MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalococcoides sp. BAV1 chromosome

Total Repeats: 21743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_009455	CTG	2	6	1140179	1140184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147669803
18503	NC_009455	T	6	6	1140229	1140234	0 %	100 %	0 %	0 %	147669803
18504	NC_009455	CTG	2	6	1140311	1140316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147669803
18505	NC_009455	CTC	2	6	1140468	1140473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147669803
18506	NC_009455	AGG	2	6	1140505	1140510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147669803
18507	NC_009455	AGT	2	6	1140520	1140525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147669803
18508	NC_009455	AAG	2	6	1140572	1140577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147669803
18509	NC_009455	GGTA	2	8	1140616	1140623	25 %	25 %	50 %	0 %	147669803
18510	NC_009455	TGC	3	9	1140630	1140638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147669803
18511	NC_009455	CTT	2	6	1140736	1140741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147669803
18512	NC_009455	ATA	2	6	1140776	1140781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147669803
18513	NC_009455	GCA	2	6	1140971	1140976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147669803
18514	NC_009455	AAC	2	6	1140977	1140982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147669803
18515	NC_009455	ATG	2	6	1141079	1141084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147669803
18516	NC_009455	GAC	2	6	1141124	1141129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147669803
18517	NC_009455	GTA	2	6	1141232	1141237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147669803
18518	NC_009455	GAA	2	6	1141314	1141319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147669804
18519	NC_009455	GCT	2	6	1141321	1141326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147669804
18520	NC_009455	ACT	2	6	1141454	1141459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147669804
18521	NC_009455	AGC	2	6	1141488	1141493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147669804
18522	NC_009455	AGA	2	6	1141680	1141685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147669804
18523	NC_009455	TGG	2	6	1141811	1141816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147669805
18524	NC_009455	GTT	2	6	1141881	1141886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147669805
18525	NC_009455	ACTTAT	2	12	1142086	1142097	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	147669805
18526	NC_009455	AT	3	6	1142175	1142180	50 %	50 %	0 %	0 %	147669805
18527	NC_009455	ATAACC	2	12	1142245	1142256	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	147669805
18528	NC_009455	AGC	2	6	1142305	1142310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147669805
18529	NC_009455	TAA	2	6	1142357	1142362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147669806
18530	NC_009455	CAG	2	6	1142386	1142391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147669806
18531	NC_009455	TGA	2	6	1142453	1142458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147669806
18532	NC_009455	TAC	2	6	1142487	1142492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147669806
18533	NC_009455	GGT	2	6	1142587	1142592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147669806
18534	NC_009455	TACC	2	8	1142685	1142692	25 %	25 %	0 %	50 %	147669806
18535	NC_009455	AAC	2	6	1142761	1142766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147669806
18536	NC_009455	GGC	2	6	1142821	1142826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147669806
18537	NC_009455	ATG	2	6	1142876	1142881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147669806
18538	NC_009455	TAT	2	6	1142917	1142922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147669806
18539	NC_009455	TAC	2	6	1142928	1142933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147669806
18540	NC_009455	AT	3	6	1143053	1143058	50 %	50 %	0 %	0 %	147669806
18541	NC_009455	TA	3	6	1143126	1143131	50 %	50 %	0 %	0 %	147669806
18542	NC_009455	CAT	2	6	1143207	1143212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147669806
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18544	NC_009455	TGA	2	6	1143390	1143395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147669806
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18547	NC_009455	A	6	6	1143600	1143605	100 %	0 %	0 %	0 %	147669807
18548	NC_009455	TAT	2	6	1143669	1143674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147669807
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18550	NC_009455	TGCTGA	2	12	1143686	1143697	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	147669807
18551	NC_009455	ACC	2	6	1143721	1143726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147669807
18552	NC_009455	TA	3	6	1143747	1143752	50 %	50 %	0 %	0 %	147669807
18553	NC_009455	CGG	2	6	1143798	1143803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147669807
18554	NC_009455	CAGTA	2	10	1143891	1143900	40 %	20 %	20 %	20 %	147669807
18555	NC_009455	TTA	2	6	1143933	1143938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147669807
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18557	NC_009455	CAC	2	6	1143978	1143983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147669807
18558	NC_009455	CT	3	6	1144041	1144046	0 %	50 %	0 %	50 %	147669807
18559	NC_009455	CGG	2	6	1144125	1144130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147669807
18560	NC_009455	TGA	2	6	1144179	1144184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147669807
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18565	NC_009455	TAT	2	6	1144441	1144446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147669807
18566	NC_009455	CTG	2	6	1144448	1144453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147669807
18567	NC_009455	TA	4	8	1144514	1144521	50 %	50 %	0 %	0 %	147669807
18568	NC_009455	ATC	2	6	1144615	1144620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147669807
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18577	NC_009455	GGT	3	9	1145137	1145145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147669807
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18583	NC_009455	G	6	6	1145609	1145614	0 %	0 %	100 %	0 %	147669808
18584	NC_009455	GACCT	2	10	1145692	1145701	20 %	20 %	20 %	40 %	147669808
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18587	NC_009455	ACG	2	6	1145799	1145804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147669809
18588	NC_009455	AGA	2	6	1145813	1145818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147669809
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18590	NC_009455	GGC	2	6	1145987	1145992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147669809
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18592	NC_009455	TGCC	2	8	1146031	1146038	0 %	25 %	25 %	50 %	147669809
18593	NC_009455	TAC	2	6	1146185	1146190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147669809
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18602	NC_009455	ATGCC	2	10	1146694	1146703	20 %	20 %	20 %	40 %	147669809
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18613	NC_009455	A	6	6	1147297	1147302	100 %	0 %	0 %	0 %	147669810
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18966	NC_009455	ATC	2	6	1169984	1169989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147669834
18967	NC_009455	GAGC	2	8	1170011	1170018	25 %	0 %	50 %	25 %	147669834
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18969	NC_009455	CAGG	2	8	1170157	1170164	25 %	0 %	50 %	25 %	147669834
18970	NC_009455	CAG	2	6	1170194	1170199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147669834
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18975	NC_009455	CCAA	2	8	1170471	1170478	50 %	0 %	0 %	50 %	147669834
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18981	NC_009455	A	7	7	1170880	1170886	100 %	0 %	0 %	0 %	147669835
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18985	NC_009455	CATAAA	2	12	1171073	1171084	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	147669835
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18989	NC_009455	GCTT	2	8	1171548	1171555	0 %	50 %	25 %	25 %	147669836
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18992	NC_009455	TATT	2	8	1171674	1171681	25 %	75 %	0 %	0 %	147669836
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18994	NC_009455	TCT	2	6	1171719	1171724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147669836
18995	NC_009455	T	6	6	1171724	1171729	0 %	100 %	0 %	0 %	147669836
18996	NC_009455	GCTG	2	8	1171750	1171757	0 %	25 %	50 %	25 %	147669836
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18999	NC_009455	GAT	2	6	1172246	1172251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147669837
19000	NC_009455	ACTG	2	8	1172296	1172303	25 %	25 %	25 %	25 %	147669837

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