MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 72355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_022579	TTGAC	2	10	641134	641143	20 %	40 %	20 %	20 %	551594233
12502	NC_022579	AGC	2	6	641150	641155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594233
12503	NC_022579	AAG	2	6	641209	641214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551594233
12504	NC_022579	AGA	2	6	641240	641245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551594233
12505	NC_022579	GAAAT	2	10	641268	641277	60 %	20 %	20 %	0 %	551594233
12506	NC_022579	TCT	2	6	641299	641304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551594233
12507	NC_022579	CAC	2	6	641309	641314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551594234
12508	NC_022579	GCA	2	6	641328	641333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594234
12509	NC_022579	TC	3	6	641344	641349	0 %	50 %	0 %	50 %	551594234
12510	NC_022579	CGA	2	6	641398	641403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594234
12511	NC_022579	TA	4	8	641426	641433	50 %	50 %	0 %	0 %	551594234
12512	NC_022579	ATC	2	6	641609	641614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594234
12513	NC_022579	CGG	2	6	641668	641673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594234
12514	NC_022579	AGG	2	6	641747	641752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551594234
12515	NC_022579	AAAT	2	8	641755	641762	75 %	25 %	0 %	0 %	551594234
12516	NC_022579	CGG	2	6	641954	641959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594234
12517	NC_022579	ACAAA	2	10	642035	642044	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12518	NC_022579	A	8	8	642042	642049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_022579	T	9	9	642126	642134	0 %	100 %	0 %	0 %	551594235
12520	NC_022579	TCA	2	6	642196	642201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594235
12521	NC_022579	A	6	6	642287	642292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_022579	AAT	2	6	642305	642310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_022579	A	6	6	642318	642323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_022579	TAAA	2	8	642381	642388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_022579	AT	4	8	642405	642412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_022579	CTA	2	6	642430	642435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12527	NC_022579	T	6	6	642468	642473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_022579	TAA	2	6	642483	642488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_022579	ATTTTT	2	12	642511	642522	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_022579	GCA	3	9	642557	642565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594236
12531	NC_022579	GAA	2	6	642584	642589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551594236
12532	NC_022579	A	7	7	642716	642722	100 %	0 %	0 %	0 %	551594236
12533	NC_022579	TATT	2	8	642759	642766	25 %	75 %	0 %	0 %	551594236
12534	NC_022579	TGA	2	6	642841	642846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594236
12535	NC_022579	GCT	2	6	642848	642853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594236
12536	NC_022579	TGA	2	6	642928	642933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594236
12537	NC_022579	CTT	2	6	642997	643002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551594236
12538	NC_022579	TGT	2	6	643039	643044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551594236
12539	NC_022579	TTTG	2	8	643051	643058	0 %	75 %	25 %	0 %	551594236
12540	NC_022579	GCA	2	6	643169	643174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594236
12541	NC_022579	A	6	6	643184	643189	100 %	0 %	0 %	0 %	551594236
12542	NC_022579	AAAG	2	8	643205	643212	75 %	0 %	25 %	0 %	551594236
12543	NC_022579	A	6	6	643245	643250	100 %	0 %	0 %	0 %	551594236
12544	NC_022579	TTA	2	6	643281	643286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551594236
12545	NC_022579	AGC	2	6	643429	643434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594236
12546	NC_022579	A	6	6	643475	643480	100 %	0 %	0 %	0 %	551594236
12547	NC_022579	TCAT	2	8	643514	643521	25 %	50 %	0 %	25 %	551594236
12548	NC_022579	AAC	2	6	643575	643580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551594236
12549	NC_022579	TTA	2	6	643670	643675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551594237
12550	NC_022579	AGC	2	6	643709	643714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594237
12551	NC_022579	TAT	2	6	643746	643751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551594237
12552	NC_022579	ACA	2	6	643763	643768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12553	NC_022579	ATA	2	6	643779	643784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_022579	A	6	6	643798	643803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_022579	TA	4	8	643837	643844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_022579	GCTTCG	2	12	643966	643977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594238
12557	NC_022579	TGA	2	6	643986	643991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594238
12558	NC_022579	GAA	2	6	643998	644003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551594238
12559	NC_022579	CAC	2	6	644056	644061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551594238
12560	NC_022579	AGT	2	6	644100	644105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594238
12561	NC_022579	T	6	6	644121	644126	0 %	100 %	0 %	0 %	551594238
12562	NC_022579	TAA	2	6	644142	644147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551594238
12563	NC_022579	GAA	2	6	644152	644157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551594238
12564	NC_022579	AGTTAA	2	12	644214	644225	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	551594238
12565	NC_022579	ATGA	2	8	644317	644324	50 %	25 %	25 %	0 %	551594238
12566	NC_022579	TGG	2	6	644372	644377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551594238
12567	NC_022579	A	6	6	644411	644416	100 %	0 %	0 %	0 %	551594238
12568	NC_022579	GA	3	6	644521	644526	50 %	0 %	50 %	0 %	551594238
12569	NC_022579	AAT	2	6	644539	644544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551594238
12570	NC_022579	TGA	2	6	644688	644693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594238
12571	NC_022579	TGA	2	6	644784	644789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594238
12572	NC_022579	CAA	2	6	644797	644802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551594238
12573	NC_022579	CAA	2	6	644805	644810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551594238
12574	NC_022579	TCAT	2	8	644826	644833	25 %	50 %	0 %	25 %	551594238
12575	NC_022579	GCA	2	6	644872	644877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594238
12576	NC_022579	TCATA	2	10	644878	644887	40 %	40 %	0 %	20 %	551594238
12577	NC_022579	AAAT	2	8	645058	645065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12578	NC_022579	TG	4	8	645083	645090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_022579	CA	3	6	645094	645099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12580	NC_022579	CCA	2	6	645106	645111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12581	NC_022579	ATA	2	6	645124	645129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_022579	TTA	2	6	645191	645196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_022579	CTG	2	6	645307	645312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594239
12584	NC_022579	AAC	2	6	645324	645329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551594239
12585	NC_022579	CAGG	2	8	645376	645383	25 %	0 %	50 %	25 %	551594239
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12587	NC_022579	TC	3	6	645559	645564	0 %	50 %	0 %	50 %	551594239
12588	NC_022579	GAAA	2	8	645655	645662	75 %	0 %	25 %	0 %	551594239
12589	NC_022579	TGTA	2	8	645775	645782	25 %	50 %	25 %	0 %	551594239
12590	NC_022579	ATCA	2	8	645788	645795	50 %	25 %	0 %	25 %	551594239
12591	NC_022579	AG	3	6	645817	645822	50 %	0 %	50 %	0 %	551594239
12592	NC_022579	CAG	4	12	645824	645835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594239
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12594	NC_022579	GACT	2	8	646020	646027	25 %	25 %	25 %	25 %	551594239
12595	NC_022579	CGC	2	6	646042	646047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551594239
12596	NC_022579	ACT	2	6	646221	646226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594239
12597	NC_022579	GCT	2	6	646279	646284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594239
12598	NC_022579	CTT	2	6	646360	646365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551594239
12599	NC_022579	AGG	2	6	646411	646416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551594239
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12602	NC_022579	TTC	2	6	646785	646790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551594239
12603	NC_022579	TGCGT	2	10	646811	646820	0 %	40 %	40 %	20 %	551594239
12604	NC_022579	GT	3	6	646835	646840	0 %	50 %	50 %	0 %	551594239
12605	NC_022579	GCA	2	6	646911	646916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594239
12606	NC_022579	CTT	2	6	646945	646950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551594239
12607	NC_022579	TTG	2	6	646960	646965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551594239
12608	NC_022579	CA	3	6	647062	647067	50 %	0 %	0 %	50 %	551594239
12609	NC_022579	TATAT	2	10	647068	647077	40 %	60 %	0 %	0 %	551594239
12610	NC_022579	CTC	2	6	647151	647156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12611	NC_022579	GGA	2	6	647172	647177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_022579	ATT	2	6	647208	647213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551594240
12613	NC_022579	TCT	2	6	647223	647228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551594240
12614	NC_022579	GC	3	6	647255	647260	0 %	0 %	50 %	50 %	551594240
12615	NC_022579	A	6	6	647338	647343	100 %	0 %	0 %	0 %	551594240
12616	NC_022579	TCA	2	6	647366	647371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594240
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12618	NC_022579	CA	3	6	647456	647461	50 %	0 %	0 %	50 %	551594240
12619	NC_022579	AGCG	2	8	647463	647470	25 %	0 %	50 %	25 %	551594240
12620	NC_022579	AGC	2	6	647507	647512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594240
12621	NC_022579	CGC	2	6	647544	647549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551594240
12622	NC_022579	ATC	2	6	647608	647613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594240
12623	NC_022579	AGCCAC	2	12	647614	647625	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	551594240
12624	NC_022579	TGA	2	6	647658	647663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594240
12625	NC_022579	AAT	2	6	647756	647761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551594240
12626	NC_022579	TGG	2	6	647793	647798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551594240
12627	NC_022579	ATA	2	6	647837	647842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12628	NC_022579	AGC	2	6	647945	647950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594241
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12630	NC_022579	CTG	2	6	647978	647983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594241
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12634	NC_022579	TCA	2	6	648098	648103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594241
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12637	NC_022579	GCATC	2	10	648330	648339	20 %	20 %	20 %	40 %	551594241
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12641	NC_022579	TCA	2	6	648473	648478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594241
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12652	NC_022579	GGC	2	6	649048	649053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594241
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12654	NC_022579	CTG	2	6	649100	649105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594241
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12658	NC_022579	CGC	2	6	649501	649506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551594242
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12662	NC_022579	TTA	2	6	649719	649724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551594243
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12671	NC_022579	TTTC	2	8	650300	650307	0 %	75 %	0 %	25 %	551594243
12672	NC_022579	GCT	2	6	650323	650328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594243
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12687	NC_022579	GAAA	2	8	650944	650951	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12688	NC_022579	AATT	2	8	651001	651008	50 %	50 %	0 %	0 %	551594244
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12694	NC_022579	T	6	6	651207	651212	0 %	100 %	0 %	0 %	551594244
12695	NC_022579	GA	3	6	651286	651291	50 %	0 %	50 %	0 %	551594244
12696	NC_022579	AGTTA	2	10	651319	651328	40 %	40 %	20 %	0 %	551594244
12697	NC_022579	CCGAGG	2	12	651376	651387	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	551594244
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12731	NC_022579	CGGA	2	8	652868	652875	25 %	0 %	50 %	25 %	551594245
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12738	NC_022579	A	6	6	653396	653401	100 %	0 %	0 %	0 %	551594245
12739	NC_022579	CT	3	6	653451	653456	0 %	50 %	0 %	50 %	551594246
12740	NC_022579	GCC	2	6	653545	653550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551594246
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12991	NC_022579	GTATC	2	10	666502	666511	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12992	NC_022579	CA	3	6	666613	666618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12993	NC_022579	CTTT	2	8	666936	666943	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12994	NC_022579	GCT	2	6	666952	666957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12995	NC_022579	CCT	2	6	666968	666973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12996	NC_022579	CCA	2	6	666990	666995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12997	NC_022579	TGG	2	6	667135	667140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12998	NC_022579	AT	3	6	667199	667204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12999	NC_022579	GA	3	6	667209	667214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13000	NC_022579	AGT	2	6	667588	667593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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