MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 72355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_022579	GCT	2	6	1210127	1210132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594771
23503	NC_022579	T	6	6	1210157	1210162	0 %	100 %	0 %	0 %	551594771
23504	NC_022579	TAC	2	6	1210182	1210187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594771
23505	NC_022579	GCG	2	6	1210203	1210208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594771
23506	NC_022579	TGT	2	6	1210292	1210297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551594771
23507	NC_022579	GTTTT	2	10	1210346	1210355	0 %	80 %	20 %	0 %	551594771
23508	NC_022579	CAT	2	6	1210364	1210369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594771
23509	NC_022579	ATG	2	6	1210372	1210377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594771
23510	NC_022579	TCA	2	6	1210393	1210398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594771
23511	NC_022579	TGA	2	6	1210544	1210549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594771
23512	NC_022579	CAGC	2	8	1210581	1210588	25 %	0 %	25 %	50 %	551594771
23513	NC_022579	GTTCA	2	10	1210650	1210659	20 %	40 %	20 %	20 %	551594771
23514	NC_022579	TA	3	6	1210680	1210685	50 %	50 %	0 %	0 %	551594771
23515	NC_022579	GC	3	6	1210708	1210713	0 %	0 %	50 %	50 %	551594771
23516	NC_022579	CCAT	2	8	1210798	1210805	25 %	25 %	0 %	50 %	551594771
23517	NC_022579	GCCT	2	8	1210922	1210929	0 %	25 %	25 %	50 %	551594771
23518	NC_022579	CAA	2	6	1210961	1210966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551594771
23519	NC_022579	CAG	2	6	1210988	1210993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594771
23520	NC_022579	TG	3	6	1211009	1211014	0 %	50 %	50 %	0 %	551594771
23521	NC_022579	AGC	2	6	1211148	1211153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23522	NC_022579	GATT	2	8	1211241	1211248	25 %	50 %	25 %	0 %	551594772
23523	NC_022579	T	7	7	1211279	1211285	0 %	100 %	0 %	0 %	551594772
23524	NC_022579	CAGC	2	8	1211364	1211371	25 %	0 %	25 %	50 %	551594772
23525	NC_022579	TGA	2	6	1211456	1211461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594772
23526	NC_022579	GCG	2	6	1211466	1211471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594772
23527	NC_022579	GAC	2	6	1211562	1211567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594772
23528	NC_022579	CAG	2	6	1211574	1211579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594772
23529	NC_022579	ATC	2	6	1211589	1211594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594772
23530	NC_022579	GCA	2	6	1211815	1211820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594772
23531	NC_022579	CCGT	2	8	1211928	1211935	0 %	25 %	25 %	50 %	551594772
23532	NC_022579	CAGT	2	8	1211939	1211946	25 %	25 %	25 %	25 %	551594772
23533	NC_022579	GCG	2	6	1212001	1212006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594772
23534	NC_022579	GCA	2	6	1212032	1212037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594772
23535	NC_022579	TTC	2	6	1212087	1212092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551594772
23536	NC_022579	CTT	2	6	1212122	1212127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551594772
23537	NC_022579	CTG	2	6	1212207	1212212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594772
23538	NC_022579	CGTT	2	8	1212220	1212227	0 %	50 %	25 %	25 %	551594772
23539	NC_022579	TCG	2	6	1212304	1212309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594772
23540	NC_022579	CGC	2	6	1212341	1212346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551594772
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23542	NC_022579	ATA	2	6	1212436	1212441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551594772
23543	NC_022579	GCT	2	6	1212506	1212511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594772
23544	NC_022579	TCA	2	6	1212517	1212522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594772
23545	NC_022579	GAT	2	6	1212579	1212584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594772
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23547	NC_022579	TTA	2	6	1212760	1212765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551594772
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23549	NC_022579	T	6	6	1212828	1212833	0 %	100 %	0 %	0 %	551594772
23550	NC_022579	CTTT	2	8	1212862	1212869	0 %	75 %	0 %	25 %	551594772
23551	NC_022579	TCCT	2	8	1212906	1212913	0 %	50 %	0 %	50 %	551594772
23552	NC_022579	AAAG	2	8	1213063	1213070	75 %	0 %	25 %	0 %	551594772
23553	NC_022579	CGCCTT	2	12	1213105	1213116	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	551594772
23554	NC_022579	AGC	2	6	1213123	1213128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594772
23555	NC_022579	AGC	2	6	1213165	1213170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594772
23556	NC_022579	TA	3	6	1213221	1213226	50 %	50 %	0 %	0 %	551594772
23557	NC_022579	A	6	6	1213270	1213275	100 %	0 %	0 %	0 %	551594772
23558	NC_022579	ATA	2	6	1213281	1213286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551594772
23559	NC_022579	TCT	2	6	1213296	1213301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551594772
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23562	NC_022579	GTTT	2	8	1213648	1213655	0 %	75 %	25 %	0 %	551594773
23563	NC_022579	CAG	2	6	1213706	1213711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594773
23564	NC_022579	CCA	2	6	1213762	1213767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551594773
23565	NC_022579	GT	3	6	1213768	1213773	0 %	50 %	50 %	0 %	551594773
23566	NC_022579	ATG	2	6	1213803	1213808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594773
23567	NC_022579	AGC	2	6	1213868	1213873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594773
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23569	NC_022579	ATA	2	6	1214090	1214095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23570	NC_022579	ATGTA	2	10	1214096	1214105	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23571	NC_022579	A	7	7	1214150	1214156	100 %	0 %	0 %	0 %	551594774
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23573	NC_022579	T	7	7	1214242	1214248	0 %	100 %	0 %	0 %	551594774
23574	NC_022579	A	6	6	1214381	1214386	100 %	0 %	0 %	0 %	551594774
23575	NC_022579	GGC	2	6	1214519	1214524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594774
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23581	NC_022579	CT	5	10	1214940	1214949	0 %	50 %	0 %	50 %	551594774
23582	NC_022579	AT	3	6	1214964	1214969	50 %	50 %	0 %	0 %	551594774
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23586	NC_022579	CGG	2	6	1215160	1215165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594774
23587	NC_022579	A	6	6	1215209	1215214	100 %	0 %	0 %	0 %	551594774
23588	NC_022579	AGA	2	6	1215232	1215237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551594774
23589	NC_022579	ATTC	2	8	1215268	1215275	25 %	50 %	0 %	25 %	551594774
23590	NC_022579	A	6	6	1215360	1215365	100 %	0 %	0 %	0 %	551594774
23591	NC_022579	ACC	2	6	1215371	1215376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551594774
23592	NC_022579	TGC	2	6	1215382	1215387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594774
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23602	NC_022579	A	7	7	1215930	1215936	100 %	0 %	0 %	0 %	551594774
23603	NC_022579	TAAA	2	8	1215951	1215958	75 %	25 %	0 %	0 %	551594774
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23610	NC_022579	GA	3	6	1216393	1216398	50 %	0 %	50 %	0 %	551594774
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23855	NC_022579	TGA	2	6	1229850	1229855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594788
23856	NC_022579	GC	3	6	1229908	1229913	0 %	0 %	50 %	50 %	551594788
23857	NC_022579	GGC	2	6	1229941	1229946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594788
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23978	NC_022579	A	6	6	1234869	1234874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23985	NC_022579	GCC	2	6	1235170	1235175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23986	NC_022579	CCG	2	6	1235205	1235210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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23999	NC_022579	GCCT	2	8	1235709	1235716	0 %	25 %	25 %	50 %	551594794
24000	NC_022579	ATT	3	9	1235719	1235727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551594794

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