MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalococcoides sp. BAV1 chromosome

Total Repeats: 21743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009455	AGC	2	6	277	282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668653
2	NC_009455	ACG	2	6	357	362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668653
3	NC_009455	A	6	6	438	443	100 %	0 %	0 %	0 %	147668653
4	NC_009455	TAC	2	6	454	459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668653
5	NC_009455	GCT	2	6	512	517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668653
6	NC_009455	ACAA	2	8	527	534	75 %	0 %	0 %	25 %	147668653
7	NC_009455	GCC	2	6	629	634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668653
8	NC_009455	CCG	2	6	736	741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668653
9	NC_009455	TCT	2	6	788	793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668653
10	NC_009455	GAA	2	6	812	817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668653
11	NC_009455	GAT	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668653
12	NC_009455	GAA	2	6	893	898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668653
13	NC_009455	CCCA	2	8	964	971	25 %	0 %	0 %	75 %	147668653
14	NC_009455	CCG	2	6	1040	1045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668653
15	NC_009455	A	6	6	1050	1055	100 %	0 %	0 %	0 %	147668653
16	NC_009455	GCC	2	6	1352	1357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668653
17	NC_009455	ACA	2	6	1408	1413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668653
18	NC_009455	CT	3	6	1423	1428	0 %	50 %	0 %	50 %	147668653
19	NC_009455	GAA	2	6	1455	1460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668653
20	NC_009455	AGCTGG	2	12	1497	1508	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147668653
21	NC_009455	ACC	2	6	1551	1556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668653
22	NC_009455	CGG	2	6	1948	1953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668654
23	NC_009455	CGG	2	6	1996	2001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668654
24	NC_009455	CGG	2	6	2017	2022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668654
25	NC_009455	CGG	2	6	2026	2031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668654
26	NC_009455	CTA	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668654
27	NC_009455	GGA	2	6	2200	2205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147668654
28	NC_009455	GGC	2	6	2236	2241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668654
29	NC_009455	AGGG	2	8	2277	2284	25 %	0 %	75 %	0 %	147668654
30	NC_009455	GCG	2	6	2352	2357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668654
31	NC_009455	TAT	2	6	2401	2406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668654
32	NC_009455	CTG	2	6	2444	2449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668654
33	NC_009455	TAC	2	6	2485	2490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668654
34	NC_009455	CTG	2	6	2639	2644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668654
35	NC_009455	GGT	2	6	2734	2739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668654
36	NC_009455	AGAT	2	8	2751	2758	50 %	25 %	25 %	0 %	147668654
37	NC_009455	GAA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668654
38	NC_009455	AAG	2	6	2805	2810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668654
39	NC_009455	T	6	6	2825	2830	0 %	100 %	0 %	0 %	147668654
40	NC_009455	CTG	2	6	2864	2869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668654
41	NC_009455	GCG	2	6	2903	2908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668654
42	NC_009455	AT	3	6	2910	2915	50 %	50 %	0 %	0 %	147668654
43	NC_009455	TGGC	2	8	3001	3008	0 %	25 %	50 %	25 %	147668654
44	NC_009455	ATT	2	6	3035	3040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668654
45	NC_009455	GGC	2	6	3072	3077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668654
46	NC_009455	G	6	6	3198	3203	0 %	0 %	100 %	0 %	147668655
47	NC_009455	A	6	6	3252	3257	100 %	0 %	0 %	0 %	147668655
48	NC_009455	GGCTGG	2	12	3260	3271	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	147668655
49	NC_009455	TAT	2	6	3304	3309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668655
50	NC_009455	AAG	2	6	3411	3416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668655
51	NC_009455	CTTTA	2	10	3481	3490	20 %	60 %	0 %	20 %	147668655
52	NC_009455	GCTGG	2	10	3492	3501	0 %	20 %	60 %	20 %	147668655
53	NC_009455	ATA	2	6	3544	3549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668655
54	NC_009455	GAT	2	6	3613	3618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668655
55	NC_009455	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668655
56	NC_009455	AT	3	6	3671	3676	50 %	50 %	0 %	0 %	147668655
57	NC_009455	CTT	2	6	3677	3682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668655
58	NC_009455	CGG	2	6	3734	3739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668655
59	NC_009455	TAAA	2	8	3780	3787	75 %	25 %	0 %	0 %	147668655
60	NC_009455	CAG	2	6	3943	3948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668656
61	NC_009455	GGC	2	6	3970	3975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668656
62	NC_009455	TCC	2	6	4026	4031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147668656
63	NC_009455	CAT	2	6	4125	4130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668656
64	NC_009455	AG	3	6	4170	4175	50 %	0 %	50 %	0 %	147668656
65	NC_009455	TAA	2	6	4206	4211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668656
66	NC_009455	GAA	2	6	4228	4233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668656
67	NC_009455	TGA	2	6	4356	4361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668656
68	NC_009455	TTC	2	6	4372	4377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668656
69	NC_009455	GCG	2	6	4453	4458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668656
70	NC_009455	ACC	2	6	4480	4485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668656
71	NC_009455	TC	4	8	4529	4536	0 %	50 %	0 %	50 %	147668656
72	NC_009455	CAGG	2	8	4557	4564	25 %	0 %	50 %	25 %	147668656
73	NC_009455	GCGG	2	8	4612	4619	0 %	0 %	75 %	25 %	147668656
74	NC_009455	GGC	2	6	4633	4638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668656
75	NC_009455	ATC	2	6	4669	4674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668656
76	NC_009455	TTC	2	6	4681	4686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668656
77	NC_009455	ACGT	2	8	4822	4829	25 %	25 %	25 %	25 %	147668656
78	NC_009455	CCG	2	6	4934	4939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668656
79	NC_009455	T	6	6	5032	5037	0 %	100 %	0 %	0 %	147668656
80	NC_009455	TA	3	6	5041	5046	50 %	50 %	0 %	0 %	147668656
81	NC_009455	ACC	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668656
82	NC_009455	TAA	2	6	5120	5125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668656
83	NC_009455	TCG	2	6	5147	5152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668656
84	NC_009455	AT	3	6	5156	5161	50 %	50 %	0 %	0 %	147668656
85	NC_009455	TTG	2	6	5174	5179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147668656
86	NC_009455	GTCA	2	8	5203	5210	25 %	25 %	25 %	25 %	147668656
87	NC_009455	GTG	2	6	5231	5236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668656
88	NC_009455	GTG	2	6	5267	5272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668656
89	NC_009455	CTT	2	6	5298	5303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668656
90	NC_009455	CCG	2	6	5426	5431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668656
91	NC_009455	GCC	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668656
92	NC_009455	GTA	2	6	5510	5515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668656
93	NC_009455	TTA	2	6	6042	6047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668657
94	NC_009455	GTG	2	6	6125	6130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668657
95	NC_009455	T	6	6	6174	6179	0 %	100 %	0 %	0 %	147668657
96	NC_009455	ACCC	2	8	6214	6221	25 %	0 %	0 %	75 %	147668657
97	NC_009455	TTC	2	6	6259	6264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668657
98	NC_009455	TC	3	6	6295	6300	0 %	50 %	0 %	50 %	147668657
99	NC_009455	TTC	2	6	6304	6309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668657
100	NC_009455	TAT	2	6	6376	6381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668657
101	NC_009455	GCA	2	6	6403	6408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668657
102	NC_009455	AGGT	2	8	6465	6472	25 %	25 %	50 %	0 %	147668657
103	NC_009455	TGG	2	6	6474	6479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668657
104	NC_009455	G	6	6	6487	6492	0 %	0 %	100 %	0 %	147668657
105	NC_009455	ACC	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668657
106	NC_009455	CTG	2	6	6514	6519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668657
107	NC_009455	GAG	2	6	6523	6528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147668657
108	NC_009455	TGA	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668657
109	NC_009455	GTTC	2	8	6698	6705	0 %	50 %	25 %	25 %	147668657
110	NC_009455	CTT	2	6	6709	6714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668657
111	NC_009455	TCTT	2	8	6800	6807	0 %	75 %	0 %	25 %	147668657
112	NC_009455	GGT	2	6	6808	6813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668657
113	NC_009455	ACC	2	6	6824	6829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668657
114	NC_009455	T	6	6	6836	6841	0 %	100 %	0 %	0 %	147668657
115	NC_009455	AAAGAC	2	12	6979	6990	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	147668657
116	NC_009455	TTC	2	6	7030	7035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668657
117	NC_009455	TCT	2	6	7106	7111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668657
118	NC_009455	CGG	2	6	7116	7121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668657
119	NC_009455	GGC	2	6	7138	7143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668657
120	NC_009455	CGG	2	6	7221	7226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668657
121	NC_009455	GTTTG	2	10	7246	7255	0 %	60 %	40 %	0 %	147668657
122	NC_009455	ATC	2	6	7270	7275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668657
123	NC_009455	GGC	2	6	7449	7454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668657
124	NC_009455	T	7	7	7478	7484	0 %	100 %	0 %	0 %	147668657
125	NC_009455	AT	3	6	7660	7665	50 %	50 %	0 %	0 %	147668657
126	NC_009455	GCG	2	6	7690	7695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668657
127	NC_009455	CCA	2	6	7785	7790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668657
128	NC_009455	GCC	2	6	7831	7836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668657
129	NC_009455	TCT	2	6	7850	7855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668657
130	NC_009455	T	6	6	7927	7932	0 %	100 %	0 %	0 %	147668657
131	NC_009455	GCG	2	6	8096	8101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668657
132	NC_009455	CCT	2	6	8115	8120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147668657
133	NC_009455	G	6	6	8141	8146	0 %	0 %	100 %	0 %	147668657
134	NC_009455	AGA	2	6	8338	8343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668658
135	NC_009455	GCA	2	6	8383	8388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668658
136	NC_009455	GCC	2	6	8390	8395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668658
137	NC_009455	GCC	2	6	8402	8407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668658
138	NC_009455	GCATG	2	10	8587	8596	20 %	20 %	40 %	20 %	147668658
139	NC_009455	TTA	2	6	8623	8628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668658
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141	NC_009455	CTG	2	6	8768	8773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668658
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143	NC_009455	TAC	2	6	8855	8860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668658
144	NC_009455	CTG	2	6	8924	8929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668658
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149	NC_009455	GA	3	6	9315	9320	50 %	0 %	50 %	0 %	147668658
150	NC_009455	GCTCA	2	10	9410	9419	20 %	20 %	20 %	40 %	147668658
151	NC_009455	GGT	2	6	9448	9453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668658
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155	NC_009455	GGCA	2	8	9516	9523	25 %	0 %	50 %	25 %	147668658
156	NC_009455	AAG	2	6	9557	9562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668658
157	NC_009455	A	6	6	9573	9578	100 %	0 %	0 %	0 %	147668659
158	NC_009455	CGG	2	6	9591	9596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668659
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162	NC_009455	AAG	2	6	9776	9781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668659
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232	NC_009455	AATA	2	8	13409	13416	75 %	25 %	0 %	0 %	147668662
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238	NC_009455	TAG	2	6	13684	13689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668663
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242	NC_009455	GGGGT	2	10	13768	13777	0 %	20 %	80 %	0 %	147668663
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249	NC_009455	AG	3	6	14331	14336	50 %	0 %	50 %	0 %	147668664
250	NC_009455	ATTT	2	8	14534	14541	25 %	75 %	0 %	0 %	147668664
251	NC_009455	TCGGG	2	10	14623	14632	0 %	20 %	60 %	20 %	147668664
252	NC_009455	TG	3	6	14701	14706	0 %	50 %	50 %	0 %	147668664
253	NC_009455	GAA	2	6	14851	14856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668665
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255	NC_009455	GTGAA	2	10	15195	15204	40 %	20 %	40 %	0 %	147668665
256	NC_009455	AAG	2	6	15266	15271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668665
257	NC_009455	ACTGGA	2	12	15277	15288	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	147668665
258	NC_009455	GCA	2	6	15294	15299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668665
259	NC_009455	GAA	2	6	15434	15439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668665
260	NC_009455	CTGAA	2	10	15468	15477	40 %	20 %	20 %	20 %	147668665
261	NC_009455	TTC	2	6	15520	15525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668665
262	NC_009455	TCTA	2	8	15606	15613	25 %	50 %	0 %	25 %	147668666
263	NC_009455	TTA	2	6	15674	15679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668666
264	NC_009455	AG	3	6	15696	15701	50 %	0 %	50 %	0 %	147668666
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391	NC_009455	A	6	6	23596	23601	100 %	0 %	0 %	0 %	147668675
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