MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus radiodurans R1 plasmid CP1

Total Repeats: 613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000959	CCT	2	6	82	87	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957549
2	NC_000959	CGT	2	6	129	134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957549
3	NC_000959	TGA	2	6	189	194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957549
4	NC_000959	GCA	2	6	213	218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957549
5	NC_000959	CCGCA	2	10	226	235	20 %	0 %	20 %	60 %	10957549
6	NC_000959	TC	3	6	755	760	0 %	50 %	0 %	50 %	10957531
7	NC_000959	TGA	3	9	772	780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957531
8	NC_000959	AAT	2	6	802	807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957531
9	NC_000959	CCA	2	6	835	840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957531
10	NC_000959	ACGA	2	8	905	912	50 %	0 %	25 %	25 %	10957531
11	NC_000959	CT	3	6	947	952	0 %	50 %	0 %	50 %	10957531
12	NC_000959	TCCT	2	8	1123	1130	0 %	50 %	0 %	50 %	10957531
13	NC_000959	GCA	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957531
14	NC_000959	CCCT	2	8	1196	1203	0 %	25 %	0 %	75 %	10957531
15	NC_000959	CGG	2	6	1254	1259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957531
16	NC_000959	AGC	2	6	1353	1358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957531
17	NC_000959	TGCG	2	8	1477	1484	0 %	25 %	50 %	25 %	10957531
18	NC_000959	CCT	2	6	1559	1564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957531
19	NC_000959	TGA	2	6	1597	1602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957531
20	NC_000959	GCGG	2	8	1790	1797	0 %	0 %	75 %	25 %	10957531
21	NC_000959	TGG	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957531
22	NC_000959	GCTC	2	8	1869	1876	0 %	25 %	25 %	50 %	10957531
23	NC_000959	TGA	2	6	1949	1954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957531
24	NC_000959	GTT	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957548
25	NC_000959	GTGG	2	8	2040	2047	0 %	25 %	75 %	0 %	10957548
26	NC_000959	AGC	2	6	2051	2056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957548
27	NC_000959	TGGGA	2	10	2075	2084	20 %	20 %	60 %	0 %	10957548
28	NC_000959	TGC	2	6	2129	2134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957548
29	NC_000959	GCTTTA	2	12	2176	2187	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	10957548
30	NC_000959	CTGG	2	8	2244	2251	0 %	25 %	50 %	25 %	10957548
31	NC_000959	CTG	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957548
32	NC_000959	TCG	2	6	2353	2358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957548
33	NC_000959	GAA	2	6	2367	2372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957548
34	NC_000959	GCT	2	6	2484	2489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957548
35	NC_000959	AC	3	6	2531	2536	50 %	0 %	0 %	50 %	10957548
36	NC_000959	TTG	2	6	2572	2577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957548
37	NC_000959	CA	3	6	2638	2643	50 %	0 %	0 %	50 %	10957548
38	NC_000959	GAC	2	6	3328	3333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789332
39	NC_000959	A	9	9	3506	3514	100 %	0 %	0 %	0 %	15789332
40	NC_000959	T	7	7	4827	4833	0 %	100 %	0 %	0 %	10957532
41	NC_000959	CAG	2	6	4837	4842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957532
42	NC_000959	GTT	2	6	4858	4863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957532
43	NC_000959	TGCTT	2	10	4914	4923	0 %	60 %	20 %	20 %	10957532
44	NC_000959	CAG	3	9	4994	5002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957532
45	NC_000959	CGC	2	6	5094	5099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957532
46	NC_000959	GTC	2	6	5102	5107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957532
47	NC_000959	CAG	2	6	5171	5176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957532
48	NC_000959	TGG	2	6	5278	5283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957532
49	NC_000959	TGC	2	6	5320	5325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957532
50	NC_000959	GGC	2	6	5491	5496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957545
51	NC_000959	TTTC	2	8	5503	5510	0 %	75 %	0 %	25 %	10957545
52	NC_000959	ACC	2	6	5565	5570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957545
53	NC_000959	TGG	2	6	5695	5700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957545
54	NC_000959	GCG	2	6	5831	5836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957545
55	NC_000959	AG	3	6	5846	5851	50 %	0 %	50 %	0 %	10957545
56	NC_000959	GCG	2	6	5876	5881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957545
57	NC_000959	CTG	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957545
58	NC_000959	CAC	2	6	6020	6025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957545
59	NC_000959	CGT	2	6	6104	6109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957545
60	NC_000959	CT	3	6	6135	6140	0 %	50 %	0 %	50 %	10957545
61	NC_000959	GGCCAC	2	12	6152	6163	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	10957545
62	NC_000959	AGG	2	6	6215	6220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957550
63	NC_000959	CTC	2	6	6238	6243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957550
64	NC_000959	TGC	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957550
65	NC_000959	CTT	2	6	6330	6335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957550
66	NC_000959	TGA	2	6	6345	6350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957550
67	NC_000959	GCCAAG	2	12	6353	6364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957550
68	NC_000959	CAT	2	6	6372	6377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957550
69	NC_000959	GTC	2	6	6394	6399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957550
70	NC_000959	AGA	2	6	6417	6422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957550
71	NC_000959	CTGG	2	8	6438	6445	0 %	25 %	50 %	25 %	10957550
72	NC_000959	GCC	2	6	6461	6466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957550
73	NC_000959	CGA	2	6	6467	6472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957550
74	NC_000959	TCG	2	6	6514	6519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957550
75	NC_000959	AAG	2	6	6674	6679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957550
76	NC_000959	AT	4	8	6764	6771	50 %	50 %	0 %	0 %	10957550
77	NC_000959	CTG	2	6	6787	6792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957550
78	NC_000959	AAG	2	6	6833	6838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957550
79	NC_000959	GCG	2	6	6950	6955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957550
80	NC_000959	ATC	2	6	7013	7018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957550
81	NC_000959	CGT	2	6	7138	7143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957550
82	NC_000959	TGA	2	6	7379	7384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957550
83	NC_000959	GTC	2	6	7392	7397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957550
84	NC_000959	AG	3	6	7404	7409	50 %	0 %	50 %	0 %	10957550
85	NC_000959	CAA	2	6	7410	7415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957550
86	NC_000959	TTG	2	6	7416	7421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957550
87	NC_000959	GGGT	2	8	7441	7448	0 %	25 %	75 %	0 %	10957550
88	NC_000959	GGC	2	6	7556	7561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957560
89	NC_000959	GAA	2	6	7689	7694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957560
90	NC_000959	CAG	2	6	7739	7744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957560
91	NC_000959	CAG	2	6	7779	7784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957560
92	NC_000959	ATA	2	6	7872	7877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957560
93	NC_000959	AAC	2	6	7968	7973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957560
94	NC_000959	GCC	2	6	8010	8015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957560
95	NC_000959	ACC	2	6	8024	8029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957560
96	NC_000959	GAC	2	6	8049	8054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957560
97	NC_000959	ACA	2	6	8347	8352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957551
98	NC_000959	GCC	2	6	8395	8400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957551
99	NC_000959	TC	3	6	8554	8559	0 %	50 %	0 %	50 %	10957551
100	NC_000959	GCC	2	6	8637	8642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957551
101	NC_000959	GTG	2	6	8717	8722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957551
102	NC_000959	TGG	2	6	8775	8780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957551
103	NC_000959	CGA	2	6	8798	8803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957551
104	NC_000959	CTC	2	6	8805	8810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957551
105	NC_000959	GCTC	2	8	8918	8925	0 %	25 %	25 %	50 %	10957551
106	NC_000959	AGC	2	6	8956	8961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957551
107	NC_000959	GCC	3	9	9001	9009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957551
108	NC_000959	CCA	2	6	9222	9227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957551
109	NC_000959	AGC	2	6	9275	9280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957551
110	NC_000959	CTG	2	6	9360	9365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957551
111	NC_000959	TGT	2	6	9414	9419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957551
112	NC_000959	AAGGAA	2	12	9451	9462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957551
113	NC_000959	ATC	2	6	9517	9522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957551
114	NC_000959	TAC	2	6	9538	9543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957551
115	NC_000959	TGG	2	6	9598	9603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957551
116	NC_000959	GGC	2	6	9616	9621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957551
117	NC_000959	CAA	2	6	9625	9630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957551
118	NC_000959	AGG	2	6	9751	9756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957551
119	NC_000959	CATC	2	8	9894	9901	25 %	25 %	0 %	50 %	10957551
120	NC_000959	GGC	2	6	9904	9909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957551
121	NC_000959	CGT	2	6	9915	9920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957551
122	NC_000959	CGA	2	6	9951	9956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957551
123	NC_000959	CGTT	2	8	10040	10047	0 %	50 %	25 %	25 %	10957551
124	NC_000959	GAC	2	6	10076	10081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957551
125	NC_000959	CGA	2	6	10136	10141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957551
126	NC_000959	TGG	2	6	10489	10494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957533
127	NC_000959	TGA	2	6	10679	10684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957533
128	NC_000959	CTT	2	6	10827	10832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957533
129	NC_000959	CTG	2	6	10899	10904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957533
130	NC_000959	CGG	2	6	10910	10915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957533
131	NC_000959	GTC	2	6	12814	12819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957534
132	NC_000959	GCC	2	6	12886	12891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957534
133	NC_000959	CGG	2	6	12947	12952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957534
134	NC_000959	GAT	2	6	12997	13002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957534
135	NC_000959	CTG	2	6	13018	13023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957534
136	NC_000959	GGA	2	6	13050	13055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957534
137	NC_000959	GCG	2	6	13071	13076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957534
138	NC_000959	TGC	2	6	13148	13153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957534
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152	NC_000959	G	6	6	13952	13957	0 %	0 %	100 %	0 %	10957546
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261	NC_000959	CAC	3	9	20025	20033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789333
262	NC_000959	GAA	3	9	20128	20136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957535
263	NC_000959	CTG	2	6	20156	20161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957535
264	NC_000959	CCGA	2	8	20267	20274	25 %	0 %	25 %	50 %	10957535
265	NC_000959	CGC	2	6	20315	20320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957535
266	NC_000959	TGA	2	6	20382	20387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957535
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268	NC_000959	GAC	2	6	20514	20519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957535
269	NC_000959	GGA	2	6	20525	20530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957535
270	NC_000959	GTC	2	6	20545	20550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957535
271	NC_000959	GCG	2	6	20580	20585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957535
272	NC_000959	CGC	2	6	20633	20638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957535
273	NC_000959	CTG	2	6	20656	20661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957535
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277	NC_000959	GAC	2	6	20900	20905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957536
278	NC_000959	GCT	2	6	20935	20940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957536
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280	NC_000959	TGA	2	6	21017	21022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957536
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282	NC_000959	ATC	2	6	21041	21046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957536
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284	NC_000959	CTG	2	6	21133	21138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957536
285	NC_000959	ACC	2	6	21270	21275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957536
286	NC_000959	CTCTT	2	10	21577	21586	0 %	60 %	0 %	40 %	15789334
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288	NC_000959	CAA	2	6	21635	21640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15789334
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293	NC_000959	CAG	2	6	21900	21905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789334
294	NC_000959	GGA	2	6	21936	21941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15789334
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302	NC_000959	GCTAC	2	10	22395	22404	20 %	20 %	20 %	40 %	15789334
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386	NC_000959	TCT	2	6	29329	29334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957537
387	NC_000959	CTG	2	6	29348	29353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957537
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392	NC_000959	TTG	2	6	29650	29655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957537
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