MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 genome

Total Repeats: 90159

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_022444	CGA	2	6	489768	489773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640789
12003	NC_022444	GAG	2	6	489862	489867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545640789
12004	NC_022444	GAT	2	6	489892	489897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545640789
12005	NC_022444	CGA	2	6	489933	489938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640789
12006	NC_022444	TTC	2	6	490090	490095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545640789
12007	NC_022444	GTC	2	6	490111	490116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640789
12008	NC_022444	GGC	2	6	490122	490127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640789
12009	NC_022444	GTC	2	6	490192	490197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640789
12010	NC_022444	GTT	2	6	490201	490206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545640789
12011	NC_022444	AGGT	2	8	490214	490221	25 %	25 %	50 %	0 %	545640789
12012	NC_022444	GAGG	2	8	490264	490271	25 %	0 %	75 %	0 %	545640789
12013	NC_022444	CCA	2	6	490278	490283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640789
12014	NC_022444	AGC	2	6	490336	490341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640789
12015	NC_022444	GCC	3	9	490357	490365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640789
12016	NC_022444	CAG	2	6	490372	490377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640789
12017	NC_022444	CGA	2	6	490392	490397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640789
12018	NC_022444	G	6	6	490425	490430	0 %	0 %	100 %	0 %	545640789
12019	NC_022444	TGA	2	6	490497	490502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12020	NC_022444	CGTG	2	8	490503	490510	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12021	NC_022444	GCC	2	6	490544	490549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640790
12022	NC_022444	GCAGG	2	10	490553	490562	20 %	0 %	60 %	20 %	545640790
12023	NC_022444	TCGGCG	2	12	490584	490595	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	545640790
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12028	NC_022444	ATC	2	6	490947	490952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640790
12029	NC_022444	CATG	2	8	490973	490980	25 %	25 %	25 %	25 %	545640790
12030	NC_022444	CGC	2	6	490990	490995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640790
12031	NC_022444	TCC	2	6	491045	491050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12032	NC_022444	GATT	2	8	491060	491067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12033	NC_022444	A	7	7	491150	491156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12034	NC_022444	GGC	2	6	491160	491165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12035	NC_022444	C	6	6	491177	491182	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12036	NC_022444	GCAA	2	8	491257	491264	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12037	NC_022444	CAC	2	6	491267	491272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12038	NC_022444	T	6	6	491331	491336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12039	NC_022444	GGT	2	6	491350	491355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12040	NC_022444	GC	3	6	491398	491403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12041	NC_022444	GCA	2	6	491489	491494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12042	NC_022444	TTA	2	6	491495	491500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12043	NC_022444	GCCCC	2	10	491525	491534	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
12044	NC_022444	GAC	2	6	491623	491628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12045	NC_022444	T	6	6	491632	491637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12046	NC_022444	TTGA	2	8	491641	491648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12047	NC_022444	C	6	6	491704	491709	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12048	NC_022444	A	6	6	491722	491727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12049	NC_022444	T	6	6	491747	491752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12050	NC_022444	TGC	2	6	491759	491764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640791
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12052	NC_022444	GC	3	6	491806	491811	0 %	0 %	50 %	50 %	545640791
12053	NC_022444	GGC	2	6	491832	491837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640791
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12056	NC_022444	CGG	2	6	491919	491924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640792
12057	NC_022444	TGC	2	6	491938	491943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640792
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12060	NC_022444	GAT	2	6	492111	492116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545640792
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12062	NC_022444	CGA	3	9	492162	492170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640792
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12124	NC_022444	GCCT	2	8	494761	494768	0 %	25 %	25 %	50 %	545640793
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12231	NC_022444	ATCAGC	2	12	499062	499073	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545640795
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12233	NC_022444	CG	3	6	499140	499145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12234	NC_022444	CTT	2	6	499148	499153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12235	NC_022444	CAA	2	6	499195	499200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12236	NC_022444	G	6	6	499207	499212	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12237	NC_022444	C	6	6	499233	499238	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12238	NC_022444	CAG	2	6	499272	499277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640796
12239	NC_022444	CATG	2	8	499303	499310	25 %	25 %	25 %	25 %	545640796
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12243	NC_022444	GC	3	6	499548	499553	0 %	0 %	50 %	50 %	545640796
12244	NC_022444	TGC	2	6	499617	499622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640796
12245	NC_022444	CGC	2	6	499657	499662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640796
12246	NC_022444	GCA	3	9	499666	499674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640796
12247	NC_022444	CAA	2	6	499799	499804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12248	NC_022444	GC	3	6	499828	499833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12249	NC_022444	TGC	2	6	499859	499864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640797
12250	NC_022444	TGA	2	6	499914	499919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545640797
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12252	NC_022444	GCT	2	6	500010	500015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640797
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12267	NC_022444	CAG	3	9	500506	500514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640797
12268	NC_022444	TGCGG	2	10	500523	500532	0 %	20 %	60 %	20 %	545640797
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12272	NC_022444	AT	3	6	500687	500692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12273	NC_022444	ATA	2	6	500775	500780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12274	NC_022444	TAG	2	6	500819	500824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12275	NC_022444	GCA	2	6	500895	500900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12276	NC_022444	GCA	2	6	500936	500941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12277	NC_022444	T	7	7	500970	500976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12278	NC_022444	GCC	2	6	500990	500995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12279	NC_022444	GGC	2	6	500998	501003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640798
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12304	NC_022444	GGCCC	2	10	501949	501958	0 %	0 %	40 %	60 %	545640798
12305	NC_022444	CTGG	2	8	501988	501995	0 %	25 %	50 %	25 %	545640798
12306	NC_022444	TGG	2	6	502029	502034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640798
12307	NC_022444	AAGGTG	2	12	502064	502075	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	545640798
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12310	NC_022444	CCG	2	6	502194	502199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640798
12311	NC_022444	CAC	2	6	502204	502209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640798
12312	NC_022444	CCG	2	6	502212	502217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640798
12313	NC_022444	AGCATC	2	12	502235	502246	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12314	NC_022444	ATCG	2	8	502262	502269	25 %	25 %	25 %	25 %	545640799
12315	NC_022444	CAT	4	12	502294	502305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640799
12316	NC_022444	CCATCA	2	12	502371	502382	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	545640799
12317	NC_022444	ATC	2	6	502436	502441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640799
12318	NC_022444	AGA	2	6	502446	502451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545640799
12319	NC_022444	TCC	2	6	502481	502486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545640799
12320	NC_022444	CTC	2	6	502531	502536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545640799
12321	NC_022444	CAGGTG	2	12	502556	502567	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545640799
12322	NC_022444	CTGGCC	2	12	502577	502588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	545640799
12323	NC_022444	CGC	2	6	502590	502595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640799
12324	NC_022444	TGA	2	6	502671	502676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545640799
12325	NC_022444	CGA	2	6	502678	502683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640799
12326	NC_022444	CCT	2	6	502719	502724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545640799
12327	NC_022444	CTG	2	6	502730	502735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640799
12328	NC_022444	GC	3	6	502782	502787	0 %	0 %	50 %	50 %	545640799
12329	NC_022444	CAA	2	6	502825	502830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545640799
12330	NC_022444	GCC	2	6	502859	502864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640799
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12333	NC_022444	CAG	2	6	502928	502933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640799
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12337	NC_022444	GGA	2	6	503257	503262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545640799
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12342	NC_022444	GGC	2	6	503395	503400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640799
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12344	NC_022444	GTG	3	9	503477	503485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640799
12345	NC_022444	CAT	2	6	503500	503505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640799
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12348	NC_022444	TGG	2	6	503571	503576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640799
12349	NC_022444	CGG	2	6	503595	503600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640799
12350	NC_022444	TGC	2	6	503679	503684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640799
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12356	NC_022444	GCG	2	6	503829	503834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640799
12357	NC_022444	GCT	2	6	503842	503847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640799
12358	NC_022444	A	6	6	503855	503860	100 %	0 %	0 %	0 %	545640799
12359	NC_022444	CGC	2	6	503890	503895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640799
12360	NC_022444	CAT	2	6	503953	503958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640799
12361	NC_022444	GC	3	6	503985	503990	0 %	0 %	50 %	50 %	545640799
12362	NC_022444	GGT	2	6	504055	504060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640799
12363	NC_022444	CGG	2	6	504249	504254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640799
12364	NC_022444	CGC	2	6	504319	504324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640799
12365	NC_022444	GGT	2	6	504376	504381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640799
12366	NC_022444	GAC	2	6	504404	504409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640799
12367	NC_022444	ATCGAC	2	12	504425	504436	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545640799
12368	NC_022444	CTGTCC	2	12	504455	504466	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	545640799
12369	NC_022444	GCG	2	6	504504	504509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640799
12370	NC_022444	ATG	2	6	504581	504586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545640799
12371	NC_022444	GTTC	2	8	504607	504614	0 %	50 %	25 %	25 %	545640799
12372	NC_022444	C	6	6	504678	504683	0 %	0 %	0 %	100 %	545640799
12373	NC_022444	GCCG	2	8	504706	504713	0 %	0 %	50 %	50 %	545640799
12374	NC_022444	CCG	2	6	504729	504734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640799
12375	NC_022444	TGG	2	6	504780	504785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640799
12376	NC_022444	CCGG	2	8	504794	504801	0 %	0 %	50 %	50 %	545640799
12377	NC_022444	TGG	2	6	504885	504890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640799
12378	NC_022444	CGG	2	6	504936	504941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640799
12379	NC_022444	GTG	2	6	504950	504955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640799
12380	NC_022444	CAT	2	6	504964	504969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640799
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12382	NC_022444	ACG	2	6	505008	505013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640799
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12386	NC_022444	TGA	2	6	505164	505169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545640799
12387	NC_022444	CCT	2	6	505170	505175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545640799
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12389	NC_022444	CCCTGG	2	12	505200	505211	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	545640799
12390	NC_022444	CAGC	2	8	505231	505238	25 %	0 %	25 %	50 %	545640799
12391	NC_022444	CGG	2	6	505261	505266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640799
12392	NC_022444	GCT	2	6	505290	505295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640799
12393	NC_022444	TTC	2	6	505310	505315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545640799
12394	NC_022444	CTG	2	6	505316	505321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640799
12395	NC_022444	TCC	2	6	505370	505375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545640799
12396	NC_022444	CGGCC	2	10	505396	505405	0 %	0 %	40 %	60 %	545640799
12397	NC_022444	CCAG	2	8	505435	505442	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12398	NC_022444	ATG	2	6	505678	505683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12399	NC_022444	GGGC	2	8	505786	505793	0 %	0 %	75 %	25 %	545640800
12400	NC_022444	TCC	2	6	505803	505808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545640800
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12402	NC_022444	CCCT	2	8	505858	505865	0 %	25 %	0 %	75 %	545640800
12403	NC_022444	GGCA	2	8	505880	505887	25 %	0 %	50 %	25 %	545640800
12404	NC_022444	AGCG	2	8	505895	505902	25 %	0 %	50 %	25 %	545640800
12405	NC_022444	TCG	2	6	505917	505922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640800
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12417	NC_022444	GCGCA	2	10	506339	506348	20 %	0 %	40 %	40 %	545640800
12418	NC_022444	C	6	6	506438	506443	0 %	0 %	0 %	100 %	545640800
12419	NC_022444	CGTAG	2	10	506466	506475	20 %	20 %	40 %	20 %	545640800
12420	NC_022444	CTTC	2	8	506517	506524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12421	NC_022444	TCC	2	6	506561	506566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12422	NC_022444	CCCG	2	8	506584	506591	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12423	NC_022444	CGG	2	6	506747	506752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12424	NC_022444	TGCC	2	8	506770	506777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12425	NC_022444	CGAAC	2	10	506902	506911	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12426	NC_022444	TGG	2	6	506970	506975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12427	NC_022444	CAT	2	6	507065	507070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640801
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12430	NC_022444	GCCC	2	8	507179	507186	0 %	0 %	25 %	75 %	545640801
12431	NC_022444	CGC	2	6	507204	507209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640801
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12433	NC_022444	CGA	2	6	507272	507277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640801
12434	NC_022444	CG	3	6	507282	507287	0 %	0 %	50 %	50 %	545640801
12435	NC_022444	CCG	2	6	507311	507316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640801
12436	NC_022444	CTG	2	6	507318	507323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640801
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12440	NC_022444	AGCC	2	8	507405	507412	25 %	0 %	25 %	50 %	545640802
12441	NC_022444	CCG	2	6	507424	507429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640802
12442	NC_022444	CTG	2	6	507487	507492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640802
12443	NC_022444	GCT	2	6	507501	507506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640802
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12447	NC_022444	GAC	3	9	507620	507628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640802
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12450	NC_022444	ACA	2	6	507753	507758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545640802
12451	NC_022444	GCG	2	6	507838	507843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640802
12452	NC_022444	GCCAGA	2	12	507873	507884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640802
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12454	NC_022444	GCT	2	6	507982	507987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640802
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12462	NC_022444	GCT	2	6	508312	508317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640802
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12465	NC_022444	AGC	2	6	508491	508496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640802
12466	NC_022444	CAG	3	9	508568	508576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640802
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12468	NC_022444	CAG	2	6	508703	508708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640803
12469	NC_022444	CGG	2	6	508763	508768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640803
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12472	NC_022444	GCG	2	6	508846	508851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640803
12473	NC_022444	GC	3	6	508903	508908	0 %	0 %	50 %	50 %	545640803
12474	NC_022444	CAT	2	6	508916	508921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640803
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12477	NC_022444	CGC	2	6	509009	509014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640803
12478	NC_022444	GC	3	6	509048	509053	0 %	0 %	50 %	50 %	545640803
12479	NC_022444	ATC	2	6	509058	509063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640803
12480	NC_022444	CGGC	2	8	509130	509137	0 %	0 %	50 %	50 %	545640803
12481	NC_022444	TGG	2	6	509167	509172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640803
12482	NC_022444	CCT	2	6	509275	509280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12483	NC_022444	ACG	2	6	509326	509331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640804
12484	NC_022444	TCC	2	6	509334	509339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545640804
12485	NC_022444	CGGC	2	8	509357	509364	0 %	0 %	50 %	50 %	545640804
12486	NC_022444	GCCG	2	8	509446	509453	0 %	0 %	50 %	50 %	545640804
12487	NC_022444	CTT	2	6	509515	509520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545640804
12488	NC_022444	ACG	2	6	509562	509567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640804
12489	NC_022444	CCT	2	6	509572	509577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545640804
12490	NC_022444	CGT	2	6	509578	509583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640804
12491	NC_022444	CGC	2	6	509623	509628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640804
12492	NC_022444	TCAT	2	8	509766	509773	25 %	50 %	0 %	25 %	545640804
12493	NC_022444	TCT	2	6	509796	509801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545640805
12494	NC_022444	CAA	2	6	509815	509820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545640805
12495	NC_022444	GT	3	6	509841	509846	0 %	50 %	50 %	0 %	545640805
12496	NC_022444	GTG	3	9	509873	509881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640805
12497	NC_022444	CAA	2	6	509887	509892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545640805
12498	NC_022444	TTC	2	6	509975	509980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545640805
12499	NC_022444	GCC	2	6	510036	510041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640805
12500	NC_022444	CGA	2	6	510094	510099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640805

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