MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 72355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022579	T	6	6	25129	25134	0 %	100 %	0 %	0 %	551593629
502	NC_022579	TAA	2	6	25164	25169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593629
503	NC_022579	TTTA	2	8	25174	25181	25 %	75 %	0 %	0 %	551593629
504	NC_022579	ATT	2	6	25252	25257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593629
505	NC_022579	CTG	2	6	25262	25267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593629
506	NC_022579	TGC	2	6	25453	25458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593629
507	NC_022579	TGC	2	6	25546	25551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593629
508	NC_022579	ATT	2	6	25579	25584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593629
509	NC_022579	TA	3	6	25708	25713	50 %	50 %	0 %	0 %	551593629
510	NC_022579	TCT	2	6	25746	25751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593629
511	NC_022579	AAC	2	6	25801	25806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593629
512	NC_022579	T	8	8	25853	25860	0 %	100 %	0 %	0 %	551593629
513	NC_022579	TACA	2	8	25905	25912	50 %	25 %	0 %	25 %	551593629
514	NC_022579	T	6	6	26019	26024	0 %	100 %	0 %	0 %	551593629
515	NC_022579	TTC	2	6	26089	26094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593629
516	NC_022579	ATC	2	6	26119	26124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593629
517	NC_022579	TTC	2	6	26152	26157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593629
518	NC_022579	TCA	2	6	26165	26170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593629
519	NC_022579	ACA	2	6	26193	26198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593629
520	NC_022579	GA	5	10	26202	26211	50 %	0 %	50 %	0 %	551593629
521	NC_022579	TCA	2	6	26249	26254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593629
522	NC_022579	TCA	2	6	26357	26362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593629
523	NC_022579	A	7	7	26362	26368	100 %	0 %	0 %	0 %	551593629
524	NC_022579	TGCC	2	8	26413	26420	0 %	25 %	25 %	50 %	551593629
525	NC_022579	ATC	2	6	26423	26428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593629
526	NC_022579	AGA	2	6	26470	26475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593629
527	NC_022579	AAG	2	6	26506	26511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593629
528	NC_022579	GCA	2	6	26517	26522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593629
529	NC_022579	GGA	2	6	26546	26551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593629
530	NC_022579	CCG	2	6	26573	26578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593629
531	NC_022579	AGC	3	9	26728	26736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593629
532	NC_022579	AGC	2	6	26855	26860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593629
533	NC_022579	T	6	6	26868	26873	0 %	100 %	0 %	0 %	551593629
534	NC_022579	TGC	2	6	26931	26936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593629
535	NC_022579	CTC	2	6	26956	26961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593629
536	NC_022579	AGT	2	6	26970	26975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593629
537	NC_022579	ATGG	3	12	26976	26987	25 %	25 %	50 %	0 %	551593629
538	NC_022579	TCG	2	6	27005	27010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593629
539	NC_022579	A	7	7	27031	27037	100 %	0 %	0 %	0 %	551593629
540	NC_022579	CCG	2	6	27046	27051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593629
541	NC_022579	ATC	2	6	27083	27088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593629
542	NC_022579	A	6	6	27131	27136	100 %	0 %	0 %	0 %	551593629
543	NC_022579	TTTC	2	8	27147	27154	0 %	75 %	0 %	25 %	551593629
544	NC_022579	GAA	3	9	27173	27181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593629
545	NC_022579	ATT	2	6	27235	27240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593629
546	NC_022579	CAGA	2	8	27249	27256	50 %	0 %	25 %	25 %	551593629
547	NC_022579	TATT	2	8	27257	27264	25 %	75 %	0 %	0 %	551593629
548	NC_022579	A	6	6	27275	27280	100 %	0 %	0 %	0 %	551593629
549	NC_022579	TAT	2	6	27324	27329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593629
550	NC_022579	CTG	2	6	27365	27370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593629
551	NC_022579	TGC	2	6	27455	27460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593629
552	NC_022579	GTTT	2	8	27477	27484	0 %	75 %	25 %	0 %	551593629
553	NC_022579	GCCA	2	8	27507	27514	25 %	0 %	25 %	50 %	551593629
554	NC_022579	AGT	2	6	27697	27702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593630
555	NC_022579	AAATT	2	10	27868	27877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_022579	AGA	2	6	27935	27940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022579	TTG	2	6	27993	27998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593631
558	NC_022579	ACT	2	6	28084	28089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593632
559	NC_022579	A	6	6	28116	28121	100 %	0 %	0 %	0 %	551593632
560	NC_022579	T	7	7	28176	28182	0 %	100 %	0 %	0 %	551593632
561	NC_022579	A	7	7	28223	28229	100 %	0 %	0 %	0 %	551593632
562	NC_022579	AATA	2	8	28300	28307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_022579	TGC	2	6	28308	28313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_022579	GCA	2	6	28370	28375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_022579	ATTA	2	8	28415	28422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_022579	A	6	6	28437	28442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_022579	G	6	6	28453	28458	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
568	NC_022579	TGTTT	2	10	28513	28522	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022579	CCA	2	6	28523	28528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_022579	TAT	2	6	28579	28584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593633
571	NC_022579	T	6	6	28586	28591	0 %	100 %	0 %	0 %	551593633
572	NC_022579	CTTT	2	8	28594	28601	0 %	75 %	0 %	25 %	551593633
573	NC_022579	ATT	2	6	28622	28627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593633
574	NC_022579	AGT	2	6	28632	28637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593633
575	NC_022579	TTTC	2	8	28645	28652	0 %	75 %	0 %	25 %	551593633
576	NC_022579	GCAG	2	8	28662	28669	25 %	0 %	50 %	25 %	551593633
577	NC_022579	T	7	7	28684	28690	0 %	100 %	0 %	0 %	551593633
578	NC_022579	TTG	2	6	28707	28712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593633
579	NC_022579	TTC	2	6	28763	28768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593633
580	NC_022579	TTC	2	6	28790	28795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593633
581	NC_022579	GGA	2	6	28832	28837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593633
582	NC_022579	TTC	2	6	28973	28978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593633
583	NC_022579	GAG	2	6	29032	29037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593633
584	NC_022579	T	8	8	29068	29075	0 %	100 %	0 %	0 %	551593633
585	NC_022579	TCA	2	6	29124	29129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593633
586	NC_022579	AGA	2	6	29201	29206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593633
587	NC_022579	GTG	2	6	29234	29239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593633
588	NC_022579	TTGG	2	8	29354	29361	0 %	50 %	50 %	0 %	551593633
589	NC_022579	TTCTC	2	10	29425	29434	0 %	60 %	0 %	40 %	551593633
590	NC_022579	ATT	2	6	29447	29452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593633
591	NC_022579	GA	4	8	29469	29476	50 %	0 %	50 %	0 %	551593633
592	NC_022579	CAG	2	6	29528	29533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593633
593	NC_022579	T	6	6	29598	29603	0 %	100 %	0 %	0 %	551593634
594	NC_022579	TTC	2	6	29677	29682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593634
595	NC_022579	TAGT	2	8	29710	29717	25 %	50 %	25 %	0 %	551593634
596	NC_022579	AGG	2	6	29827	29832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593634
597	NC_022579	ATTTTT	2	12	29860	29871	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	551593634
598	NC_022579	CTG	2	6	29903	29908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593634
599	NC_022579	CTTTGC	2	12	29915	29926	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	551593634
600	NC_022579	TGT	2	6	29963	29968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593634
601	NC_022579	GCC	2	6	30040	30045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593635
602	NC_022579	TTG	2	6	30081	30086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593635
603	NC_022579	ATC	2	6	30109	30114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593635
604	NC_022579	AGG	2	6	30124	30129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593635
605	NC_022579	CTG	2	6	30162	30167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593635
606	NC_022579	TTC	2	6	30175	30180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593635
607	NC_022579	AGA	2	6	30397	30402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593635
608	NC_022579	ATG	2	6	30404	30409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593635
609	NC_022579	A	7	7	30505	30511	100 %	0 %	0 %	0 %	551593635
610	NC_022579	AGT	2	6	30566	30571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593635
611	NC_022579	TGT	2	6	30582	30587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593635
612	NC_022579	CGA	2	6	30595	30600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593635
613	NC_022579	TG	3	6	30616	30621	0 %	50 %	50 %	0 %	551593635
614	NC_022579	TTC	2	6	30622	30627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593635
615	NC_022579	GTC	2	6	30640	30645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593635
616	NC_022579	TC	3	6	30662	30667	0 %	50 %	0 %	50 %	551593635
617	NC_022579	CGC	2	6	30762	30767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593635
618	NC_022579	TA	4	8	30789	30796	50 %	50 %	0 %	0 %	551593635
619	NC_022579	GCAG	2	8	30853	30860	25 %	0 %	50 %	25 %	551593636
620	NC_022579	A	6	6	30882	30887	100 %	0 %	0 %	0 %	551593636
621	NC_022579	TCA	2	6	30888	30893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593636
622	NC_022579	CTGC	2	8	30966	30973	0 %	25 %	25 %	50 %	551593636
623	NC_022579	CTT	2	6	30984	30989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593636
624	NC_022579	GTT	3	9	30997	31005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593636
625	NC_022579	T	6	6	31004	31009	0 %	100 %	0 %	0 %	551593636
626	NC_022579	CATAT	2	10	31013	31022	40 %	40 %	0 %	20 %	551593636
627	NC_022579	GCC	2	6	31053	31058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593636
628	NC_022579	TGA	2	6	31093	31098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593636
629	NC_022579	GTT	2	6	31106	31111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593636
630	NC_022579	GCAGA	2	10	31352	31361	40 %	0 %	40 %	20 %	551593636
631	NC_022579	TTG	2	6	31523	31528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593636
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732	NC_022579	T	7	7	36496	36502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
733	NC_022579	AATA	2	8	36516	36523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
734	NC_022579	AT	3	6	36541	36546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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