MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio alaskensis G20 chromosome

Total Repeats: 72442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007519	AGC	3	9	29523	29531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355084
502	NC_007519	GTC	2	6	29609	29614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355084
503	NC_007519	TGCC	2	8	29638	29645	0 %	25 %	25 %	50 %	78355084
504	NC_007519	CTG	2	6	29655	29660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355084
505	NC_007519	GTG	2	6	29688	29693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355084
506	NC_007519	CAA	2	6	29704	29709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355084
507	NC_007519	ATT	2	6	29718	29723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78355084
508	NC_007519	AGGC	3	12	29731	29742	25 %	0 %	50 %	25 %	78355084
509	NC_007519	T	6	6	29829	29834	0 %	100 %	0 %	0 %	78355084
510	NC_007519	TCCG	2	8	29867	29874	0 %	25 %	25 %	50 %	78355084
511	NC_007519	GCC	2	6	29934	29939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355084
512	NC_007519	GACC	2	8	29980	29987	25 %	0 %	25 %	50 %	78355084
513	NC_007519	GCC	2	6	30053	30058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355084
514	NC_007519	CAC	2	6	30170	30175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355084
515	NC_007519	GT	3	6	30183	30188	0 %	50 %	50 %	0 %	78355084
516	NC_007519	TGGCA	2	10	30218	30227	20 %	20 %	40 %	20 %	78355084
517	NC_007519	GGCAT	2	10	30646	30655	20 %	20 %	40 %	20 %	78355085
518	NC_007519	G	6	6	30707	30712	0 %	0 %	100 %	0 %	78355085
519	NC_007519	CTG	2	6	30730	30735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355085
520	NC_007519	G	6	6	30806	30811	0 %	0 %	100 %	0 %	78355085
521	NC_007519	TCG	2	6	30820	30825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355085
522	NC_007519	GCG	2	6	30835	30840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355085
523	NC_007519	CG	3	6	30872	30877	0 %	0 %	50 %	50 %	78355085
524	NC_007519	GCA	2	6	30905	30910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355085
525	NC_007519	CGC	2	6	30914	30919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355085
526	NC_007519	GTC	2	6	30945	30950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355085
527	NC_007519	GGC	2	6	31021	31026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355085
528	NC_007519	G	6	6	31035	31040	0 %	0 %	100 %	0 %	78355085
529	NC_007519	TGC	2	6	31043	31048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355085
530	NC_007519	GCG	2	6	31061	31066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355085
531	NC_007519	GCCC	2	8	31132	31139	0 %	0 %	25 %	75 %	78355085
532	NC_007519	T	6	6	31187	31192	0 %	100 %	0 %	0 %	78355085
533	NC_007519	GC	3	6	31195	31200	0 %	0 %	50 %	50 %	78355085
534	NC_007519	GCC	2	6	31208	31213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355085
535	NC_007519	GCG	2	6	31252	31257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355085
536	NC_007519	GCA	2	6	31288	31293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355085
537	NC_007519	GGC	2	6	31323	31328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355085
538	NC_007519	CTG	2	6	31332	31337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355085
539	NC_007519	CCTGC	2	10	31344	31353	0 %	20 %	20 %	60 %	78355085
540	NC_007519	CAT	2	6	31373	31378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355085
541	NC_007519	TCC	2	6	31462	31467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78355086
542	NC_007519	TTC	2	6	31499	31504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78355086
543	NC_007519	TGG	2	6	31540	31545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355086
544	NC_007519	T	6	6	31757	31762	0 %	100 %	0 %	0 %	78355086
545	NC_007519	GCT	2	6	31848	31853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355086
546	NC_007519	CTG	2	6	32063	32068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355086
547	NC_007519	CCTGC	2	10	32135	32144	0 %	20 %	20 %	60 %	78355086
548	NC_007519	GTC	2	6	32315	32320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355086
549	NC_007519	GCC	2	6	32352	32357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355086
550	NC_007519	GGCA	2	8	32383	32390	25 %	0 %	50 %	25 %	78355086
551	NC_007519	TA	3	6	32443	32448	50 %	50 %	0 %	0 %	78355086
552	NC_007519	GCG	2	6	32479	32484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355086
553	NC_007519	TGA	2	6	32485	32490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78355086
554	NC_007519	GCA	2	6	32551	32556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355086
555	NC_007519	GGC	2	6	32573	32578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355086
556	NC_007519	CTT	3	9	32676	32684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78355087
557	NC_007519	CGG	2	6	32756	32761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355087
558	NC_007519	G	6	6	32760	32765	0 %	0 %	100 %	0 %	78355087
559	NC_007519	TGG	2	6	32790	32795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355087
560	NC_007519	TGA	2	6	32811	32816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78355087
561	NC_007519	AGC	3	9	32843	32851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355087
562	NC_007519	TGA	2	6	32862	32867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78355087
563	NC_007519	CAA	2	6	33024	33029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355087
564	NC_007519	GTA	2	6	33043	33048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78355087
565	NC_007519	CTT	2	6	33063	33068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78355087
566	NC_007519	GCC	2	6	33073	33078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355087
567	NC_007519	GGT	2	6	33097	33102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355087
568	NC_007519	CCA	2	6	33117	33122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355087
569	NC_007519	CA	3	6	33121	33126	50 %	0 %	0 %	50 %	78355087
570	NC_007519	AAG	3	9	33130	33138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355087
571	NC_007519	TTC	2	6	33155	33160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78355087
572	NC_007519	CGC	2	6	33501	33506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355089
573	NC_007519	CAG	2	6	33524	33529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355089
574	NC_007519	CCG	2	6	33535	33540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355089
575	NC_007519	GAC	2	6	33543	33548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355089
576	NC_007519	CT	3	6	33551	33556	0 %	50 %	0 %	50 %	78355089
577	NC_007519	GAA	2	6	33582	33587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355089
578	NC_007519	GCA	2	6	33596	33601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355089
579	NC_007519	CCG	2	6	33603	33608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355089
580	NC_007519	AC	3	6	33661	33666	50 %	0 %	0 %	50 %	78355089
581	NC_007519	CTT	2	6	33670	33675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78355089
582	NC_007519	CTG	2	6	33711	33716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355089
583	NC_007519	CAA	2	6	33722	33727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355089
584	NC_007519	CG	3	6	33730	33735	0 %	0 %	50 %	50 %	78355089
585	NC_007519	TGC	2	6	33736	33741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355089
586	NC_007519	CG	3	6	33743	33748	0 %	0 %	50 %	50 %	78355089
587	NC_007519	CGG	2	6	33770	33775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355089
588	NC_007519	CTG	2	6	33789	33794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355089
589	NC_007519	CCGCTG	2	12	33801	33812	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	78355089
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591	NC_007519	TGC	2	6	33931	33936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355089
592	NC_007519	CAG	2	6	34064	34069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355089
593	NC_007519	CAG	2	6	34085	34090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355089
594	NC_007519	GGC	2	6	34112	34117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355089
595	NC_007519	CGT	2	6	34156	34161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355089
596	NC_007519	GCCG	2	8	34324	34331	0 %	0 %	50 %	50 %	78355089
597	NC_007519	CAC	2	6	34346	34351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355089
598	NC_007519	GGAC	2	8	34414	34421	25 %	0 %	50 %	25 %	78355089
599	NC_007519	TATC	2	8	34427	34434	25 %	50 %	0 %	25 %	78355089
600	NC_007519	CAT	2	6	34463	34468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355089
601	NC_007519	ATG	2	6	34503	34508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78355089
602	NC_007519	A	6	6	34531	34536	100 %	0 %	0 %	0 %	78355089
603	NC_007519	CTG	2	6	34806	34811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355090
604	NC_007519	CAC	2	6	34814	34819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355090
605	NC_007519	ATC	2	6	34836	34841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355090
606	NC_007519	GC	3	6	34930	34935	0 %	0 %	50 %	50 %	78355090
607	NC_007519	TCA	2	6	35039	35044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355091
608	NC_007519	GCTG	2	8	35073	35080	0 %	25 %	50 %	25 %	78355091
609	NC_007519	CGC	2	6	35114	35119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355091
610	NC_007519	CAT	2	6	35151	35156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355091
611	NC_007519	GCAG	2	8	35178	35185	25 %	0 %	50 %	25 %	78355091
612	NC_007519	TGC	2	6	35210	35215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355091
613	NC_007519	CGGC	2	8	35228	35235	0 %	0 %	50 %	50 %	78355091
614	NC_007519	CGG	2	6	35343	35348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355091
615	NC_007519	TCG	2	6	35371	35376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355091
616	NC_007519	CGG	3	9	35403	35411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355091
617	NC_007519	TGCT	2	8	35435	35442	0 %	50 %	25 %	25 %	78355091
618	NC_007519	ATG	2	6	35470	35475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78355091
619	NC_007519	A	6	6	35579	35584	100 %	0 %	0 %	0 %	78355091
620	NC_007519	GCC	2	6	35623	35628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355091
621	NC_007519	TGA	2	6	35664	35669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78355091
622	NC_007519	GCA	2	6	35700	35705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355091
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624	NC_007519	GTG	2	6	35770	35775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355091
625	NC_007519	GCC	2	6	35819	35824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355091
626	NC_007519	TGCG	2	8	35825	35832	0 %	25 %	50 %	25 %	78355091
627	NC_007519	GAC	2	6	36037	36042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355091
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629	NC_007519	ACT	2	6	36152	36157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355092
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