MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 72355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022579	TCC	2	6	667613	667618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13002	NC_022579	TGC	2	6	667668	667673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_022579	CT	3	6	667700	667705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13004	NC_022579	AC	3	6	667783	667788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13005	NC_022579	TCGC	2	8	667808	667815	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13006	NC_022579	GATT	2	8	667834	667841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_022579	TCC	2	6	667847	667852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13008	NC_022579	TTCAC	2	10	667867	667876	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13009	NC_022579	TAA	2	6	668053	668058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_022579	TCTT	2	8	668063	668070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13011	NC_022579	GGA	2	6	668135	668140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_022579	ACA	2	6	668156	668161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_022579	TGG	2	6	668204	668209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_022579	GTG	2	6	668295	668300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551594256
13015	NC_022579	TAGA	2	8	668305	668312	50 %	25 %	25 %	0 %	551594256
13016	NC_022579	AGG	2	6	668451	668456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_022579	GTG	2	6	668577	668582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_022579	GT	3	6	668592	668597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_022579	CA	3	6	668660	668665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13020	NC_022579	CCA	2	6	668746	668751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13021	NC_022579	GTA	2	6	668754	668759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_022579	GT	3	6	668761	668766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_022579	ATG	2	6	668786	668791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_022579	CGT	2	6	668798	668803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_022579	TCC	2	6	668812	668817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13026	NC_022579	CCA	2	6	668848	668853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_022579	GAC	2	6	668926	668931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13028	NC_022579	GCA	2	6	668938	668943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_022579	CTC	2	6	668970	668975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13030	NC_022579	TTC	2	6	669016	669021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_022579	CATC	2	8	669168	669175	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13032	NC_022579	GCC	2	6	669258	669263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13033	NC_022579	TCC	2	6	669278	669283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13034	NC_022579	GCC	2	6	669404	669409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13035	NC_022579	CG	3	6	669412	669417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13036	NC_022579	GCT	2	6	669468	669473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_022579	AG	3	6	669519	669524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_022579	TTC	2	6	669542	669547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_022579	CCT	2	6	669548	669553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13040	NC_022579	CTG	2	6	669637	669642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_022579	TCG	2	6	669712	669717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_022579	TC	3	6	669801	669806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13043	NC_022579	CTA	2	6	669909	669914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_022579	GAA	2	6	669922	669927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_022579	CCA	2	6	669962	669967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13046	NC_022579	TATG	2	8	670036	670043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_022579	GTC	2	6	670045	670050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_022579	AGT	2	6	670125	670130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_022579	CGAAA	2	10	670211	670220	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13050	NC_022579	GCG	2	6	670277	670282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13051	NC_022579	GAT	2	6	670298	670303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_022579	CAA	2	6	670318	670323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_022579	ATTT	2	8	670333	670340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_022579	T	8	8	670427	670434	0 %	100 %	0 %	0 %	551594257
13055	NC_022579	CTT	2	6	670453	670458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551594257
13056	NC_022579	AAG	2	6	670461	670466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551594257
13057	NC_022579	CCG	2	6	670608	670613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13058	NC_022579	GTCA	2	8	670743	670750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13059	NC_022579	A	7	7	670750	670756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_022579	ATT	2	6	670844	670849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_022579	AT	3	6	670854	670859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_022579	CTA	2	6	670904	670909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594258
13063	NC_022579	AAC	2	6	670925	670930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551594258
13064	NC_022579	AGC	2	6	670974	670979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594258
13065	NC_022579	ATC	2	6	671097	671102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594258
13066	NC_022579	GAA	2	6	671153	671158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551594258
13067	NC_022579	GAC	2	6	671168	671173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594258
13068	NC_022579	CAG	2	6	671195	671200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594258
13069	NC_022579	C	6	6	671238	671243	0 %	0 %	0 %	100 %	551594258
13070	NC_022579	AC	3	6	671332	671337	50 %	0 %	0 %	50 %	551594258
13071	NC_022579	CAA	2	6	671399	671404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551594258
13072	NC_022579	A	6	6	671430	671435	100 %	0 %	0 %	0 %	551594258
13073	NC_022579	TA	3	6	671471	671476	50 %	50 %	0 %	0 %	551594258
13074	NC_022579	TGA	2	6	671501	671506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594258
13075	NC_022579	A	8	8	671523	671530	100 %	0 %	0 %	0 %	551594258
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13077	NC_022579	ATC	2	6	671576	671581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594258
13078	NC_022579	CTG	2	6	671607	671612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594258
13079	NC_022579	ATAG	2	8	671622	671629	50 %	25 %	25 %	0 %	551594258
13080	NC_022579	C	6	6	671638	671643	0 %	0 %	0 %	100 %	551594258
13081	NC_022579	A	7	7	671696	671702	100 %	0 %	0 %	0 %	551594258
13082	NC_022579	CT	3	6	671711	671716	0 %	50 %	0 %	50 %	551594258
13083	NC_022579	A	6	6	671730	671735	100 %	0 %	0 %	0 %	551594258
13084	NC_022579	AATTA	2	10	671753	671762	60 %	40 %	0 %	0 %	551594258
13085	NC_022579	ATCCC	2	10	671782	671791	20 %	20 %	0 %	60 %	551594258
13086	NC_022579	AT	3	6	671807	671812	50 %	50 %	0 %	0 %	551594258
13087	NC_022579	ACA	2	6	671931	671936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551594258
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13091	NC_022579	ACC	2	6	672113	672118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13092	NC_022579	GGA	2	6	672148	672153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_022579	AT	3	6	672182	672187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_022579	AGC	2	6	672210	672215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_022579	TAC	2	6	672271	672276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_022579	T	6	6	672279	672284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_022579	CA	3	6	672302	672307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13098	NC_022579	TGCC	2	8	672419	672426	0 %	25 %	25 %	50 %	551594259
13099	NC_022579	CAT	2	6	672504	672509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594259
13100	NC_022579	TGC	2	6	672596	672601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594259
13101	NC_022579	CAG	2	6	672613	672618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594259
13102	NC_022579	TAA	2	6	672702	672707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551594259
13103	NC_022579	GCCT	2	8	672736	672743	0 %	25 %	25 %	50 %	551594259
13104	NC_022579	TGA	2	6	672767	672772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594259
13105	NC_022579	CTG	2	6	672889	672894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594259
13106	NC_022579	CCA	2	6	672932	672937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551594259
13107	NC_022579	GAC	2	6	672961	672966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594259
13108	NC_022579	CTG	3	9	672982	672990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594259
13109	NC_022579	CAGACC	2	12	672997	673008	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	551594259
13110	NC_022579	CGCATG	2	12	673027	673038	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	551594259
13111	NC_022579	ACT	3	9	673163	673171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594259
13112	NC_022579	A	6	6	673243	673248	100 %	0 %	0 %	0 %	551594259
13113	NC_022579	TCA	2	6	673367	673372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594259
13114	NC_022579	GCA	2	6	673420	673425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594259
13115	NC_022579	TTG	2	6	673433	673438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551594259
13116	NC_022579	AGA	2	6	673555	673560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551594259
13117	NC_022579	CAC	2	6	673617	673622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551594259
13118	NC_022579	GCAT	2	8	673676	673683	25 %	25 %	25 %	25 %	551594259
13119	NC_022579	GACC	2	8	673692	673699	25 %	0 %	25 %	50 %	551594259
13120	NC_022579	TGA	2	6	673719	673724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594259
13121	NC_022579	A	7	7	673755	673761	100 %	0 %	0 %	0 %	551594259
13122	NC_022579	TGC	2	6	673896	673901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594259
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13124	NC_022579	AAG	2	6	673957	673962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551594259
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13126	NC_022579	TGT	2	6	674049	674054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551594259
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13156	NC_022579	TGC	2	6	675437	675442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594259
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13243	NC_022579	AGCA	2	8	679555	679562	50 %	0 %	25 %	25 %	551594265
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13247	NC_022579	T	6	6	679680	679685	0 %	100 %	0 %	0 %	551594266
13248	NC_022579	CTG	2	6	679689	679694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594266
13249	NC_022579	GAT	2	6	679899	679904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594266
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13252	NC_022579	CCA	2	6	680116	680121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551594266
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13255	NC_022579	GGC	2	6	680178	680183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594266
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13259	NC_022579	AACTG	2	10	680437	680446	40 %	20 %	20 %	20 %	551594267
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13263	NC_022579	CTG	3	9	680831	680839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594267
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13268	NC_022579	ACC	2	6	681137	681142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551594267
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13270	NC_022579	AT	3	6	681279	681284	50 %	50 %	0 %	0 %	551594267
13271	NC_022579	GCCT	2	8	681339	681346	0 %	25 %	25 %	50 %	551594267
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13274	NC_022579	T	6	6	681418	681423	0 %	100 %	0 %	0 %	551594267
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13277	NC_022579	TAC	2	6	681600	681605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594267
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13282	NC_022579	ATC	2	6	681774	681779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594267
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13286	NC_022579	T	6	6	681996	682001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13287	NC_022579	ATA	2	6	682002	682007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13288	NC_022579	AT	3	6	682036	682041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13289	NC_022579	TTA	2	6	682051	682056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13294	NC_022579	CCCTTA	2	12	682344	682355	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
13295	NC_022579	CAT	2	6	682484	682489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13298	NC_022579	TAA	2	6	682604	682609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13299	NC_022579	ACC	2	6	682692	682697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551594269
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13336	NC_022579	A	9	9	684386	684394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13337	NC_022579	GCA	2	6	684569	684574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594270
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13352	NC_022579	TCAA	2	8	685520	685527	50 %	25 %	0 %	25 %	551594270
13353	NC_022579	GC	3	6	685586	685591	0 %	0 %	50 %	50 %	551594270
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13357	NC_022579	TTA	2	6	685844	685849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551594270
13358	NC_022579	TTC	2	6	685867	685872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551594270
13359	NC_022579	T	6	6	685873	685878	0 %	100 %	0 %	0 %	551594270
13360	NC_022579	TTA	2	6	685915	685920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13361	NC_022579	TA	3	6	685924	685929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13362	NC_022579	TAC	2	6	685950	685955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594271
13363	NC_022579	TTC	2	6	685997	686002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551594271
13364	NC_022579	T	6	6	686090	686095	0 %	100 %	0 %	0 %	551594271
13365	NC_022579	ATC	2	6	686252	686257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594271
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13367	NC_022579	AT	3	6	686417	686422	50 %	50 %	0 %	0 %	551594271
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13493	NC_022579	GCCT	2	8	692651	692658	0 %	25 %	25 %	50 %	551594278
13494	NC_022579	TCA	2	6	692660	692665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594278
13495	NC_022579	ATC	2	6	692761	692766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594278
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13497	NC_022579	TCT	2	6	692882	692887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551594278
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13499	NC_022579	ACGA	2	8	693028	693035	50 %	0 %	25 %	25 %	551594278
13500	NC_022579	CTT	2	6	693133	693138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551594278

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