
576	NC_009939	GTG	2	6	27065	27070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421447
577	NC_009939	AAC	2	6	27073	27078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158421447
578	NC_009939	CGTT	2	8	27110	27117	0 %	50 %	25 %	25 %	158421447
579	NC_009939	CA	3	6	27144	27149	50 %	0 %	0 %	50 %	158421447
580	NC_009939	TCG	2	6	27176	27181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421447
581	NC_009939	AGG	2	6	27236	27241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158421447
582	NC_009939	TGG	2	6	27310	27315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421447
583	NC_009939	AGA	2	6	27344	27349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421447
584	NC_009939	AGC	2	6	27406	27411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421448
585	NC_009939	GCA	2	6	27418	27423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421448
586	NC_009939	AC	4	8	27503	27510	50 %	0 %	0 %	50 %	158421448
587	NC_009939	ATG	2	6	27540	27545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421448
588	NC_009939	ATGC	2	8	27590	27597	25 %	25 %	25 %	25 %	158421448
589	NC_009939	AC	3	6	27603	27608	50 %	0 %	0 %	50 %	158421448
590	NC_009939	AGT	2	6	27682	27687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421448
591	NC_009939	CGA	2	6	27758	27763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421449
592	NC_009939	GTC	2	6	27872	27877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421449
593	NC_009939	GAA	2	6	28071	28076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421450
594	NC_009939	GTG	2	6	28077	28082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421450
595	NC_009939	GCA	2	6	28156	28161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421450
596	NC_009939	ACG	2	6	28291	28296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421450
597	NC_009939	CGA	2	6	28421	28426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421450
598	NC_009939	CAG	2	6	28526	28531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421451
599	NC_009939	GC	3	6	28610	28615	0 %	0 %	50 %	50 %	158421451
600	NC_009939	CGC	2	6	28625	28630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421451
601	NC_009939	GCG	2	6	28697	28702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421451
602	NC_009939	GA	3	6	28707	28712	50 %	0 %	50 %	0 %	158421451
603	NC_009939	ACC	2	6	28716	28721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421451
604	NC_009939	TGGG	2	8	28732	28739	0 %	25 %	75 %	0 %	158421451
605	NC_009939	GT	3	6	28864	28869	0 %	50 %	50 %	0 %	158421452
606	NC_009939	CTG	3	9	28875	28883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421452
607	NC_009939	GGC	2	6	28955	28960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421452
608	NC_009939	CG	3	6	29054	29059	0 %	0 %	50 %	50 %	158421452
609	NC_009939	CGCC	2	8	29071	29078	0 %	0 %	25 %	75 %	158421452
610	NC_009939	CAC	2	6	29160	29165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421452
611	NC_009939	TCC	2	6	29194	29199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421452
612	NC_009939	GAT	2	6	29201	29206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421452
613	NC_009939	CAC	2	6	29210	29215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421452
614	NC_009939	AGG	2	6	29248	29253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158421452
615	NC_009939	CTG	2	6	29331	29336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421452
616	NC_009939	GAC	2	6	29361	29366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421452
617	NC_009939	CAT	2	6	29429	29434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158421452
618	NC_009939	CGA	2	6	29435	29440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421452
619	NC_009939	ATC	2	6	29451	29456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158421452
620	NC_009939	GCG	2	6	29467	29472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421452
621	NC_009939	CCG	2	6	29516	29521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421452
622	NC_009939	GTTG	2	8	29573	29580	0 %	50 %	50 %	0 %	158421452
623	NC_009939	CG	3	6	29582	29587	0 %	0 %	50 %	50 %	158421452
624	NC_009939	CTT	2	6	29624	29629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158421452
625	NC_009939	AGC	2	6	29632	29637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421452
626	NC_009939	CCTGG	2	10	29666	29675	0 %	20 %	40 %	40 %	158421452
627	NC_009939	GACC	2	8	29756	29763	25 %	0 %	25 %	50 %	158421452
628	NC_009939	CGA	2	6	29780	29785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421452
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631	NC_009939	GCT	2	6	29897	29902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421452
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659	NC_009939	CCT	2	6	31351	31356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421453
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751	NC_009939	CCT	2	6	37094	37099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421458
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