MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 genome

Total Repeats: 90159

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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80002	NC_022444	CCTT	2	8	3270856	3270863	0 %	50 %	0 %	50 %	545643240
80003	NC_022444	GGC	2	6	3270914	3270919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643240
80004	NC_022444	GAT	2	6	3270936	3270941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643240
80005	NC_022444	GCA	2	6	3271007	3271012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643240
80006	NC_022444	ATG	2	6	3271014	3271019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643240
80007	NC_022444	CTT	2	6	3271088	3271093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545643240
80008	NC_022444	GCCGG	2	10	3271201	3271210	0 %	0 %	60 %	40 %	545643240
80009	NC_022444	AAT	2	6	3271212	3271217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545643240
80010	NC_022444	TGT	2	6	3271316	3271321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545643240
80011	NC_022444	GTT	2	6	3271347	3271352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545643240
80012	NC_022444	GAT	2	6	3271416	3271421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643240
80013	NC_022444	GGC	2	6	3271451	3271456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643240
80014	NC_022444	CCAT	2	8	3271457	3271464	25 %	25 %	0 %	50 %	545643240
80015	NC_022444	CAC	2	6	3271500	3271505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643240
80016	NC_022444	CAC	2	6	3271536	3271541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643240
80017	NC_022444	CCA	2	6	3271553	3271558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643240
80018	NC_022444	GCA	2	6	3271604	3271609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643240
80019	NC_022444	GCC	2	6	3271614	3271619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643240
80020	NC_022444	GCA	2	6	3271694	3271699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643240
80021	NC_022444	GTC	2	6	3271701	3271706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643240
80022	NC_022444	CTT	2	6	3271727	3271732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545643240
80023	NC_022444	GC	3	6	3271753	3271758	0 %	0 %	50 %	50 %	545643240
80024	NC_022444	TCG	2	6	3271765	3271770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643240
80025	NC_022444	CGA	2	6	3271811	3271816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643240
80026	NC_022444	G	7	7	3271901	3271907	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80027	NC_022444	CG	4	8	3271909	3271916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80028	NC_022444	TGC	2	6	3271960	3271965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80029	NC_022444	GCAG	2	8	3272026	3272033	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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80031	NC_022444	G	6	6	3272088	3272093	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80032	NC_022444	TTTC	2	8	3272104	3272111	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80033	NC_022444	A	6	6	3272211	3272216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80034	NC_022444	GCA	2	6	3272262	3272267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643241
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80037	NC_022444	GCTGCA	2	12	3272367	3272378	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545643241
80038	NC_022444	CCATT	2	10	3272473	3272482	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
80039	NC_022444	CCAG	2	8	3272537	3272544	25 %	0 %	25 %	50 %	545643242
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80041	NC_022444	CGC	2	6	3272630	3272635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643242
80042	NC_022444	GCG	2	6	3272662	3272667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643242
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80044	NC_022444	CGC	2	6	3272708	3272713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643242
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80047	NC_022444	CGCC	2	8	3272865	3272872	0 %	0 %	25 %	75 %	545643242
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80050	NC_022444	GCCG	2	8	3272996	3273003	0 %	0 %	50 %	50 %	545643242
80051	NC_022444	GCG	2	6	3273027	3273032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643242
80052	NC_022444	GCT	2	6	3273044	3273049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643242
80053	NC_022444	GCA	2	6	3273084	3273089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643242
80054	NC_022444	CAC	2	6	3273108	3273113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643242
80055	NC_022444	CAG	2	6	3273132	3273137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643242
80056	NC_022444	CGG	2	6	3273139	3273144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643242
80057	NC_022444	CCCTG	2	10	3273206	3273215	0 %	20 %	20 %	60 %	545643242
80058	NC_022444	GC	4	8	3273236	3273243	0 %	0 %	50 %	50 %	545643242
80059	NC_022444	AGG	2	6	3273301	3273306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545643242
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80062	NC_022444	CAGC	2	8	3273366	3273373	25 %	0 %	25 %	50 %	545643242
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80064	NC_022444	GCCCG	2	10	3273389	3273398	0 %	0 %	40 %	60 %	545643242
80065	NC_022444	GCC	2	6	3273403	3273408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643242
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80068	NC_022444	GGC	2	6	3273474	3273479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643242
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80070	NC_022444	CTGCC	2	10	3273514	3273523	0 %	20 %	20 %	60 %	545643242
80071	NC_022444	GTGG	2	8	3273543	3273550	0 %	25 %	75 %	0 %	545643242
80072	NC_022444	TTTG	2	8	3273705	3273712	0 %	75 %	25 %	0 %	545643243
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80083	NC_022444	TGC	2	6	3274053	3274058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643243
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80085	NC_022444	CCCTG	2	10	3274086	3274095	0 %	20 %	20 %	60 %	545643243
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80089	NC_022444	GCC	2	6	3274289	3274294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643243
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80101	NC_022444	CCA	2	6	3274707	3274712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643243
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80107	NC_022444	TGG	2	6	3274812	3274817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643243
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80230	NC_022444	GGC	2	6	3280503	3280508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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80232	NC_022444	GGC	2	6	3280597	3280602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643251
80233	NC_022444	GCG	2	6	3280604	3280609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643251
80234	NC_022444	CAC	2	6	3280625	3280630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643251
80235	NC_022444	AGGTGG	2	12	3280711	3280722	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	545643251
80236	NC_022444	GAT	2	6	3280787	3280792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643251
80237	NC_022444	GAT	2	6	3280871	3280876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643251
80238	NC_022444	A	6	6	3280899	3280904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80239	NC_022444	CGT	2	6	3280909	3280914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80240	NC_022444	TGGCCG	2	12	3280996	3281007	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	545643252
80241	NC_022444	CGCA	2	8	3281009	3281016	25 %	0 %	25 %	50 %	545643252
80242	NC_022444	GGT	2	6	3281023	3281028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643252
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80245	NC_022444	TGG	2	6	3281218	3281223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643252
80246	NC_022444	CGGC	2	8	3281237	3281244	0 %	0 %	50 %	50 %	545643252
80247	NC_022444	CCA	2	6	3281257	3281262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643252
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80250	NC_022444	CCGC	2	8	3281337	3281344	0 %	0 %	25 %	75 %	545643252
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80260	NC_022444	CCGG	2	8	3281632	3281639	0 %	0 %	50 %	50 %	545643252
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80262	NC_022444	TCG	2	6	3281790	3281795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643252
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80281	NC_022444	CGG	2	6	3282642	3282647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643253
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80303	NC_022444	CGGG	2	8	3283426	3283433	0 %	0 %	75 %	25 %	545643254
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80309	NC_022444	CG	3	6	3283588	3283593	0 %	0 %	50 %	50 %	545643254
80310	NC_022444	CCAG	2	8	3283594	3283601	25 %	0 %	25 %	50 %	545643254
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80313	NC_022444	GCCG	2	8	3283846	3283853	0 %	0 %	50 %	50 %	545643255
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80318	NC_022444	GCA	2	6	3284054	3284059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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80322	NC_022444	CGG	2	6	3284175	3284180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643256
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80331	NC_022444	GCC	2	6	3284509	3284514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643257
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80333	NC_022444	G	6	6	3284530	3284535	0 %	0 %	100 %	0 %	545643257
80334	NC_022444	GGCCA	2	10	3284554	3284563	20 %	0 %	40 %	40 %	545643257
80335	NC_022444	GCC	2	6	3284572	3284577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643257
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80337	NC_022444	T	6	6	3284626	3284631	0 %	100 %	0 %	0 %	545643257
80338	NC_022444	GCC	2	6	3284632	3284637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643257
80339	NC_022444	CAT	2	6	3284641	3284646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643257
80340	NC_022444	CTG	2	6	3284647	3284652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643257
80341	NC_022444	CAT	2	6	3284653	3284658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643257
80342	NC_022444	CTG	2	6	3284659	3284664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643257
80343	NC_022444	GAA	2	6	3284671	3284676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545643257
80344	NC_022444	CAG	2	6	3284683	3284688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643257
80345	NC_022444	CGC	2	6	3284732	3284737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643257
80346	NC_022444	GCA	2	6	3284754	3284759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643257
80347	NC_022444	GGC	2	6	3284769	3284774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643257
80348	NC_022444	CGG	2	6	3284830	3284835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643257
80349	NC_022444	TCA	2	6	3284886	3284891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643257
80350	NC_022444	CG	3	6	3284959	3284964	0 %	0 %	50 %	50 %	545643257
80351	NC_022444	CAT	2	6	3284965	3284970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643257
80352	NC_022444	CATGGC	2	12	3284980	3284991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545643257
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80373	NC_022444	ACC	2	6	3285791	3285796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643257
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80377	NC_022444	CG	3	6	3285954	3285959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80378	NC_022444	TGC	2	6	3285961	3285966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80379	NC_022444	CAT	2	6	3286058	3286063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80380	NC_022444	CT	3	6	3286083	3286088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80381	NC_022444	T	7	7	3286173	3286179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80382	NC_022444	GC	3	6	3286192	3286197	0 %	0 %	50 %	50 %	545643258
80383	NC_022444	CTG	2	6	3286235	3286240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643258
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80394	NC_022444	TGC	2	6	3286722	3286727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643258
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80421	NC_022444	CTG	2	6	3287675	3287680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643258
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80423	NC_022444	CGG	2	6	3287757	3287762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643258
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80430	NC_022444	CGCA	2	8	3287988	3287995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80431	NC_022444	GTT	3	9	3288024	3288032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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80450	NC_022444	TGG	3	9	3288853	3288861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643260
80451	NC_022444	GCA	2	6	3288862	3288867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643260
80452	NC_022444	CAC	2	6	3288917	3288922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643260
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80454	NC_022444	CCGG	2	8	3288987	3288994	0 %	0 %	50 %	50 %	545643260
80455	NC_022444	TACC	2	8	3289031	3289038	25 %	25 %	0 %	50 %	545643260
80456	NC_022444	GCC	2	6	3289048	3289053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643260
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80458	NC_022444	TCG	2	6	3289099	3289104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643260
80459	NC_022444	CCCTGC	2	12	3289117	3289128	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	545643260
80460	NC_022444	ATG	2	6	3289191	3289196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643260
80461	NC_022444	GCCCT	2	10	3289254	3289263	0 %	20 %	20 %	60 %	545643260
80462	NC_022444	CCA	2	6	3289279	3289284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643260
80463	NC_022444	CGA	2	6	3289298	3289303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643260
80464	NC_022444	CTC	2	6	3289332	3289337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545643260
80465	NC_022444	CTG	2	6	3289389	3289394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643260
80466	NC_022444	TGC	2	6	3289510	3289515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643260
80467	NC_022444	TCC	2	6	3289551	3289556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545643260
80468	NC_022444	CCTGG	2	10	3289565	3289574	0 %	20 %	40 %	40 %	545643260
80469	NC_022444	GAC	2	6	3289638	3289643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643260
80470	NC_022444	GCGT	2	8	3289662	3289669	0 %	25 %	50 %	25 %	545643260
80471	NC_022444	CTG	2	6	3289704	3289709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643260
80472	NC_022444	CGG	2	6	3289732	3289737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643260
80473	NC_022444	CGG	2	6	3289742	3289747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643260
80474	NC_022444	CTT	2	6	3289805	3289810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545643260
80475	NC_022444	CCG	2	6	3289852	3289857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643260
80476	NC_022444	CAAGGA	2	12	3289880	3289891	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	545643260
80477	NC_022444	CGC	2	6	3289892	3289897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643260
80478	NC_022444	CCG	2	6	3290069	3290074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643260
80479	NC_022444	GGC	2	6	3290083	3290088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643260
80480	NC_022444	GGA	2	6	3290186	3290191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545643260
80481	NC_022444	AGA	2	6	3290212	3290217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545643260
80482	NC_022444	GGGC	2	8	3290237	3290244	0 %	0 %	75 %	25 %	545643260
80483	NC_022444	GCGAC	2	10	3290256	3290265	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80484	NC_022444	G	6	6	3290270	3290275	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80485	NC_022444	C	6	6	3290297	3290302	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80486	NC_022444	CA	3	6	3290339	3290344	50 %	0 %	0 %	50 %	545643261
80487	NC_022444	GCCG	2	8	3290381	3290388	0 %	0 %	50 %	50 %	545643261
80488	NC_022444	ACC	2	6	3290466	3290471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643261
80489	NC_022444	ATCT	2	8	3290481	3290488	25 %	50 %	0 %	25 %	545643261
80490	NC_022444	ACGGC	2	10	3290531	3290540	20 %	0 %	40 %	40 %	545643261
80491	NC_022444	AGAA	2	8	3290650	3290657	75 %	0 %	25 %	0 %	545643261
80492	NC_022444	AGC	2	6	3290770	3290775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643261
80493	NC_022444	ATA	2	6	3290907	3290912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545643261
80494	NC_022444	CAG	2	6	3290928	3290933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643261
80495	NC_022444	CG	3	6	3290942	3290947	0 %	0 %	50 %	50 %	545643261
80496	NC_022444	CGG	2	6	3290955	3290960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643261
80497	NC_022444	CCAAT	2	10	3290998	3291007	40 %	20 %	0 %	40 %	545643261
80498	NC_022444	TTG	2	6	3291037	3291042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545643261
80499	NC_022444	TGA	2	6	3291152	3291157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643261
80500	NC_022444	GCG	2	6	3291174	3291179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643261

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