MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 72355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_022579	GAA	2	6	542059	542064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551594129
10502	NC_022579	CAG	2	6	542136	542141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594129
10503	NC_022579	AAC	2	6	542152	542157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551594129
10504	NC_022579	CGG	2	6	542244	542249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594129
10505	NC_022579	GAA	2	6	542251	542256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551594129
10506	NC_022579	TA	3	6	542467	542472	50 %	50 %	0 %	0 %	551594130
10507	NC_022579	TTC	2	6	542494	542499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551594130
10508	NC_022579	TAA	2	6	542537	542542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551594130
10509	NC_022579	CATA	2	8	542552	542559	50 %	25 %	0 %	25 %	551594130
10510	NC_022579	TTTA	2	8	542583	542590	25 %	75 %	0 %	0 %	551594130
10511	NC_022579	A	6	6	542660	542665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_022579	AATTA	2	10	542711	542720	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_022579	CAT	2	6	542749	542754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594131
10514	NC_022579	GATG	2	8	542788	542795	25 %	25 %	50 %	0 %	551594131
10515	NC_022579	AAGC	2	8	542818	542825	50 %	0 %	25 %	25 %	551594131
10516	NC_022579	CAGA	2	8	542906	542913	50 %	0 %	25 %	25 %	551594131
10517	NC_022579	TAA	2	6	542926	542931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551594131
10518	NC_022579	GCAGTT	2	12	543158	543169	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	551594131
10519	NC_022579	AGC	2	6	543180	543185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594131
10520	NC_022579	CAT	2	6	543244	543249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594131
10521	NC_022579	GGC	2	6	543267	543272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594131
10522	NC_022579	ATC	2	6	543290	543295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594131
10523	NC_022579	GCCA	2	8	543296	543303	25 %	0 %	25 %	50 %	551594131
10524	NC_022579	CTG	2	6	543356	543361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594131
10525	NC_022579	ATG	2	6	543386	543391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594131
10526	NC_022579	CGC	2	6	543412	543417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551594131
10527	NC_022579	A	7	7	543435	543441	100 %	0 %	0 %	0 %	551594131
10528	NC_022579	GTC	2	6	543467	543472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594131
10529	NC_022579	GGC	2	6	543497	543502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594131
10530	NC_022579	ATC	2	6	543555	543560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594131
10531	NC_022579	AGC	2	6	543574	543579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594131
10532	NC_022579	GA	3	6	543680	543685	50 %	0 %	50 %	0 %	551594131
10533	NC_022579	T	7	7	543887	543893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_022579	A	7	7	543903	543909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_022579	AAAG	2	8	543952	543959	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_022579	GGA	2	6	543982	543987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_022579	CGG	2	6	544050	544055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594132
10538	NC_022579	T	6	6	544219	544224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_022579	CCG	2	6	544304	544309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10540	NC_022579	CGG	2	6	544314	544319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10541	NC_022579	T	7	7	544321	544327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_022579	GAT	2	6	544358	544363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_022579	CGG	2	6	544420	544425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594133
10544	NC_022579	GCAC	2	8	544427	544434	25 %	0 %	25 %	50 %	551594133
10545	NC_022579	CGC	2	6	544460	544465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551594133
10546	NC_022579	TGC	2	6	544482	544487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594133
10547	NC_022579	ACCG	2	8	544499	544506	25 %	0 %	25 %	50 %	551594133
10548	NC_022579	GAAA	2	8	544708	544715	75 %	0 %	25 %	0 %	551594133
10549	NC_022579	A	7	7	544749	544755	100 %	0 %	0 %	0 %	551594133
10550	NC_022579	CTC	2	6	544794	544799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551594133
10551	NC_022579	CTT	2	6	544812	544817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551594133
10552	NC_022579	TGT	3	9	544915	544923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551594133
10553	NC_022579	TGC	2	6	544953	544958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594133
10554	NC_022579	TGA	2	6	544963	544968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594133
10555	NC_022579	CAA	2	6	544975	544980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551594133
10556	NC_022579	C	6	6	544983	544988	0 %	0 %	0 %	100 %	551594133
10557	NC_022579	GGATG	2	10	545015	545024	20 %	20 %	60 %	0 %	551594133
10558	NC_022579	A	6	6	545069	545074	100 %	0 %	0 %	0 %	551594133
10559	NC_022579	AGA	2	6	545115	545120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551594133
10560	NC_022579	AGT	2	6	545140	545145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594133
10561	NC_022579	TCT	2	6	545190	545195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551594133
10562	NC_022579	CG	3	6	545196	545201	0 %	0 %	50 %	50 %	551594133
10563	NC_022579	A	6	6	545264	545269	100 %	0 %	0 %	0 %	551594133
10564	NC_022579	CCTG	2	8	545341	545348	0 %	25 %	25 %	50 %	551594133
10565	NC_022579	A	6	6	545379	545384	100 %	0 %	0 %	0 %	551594133
10566	NC_022579	ACC	2	6	545411	545416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551594133
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10568	NC_022579	ATG	2	6	545475	545480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594133
10569	NC_022579	GAA	2	6	545606	545611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551594133
10570	NC_022579	CGG	2	6	545680	545685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594133
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10574	NC_022579	ATC	2	6	545897	545902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594134
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10577	NC_022579	CCGC	2	8	546025	546032	0 %	0 %	25 %	75 %	551594134
10578	NC_022579	A	6	6	546033	546038	100 %	0 %	0 %	0 %	551594134
10579	NC_022579	TTCT	2	8	546049	546056	0 %	75 %	0 %	25 %	551594134
10580	NC_022579	TGA	2	6	546159	546164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594134
10581	NC_022579	GTC	2	6	546170	546175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594134
10582	NC_022579	CGA	3	9	546223	546231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594134
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10584	NC_022579	ATTT	2	8	546389	546396	25 %	75 %	0 %	0 %	551594134
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10588	NC_022579	GGA	2	6	546486	546491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551594134
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10590	NC_022579	ATA	2	6	546596	546601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10591	NC_022579	TC	3	6	546627	546632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10592	NC_022579	AAT	2	6	546643	546648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_022579	AT	3	6	546663	546668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_022579	CAAC	2	8	546700	546707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10595	NC_022579	ATG	2	6	546750	546755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_022579	ATTCA	2	10	546836	546845	40 %	40 %	0 %	20 %	551594135
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10602	NC_022579	TGCCTT	2	12	547016	547027	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	551594135
10603	NC_022579	TAC	2	6	547029	547034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594135
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10605	NC_022579	A	7	7	547047	547053	100 %	0 %	0 %	0 %	551594135
10606	NC_022579	CGC	2	6	547109	547114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551594135
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10608	NC_022579	CAGT	2	8	547270	547277	25 %	25 %	25 %	25 %	551594135
10609	NC_022579	AGA	2	6	547301	547306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551594135
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10613	NC_022579	CGG	2	6	547508	547513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594135
10614	NC_022579	A	6	6	547524	547529	100 %	0 %	0 %	0 %	551594135
10615	NC_022579	AC	3	6	547541	547546	50 %	0 %	0 %	50 %	551594135
10616	NC_022579	TCC	2	6	547604	547609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551594135
10617	NC_022579	GC	3	6	547678	547683	0 %	0 %	50 %	50 %	551594135
10618	NC_022579	CAG	2	6	547690	547695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551594135
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10621	NC_022579	GGC	2	6	547823	547828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551594135
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10623	NC_022579	GCT	2	6	547930	547935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594135
10624	NC_022579	CT	3	6	547934	547939	0 %	50 %	0 %	50 %	551594135
10625	NC_022579	TAT	2	6	547973	547978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551594135
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10628	NC_022579	CTGC	2	8	548096	548103	0 %	25 %	25 %	50 %	551594135
10629	NC_022579	GC	3	6	548102	548107	0 %	0 %	50 %	50 %	551594135
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10638	NC_022579	T	6	6	548555	548560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10639	NC_022579	ATA	2	6	548576	548581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10640	NC_022579	T	6	6	548606	548611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10641	NC_022579	ATG	2	6	548645	548650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10642	NC_022579	GACA	2	8	548676	548683	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10643	NC_022579	TA	3	6	548705	548710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10644	NC_022579	ACA	2	6	548782	548787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10645	NC_022579	T	6	6	548806	548811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10646	NC_022579	CCCA	2	8	548830	548837	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10647	NC_022579	TTTAA	2	10	548867	548876	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10719	NC_022579	T	6	6	552369	552374	0 %	100 %	0 %	0 %	551594140
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10728	NC_022579	A	8	8	552714	552721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10729	NC_022579	CG	3	6	552861	552866	0 %	0 %	50 %	50 %	551594141
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10737	NC_022579	CGT	2	6	553366	553371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594142
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10988	NC_022579	TCC	2	6	567108	567113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551594157
10989	NC_022579	GAAG	2	8	567192	567199	50 %	0 %	50 %	0 %	551594157
10990	NC_022579	TGA	2	6	567227	567232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551594157
10991	NC_022579	GCT	2	6	567254	567259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594157
10992	NC_022579	ATC	2	6	567261	567266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551594157
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10996	NC_022579	AGT	2	6	567611	567616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10999	NC_022579	TGC	2	6	567663	567668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551594158
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