MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 genome

Total Repeats: 90159

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
90001	NC_022444	CGT	2	6	3687697	3687702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643624
90002	NC_022444	GGC	2	6	3687713	3687718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643624
90003	NC_022444	TGGT	2	8	3687747	3687754	0 %	50 %	50 %	0 %	545643624
90004	NC_022444	TCCACG	2	12	3687813	3687824	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545643624
90005	NC_022444	GCC	2	6	3687885	3687890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643624
90006	NC_022444	GTC	2	6	3687952	3687957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90007	NC_022444	G	6	6	3687969	3687974	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90008	NC_022444	GCA	2	6	3688050	3688055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643625
90009	NC_022444	TGA	3	9	3688124	3688132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643625
90010	NC_022444	CGC	2	6	3688199	3688204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643625
90011	NC_022444	GCA	2	6	3688205	3688210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643625
90012	NC_022444	AGGG	2	8	3688285	3688292	25 %	0 %	75 %	0 %	545643625
90013	NC_022444	CTG	2	6	3688293	3688298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643625
90014	NC_022444	CGC	2	6	3688334	3688339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643625
90015	NC_022444	GGCG	2	8	3688505	3688512	0 %	0 %	75 %	25 %	545643625
90016	NC_022444	GGT	2	6	3688611	3688616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643625
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90018	NC_022444	GAT	2	6	3688725	3688730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643625
90019	NC_022444	GAT	2	6	3688751	3688756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90020	NC_022444	CGC	2	6	3688791	3688796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90021	NC_022444	AAC	2	6	3688811	3688816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90022	NC_022444	GCC	2	6	3688826	3688831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90023	NC_022444	TGC	2	6	3688834	3688839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90024	NC_022444	GGC	2	6	3688847	3688852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90025	NC_022444	GCG	2	6	3688859	3688864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90026	NC_022444	T	6	6	3688913	3688918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90027	NC_022444	CCT	2	6	3688948	3688953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90028	NC_022444	GCAT	2	8	3688976	3688983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90029	NC_022444	CAA	2	6	3689031	3689036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545643626
90030	NC_022444	CTG	2	6	3689039	3689044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643626
90031	NC_022444	GCC	2	6	3689066	3689071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643626
90032	NC_022444	GCG	2	6	3689075	3689080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643626
90033	NC_022444	TGC	2	6	3689223	3689228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643626
90034	NC_022444	ACC	2	6	3689231	3689236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643626
90035	NC_022444	ACA	2	6	3689346	3689351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545643626
90036	NC_022444	CGGTTC	2	12	3689429	3689440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643626
90037	NC_022444	CAT	2	6	3689441	3689446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643626
90038	NC_022444	CGGG	2	8	3689494	3689501	0 %	0 %	75 %	25 %	545643626
90039	NC_022444	ACCA	2	8	3689510	3689517	50 %	0 %	0 %	50 %	545643626
90040	NC_022444	GGCC	2	8	3689566	3689573	0 %	0 %	50 %	50 %	545643626
90041	NC_022444	CAG	2	6	3689618	3689623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643626
90042	NC_022444	TGCG	2	8	3689648	3689655	0 %	25 %	50 %	25 %	545643626
90043	NC_022444	CGC	2	6	3689674	3689679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643626
90044	NC_022444	GC	3	6	3689678	3689683	0 %	0 %	50 %	50 %	545643626
90045	NC_022444	GCA	2	6	3689686	3689691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643626
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90048	NC_022444	TTC	2	6	3689850	3689855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90049	NC_022444	C	6	6	3689866	3689871	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90050	NC_022444	CGG	2	6	3689898	3689903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90051	NC_022444	GA	3	6	3689923	3689928	50 %	0 %	50 %	0 %	545643627
90052	NC_022444	CTG	2	6	3689970	3689975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643627
90053	NC_022444	GTC	2	6	3690087	3690092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643627
90054	NC_022444	TTG	2	6	3690220	3690225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545643627
90055	NC_022444	CAG	2	6	3690237	3690242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643627
90056	NC_022444	CGC	2	6	3690248	3690253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643627
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90058	NC_022444	CTG	2	6	3690318	3690323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643627
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90060	NC_022444	CAG	2	6	3690403	3690408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643627
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90063	NC_022444	GGC	2	6	3690483	3690488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90064	NC_022444	CTG	2	6	3690498	3690503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643628
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90068	NC_022444	GCGTG	2	10	3690782	3690791	0 %	20 %	60 %	20 %	545643628
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90083	NC_022444	ATG	2	6	3691180	3691185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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90085	NC_022444	A	6	6	3691255	3691260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90086	NC_022444	C	7	7	3691262	3691268	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90087	NC_022444	G	7	7	3691289	3691295	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90088	NC_022444	AG	3	6	3691351	3691356	50 %	0 %	50 %	0 %	545643629
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90091	NC_022444	GC	3	6	3691523	3691528	0 %	0 %	50 %	50 %	545643629
90092	NC_022444	GAT	2	6	3691542	3691547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643629
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90099	NC_022444	ACCAG	2	10	3691753	3691762	40 %	0 %	20 %	40 %	545643629
90100	NC_022444	CAT	2	6	3691766	3691771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643629
90101	NC_022444	GCTGGA	2	12	3691773	3691784	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545643629
90102	NC_022444	GAT	2	6	3691875	3691880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643629
90103	NC_022444	TCG	2	6	3691951	3691956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643629
90104	NC_022444	CG	3	6	3692043	3692048	0 %	0 %	50 %	50 %	545643629
90105	NC_022444	CGT	2	6	3692078	3692083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643629
90106	NC_022444	GCA	2	6	3692086	3692091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643629
90107	NC_022444	AGAC	2	8	3692112	3692119	50 %	0 %	25 %	25 %	545643629
90108	NC_022444	CAT	2	6	3692181	3692186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643629
90109	NC_022444	TCC	2	6	3692217	3692222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90110	NC_022444	GAC	2	6	3692257	3692262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90111	NC_022444	CCT	2	6	3692287	3692292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90112	NC_022444	CAG	2	6	3692406	3692411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643630
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90114	NC_022444	GGA	2	6	3692460	3692465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545643630
90115	NC_022444	CAA	2	6	3692482	3692487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90116	NC_022444	ATA	2	6	3692492	3692497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90117	NC_022444	GAG	2	6	3692533	3692538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90118	NC_022444	CCG	2	6	3692554	3692559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90119	NC_022444	CGG	2	6	3692599	3692604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90120	NC_022444	CAG	2	6	3692617	3692622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90121	NC_022444	GCA	2	6	3692674	3692679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90122	NC_022444	CCG	2	6	3692698	3692703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643631
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90142	NC_022444	TGA	3	9	3693317	3693325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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90147	NC_022444	A	7	7	3693529	3693535	100 %	0 %	0 %	0 %	545643632
90148	NC_022444	TC	3	6	3693569	3693574	0 %	50 %	0 %	50 %	545643632
90149	NC_022444	GA	3	6	3693603	3693608	50 %	0 %	50 %	0 %	545643632
90150	NC_022444	CT	3	6	3693611	3693616	0 %	50 %	0 %	50 %	545643632
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.