MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalococcoides sp. CBDB1 chromosome

Total Repeats: 22807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007356	CCA	2	6	241471	241476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748185
4002	NC_007356	GGC	2	6	241535	241540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748185
4003	NC_007356	T	7	7	241658	241664	0 %	100 %	0 %	0 %	73748185
4004	NC_007356	CGTC	2	8	241737	241744	0 %	25 %	25 %	50 %	73748185
4005	NC_007356	TGC	2	6	241753	241758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748185
4006	NC_007356	GCA	2	6	241783	241788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748185
4007	NC_007356	GGC	2	6	241790	241795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748185
4008	NC_007356	CAGA	2	8	241908	241915	50 %	0 %	25 %	25 %	73748185
4009	NC_007356	TG	3	6	241976	241981	0 %	50 %	50 %	0 %	73748185
4010	NC_007356	CTGG	2	8	242075	242082	0 %	25 %	50 %	25 %	73748185
4011	NC_007356	TTC	2	6	242102	242107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748185
4012	NC_007356	TAA	2	6	242155	242160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748185
4013	NC_007356	CAA	2	6	242308	242313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73748185
4014	NC_007356	GCA	2	6	242443	242448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748185
4015	NC_007356	GCA	2	6	242520	242525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748185
4016	NC_007356	T	6	6	242570	242575	0 %	100 %	0 %	0 %	73748185
4017	NC_007356	CCA	2	6	242602	242607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748185
4018	NC_007356	CAAG	2	8	242653	242660	50 %	0 %	25 %	25 %	73748185
4019	NC_007356	T	7	7	242668	242674	0 %	100 %	0 %	0 %	73748185
4020	NC_007356	AGC	2	6	242685	242690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748185
4021	NC_007356	CT	3	6	242920	242925	0 %	50 %	0 %	50 %	73748186
4022	NC_007356	TCT	2	6	243063	243068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748186
4023	NC_007356	CGC	2	6	243124	243129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748186
4024	NC_007356	GGC	2	6	243170	243175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748186
4025	NC_007356	TC	3	6	243223	243228	0 %	50 %	0 %	50 %	73748186
4026	NC_007356	TGA	2	6	243248	243253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748186
4027	NC_007356	ATCAAT	2	12	243546	243557	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73748187
4028	NC_007356	GGA	2	6	243587	243592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748187
4029	NC_007356	CTG	3	9	243744	243752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748187
4030	NC_007356	G	6	6	243804	243809	0 %	0 %	100 %	0 %	73748187
4031	NC_007356	ATT	2	6	243810	243815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748187
4032	NC_007356	GT	3	6	243899	243904	0 %	50 %	50 %	0 %	73748187
4033	NC_007356	ACT	2	6	243916	243921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748187
4034	NC_007356	GCC	2	6	243924	243929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748187
4035	NC_007356	CAG	2	6	243966	243971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748187
4036	NC_007356	TTA	2	6	244028	244033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748187
4037	NC_007356	CCA	2	6	244037	244042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748187
4038	NC_007356	GGC	2	6	244109	244114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748187
4039	NC_007356	CTG	2	6	244131	244136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748187
4040	NC_007356	AGCC	2	8	244197	244204	25 %	0 %	25 %	50 %	73748187
4041	NC_007356	TCC	2	6	244213	244218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73748187
4042	NC_007356	CGG	2	6	244252	244257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748187
4043	NC_007356	TGCC	2	8	244294	244301	0 %	25 %	25 %	50 %	73748187
4044	NC_007356	GTAA	2	8	244338	244345	50 %	25 %	25 %	0 %	73748187
4045	NC_007356	CCGCC	2	10	244411	244420	0 %	0 %	20 %	80 %	73748187
4046	NC_007356	TTC	2	6	244677	244682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748187
4047	NC_007356	CTG	2	6	244731	244736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748187
4048	NC_007356	ATG	3	9	244765	244773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748187
4049	NC_007356	T	6	6	244840	244845	0 %	100 %	0 %	0 %	73748187
4050	NC_007356	GGC	2	6	244883	244888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748187
4051	NC_007356	G	6	6	244943	244948	0 %	0 %	100 %	0 %	73748187
4052	NC_007356	T	6	6	244980	244985	0 %	100 %	0 %	0 %	73748187
4053	NC_007356	CAGC	2	8	245003	245010	25 %	0 %	25 %	50 %	73748187
4054	NC_007356	GAG	2	6	245135	245140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748187
4055	NC_007356	CTC	2	6	245208	245213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73748187
4056	NC_007356	TCT	2	6	245231	245236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748187
4057	NC_007356	GCA	2	6	245254	245259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748187
4058	NC_007356	TAA	2	6	245372	245377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748187
4059	NC_007356	T	7	7	245504	245510	0 %	100 %	0 %	0 %	73748187
4060	NC_007356	AT	3	6	245516	245521	50 %	50 %	0 %	0 %	73748187
4061	NC_007356	CAGTT	2	10	245526	245535	20 %	40 %	20 %	20 %	73748187
4062	NC_007356	T	6	6	245573	245578	0 %	100 %	0 %	0 %	73748187
4063	NC_007356	GCG	2	6	245658	245663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748187
4064	NC_007356	GCA	2	6	245678	245683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748187
4065	NC_007356	TGC	2	6	245705	245710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748187
4066	NC_007356	TGA	2	6	245749	245754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748187
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4068	NC_007356	GCG	2	6	245765	245770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748187
4069	NC_007356	CGC	2	6	245783	245788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748187
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4071	NC_007356	GCT	2	6	246030	246035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748188
4072	NC_007356	CTT	2	6	246086	246091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748188
4073	NC_007356	GGAAGG	2	12	246124	246135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748188
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4076	NC_007356	TCT	2	6	246342	246347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748188
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4081	NC_007356	AG	3	6	246572	246577	50 %	0 %	50 %	0 %	73748189
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4088	NC_007356	CAG	2	6	246734	246739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748189
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4091	NC_007356	GGGGT	2	10	247020	247029	0 %	20 %	80 %	0 %	73748189
4092	NC_007356	TCT	2	6	247044	247049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748189
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4095	NC_007356	TA	3	6	247153	247158	50 %	50 %	0 %	0 %	73748189
4096	NC_007356	ATT	2	6	247175	247180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748189
4097	NC_007356	TTC	2	6	247205	247210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748189
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4099	NC_007356	CAGCC	2	10	247509	247518	20 %	0 %	20 %	60 %	73748190
4100	NC_007356	A	6	6	247589	247594	100 %	0 %	0 %	0 %	73748190
4101	NC_007356	TAC	2	6	247615	247620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748190
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4104	NC_007356	CAA	2	6	247768	247773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73748190
4105	NC_007356	GCCA	2	8	247820	247827	25 %	0 %	25 %	50 %	73748190
4106	NC_007356	ATA	2	6	247844	247849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748190
4107	NC_007356	GAG	2	6	247859	247864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748190
4108	NC_007356	CGG	2	6	248014	248019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748191
4109	NC_007356	GGC	2	6	248062	248067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748191
4110	NC_007356	AT	3	6	248133	248138	50 %	50 %	0 %	0 %	73748191
4111	NC_007356	AT	3	6	248152	248157	50 %	50 %	0 %	0 %	73748191
4112	NC_007356	TTTG	2	8	248173	248180	0 %	75 %	25 %	0 %	73748191
4113	NC_007356	TCC	2	6	248192	248197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73748191
4114	NC_007356	CTC	2	6	248244	248249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73748191
4115	NC_007356	CGG	2	6	248283	248288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748191
4116	NC_007356	ATT	2	6	248294	248299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748191
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4118	NC_007356	CGG	2	6	248363	248368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748191
4119	NC_007356	ACC	3	9	248405	248413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748191
4120	NC_007356	GCT	3	9	248420	248428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748191
4121	NC_007356	AG	3	6	248431	248436	50 %	0 %	50 %	0 %	73748191
4122	NC_007356	GGCG	2	8	248444	248451	0 %	0 %	75 %	25 %	73748191
4123	NC_007356	CTG	2	6	248555	248560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748191
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4125	NC_007356	TGG	2	6	248577	248582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748191
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4498	NC_007356	TTC	2	6	272861	272866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748214
4499	NC_007356	TGGAC	2	10	272923	272932	20 %	20 %	40 %	20 %	73748214
4500	NC_007356	CGC	2	6	272991	272996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748214

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