MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalococcoides sp. CBDB1 chromosome

Total Repeats: 22807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007356	TAC	2	6	302629	302634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748245
5002	NC_007356	ATG	2	6	302775	302780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748245
5003	NC_007356	AGA	2	6	302835	302840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748245
5004	NC_007356	GAT	2	6	302978	302983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748246
5005	NC_007356	GCA	2	6	303020	303025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748246
5006	NC_007356	T	6	6	303026	303031	0 %	100 %	0 %	0 %	73748246
5007	NC_007356	ACCG	2	8	303080	303087	25 %	0 %	25 %	50 %	73748246
5008	NC_007356	GAA	2	6	303129	303134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748246
5009	NC_007356	TTA	2	6	303314	303319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748246
5010	NC_007356	TGG	2	6	303376	303381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748246
5011	NC_007356	GAAG	2	8	303392	303399	50 %	0 %	50 %	0 %	73748246
5012	NC_007356	CGTT	2	8	303452	303459	0 %	50 %	25 %	25 %	73748246
5013	NC_007356	CGGG	2	8	303493	303500	0 %	0 %	75 %	25 %	73748246
5014	NC_007356	T	6	6	303590	303595	0 %	100 %	0 %	0 %	73748246
5015	NC_007356	CGC	2	6	303624	303629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748246
5016	NC_007356	CCG	2	6	303719	303724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748246
5017	NC_007356	GGA	2	6	303743	303748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73748246
5018	NC_007356	TG	3	6	303891	303896	0 %	50 %	50 %	0 %	73748247
5019	NC_007356	G	6	6	304069	304074	0 %	0 %	100 %	0 %	73748247
5020	NC_007356	GCG	2	6	304088	304093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748247
5021	NC_007356	CTG	2	6	304138	304143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748247
5022	NC_007356	T	6	6	304187	304192	0 %	100 %	0 %	0 %	73748247
5023	NC_007356	ATG	2	6	304211	304216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748247
5024	NC_007356	CTC	2	6	304239	304244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73748247
5025	NC_007356	CTG	2	6	304311	304316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748247
5026	NC_007356	GA	3	6	304356	304361	50 %	0 %	50 %	0 %	73748247
5027	NC_007356	GCT	2	6	304372	304377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748247
5028	NC_007356	CTCAGC	2	12	304400	304411	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	73748247
5029	NC_007356	GACC	2	8	304524	304531	25 %	0 %	25 %	50 %	73748247
5030	NC_007356	CTG	2	6	304560	304565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748247
5031	NC_007356	T	8	8	304759	304766	0 %	100 %	0 %	0 %	73748248
5032	NC_007356	GTAT	2	8	304936	304943	25 %	50 %	25 %	0 %	73748248
5033	NC_007356	AAG	2	6	304957	304962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748248
5034	NC_007356	CAA	2	6	305009	305014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73748248
5035	NC_007356	A	6	6	305020	305025	100 %	0 %	0 %	0 %	73748248
5036	NC_007356	CCA	2	6	305027	305032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748248
5037	NC_007356	GTTT	2	8	305035	305042	0 %	75 %	25 %	0 %	73748248
5038	NC_007356	AAG	2	6	305056	305061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748248
5039	NC_007356	TAT	2	6	305094	305099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748248
5040	NC_007356	GCCT	2	8	305165	305172	0 %	25 %	25 %	50 %	73748248
5041	NC_007356	GCA	2	6	305325	305330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748249
5042	NC_007356	CCG	2	6	305389	305394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748249
5043	NC_007356	TA	3	6	305418	305423	50 %	50 %	0 %	0 %	73748249
5044	NC_007356	T	7	7	305496	305502	0 %	100 %	0 %	0 %	73748249
5045	NC_007356	T	7	7	305646	305652	0 %	100 %	0 %	0 %	73748250
5046	NC_007356	TTC	2	6	305662	305667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748250
5047	NC_007356	GGTA	2	8	305692	305699	25 %	25 %	50 %	0 %	73748250
5048	NC_007356	AGT	2	6	305788	305793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748250
5049	NC_007356	CAC	2	6	305810	305815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748250
5050	NC_007356	ATA	2	6	305891	305896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748250
5051	NC_007356	AGC	2	6	305897	305902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748250
5052	NC_007356	CCGG	2	8	306127	306134	0 %	0 %	50 %	50 %	73748250
5053	NC_007356	ATA	2	6	306311	306316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73748250
5054	NC_007356	CGG	2	6	306332	306337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748250
5055	NC_007356	GGCT	2	8	306338	306345	0 %	25 %	50 %	25 %	73748250
5056	NC_007356	CCGGG	2	10	306502	306511	0 %	0 %	60 %	40 %	73748251
5057	NC_007356	TTC	2	6	306569	306574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73748251
5058	NC_007356	T	6	6	306644	306649	0 %	100 %	0 %	0 %	73748251
5059	NC_007356	GCAG	2	8	306820	306827	25 %	0 %	50 %	25 %	73748251
5060	NC_007356	CAGGGT	2	12	307055	307066	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	73748251
5061	NC_007356	ATTT	2	8	307250	307257	25 %	75 %	0 %	0 %	73748251
5062	NC_007356	GTT	2	6	307388	307393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748251
5063	NC_007356	CAG	2	6	307502	307507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748251
5064	NC_007356	GCCC	2	8	307522	307529	0 %	0 %	25 %	75 %	73748251
5065	NC_007356	TGGC	2	8	307551	307558	0 %	25 %	50 %	25 %	73748251
5066	NC_007356	TGCA	2	8	307571	307578	25 %	25 %	25 %	25 %	73748251
5067	NC_007356	T	6	6	307611	307616	0 %	100 %	0 %	0 %	73748251
5068	NC_007356	A	6	6	307617	307622	100 %	0 %	0 %	0 %	73748251
5069	NC_007356	CATT	2	8	307639	307646	25 %	50 %	0 %	25 %	73748251
5070	NC_007356	ACTGC	2	10	307775	307784	20 %	20 %	20 %	40 %	73748252
5071	NC_007356	TGGA	2	8	307787	307794	25 %	25 %	50 %	0 %	73748252
5072	NC_007356	CCA	2	6	307935	307940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748252
5073	NC_007356	AG	3	6	308069	308074	50 %	0 %	50 %	0 %	73748252
5074	NC_007356	GCG	3	9	308148	308156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748252
5075	NC_007356	TGC	2	6	308159	308164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748252
5076	NC_007356	ATT	3	9	308194	308202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748252
5077	NC_007356	CAC	2	6	308298	308303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73748252
5078	NC_007356	TGTGT	2	10	308325	308334	0 %	60 %	40 %	0 %	73748252
5079	NC_007356	TGGATA	2	12	308369	308380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748252
5080	NC_007356	TGG	2	6	308393	308398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748252
5081	NC_007356	CGC	2	6	308476	308481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748252
5082	NC_007356	TGG	2	6	308633	308638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748252
5083	NC_007356	TAT	2	6	308819	308824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748253
5084	NC_007356	GTGA	2	8	308943	308950	25 %	25 %	50 %	0 %	73748253
5085	NC_007356	TGT	2	6	308951	308956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73748253
5086	NC_007356	CAT	2	6	308990	308995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748253
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5088	NC_007356	CTG	2	6	309012	309017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748253
5089	NC_007356	GCG	2	6	309021	309026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748253
5090	NC_007356	CTG	2	6	309057	309062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73748253
5091	NC_007356	ATT	3	9	309151	309159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748253
5092	NC_007356	T	6	6	309185	309190	0 %	100 %	0 %	0 %	73748253
5093	NC_007356	T	6	6	309200	309205	0 %	100 %	0 %	0 %	73748253
5094	NC_007356	CGG	2	6	309265	309270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748253
5095	NC_007356	CGG	2	6	309352	309357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73748253
5096	NC_007356	TA	3	6	309363	309368	50 %	50 %	0 %	0 %	73748253
5097	NC_007356	TGG	2	6	309473	309478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748254
5098	NC_007356	TGA	2	6	309561	309566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748254
5099	NC_007356	TGAA	2	8	309593	309600	50 %	25 %	25 %	0 %	73748254
5100	NC_007356	TGA	2	6	309681	309686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748254
5101	NC_007356	GTA	2	6	309709	309714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748254
5102	NC_007356	CTA	2	6	309756	309761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73748254
5103	NC_007356	ATG	3	9	309851	309859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748254
5104	NC_007356	GGCCG	2	10	309900	309909	0 %	0 %	60 %	40 %	73748254
5105	NC_007356	GAAC	2	8	309936	309943	50 %	0 %	25 %	25 %	73748254
5106	NC_007356	GCC	2	6	310009	310014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748255
5107	NC_007356	TTA	2	6	310252	310257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73748255
5108	NC_007356	TG	3	6	310327	310332	0 %	50 %	50 %	0 %	73748255
5109	NC_007356	GAT	2	6	310389	310394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748255
5110	NC_007356	GGT	2	6	310430	310435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748255
5111	NC_007356	TCC	2	6	310448	310453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73748255
5112	NC_007356	GT	3	6	310454	310459	0 %	50 %	50 %	0 %	73748255
5113	NC_007356	AAG	2	6	310477	310482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73748255
5114	NC_007356	CAG	2	6	310634	310639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73748256
5115	NC_007356	CCG	2	6	310717	310722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73748256
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5117	NC_007356	AGT	2	6	310778	310783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73748256
5118	NC_007356	GCCA	2	8	310800	310807	25 %	0 %	25 %	50 %	73748256
5119	NC_007356	A	6	6	310813	310818	100 %	0 %	0 %	0 %	73748256
5120	NC_007356	GTG	2	6	310830	310835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73748256
5121	NC_007356	TACCGG	2	12	310838	310849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	73748256
5122	NC_007356	AC	3	6	310922	310927	50 %	0 %	0 %	50 %	73748256
5123	NC_007356	GGGGT	2	10	311001	311010	0 %	20 %	80 %	0 %	73748256
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5125	NC_007356	CAA	2	6	311111	311116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73748256
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