MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 genome

Total Repeats: 90159

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
87001	NC_022444	ACACA	2	10	3567573	3567582	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
87002	NC_022444	GGC	2	6	3567598	3567603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87003	NC_022444	ATGC	2	8	3567637	3567644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87004	NC_022444	CGG	2	6	3567649	3567654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87005	NC_022444	CCCTTG	2	12	3567788	3567799	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	545643516
87006	NC_022444	CTT	2	6	3567807	3567812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545643516
87007	NC_022444	CGT	3	9	3567885	3567893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643516
87008	NC_022444	GAT	2	6	3567901	3567906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643516
87009	NC_022444	TGT	2	6	3567915	3567920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545643516
87010	NC_022444	GTCA	2	8	3567937	3567944	25 %	25 %	25 %	25 %	545643516
87011	NC_022444	CTT	2	6	3567967	3567972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545643516
87012	NC_022444	TTC	2	6	3567991	3567996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545643516
87013	NC_022444	GAT	2	6	3568009	3568014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643516
87014	NC_022444	GCC	2	6	3568051	3568056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643516
87015	NC_022444	GCA	2	6	3568095	3568100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643516
87016	NC_022444	GCG	2	6	3568117	3568122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643516
87017	NC_022444	GGC	2	6	3568141	3568146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643516
87018	NC_022444	CTT	2	6	3568153	3568158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545643516
87019	NC_022444	GCC	2	6	3568204	3568209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643516
87020	NC_022444	CCA	2	6	3568221	3568226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643516
87021	NC_022444	GCA	2	6	3568316	3568321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643516
87022	NC_022444	CGT	2	6	3568335	3568340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643516
87023	NC_022444	CTG	2	6	3568366	3568371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643516
87024	NC_022444	GCG	2	6	3568435	3568440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643516
87025	NC_022444	GCG	2	6	3568547	3568552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87026	NC_022444	CG	3	6	3568551	3568556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87027	NC_022444	GCACG	2	10	3568573	3568582	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87028	NC_022444	TG	3	6	3568602	3568607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87029	NC_022444	AGG	2	6	3568629	3568634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87030	NC_022444	GCAA	2	8	3568649	3568656	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87031	NC_022444	ATG	2	6	3568702	3568707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87032	NC_022444	CAACC	2	10	3568713	3568722	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
87033	NC_022444	TGC	2	6	3568780	3568785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87034	NC_022444	CG	3	6	3568791	3568796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87035	NC_022444	GA	3	6	3568805	3568810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87036	NC_022444	GA	4	8	3568817	3568824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87037	NC_022444	TCC	2	6	3568932	3568937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545643517
87038	NC_022444	CAT	2	6	3568971	3568976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643517
87039	NC_022444	GGC	2	6	3568981	3568986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643517
87040	NC_022444	GGCT	2	8	3569012	3569019	0 %	25 %	50 %	25 %	545643517
87041	NC_022444	GGC	2	6	3569038	3569043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643517
87042	NC_022444	AGGCCA	2	12	3569144	3569155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643517
87043	NC_022444	GGC	2	6	3569164	3569169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643517
87044	NC_022444	CAT	2	6	3569184	3569189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643517
87045	NC_022444	GCCACG	2	12	3569221	3569232	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	545643517
87046	NC_022444	CAT	2	6	3569247	3569252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643517
87047	NC_022444	CCA	3	9	3569306	3569314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643517
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87049	NC_022444	CGC	2	6	3569346	3569351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643517
87050	NC_022444	CTGC	2	8	3569385	3569392	0 %	25 %	25 %	50 %	545643517
87051	NC_022444	GTG	3	9	3569401	3569409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643517
87052	NC_022444	CTGG	2	8	3569419	3569426	0 %	25 %	50 %	25 %	545643517
87053	NC_022444	CAT	2	6	3569592	3569597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643517
87054	NC_022444	CGCCAC	2	12	3569691	3569702	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	545643517
87055	NC_022444	GCG	2	6	3569780	3569785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643517
87056	NC_022444	CCA	2	6	3569834	3569839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643517
87057	NC_022444	GAC	2	6	3569890	3569895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643517
87058	NC_022444	GCT	2	6	3569940	3569945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643517
87059	NC_022444	CGGC	2	8	3570062	3570069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87060	NC_022444	TCC	2	6	3570072	3570077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87061	NC_022444	GCCG	2	8	3570094	3570101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87062	NC_022444	GC	3	6	3570193	3570198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87063	NC_022444	GAGC	2	8	3570223	3570230	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87064	NC_022444	GTG	2	6	3570279	3570284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643518
87065	NC_022444	GGGCC	2	10	3570320	3570329	0 %	0 %	60 %	40 %	545643518
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87071	NC_022444	A	6	6	3570510	3570515	100 %	0 %	0 %	0 %	545643518
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87097	NC_022444	GC	3	6	3571484	3571489	0 %	0 %	50 %	50 %	545643518
87098	NC_022444	CCCT	2	8	3571503	3571510	0 %	25 %	0 %	75 %	545643518
87099	NC_022444	TGC	2	6	3571513	3571518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643518
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87101	NC_022444	GAA	2	6	3571663	3571668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87102	NC_022444	AGCG	2	8	3571800	3571807	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87103	NC_022444	GCA	2	6	3571809	3571814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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87105	NC_022444	GCG	2	6	3571867	3571872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87106	NC_022444	TTC	2	6	3571951	3571956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545643519
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87114	NC_022444	GGC	2	6	3572228	3572233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643519
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87255	NC_022444	A	8	8	3578904	3578911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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87347	NC_022444	GCA	2	6	3582344	3582349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87348	NC_022444	G	6	6	3582350	3582355	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87349	NC_022444	CTT	2	6	3582376	3582381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87350	NC_022444	GC	4	8	3582384	3582391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87351	NC_022444	CGG	2	6	3582396	3582401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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87471	NC_022444	ACC	2	6	3586394	3586399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643526
87472	NC_022444	TGG	2	6	3586450	3586455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643526
87473	NC_022444	ATG	2	6	3586525	3586530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643526
87474	NC_022444	CACG	2	8	3586544	3586551	25 %	0 %	25 %	50 %	545643526
87475	NC_022444	CG	3	6	3586550	3586555	0 %	0 %	50 %	50 %	545643526
87476	NC_022444	AGA	2	6	3586584	3586589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545643526
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87480	NC_022444	GCT	2	6	3586722	3586727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643526
87481	NC_022444	TGC	2	6	3586763	3586768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643526
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87490	NC_022444	CGA	2	6	3587230	3587235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643527
87491	NC_022444	ATG	2	6	3587255	3587260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643527
87492	NC_022444	CGC	2	6	3587264	3587269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643527
87493	NC_022444	ATC	2	6	3587271	3587276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643527
87494	NC_022444	CT	3	6	3587288	3587293	0 %	50 %	0 %	50 %	545643527
87495	NC_022444	AGC	3	9	3587301	3587309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643527
87496	NC_022444	CAT	2	6	3587347	3587352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643527
87497	NC_022444	AAGAC	2	10	3587433	3587442	60 %	0 %	20 %	20 %	545643527
87498	NC_022444	TGG	3	9	3587448	3587456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643527
87499	NC_022444	GGC	2	6	3587546	3587551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87500	NC_022444	GCGTTC	2	12	3587552	3587563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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