MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 72355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022579	CTC	2	6	262540	262545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593868
5002	NC_022579	A	7	7	262583	262589	100 %	0 %	0 %	0 %	551593868
5003	NC_022579	TCT	2	6	262602	262607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593868
5004	NC_022579	CT	3	6	262776	262781	0 %	50 %	0 %	50 %	551593868
5005	NC_022579	AAGA	2	8	262807	262814	75 %	0 %	25 %	0 %	551593868
5006	NC_022579	TCA	2	6	262819	262824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593868
5007	NC_022579	GAAATT	2	12	262825	262836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	551593868
5008	NC_022579	AGG	2	6	262840	262845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593868
5009	NC_022579	GAA	2	6	262876	262881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593868
5010	NC_022579	GAA	2	6	262992	262997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593868
5011	NC_022579	TGCG	2	8	263013	263020	0 %	25 %	50 %	25 %	551593868
5012	NC_022579	AGA	2	6	263031	263036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593868
5013	NC_022579	AGA	2	6	263045	263050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593868
5014	NC_022579	AAT	2	6	263112	263117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593868
5015	NC_022579	AATA	2	8	263269	263276	75 %	25 %	0 %	0 %	551593868
5016	NC_022579	CTT	2	6	263292	263297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593868
5017	NC_022579	TGA	2	6	263319	263324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593868
5018	NC_022579	GGA	2	6	263343	263348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593868
5019	NC_022579	T	6	6	263496	263501	0 %	100 %	0 %	0 %	551593868
5020	NC_022579	ATA	2	6	263546	263551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593868
5021	NC_022579	AAAGG	2	10	263655	263664	60 %	0 %	40 %	0 %	551593868
5022	NC_022579	AAT	2	6	263836	263841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593868
5023	NC_022579	TCT	2	6	263902	263907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593868
5024	NC_022579	TGA	2	6	264030	264035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593868
5025	NC_022579	TTC	2	6	264097	264102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593869
5026	NC_022579	GGCA	2	8	264110	264117	25 %	0 %	50 %	25 %	551593869
5027	NC_022579	AAT	2	6	264155	264160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593869
5028	NC_022579	ACT	2	6	264209	264214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593869
5029	NC_022579	A	6	6	264219	264224	100 %	0 %	0 %	0 %	551593869
5030	NC_022579	CAA	2	6	264327	264332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593869
5031	NC_022579	ATC	2	6	264344	264349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593869
5032	NC_022579	TGA	2	6	264416	264421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593869
5033	NC_022579	GATCA	2	10	264437	264446	40 %	20 %	20 %	20 %	551593869
5034	NC_022579	GAAG	2	8	264483	264490	50 %	0 %	50 %	0 %	551593869
5035	NC_022579	GTT	2	6	264494	264499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593869
5036	NC_022579	GAT	2	6	264543	264548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593869
5037	NC_022579	TCC	2	6	264629	264634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593869
5038	NC_022579	TGT	2	6	264647	264652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593869
5039	NC_022579	CTT	2	6	264700	264705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593869
5040	NC_022579	ATG	2	6	264748	264753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593869
5041	NC_022579	TCC	2	6	264827	264832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593869
5042	NC_022579	AT	3	6	264903	264908	50 %	50 %	0 %	0 %	551593869
5043	NC_022579	GAAG	2	8	264977	264984	50 %	0 %	50 %	0 %	551593869
5044	NC_022579	GGAAA	2	10	265015	265024	60 %	0 %	40 %	0 %	551593869
5045	NC_022579	ACA	2	6	265040	265045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593869
5046	NC_022579	A	6	6	265047	265052	100 %	0 %	0 %	0 %	551593869
5047	NC_022579	A	6	6	265155	265160	100 %	0 %	0 %	0 %	551593869
5048	NC_022579	TC	3	6	265161	265166	0 %	50 %	0 %	50 %	551593869
5049	NC_022579	T	6	6	265188	265193	0 %	100 %	0 %	0 %	551593869
5050	NC_022579	GA	3	6	265229	265234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_022579	A	6	6	265249	265254	100 %	0 %	0 %	0 %	551593870
5052	NC_022579	GGT	3	9	265280	265288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593870
5053	NC_022579	ATG	2	6	265295	265300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593870
5054	NC_022579	AAG	2	6	265355	265360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593870
5055	NC_022579	AGG	2	6	265551	265556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_022579	ATT	2	6	265585	265590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593871
5057	NC_022579	CGA	2	6	265613	265618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593871
5058	NC_022579	TAC	2	6	265767	265772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593871
5059	NC_022579	T	6	6	265898	265903	0 %	100 %	0 %	0 %	551593871
5060	NC_022579	TGA	2	6	266131	266136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593872
5061	NC_022579	ATT	2	6	266141	266146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593872
5062	NC_022579	T	7	7	266202	266208	0 %	100 %	0 %	0 %	551593872
5063	NC_022579	AAG	2	6	266217	266222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593872
5064	NC_022579	AGC	2	6	266242	266247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593872
5065	NC_022579	CCA	2	6	266281	266286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593872
5066	NC_022579	AT	3	6	266350	266355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_022579	TA	3	6	266447	266452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_022579	TTA	2	6	266488	266493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_022579	A	6	6	266512	266517	100 %	0 %	0 %	0 %	551593873
5070	NC_022579	GGC	2	6	266568	266573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593873
5071	NC_022579	GTT	2	6	266581	266586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593873
5072	NC_022579	T	6	6	266644	266649	0 %	100 %	0 %	0 %	551593873
5073	NC_022579	AAC	2	6	266678	266683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593873
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5075	NC_022579	A	6	6	266724	266729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_022579	G	6	6	266773	266778	0 %	0 %	100 %	0 %	551593874
5077	NC_022579	GCC	2	6	266830	266835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593874
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5079	NC_022579	T	6	6	266899	266904	0 %	100 %	0 %	0 %	551593874
5080	NC_022579	GCTT	2	8	266954	266961	0 %	50 %	25 %	25 %	551593874
5081	NC_022579	GTG	2	6	267068	267073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593874
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5083	NC_022579	GTA	2	6	267156	267161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593874
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5089	NC_022579	GTT	2	6	267398	267403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593874
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5091	NC_022579	TGT	2	6	267552	267557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_022579	GGT	2	6	267591	267596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5097	NC_022579	ATT	2	6	267969	267974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_022579	AAT	2	6	268157	268162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593876
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5100	NC_022579	TGC	2	6	268194	268199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593876
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5102	NC_022579	CCT	2	6	268277	268282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_022579	ATT	2	6	268299	268304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_022579	ACG	2	6	268316	268321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_022579	AAG	2	6	268342	268347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_022579	TATG	2	8	268447	268454	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_022579	CAG	2	6	268471	268476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_022579	GGC	2	6	268499	268504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_022579	A	7	7	268515	268521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_022579	T	7	7	268543	268549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_022579	A	6	6	268558	268563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_022579	CT	3	6	268565	268570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5113	NC_022579	T	6	6	268638	268643	0 %	100 %	0 %	0 %	551593877
5114	NC_022579	A	6	6	268656	268661	100 %	0 %	0 %	0 %	551593877
5115	NC_022579	TTCC	2	8	268799	268806	0 %	50 %	0 %	50 %	551593877
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5492	NC_022579	AAAAT	2	10	285727	285736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5494	NC_022579	TTTTG	2	10	285941	285950	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5495	NC_022579	GA	3	6	285960	285965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_022579	CAGA	2	8	285989	285996	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5497	NC_022579	GT	3	6	286036	286041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5500	NC_022579	T	7	7	286181	286187	0 %	100 %	0 %	0 %	551593905

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