MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalococcoides sp. BAV1 chromosome

Total Repeats: 21743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009455	ACC	2	6	227113	227118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668869
3502	NC_009455	AAG	2	6	227506	227511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668870
3503	NC_009455	GCATGG	2	12	227572	227583	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147668870
3504	NC_009455	TGA	2	6	227633	227638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668870
3505	NC_009455	TGAA	2	8	227674	227681	50 %	25 %	25 %	0 %	147668870
3506	NC_009455	AGA	2	6	227684	227689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668870
3507	NC_009455	GAAGCA	2	12	227715	227726	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	147668870
3508	NC_009455	AGA	2	6	227732	227737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668870
3509	NC_009455	CAGA	2	8	227902	227909	50 %	0 %	25 %	25 %	147668871
3510	NC_009455	TA	3	6	227989	227994	50 %	50 %	0 %	0 %	147668871
3511	NC_009455	GGC	2	6	228075	228080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668871
3512	NC_009455	ATG	2	6	228115	228120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668871
3513	NC_009455	CCG	2	6	228121	228126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668871
3514	NC_009455	TCT	2	6	228133	228138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668871
3515	NC_009455	TTA	2	6	228178	228183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668871
3516	NC_009455	TTA	2	6	228190	228195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668871
3517	NC_009455	CAC	2	6	228306	228311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668871
3518	NC_009455	GGC	2	6	228329	228334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668871
3519	NC_009455	GAA	2	6	228374	228379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668871
3520	NC_009455	ATT	2	6	228399	228404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668871
3521	NC_009455	GAAC	2	8	228518	228525	50 %	0 %	25 %	25 %	147668871
3522	NC_009455	TCT	2	6	228815	228820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668872
3523	NC_009455	CAT	2	6	228888	228893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668872
3524	NC_009455	CCAG	2	8	228998	229005	25 %	0 %	25 %	50 %	147668872
3525	NC_009455	CAG	2	6	229041	229046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668872
3526	NC_009455	GCC	2	6	229054	229059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668872
3527	NC_009455	ATG	2	6	229060	229065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668872
3528	NC_009455	G	6	6	229229	229234	0 %	0 %	100 %	0 %	147668872
3529	NC_009455	A	6	6	229261	229266	100 %	0 %	0 %	0 %	147668872
3530	NC_009455	ATTT	2	8	229312	229319	25 %	75 %	0 %	0 %	147668872
3531	NC_009455	AT	3	6	229434	229439	50 %	50 %	0 %	0 %	147668873
3532	NC_009455	TGG	2	6	229459	229464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668873
3533	NC_009455	TCT	2	6	229489	229494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668873
3534	NC_009455	T	6	6	229515	229520	0 %	100 %	0 %	0 %	147668873
3535	NC_009455	GCC	2	6	229551	229556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668873
3536	NC_009455	ACC	2	6	229557	229562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668873
3537	NC_009455	CCG	2	6	229570	229575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668873
3538	NC_009455	GCTACC	2	12	229663	229674	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	147668873
3539	NC_009455	TTC	2	6	229872	229877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668873
3540	NC_009455	TCAT	2	8	229969	229976	25 %	50 %	0 %	25 %	147668873
3541	NC_009455	CTT	2	6	229998	230003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668873
3542	NC_009455	TGCC	2	8	230051	230058	0 %	25 %	25 %	50 %	147668873
3543	NC_009455	ATA	2	6	230067	230072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668873
3544	NC_009455	CTG	2	6	230097	230102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668873
3545	NC_009455	G	6	6	230102	230107	0 %	0 %	100 %	0 %	147668873
3546	NC_009455	GGA	2	6	230115	230120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147668873
3547	NC_009455	ATA	2	6	230142	230147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668873
3548	NC_009455	GCA	2	6	230175	230180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668873
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3550	NC_009455	CCA	2	6	230222	230227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668873
3551	NC_009455	GGTCA	2	10	230250	230259	20 %	20 %	40 %	20 %	147668873
3552	NC_009455	GGCA	2	8	230340	230347	25 %	0 %	50 %	25 %	147668873
3553	NC_009455	AAC	2	6	230394	230399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668873
3554	NC_009455	GCC	2	6	230425	230430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668873
3555	NC_009455	CCG	2	6	230444	230449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668873
3556	NC_009455	CACC	2	8	230465	230472	25 %	0 %	0 %	75 %	147668873
3557	NC_009455	CCA	2	6	230543	230548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668873
3558	NC_009455	TTTA	2	8	230562	230569	25 %	75 %	0 %	0 %	147668873
3559	NC_009455	TAT	2	6	230669	230674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668873
3560	NC_009455	TTC	2	6	230700	230705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668873
3561	NC_009455	CAG	2	6	230802	230807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668873
3562	NC_009455	GCG	2	6	230832	230837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668873
3563	NC_009455	GATATT	2	12	230985	230996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	147668873
3564	NC_009455	GGC	2	6	231006	231011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668873
3565	NC_009455	TCC	2	6	231081	231086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147668874
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3567	NC_009455	CGG	2	6	231270	231275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668874
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3569	NC_009455	AAG	2	6	231321	231326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668874
3570	NC_009455	C	8	8	231507	231514	0 %	0 %	0 %	100 %	147668874
3571	NC_009455	CAAG	2	8	231520	231527	50 %	0 %	25 %	25 %	147668874
3572	NC_009455	AGA	2	6	231592	231597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668874
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3574	NC_009455	TTG	2	6	231690	231695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147668874
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3579	NC_009455	GCC	2	6	232143	232148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668874
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3582	NC_009455	GCC	2	6	232235	232240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668874
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3588	NC_009455	AAT	2	6	232652	232657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668875
3589	NC_009455	GA	4	8	232716	232723	50 %	0 %	50 %	0 %	147668875
3590	NC_009455	TTTC	2	8	232763	232770	0 %	75 %	0 %	25 %	147668875
3591	NC_009455	CAG	2	6	233257	233262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668876
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3593	NC_009455	TTA	2	6	233400	233405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668876
3594	NC_009455	CTTC	2	8	233475	233482	0 %	50 %	0 %	50 %	147668876
3595	NC_009455	GGA	2	6	233512	233517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147668876
3596	NC_009455	AG	3	6	233557	233562	50 %	0 %	50 %	0 %	147668876
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3599	NC_009455	CGGC	2	8	233594	233601	0 %	0 %	50 %	50 %	147668876
3600	NC_009455	TGA	2	6	233654	233659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668877
3601	NC_009455	CT	3	6	233698	233703	0 %	50 %	0 %	50 %	147668877
3602	NC_009455	AT	3	6	233707	233712	50 %	50 %	0 %	0 %	147668877
3603	NC_009455	TCGTCA	2	12	233847	233858	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	147668877
3604	NC_009455	CCA	2	6	233956	233961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668877
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3606	NC_009455	TAT	2	6	234068	234073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668877
3607	NC_009455	T	6	6	234121	234126	0 %	100 %	0 %	0 %	147668877
3608	NC_009455	TCT	3	9	234162	234170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668877
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3611	NC_009455	CAG	2	6	234419	234424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668878
3612	NC_009455	CCAGT	2	10	234429	234438	20 %	20 %	20 %	40 %	147668878
3613	NC_009455	GCGG	2	8	234446	234453	0 %	0 %	75 %	25 %	147668878
3614	NC_009455	CTG	2	6	234455	234460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668878
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3617	NC_009455	TTC	2	6	234515	234520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668878
3618	NC_009455	CATC	2	8	234562	234569	25 %	25 %	0 %	50 %	147668878
3619	NC_009455	TGC	3	9	234618	234626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668878
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