MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalococcoides sp. BAV1 chromosome

Total Repeats: 21743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009455	TTTG	2	8	189811	189818	0 %	75 %	25 %	0 %	147668834
3002	NC_009455	TTCT	2	8	189884	189891	0 %	75 %	0 %	25 %	147668834
3003	NC_009455	ATA	2	6	190002	190007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668834
3004	NC_009455	TAT	2	6	190020	190025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668834
3005	NC_009455	TCA	2	6	190124	190129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668834
3006	NC_009455	ATG	2	6	190130	190135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668834
3007	NC_009455	GAAC	2	8	190157	190164	50 %	0 %	25 %	25 %	147668834
3008	NC_009455	TTC	2	6	190178	190183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668834
3009	NC_009455	TCT	2	6	190232	190237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668834
3010	NC_009455	TCC	2	6	190245	190250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147668834
3011	NC_009455	GCA	2	6	190259	190264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668834
3012	NC_009455	GAT	2	6	190297	190302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668834
3013	NC_009455	AAT	2	6	190339	190344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668834
3014	NC_009455	ACA	2	6	190361	190366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668834
3015	NC_009455	T	6	6	190453	190458	0 %	100 %	0 %	0 %	147668834
3016	NC_009455	GCTTT	2	10	190477	190486	0 %	60 %	20 %	20 %	147668834
3017	NC_009455	TA	3	6	190510	190515	50 %	50 %	0 %	0 %	147668834
3018	NC_009455	TAG	2	6	190561	190566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668834
3019	NC_009455	T	7	7	190569	190575	0 %	100 %	0 %	0 %	147668834
3020	NC_009455	AAG	2	6	190579	190584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668834
3021	NC_009455	ATCT	2	8	190593	190600	25 %	50 %	0 %	25 %	147668834
3022	NC_009455	CTT	2	6	190632	190637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668834
3023	NC_009455	TCA	2	6	190646	190651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668834
3024	NC_009455	CTT	2	6	190665	190670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668834
3025	NC_009455	ATTC	2	8	190701	190708	25 %	50 %	0 %	25 %	147668834
3026	NC_009455	TGA	2	6	190709	190714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668834
3027	NC_009455	TGC	3	9	190737	190745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668834
3028	NC_009455	GAA	2	6	190753	190758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668834
3029	NC_009455	CTTT	2	8	190761	190768	0 %	75 %	0 %	25 %	147668834
3030	NC_009455	AT	3	6	190799	190804	50 %	50 %	0 %	0 %	147668834
3031	NC_009455	AAG	2	6	190868	190873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668834
3032	NC_009455	GTA	2	6	190982	190987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668834
3033	NC_009455	CGA	2	6	191034	191039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668834
3034	NC_009455	ATT	2	6	191062	191067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668834
3035	NC_009455	A	6	6	191108	191113	100 %	0 %	0 %	0 %	147668834
3036	NC_009455	CGA	2	6	191115	191120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668834
3037	NC_009455	TG	3	6	191139	191144	0 %	50 %	50 %	0 %	147668834
3038	NC_009455	TTA	2	6	191177	191182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668834
3039	NC_009455	TAA	2	6	191193	191198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668834
3040	NC_009455	TTC	2	6	191598	191603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668835
3041	NC_009455	GCTG	2	8	191619	191626	0 %	25 %	50 %	25 %	147668835
3042	NC_009455	TC	3	6	191634	191639	0 %	50 %	0 %	50 %	147668835
3043	NC_009455	CCT	2	6	191647	191652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147668835
3044	NC_009455	CTT	2	6	191653	191658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668835
3045	NC_009455	TTC	2	6	191979	191984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668835
3046	NC_009455	GAT	2	6	192026	192031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668835
3047	NC_009455	TACC	2	8	192046	192053	25 %	25 %	0 %	50 %	147668835
3048	NC_009455	ATC	2	6	192063	192068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668835
3049	NC_009455	GTG	2	6	192155	192160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668836
3050	NC_009455	T	6	6	192447	192452	0 %	100 %	0 %	0 %	147668836
3051	NC_009455	GCAG	2	8	192524	192531	25 %	0 %	50 %	25 %	147668837
3052	NC_009455	AGT	2	6	192533	192538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668837
3053	NC_009455	GCT	2	6	192661	192666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668837
3054	NC_009455	CCATT	2	10	192735	192744	20 %	40 %	0 %	40 %	147668837
3055	NC_009455	CCG	2	6	192787	192792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668837
3056	NC_009455	CGT	2	6	192794	192799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668837
3057	NC_009455	CGC	2	6	192868	192873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668837
3058	NC_009455	GGC	2	6	192894	192899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668837
3059	NC_009455	GTA	2	6	192919	192924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668837
3060	NC_009455	GCTTC	2	10	194002	194011	0 %	40 %	20 %	40 %	147668838
3061	NC_009455	CGG	2	6	194118	194123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668838
3062	NC_009455	CGG	2	6	194148	194153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668838
3063	NC_009455	CGG	2	6	194346	194351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668838
3064	NC_009455	ATC	2	6	194371	194376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668838
3065	NC_009455	TTGCCG	2	12	194396	194407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668838
3066	NC_009455	TGAG	2	8	194451	194458	25 %	25 %	50 %	0 %	147668838
3067	NC_009455	CACCCT	2	12	194635	194646	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	147668838
3068	NC_009455	TCA	2	6	194711	194716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668838
3069	NC_009455	ACC	2	6	194996	195001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668838
3070	NC_009455	TAA	2	6	195385	195390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668839
3071	NC_009455	GTC	2	6	195405	195410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668839
3072	NC_009455	T	6	6	195436	195441	0 %	100 %	0 %	0 %	147668839
3073	NC_009455	AAG	2	6	195502	195507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668839
3074	NC_009455	ATC	2	6	195550	195555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668839
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3077	NC_009455	ATAGG	2	10	195934	195943	40 %	20 %	40 %	0 %	147668839
3078	NC_009455	GTC	2	6	195949	195954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668839
3079	NC_009455	TAA	2	6	196349	196354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668840
3080	NC_009455	GCT	2	6	196402	196407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668840
3081	NC_009455	CTA	2	6	196445	196450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668840
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3083	NC_009455	GTCTT	2	10	196579	196588	0 %	60 %	20 %	20 %	147668840
3084	NC_009455	CTG	2	6	196627	196632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668840
3085	NC_009455	CA	3	6	196641	196646	50 %	0 %	0 %	50 %	147668840
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3088	NC_009455	CCG	3	9	196873	196881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668840
3089	NC_009455	GCC	2	6	196944	196949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668840
3090	NC_009455	TGGA	2	8	197003	197010	25 %	25 %	50 %	0 %	147668840
3091	NC_009455	CCT	2	6	197028	197033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147668840
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3093	NC_009455	CTTT	2	8	197093	197100	0 %	75 %	0 %	25 %	147668840
3094	NC_009455	G	6	6	197150	197155	0 %	0 %	100 %	0 %	147668840
3095	NC_009455	GA	3	6	197160	197165	50 %	0 %	50 %	0 %	147668840
3096	NC_009455	TTC	2	6	197176	197181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668840
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3102	NC_009455	TTTC	2	8	197673	197680	0 %	75 %	0 %	25 %	147668841
3103	NC_009455	ATT	2	6	197805	197810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668841
3104	NC_009455	GA	3	6	197887	197892	50 %	0 %	50 %	0 %	147668841
3105	NC_009455	CCA	2	6	197918	197923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668841
3106	NC_009455	TTG	2	6	197935	197940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147668841
3107	NC_009455	CGA	2	6	197960	197965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668841
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3109	NC_009455	ACT	2	6	198178	198183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668841
3110	NC_009455	GA	3	6	198236	198241	50 %	0 %	50 %	0 %	147668841
3111	NC_009455	AAG	2	6	198462	198467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668841
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3115	NC_009455	GGC	2	6	198795	198800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668841
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3118	NC_009455	GAA	2	6	198948	198953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668841
3119	NC_009455	CGT	2	6	199004	199009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668841
3120	NC_009455	ATG	2	6	199030	199035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668841
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3122	NC_009455	GAT	2	6	199227	199232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668841
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3241	NC_009455	CCA	2	6	208999	209004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668850
3242	NC_009455	ACCG	2	8	209021	209028	25 %	0 %	25 %	50 %	147668850
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3359	NC_009455	GAC	2	6	218418	218423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668861
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3488	NC_009455	ACT	2	6	226266	226271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668868
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