MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus radiodurans R1 chromosome 2

Total Repeats: 9905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001264	GGGC	2	8	748	755	0 %	0 %	75 %	25 %	15807673
2	NC_001264	TGC	3	9	762	770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807673
3	NC_001264	TCGACC	2	12	771	782	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15807673
4	NC_001264	GGCT	2	8	800	807	0 %	25 %	50 %	25 %	15807673
5	NC_001264	GAT	2	6	943	948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15807673
6	NC_001264	ACG	2	6	1008	1013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807673
7	NC_001264	GAT	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15807673
8	NC_001264	CTGA	2	8	1145	1152	25 %	25 %	25 %	25 %	15807673
9	NC_001264	GC	3	6	1271	1276	0 %	0 %	50 %	50 %	15807673
10	NC_001264	CTCGA	2	10	1304	1313	20 %	20 %	20 %	40 %	15807673
11	NC_001264	GCGTA	2	10	1407	1416	20 %	20 %	40 %	20 %	15807673
12	NC_001264	CGT	2	6	1441	1446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807674
13	NC_001264	TGCCC	2	10	1521	1530	0 %	20 %	20 %	60 %	15807674
14	NC_001264	CGC	2	6	1564	1569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807674
15	NC_001264	GCT	2	6	1635	1640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807674
16	NC_001264	TTG	2	6	1670	1675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15807674
17	NC_001264	CGT	2	6	1684	1689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807674
18	NC_001264	GCC	2	6	1696	1701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807674
19	NC_001264	GCTG	2	8	1704	1711	0 %	25 %	50 %	25 %	15807674
20	NC_001264	GTC	2	6	1729	1734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807674
21	NC_001264	GCT	2	6	1765	1770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807674
22	NC_001264	TGA	2	6	1812	1817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15807674
23	NC_001264	GAA	2	6	1867	1872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15807674
24	NC_001264	GC	3	6	1873	1878	0 %	0 %	50 %	50 %	15807674
25	NC_001264	CTG	2	6	1894	1899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807674
26	NC_001264	CGA	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807674
27	NC_001264	AAC	2	6	1925	1930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15807674
28	NC_001264	AGC	2	6	2203	2208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807674
29	NC_001264	GCTG	2	8	2258	2265	0 %	25 %	50 %	25 %	15807674
30	NC_001264	TCC	2	6	2458	2463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15807675
31	NC_001264	CCA	2	6	2509	2514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15807675
32	NC_001264	GCT	2	6	2784	2789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807675
33	NC_001264	TGCT	2	8	2865	2872	0 %	50 %	25 %	25 %	15807675
34	NC_001264	GACCG	2	10	2877	2886	20 %	0 %	40 %	40 %	15807675
35	NC_001264	TCT	2	6	2933	2938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15807675
36	NC_001264	TTC	2	6	2958	2963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15807675
37	NC_001264	TCGC	2	8	3043	3050	0 %	25 %	25 %	50 %	15807675
38	NC_001264	GC	3	6	3052	3057	0 %	0 %	50 %	50 %	15807675
39	NC_001264	AAGG	2	8	3081	3088	50 %	0 %	50 %	0 %	15807675
40	NC_001264	CCG	2	6	3097	3102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807675
41	NC_001264	TGC	2	6	3167	3172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807675
42	NC_001264	CGT	2	6	3233	3238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807675
43	NC_001264	CCT	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15807675
44	NC_001264	CAGC	2	8	3356	3363	25 %	0 %	25 %	50 %	15807675
45	NC_001264	CAC	2	6	3517	3522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15807675
46	NC_001264	CGC	2	6	3534	3539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807675
47	NC_001264	CG	3	6	3554	3559	0 %	0 %	50 %	50 %	15807675
48	NC_001264	TTC	2	6	3606	3611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15807675
49	NC_001264	GCG	2	6	3639	3644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807675
50	NC_001264	GCC	2	6	3677	3682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807675
51	NC_001264	CGG	2	6	3701	3706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807675
52	NC_001264	GCGCG	2	10	3795	3804	0 %	0 %	60 %	40 %	15807675
53	NC_001264	GTT	2	6	3856	3861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15807675
54	NC_001264	GTG	2	6	3871	3876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807675
55	NC_001264	CTC	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15807676
56	NC_001264	GCA	2	6	4070	4075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807676
57	NC_001264	TGC	2	6	4100	4105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807676
58	NC_001264	TGG	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807676
59	NC_001264	GCT	2	6	4135	4140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807676
60	NC_001264	GGCT	2	8	4155	4162	0 %	25 %	50 %	25 %	15807676
61	NC_001264	TCCT	2	8	4181	4188	0 %	50 %	0 %	50 %	15807676
62	NC_001264	GCT	2	6	4272	4277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807676
63	NC_001264	TCT	2	6	4279	4284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15807676
64	NC_001264	GGC	2	6	4290	4295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807676
65	NC_001264	CCG	2	6	4365	4370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807676
66	NC_001264	CCA	2	6	4377	4382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15807676
67	NC_001264	GCG	2	6	4417	4422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807676
68	NC_001264	ATC	2	6	4423	4428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15807676
69	NC_001264	CTG	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807676
70	NC_001264	GCT	2	6	4527	4532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807676
71	NC_001264	AG	3	6	4546	4551	50 %	0 %	50 %	0 %	15807676
72	NC_001264	GAA	2	6	4554	4559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15807676
73	NC_001264	GCGCAG	2	12	4612	4623	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15807676
74	NC_001264	A	7	7	4667	4673	100 %	0 %	0 %	0 %	15807676
75	NC_001264	GCA	2	6	4749	4754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807677
76	NC_001264	CGAG	2	8	4799	4806	25 %	0 %	50 %	25 %	15807677
77	NC_001264	CAG	2	6	4860	4865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807677
78	NC_001264	GGTG	2	8	4880	4887	0 %	25 %	75 %	0 %	15807677
79	NC_001264	CCA	2	6	4949	4954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15807677
80	NC_001264	GCC	2	6	4956	4961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807677
81	NC_001264	GCC	2	6	4986	4991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807677
82	NC_001264	CTG	2	6	5055	5060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807677
83	NC_001264	TGG	2	6	5072	5077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807677
84	NC_001264	GCCGTG	2	12	5085	5096	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15807677
85	NC_001264	GTCCGC	2	12	5132	5143	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15807677
86	NC_001264	AGC	2	6	5164	5169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807677
87	NC_001264	CTTC	2	8	5174	5181	0 %	50 %	0 %	50 %	15807677
88	NC_001264	GC	3	6	5276	5281	0 %	0 %	50 %	50 %	15807677
89	NC_001264	GACC	2	8	5297	5304	25 %	0 %	25 %	50 %	15807677
90	NC_001264	CCA	2	6	5324	5329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15807677
91	NC_001264	CGG	2	6	5360	5365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807677
92	NC_001264	GCCC	2	8	5480	5487	0 %	0 %	25 %	75 %	15807677
93	NC_001264	GCC	2	6	5493	5498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807677
94	NC_001264	CGC	2	6	5528	5533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807677
95	NC_001264	TGG	2	6	5534	5539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807677
96	NC_001264	AG	3	6	5546	5551	50 %	0 %	50 %	0 %	15807677
97	NC_001264	ACC	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15807677
98	NC_001264	CGA	2	6	5696	5701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807677
99	NC_001264	GCAGGT	2	12	5765	5776	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15807677
100	NC_001264	TTG	2	6	5866	5871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15807677
101	NC_001264	G	8	8	5918	5925	0 %	0 %	100 %	0 %	15807678
102	NC_001264	GCG	2	6	5931	5936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807678
103	NC_001264	GTC	2	6	6005	6010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807678
104	NC_001264	TGC	2	6	6018	6023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807678
105	NC_001264	CGGCGC	2	12	6055	6066	0 %	0 %	50 %	50 %	15807678
106	NC_001264	GCC	2	6	6068	6073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807678
107	NC_001264	G	6	6	6074	6079	0 %	0 %	100 %	0 %	15807678
108	NC_001264	CAC	2	6	6095	6100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15807678
109	NC_001264	CGC	2	6	6145	6150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807678
110	NC_001264	ATGCG	2	10	6184	6193	20 %	20 %	40 %	20 %	15807678
111	NC_001264	TCG	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807678
112	NC_001264	GTC	2	6	6281	6286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807678
113	NC_001264	TCA	2	6	6313	6318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15807678
114	NC_001264	CGG	2	6	6364	6369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807678
115	NC_001264	TCG	2	6	6411	6416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807678
116	NC_001264	CGC	2	6	6461	6466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807678
117	NC_001264	GCG	2	6	6549	6554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807678
118	NC_001264	AGCG	2	8	6570	6577	25 %	0 %	50 %	25 %	15807678
119	NC_001264	TGG	2	6	6592	6597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807678
120	NC_001264	GAA	2	6	6606	6611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15807678
121	NC_001264	G	6	6	6634	6639	0 %	0 %	100 %	0 %	15807678
122	NC_001264	GCT	2	6	6643	6648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807678
123	NC_001264	CCG	2	6	6689	6694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807678
124	NC_001264	CAC	2	6	6844	6849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15807679
125	NC_001264	ACTG	2	8	6925	6932	25 %	25 %	25 %	25 %	15807679
126	NC_001264	GGGC	2	8	6951	6958	0 %	0 %	75 %	25 %	15807679
127	NC_001264	CTG	2	6	6977	6982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807679
128	NC_001264	CGG	2	6	7092	7097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807679
129	NC_001264	CGC	2	6	7202	7207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807679
130	NC_001264	GCC	2	6	7236	7241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807679
131	NC_001264	GGT	2	6	7258	7263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807679
132	NC_001264	GCT	3	9	7276	7284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807679
133	NC_001264	CGA	2	6	7288	7293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807679
134	NC_001264	GCCGC	2	10	7320	7329	0 %	0 %	40 %	60 %	15807679
135	NC_001264	CAC	2	6	7381	7386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15807679
136	NC_001264	GAA	2	6	7397	7402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15807679
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138	NC_001264	GTG	2	6	7424	7429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807679
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262	NC_001264	CGT	2	6	12443	12448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161579495
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267	NC_001264	CAC	2	6	12806	12811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161579495
268	NC_001264	GTC	2	6	12839	12844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161579495
269	NC_001264	CG	3	6	12847	12852	0 %	0 %	50 %	50 %	161579495
270	NC_001264	GCG	2	6	12912	12917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161579495
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272	NC_001264	ACC	2	6	12972	12977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161579495
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277	NC_001264	C	6	6	13110	13115	0 %	0 %	0 %	100 %	161579495
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282	NC_001264	GCA	2	6	13231	13236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161579495
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292	NC_001264	CGC	3	9	13614	13622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807685
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390	NC_001264	CTC	2	6	17594	17599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15807688
391	NC_001264	CAC	2	6	17601	17606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15807688
392	NC_001264	GACC	2	8	17835	17842	25 %	0 %	25 %	50 %	15807689
393	NC_001264	CGG	2	6	17918	17923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807689
394	NC_001264	CGC	2	6	17931	17936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807689
395	NC_001264	CGT	2	6	17985	17990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807689
396	NC_001264	CGG	2	6	18042	18047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807689
397	NC_001264	GCT	2	6	18060	18065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807689
398	NC_001264	CGG	2	6	18071	18076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807689
399	NC_001264	CTGC	2	8	18100	18107	0 %	25 %	25 %	50 %	15807689
400	NC_001264	ACG	2	6	18277	18282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807689
401	NC_001264	CTT	2	6	18475	18480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15808028
402	NC_001264	GTTC	2	8	18483	18490	0 %	50 %	25 %	25 %	15808028
403	NC_001264	CACGTC	2	12	18556	18567	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15808028
404	NC_001264	CGC	3	9	18618	18626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15808028
405	NC_001264	GTT	2	6	18637	18642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15808028
406	NC_001264	CGT	2	6	18666	18671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808028
407	NC_001264	CGG	2	6	18714	18719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15808028
408	NC_001264	TGG	2	6	18723	18728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15808028
409	NC_001264	CG	3	6	18750	18755	0 %	0 %	50 %	50 %	15808028
410	NC_001264	GC	3	6	18825	18830	0 %	0 %	50 %	50 %	15808028
411	NC_001264	TGA	2	6	18840	18845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15808028
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415	NC_001264	CGG	2	6	19016	19021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15808028
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417	NC_001264	GGT	2	6	19057	19062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15808028
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429	NC_001264	CTG	2	6	19398	19403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808028
430	NC_001264	TTG	2	6	19441	19446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15808028
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434	NC_001264	CGC	2	6	19577	19582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15808028
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441	NC_001264	GTC	2	6	19944	19949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15808028
442	NC_001264	GCG	2	6	19973	19978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15808028
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444	NC_001264	CAG	2	6	20022	20027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15808028
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452	NC_001264	TGC	2	6	20279	20284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807690
453	NC_001264	CGA	2	6	20322	20327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807690
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455	NC_001264	GGC	3	9	20475	20483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807690
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461	NC_001264	GCC	2	6	20660	20665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807690
462	NC_001264	CCG	2	6	20729	20734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807690
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465	NC_001264	GAC	2	6	20782	20787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15807690
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471	NC_001264	CCG	2	6	20954	20959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807690
472	NC_001264	CGC	2	6	20967	20972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807690
473	NC_001264	TGG	2	6	21011	21016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15807690
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490	NC_001264	GGC	3	9	21467	21475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15807691
491	NC_001264	GCC	2	6	21489	21494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807691
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497	NC_001264	GCT	2	6	21989	21994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807692
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499	NC_001264	CTG	2	6	22080	22085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15807692
500	NC_001264	GCC	2	6	22151	22156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15807692

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