MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough plasmid pDV

Total Repeats: 4219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_005863	CGG	2	6	192509	192514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562249
4002	NC_005863	GCC	2	6	192517	192522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562249
4003	NC_005863	CAG	2	6	192574	192579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562249
4004	NC_005863	CAT	2	6	192618	192623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562249
4005	NC_005863	TGGC	2	8	192682	192689	0 %	25 %	50 %	25 %	46562249
4006	NC_005863	GCG	2	6	192701	192706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562249
4007	NC_005863	CTA	2	6	192732	192737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562249
4008	NC_005863	CCG	2	6	192740	192745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562249
4009	NC_005863	CCG	2	6	192759	192764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562249
4010	NC_005863	GCT	2	6	192783	192788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562249
4011	NC_005863	ACG	2	6	193010	193015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562249
4012	NC_005863	CGA	2	6	193047	193052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562249
4013	NC_005863	CGACCT	2	12	193155	193166	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	46562249
4014	NC_005863	CCA	2	6	193205	193210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562249
4015	NC_005863	ACC	2	6	193231	193236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562249
4016	NC_005863	CTG	2	6	193270	193275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562249
4017	NC_005863	CG	3	6	193288	193293	0 %	0 %	50 %	50 %	46562249
4018	NC_005863	TGC	2	6	193343	193348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562249
4019	NC_005863	CGA	2	6	193371	193376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562249
4020	NC_005863	CGAGGC	2	12	193389	193400	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46562249
4021	NC_005863	CG	3	6	193406	193411	0 %	0 %	50 %	50 %	46562249
4022	NC_005863	CCG	2	6	193510	193515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562249
4023	NC_005863	CGC	2	6	193527	193532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562249
4024	NC_005863	CGA	2	6	193536	193541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562249
4025	NC_005863	CCA	2	6	193545	193550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562249
4026	NC_005863	CATGG	2	10	193630	193639	20 %	20 %	40 %	20 %	46562248
4027	NC_005863	CTG	2	6	193652	193657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4028	NC_005863	TCG	2	6	193683	193688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4029	NC_005863	GAC	2	6	193748	193753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4030	NC_005863	CGG	2	6	193760	193765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562248
4031	NC_005863	ACC	2	6	193844	193849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562248
4032	NC_005863	CGC	2	6	193876	193881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562248
4033	NC_005863	TGC	2	6	193917	193922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4034	NC_005863	CCGC	2	8	193934	193941	0 %	0 %	25 %	75 %	46562248
4035	NC_005863	CGA	2	6	193987	193992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4036	NC_005863	TGC	3	9	194049	194057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4037	NC_005863	GCAG	2	8	194077	194084	25 %	0 %	50 %	25 %	46562248
4038	NC_005863	CGC	2	6	194095	194100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562248
4039	NC_005863	CGGG	2	8	194130	194137	0 %	0 %	75 %	25 %	46562248
4040	NC_005863	CTG	3	9	194144	194152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4041	NC_005863	GTG	2	6	194153	194158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562248
4042	NC_005863	GCT	2	6	194170	194175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4043	NC_005863	CGG	2	6	194185	194190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562248
4044	NC_005863	AGGCA	2	10	194226	194235	40 %	0 %	40 %	20 %	46562248
4045	NC_005863	GGCAG	2	10	194254	194263	20 %	0 %	60 %	20 %	46562248
4046	NC_005863	CG	3	6	194277	194282	0 %	0 %	50 %	50 %	46562248
4047	NC_005863	CG	3	6	194317	194322	0 %	0 %	50 %	50 %	46562248
4048	NC_005863	GCC	2	6	194331	194336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562248
4049	NC_005863	GCC	2	6	194390	194395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562248
4050	NC_005863	CCA	2	6	194419	194424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562248
4051	NC_005863	CGC	2	6	194443	194448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562248
4052	NC_005863	CATC	2	8	194481	194488	25 %	25 %	0 %	50 %	46562248
4053	NC_005863	ACCTGC	2	12	194529	194540	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	46562248
4054	NC_005863	GGC	2	6	194569	194574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562248
4055	NC_005863	CTG	2	6	194603	194608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4056	NC_005863	CGA	2	6	194625	194630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4057	NC_005863	GCC	2	6	194692	194697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562248
4058	NC_005863	CCG	2	6	194699	194704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562248
4059	NC_005863	CGCGC	2	10	194714	194723	0 %	0 %	40 %	60 %	46562248
4060	NC_005863	CTG	2	6	194733	194738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4061	NC_005863	GCC	2	6	194795	194800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562248
4062	NC_005863	GCG	2	6	194880	194885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562248
4063	NC_005863	GCC	2	6	194909	194914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562248
4064	NC_005863	GTG	2	6	194963	194968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562248
4065	NC_005863	TGC	3	9	194973	194981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4066	NC_005863	TGC	2	6	195000	195005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4067	NC_005863	ATGC	2	8	195008	195015	25 %	25 %	25 %	25 %	46562248
4068	NC_005863	GCG	2	6	195044	195049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562248
4069	NC_005863	CGG	2	6	195148	195153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562248
4070	NC_005863	ACC	2	6	195230	195235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562248
4071	NC_005863	CCCCG	2	10	195252	195261	0 %	0 %	20 %	80 %	46562248
4072	NC_005863	CTG	2	6	195299	195304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4073	NC_005863	TCT	3	9	195336	195344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562248
4074	NC_005863	CGG	2	6	195453	195458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562248
4075	NC_005863	TGG	2	6	195468	195473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562248
4076	NC_005863	CGG	2	6	195490	195495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562248
4077	NC_005863	GCT	3	9	195526	195534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4078	NC_005863	GCG	2	6	195537	195542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562248
4079	NC_005863	TGC	2	6	195543	195548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4080	NC_005863	CGG	2	6	195579	195584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562248
4081	NC_005863	CGC	2	6	195604	195609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562248
4082	NC_005863	GC	3	6	195608	195613	0 %	0 %	50 %	50 %	46562248
4083	NC_005863	GCCGGG	2	12	195620	195631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562248
4084	NC_005863	CGA	2	6	195679	195684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4085	NC_005863	CGGG	2	8	195692	195699	0 %	0 %	75 %	25 %	46562248
4086	NC_005863	GGC	2	6	195758	195763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562248
4087	NC_005863	TTC	2	6	195797	195802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562248
4088	NC_005863	CGC	2	6	195805	195810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562248
4089	NC_005863	CCCGC	3	15	195882	195896	0 %	0 %	20 %	80 %	46562248
4090	NC_005863	CGG	2	6	195957	195962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562248
4091	NC_005863	TGG	2	6	195993	195998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562248
4092	NC_005863	CTG	2	6	196001	196006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4093	NC_005863	CAT	2	6	196015	196020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562248
4094	NC_005863	TTC	2	6	196055	196060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562248
4095	NC_005863	G	7	7	196082	196088	0 %	0 %	100 %	0 %	46562248
4096	NC_005863	CCG	2	6	196095	196100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562248
4097	NC_005863	GTG	2	6	196133	196138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562248
4098	NC_005863	GCC	2	6	196235	196240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562248
4099	NC_005863	CTG	2	6	196241	196246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4100	NC_005863	GCG	2	6	196251	196256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562248
4101	NC_005863	GTC	2	6	196280	196285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4102	NC_005863	CGC	2	6	196309	196314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562248
4103	NC_005863	GC	3	6	196317	196322	0 %	0 %	50 %	50 %	46562248
4104	NC_005863	GC	3	6	196370	196375	0 %	0 %	50 %	50 %	46562248
4105	NC_005863	ACA	2	6	196389	196394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562248
4106	NC_005863	TGC	2	6	196440	196445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4107	NC_005863	GCT	2	6	196450	196455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4108	NC_005863	CTG	2	6	196472	196477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562248
4109	NC_005863	CGC	2	6	196495	196500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562248
4110	NC_005863	CGGG	2	8	196527	196534	0 %	0 %	75 %	25 %	46562248
4111	NC_005863	CCG	2	6	196563	196568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562248
4112	NC_005863	ACC	3	9	196571	196579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562248
4113	NC_005863	GGC	2	6	196581	196586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562248
4114	NC_005863	CGC	2	6	196654	196659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562247
4115	NC_005863	GTGCC	2	10	196750	196759	0 %	20 %	40 %	40 %	46562247
4116	NC_005863	GGC	2	6	196865	196870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562247
4117	NC_005863	CCAT	2	8	196912	196919	25 %	25 %	0 %	50 %	46562247
4118	NC_005863	TTC	2	6	196920	196925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562247
4119	NC_005863	CGG	2	6	196988	196993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562247
4120	NC_005863	CGG	2	6	197024	197029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562247
4121	NC_005863	GGGC	2	8	197042	197049	0 %	0 %	75 %	25 %	46562247
4122	NC_005863	CGG	2	6	197069	197074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562247
4123	NC_005863	GGGC	2	8	197087	197094	0 %	0 %	75 %	25 %	46562247
4124	NC_005863	CGA	2	6	197140	197145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562247
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4215	NC_005863	TCG	2	6	201237	201242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562245
4216	NC_005863	GC	3	6	201293	201298	0 %	0 %	50 %	50 %	46562245
4217	NC_005863	CTGCG	2	10	201320	201329	0 %	20 %	40 %	40 %	46562245
4218	NC_005863	CGC	2	6	201460	201465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562245
4219	NC_005863	GCG	2	6	201468	201473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562245

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