MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dechloromonas aromatica RCB

Total Repeats: 87239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007298	CAA	2	6	205	210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71905643
2	NC_007298	CTT	2	6	354	359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71905643
3	NC_007298	GCC	2	6	409	414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905643
4	NC_007298	CAA	2	6	425	430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71905643
5	NC_007298	GCC	2	6	490	495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905643
6	NC_007298	TGG	2	6	569	574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71905643
7	NC_007298	AAT	2	6	622	627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71905643
8	NC_007298	TCGT	2	8	737	744	0 %	50 %	25 %	25 %	71905643
9	NC_007298	ATT	2	6	761	766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71905643
10	NC_007298	GTT	2	6	775	780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71905643
11	NC_007298	CAG	2	6	790	795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905643
12	NC_007298	TGC	3	9	839	847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905643
13	NC_007298	ATC	3	9	937	945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71905643
14	NC_007298	GAC	2	6	982	987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905643
15	NC_007298	CCG	2	6	1033	1038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905643
16	NC_007298	GAA	3	9	1065	1073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71905643
17	NC_007298	CTT	2	6	1113	1118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71905643
18	NC_007298	GAA	2	6	1167	1172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71905643
19	NC_007298	TTC	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71905643
20	NC_007298	ACA	2	6	1274	1279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71905643
21	NC_007298	AGA	2	6	1283	1288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71905643
22	NC_007298	GTT	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71905643
23	NC_007298	AAG	2	6	1333	1338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71905643
24	NC_007298	CAC	2	6	1446	1451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71905643
25	NC_007298	TCAT	2	8	1454	1461	25 %	50 %	0 %	25 %	71905643
26	NC_007298	CGAT	2	8	1472	1479	25 %	25 %	25 %	25 %	71905643
27	NC_007298	TGC	2	6	1526	1531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905643
28	NC_007298	AT	3	6	1754	1759	50 %	50 %	0 %	0 %	71905644
29	NC_007298	TTA	2	6	1765	1770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71905644
30	NC_007298	CGT	2	6	1827	1832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905644
31	NC_007298	TGC	2	6	1858	1863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905644
32	NC_007298	GAA	2	6	1868	1873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71905644
33	NC_007298	CGAC	2	8	1897	1904	25 %	0 %	25 %	50 %	71905644
34	NC_007298	CAC	2	6	1919	1924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71905644
35	NC_007298	GGT	2	6	1941	1946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71905644
36	NC_007298	GTGC	2	8	2055	2062	0 %	25 %	50 %	25 %	71905644
37	NC_007298	GCCG	2	8	2093	2100	0 %	0 %	50 %	50 %	71905644
38	NC_007298	CTA	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71905644
39	NC_007298	TGC	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905644
40	NC_007298	CTG	2	6	2379	2384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905644
41	NC_007298	GAT	2	6	2394	2399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71905644
42	NC_007298	CTG	2	6	2400	2405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905644
43	NC_007298	GTG	2	6	2451	2456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71905644
44	NC_007298	GAA	2	6	2519	2524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71905644
45	NC_007298	GCC	2	6	2539	2544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905644
46	NC_007298	GC	3	6	2567	2572	0 %	0 %	50 %	50 %	71905644
47	NC_007298	CGT	2	6	2609	2614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905644
48	NC_007298	ACA	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71905644
49	NC_007298	GAA	2	6	2661	2666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71905644
50	NC_007298	AGA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71905644
51	NC_007298	AAC	2	6	2748	2753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71905644
52	NC_007298	ACG	2	6	2785	2790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905644
53	NC_007298	CGT	2	6	2840	2845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905644
54	NC_007298	GAA	2	6	2944	2949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71905645
55	NC_007298	AGC	2	6	2962	2967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905645
56	NC_007298	GTG	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71905645
57	NC_007298	CGA	2	6	3123	3128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905645
58	NC_007298	GCTG	2	8	3132	3139	0 %	25 %	50 %	25 %	71905645
59	NC_007298	CAT	2	6	3153	3158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71905645
60	NC_007298	CCAT	2	8	3164	3171	25 %	25 %	0 %	50 %	71905645
61	NC_007298	GAC	2	6	3232	3237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905645
62	NC_007298	CGG	2	6	3257	3262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71905645
63	NC_007298	GGC	2	6	3292	3297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71905645
64	NC_007298	GGT	2	6	3328	3333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71905645
65	NC_007298	CGC	2	6	3394	3399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905645
66	NC_007298	AAG	2	6	3406	3411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71905645
67	NC_007298	CGA	2	6	3540	3545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905645
68	NC_007298	TCCT	2	8	3607	3614	0 %	50 %	0 %	50 %	71905645
69	NC_007298	AAC	2	6	3616	3621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71905645
70	NC_007298	GAA	2	6	3661	3666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71905645
71	NC_007298	TTTGCT	2	12	3670	3681	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	71905645
72	NC_007298	GGT	2	6	3682	3687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71905645
73	NC_007298	CGGC	2	8	3752	3759	0 %	0 %	50 %	50 %	71905645
74	NC_007298	CAT	3	9	3795	3803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71905645
75	NC_007298	CAA	2	6	3864	3869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71905645
76	NC_007298	GGT	2	6	3886	3891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71905645
77	NC_007298	GC	3	6	3909	3914	0 %	0 %	50 %	50 %	71905645
78	NC_007298	TCA	2	6	3929	3934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71905645
79	NC_007298	CGA	2	6	3945	3950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905645
80	NC_007298	AAG	2	6	3964	3969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71905645
81	NC_007298	CGA	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905645
82	NC_007298	GGCCT	2	10	4006	4015	0 %	20 %	40 %	40 %	71905645
83	NC_007298	TCC	2	6	4078	4083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	71905645
84	NC_007298	TGC	2	6	4092	4097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905645
85	NC_007298	GTC	2	6	4108	4113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905645
86	NC_007298	GAT	2	6	4161	4166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71905645
87	NC_007298	TCG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905645
88	NC_007298	GCC	2	6	4204	4209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905645
89	NC_007298	CGT	2	6	4210	4215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905645
90	NC_007298	CGC	2	6	4231	4236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905645
91	NC_007298	TCG	2	6	4319	4324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905645
92	NC_007298	CCG	2	6	4334	4339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905645
93	NC_007298	GAC	2	6	4495	4500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905645
94	NC_007298	ACC	2	6	4523	4528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71905645
95	NC_007298	CAT	4	12	4530	4541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71905645
96	NC_007298	GCT	2	6	4590	4595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905645
97	NC_007298	GCC	2	6	4647	4652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905645
98	NC_007298	CGA	2	6	4737	4742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905645
99	NC_007298	CGC	2	6	4754	4759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905645
100	NC_007298	CCGGC	2	10	4781	4790	0 %	0 %	40 %	60 %	71905645
101	NC_007298	TGGC	2	8	4813	4820	0 %	25 %	50 %	25 %	71905645
102	NC_007298	TGC	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905645
103	NC_007298	GAA	2	6	4915	4920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71905645
104	NC_007298	CCGG	2	8	4960	4967	0 %	0 %	50 %	50 %	71905645
105	NC_007298	CAC	2	6	5032	5037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71905645
106	NC_007298	TGC	2	6	5072	5077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905645
107	NC_007298	CCA	2	6	5144	5149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71905645
108	NC_007298	GAA	2	6	5163	5168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71905645
109	NC_007298	GCT	2	6	5205	5210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905645
110	NC_007298	AGC	2	6	5237	5242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905645
111	NC_007298	CGC	2	6	5308	5313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905645
112	NC_007298	GAC	2	6	5332	5337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905645
113	NC_007298	ACG	2	6	5362	5367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905645
114	NC_007298	AACG	2	8	5409	5416	50 %	0 %	25 %	25 %	71905645
115	NC_007298	CTG	2	6	5584	5589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905646
116	NC_007298	GGTCA	2	10	5634	5643	20 %	20 %	40 %	20 %	71905646
117	NC_007298	CGC	2	6	5678	5683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905646
118	NC_007298	GCA	2	6	5715	5720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905646
119	NC_007298	GACT	2	8	5779	5786	25 %	25 %	25 %	25 %	71905646
120	NC_007298	TGC	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905646
121	NC_007298	AAGG	2	8	5805	5812	50 %	0 %	50 %	0 %	71905646
122	NC_007298	CGT	2	6	5843	5848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905646
123	NC_007298	TGA	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71905646
124	NC_007298	CG	3	6	5902	5907	0 %	0 %	50 %	50 %	71905646
125	NC_007298	TGCGTC	2	12	5929	5940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905646
126	NC_007298	GTG	2	6	5982	5987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71905647
127	NC_007298	GTCG	2	8	6008	6015	0 %	25 %	50 %	25 %	71905647
128	NC_007298	CTG	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905647
129	NC_007298	GAG	2	6	6075	6080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71905647
130	NC_007298	TCGT	2	8	6121	6128	0 %	50 %	25 %	25 %	71905647
131	NC_007298	TGA	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71905647
132	NC_007298	GAA	2	6	6230	6235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71905647
133	NC_007298	CGT	2	6	6247	6252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905647
134	NC_007298	CGAGG	2	10	6267	6276	20 %	0 %	60 %	20 %	71905647
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265	NC_007298	GAA	2	6	12527	12532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71905650
266	NC_007298	GCA	2	6	12547	12552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905650
267	NC_007298	T	6	6	12576	12581	0 %	100 %	0 %	0 %	71905650
268	NC_007298	GCT	2	6	12593	12598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905650
269	NC_007298	AGC	2	6	12663	12668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905650
270	NC_007298	GGCC	2	8	12699	12706	0 %	0 %	50 %	50 %	71905650
271	NC_007298	GTA	2	6	12713	12718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71905650
272	NC_007298	GGC	2	6	12734	12739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71905650
273	NC_007298	CAG	2	6	12755	12760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905650
274	NC_007298	GCT	2	6	12779	12784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905650
275	NC_007298	G	7	7	12972	12978	0 %	0 %	100 %	0 %	71905651
276	NC_007298	GCCA	2	8	13084	13091	25 %	0 %	25 %	50 %	71905651
277	NC_007298	GT	3	6	13182	13187	0 %	50 %	50 %	0 %	71905651
278	NC_007298	CGT	2	6	13230	13235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905651
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280	NC_007298	CTT	2	6	13352	13357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71905651
281	NC_007298	CCTT	2	8	13359	13366	0 %	50 %	0 %	50 %	71905651
282	NC_007298	GCC	2	6	13388	13393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905651
283	NC_007298	GGA	2	6	13429	13434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71905651
284	NC_007298	GCC	2	6	13472	13477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905651
285	NC_007298	ACG	2	6	13530	13535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905651
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287	NC_007298	GCA	2	6	13581	13586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905651
288	NC_007298	TCG	2	6	13605	13610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905651
289	NC_007298	GGC	2	6	13703	13708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71905651
290	NC_007298	CGG	2	6	13825	13830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71905651
291	NC_007298	GAC	2	6	13865	13870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905651
292	NC_007298	CTG	2	6	13904	13909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905651
293	NC_007298	AGC	2	6	13941	13946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905651
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295	NC_007298	GCCG	2	8	14017	14024	0 %	0 %	50 %	50 %	71905652
296	NC_007298	CTG	2	6	14038	14043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905652
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298	NC_007298	CAC	2	6	14261	14266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71905652
299	NC_007298	ATG	2	6	14339	14344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71905652
300	NC_007298	CGA	2	6	14373	14378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905652
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303	NC_007298	AGC	2	6	14621	14626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905652
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342	NC_007298	GATCA	2	10	16472	16481	40 %	20 %	20 %	20 %	71905654
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346	NC_007298	TGG	2	6	16582	16587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71905654
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349	NC_007298	AGC	2	6	16634	16639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905654
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364	NC_007298	CAG	2	6	17417	17422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905654
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373	NC_007298	CAA	2	6	18167	18172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71905655
374	NC_007298	GCTG	2	8	18193	18200	0 %	25 %	50 %	25 %	71905655
375	NC_007298	CGA	2	6	18226	18231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905655
376	NC_007298	ATC	3	9	18234	18242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71905655
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379	NC_007298	CCAACG	2	12	18373	18384	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	71905655
380	NC_007298	CCAAGG	2	12	18385	18396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905655
381	NC_007298	CCG	2	6	18425	18430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905655
382	NC_007298	TCG	2	6	18516	18521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905655
383	NC_007298	ACG	2	6	18550	18555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905655
384	NC_007298	TCGAGA	2	12	18583	18594	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	71905655
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386	NC_007298	CGC	2	6	18739	18744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905655
387	NC_007298	CTA	2	6	18785	18790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71905655
388	NC_007298	CCA	2	6	18862	18867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71905655
389	NC_007298	TGT	2	6	18919	18924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71905655
390	NC_007298	CGA	2	6	18932	18937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71905655
391	NC_007298	AAG	2	6	18942	18947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71905655
392	NC_007298	CGG	2	6	18965	18970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71905655
393	NC_007298	TGC	2	6	19021	19026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905655
394	NC_007298	ACCA	2	8	19041	19048	50 %	0 %	0 %	50 %	71905655
395	NC_007298	ATCG	2	8	19061	19068	25 %	25 %	25 %	25 %	71905655
396	NC_007298	TCG	2	6	19186	19191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905655
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399	NC_007298	CGC	2	6	19387	19392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905656
400	NC_007298	GTC	2	6	19397	19402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71905656
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421	NC_007298	CCG	2	6	20579	20584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71905658
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423	NC_007298	GCCG	2	8	20714	20721	0 %	0 %	50 %	50 %	71905658
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