MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalococcoides sp. BAV1 chromosome

Total Repeats: 21743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009455	GCC	2	6	159337	159342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668810
2502	NC_009455	CGG	2	6	159383	159388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668810
2503	NC_009455	AC	3	6	159413	159418	50 %	0 %	0 %	50 %	147668810
2504	NC_009455	TGCT	2	8	159437	159444	0 %	50 %	25 %	25 %	147668810
2505	NC_009455	C	6	6	159452	159457	0 %	0 %	0 %	100 %	147668810
2506	NC_009455	GAA	2	6	159532	159537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668810
2507	NC_009455	ATT	2	6	159565	159570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668810
2508	NC_009455	GCCG	2	8	159606	159613	0 %	0 %	50 %	50 %	147668810
2509	NC_009455	CTG	2	6	159673	159678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668810
2510	NC_009455	TA	3	6	159699	159704	50 %	50 %	0 %	0 %	147668810
2511	NC_009455	CGG	2	6	159760	159765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668811
2512	NC_009455	A	7	7	159804	159810	100 %	0 %	0 %	0 %	147668811
2513	NC_009455	GCCC	2	8	159816	159823	0 %	0 %	25 %	75 %	147668811
2514	NC_009455	TACC	2	8	159862	159869	25 %	25 %	0 %	50 %	147668811
2515	NC_009455	ACC	2	6	159893	159898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668811
2516	NC_009455	CTG	2	6	159938	159943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668811
2517	NC_009455	ATT	2	6	160022	160027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668811
2518	NC_009455	GCG	2	6	160053	160058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668811
2519	NC_009455	GGT	2	6	160075	160080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668811
2520	NC_009455	GGCATG	2	12	160112	160123	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	147668811
2521	NC_009455	CTGCC	2	10	160134	160143	0 %	20 %	20 %	60 %	147668811
2522	NC_009455	AT	3	6	160205	160210	50 %	50 %	0 %	0 %	147668811
2523	NC_009455	TTTC	2	8	160270	160277	0 %	75 %	0 %	25 %	147668811
2524	NC_009455	GAA	2	6	160328	160333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668811
2525	NC_009455	CGG	2	6	160432	160437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668811
2526	NC_009455	TAC	2	6	160438	160443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668811
2527	NC_009455	GAA	2	6	160466	160471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668811
2528	NC_009455	GCC	2	6	160508	160513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668811
2529	NC_009455	TGG	2	6	160731	160736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147668812
2530	NC_009455	ATA	2	6	160742	160747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668812
2531	NC_009455	GGCC	2	8	160759	160766	0 %	0 %	50 %	50 %	147668812
2532	NC_009455	CTG	2	6	160838	160843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668812
2533	NC_009455	TGA	2	6	160848	160853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668812
2534	NC_009455	ACC	2	6	160868	160873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668812
2535	NC_009455	GCT	2	6	160885	160890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668812
2536	NC_009455	GCC	2	6	160979	160984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668812
2537	NC_009455	CGGTT	2	10	161017	161026	0 %	40 %	40 %	20 %	147668812
2538	NC_009455	CTT	2	6	161054	161059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668812
2539	NC_009455	TGA	2	6	161092	161097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668812
2540	NC_009455	TTACTT	2	12	161233	161244	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	147668813
2541	NC_009455	CA	3	6	161314	161319	50 %	0 %	0 %	50 %	147668813
2542	NC_009455	AAT	2	6	161395	161400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668813
2543	NC_009455	AGAC	2	8	161584	161591	50 %	0 %	25 %	25 %	147668814
2544	NC_009455	T	6	6	161601	161606	0 %	100 %	0 %	0 %	147668814
2545	NC_009455	GGTACT	2	12	161689	161700	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	147668814
2546	NC_009455	CAA	2	6	161718	161723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668814
2547	NC_009455	CGG	2	6	161745	161750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668814
2548	NC_009455	CATTTC	2	12	161762	161773	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	147668814
2549	NC_009455	TGA	2	6	161902	161907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668814
2550	NC_009455	CGG	2	6	161920	161925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668814
2551	NC_009455	AAT	2	6	161966	161971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668814
2552	NC_009455	TA	3	6	162079	162084	50 %	50 %	0 %	0 %	147668815
2553	NC_009455	CTG	2	6	162237	162242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668815
2554	NC_009455	TACGG	2	10	162245	162254	20 %	20 %	40 %	20 %	147668815
2555	NC_009455	AAG	2	6	162289	162294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668815
2556	NC_009455	TAT	2	6	162369	162374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147668815
2557	NC_009455	CAA	2	6	162379	162384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668815
2558	NC_009455	CAA	2	6	162398	162403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668815
2559	NC_009455	AATA	2	8	162461	162468	75 %	25 %	0 %	0 %	147668815
2560	NC_009455	CAT	2	6	162513	162518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668815
2561	NC_009455	GAT	2	6	162570	162575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668815
2562	NC_009455	AAT	2	6	162600	162605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668815
2563	NC_009455	TGA	2	6	162988	162993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668816
2564	NC_009455	TAG	2	6	163004	163009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668816
2565	NC_009455	ACC	3	9	163134	163142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147668816
2566	NC_009455	CGGC	2	8	163192	163199	0 %	0 %	50 %	50 %	147668816
2567	NC_009455	AAT	2	6	163287	163292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668816
2568	NC_009455	CGC	2	6	163322	163327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668816
2569	NC_009455	GAA	2	6	163344	163349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668816
2570	NC_009455	TGC	2	6	163427	163432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668816
2571	NC_009455	GAA	2	6	163494	163499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668816
2572	NC_009455	TCT	2	6	163505	163510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668816
2573	NC_009455	GCCAG	2	10	163552	163561	20 %	0 %	40 %	40 %	147668816
2574	NC_009455	TTCG	2	8	163598	163605	0 %	50 %	25 %	25 %	147668816
2575	NC_009455	CCTG	2	8	163692	163699	0 %	25 %	25 %	50 %	147668816
2576	NC_009455	GCC	2	6	163756	163761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668816
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2579	NC_009455	CGG	2	6	163829	163834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668816
2580	NC_009455	GTA	2	6	163923	163928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668816
2581	NC_009455	ACA	2	6	163978	163983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668816
2582	NC_009455	GCCA	2	8	163986	163993	25 %	0 %	25 %	50 %	147668816
2583	NC_009455	GAA	2	6	164093	164098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668816
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2587	NC_009455	TGC	2	6	164360	164365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668816
2588	NC_009455	TTAT	2	8	164399	164406	25 %	75 %	0 %	0 %	147668816
2589	NC_009455	GCC	2	6	164436	164441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668816
2590	NC_009455	CAGC	2	8	164470	164477	25 %	0 %	25 %	50 %	147668816
2591	NC_009455	CGGCTT	3	18	164519	164536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668816
2592	NC_009455	ATA	3	9	164551	164559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668816
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2594	NC_009455	TGC	3	9	164651	164659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668816
2595	NC_009455	ACTGG	2	10	164687	164696	20 %	20 %	40 %	20 %	147668816
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2598	NC_009455	CTG	2	6	164778	164783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668816
2599	NC_009455	AAG	2	6	164806	164811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147668816
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2602	NC_009455	AAC	2	6	165222	165227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147668816
2603	NC_009455	GCG	2	6	165346	165351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668816
2604	NC_009455	GCC	2	6	165396	165401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668816
2605	NC_009455	AAT	2	6	165477	165482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147668816
2606	NC_009455	GGC	2	6	165576	165581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668816
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2608	NC_009455	GGC	2	6	165762	165767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147668816
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2610	NC_009455	AGC	2	6	165914	165919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668816
2611	NC_009455	GTACC	2	10	165925	165934	20 %	20 %	20 %	40 %	147668816
2612	NC_009455	ACT	2	6	166139	166144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668817
2613	NC_009455	GCC	2	6	166179	166184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147668817
2614	NC_009455	AT	3	6	166271	166276	50 %	50 %	0 %	0 %	147668817
2615	NC_009455	GCT	2	6	166284	166289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147668817
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2617	NC_009455	GGCC	2	8	166354	166361	0 %	0 %	50 %	50 %	147668817
2618	NC_009455	CAT	2	6	166469	166474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147668817
2619	NC_009455	ATG	2	6	166497	166502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147668817
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2621	NC_009455	GCA	2	6	166577	166582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147668817
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2990	NC_009455	CTT	2	6	189076	189081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668834
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2993	NC_009455	TCT	2	6	189300	189305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147668834
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