MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides mccartyi DCMB5

Total Repeats: 26327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020386	ATGAA	2	10	157505	157514	60 %	20 %	20 %	0 %	452202986
3002	NC_020386	GAA	2	6	157528	157533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202986
3003	NC_020386	CGG	2	6	157576	157581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202986
3004	NC_020386	GCG	2	6	157594	157599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202986
3005	NC_020386	TCA	2	6	157717	157722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202987
3006	NC_020386	C	6	6	157774	157779	0 %	0 %	0 %	100 %	452202987
3007	NC_020386	TAC	2	6	157848	157853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202987
3008	NC_020386	CTT	2	6	157881	157886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202987
3009	NC_020386	TCA	2	6	157921	157926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202987
3010	NC_020386	TTC	2	6	157955	157960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_020386	ATTT	2	8	157974	157981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_020386	A	7	7	158021	158027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_020386	ATA	2	6	158057	158062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_020386	ATC	2	6	158108	158113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202988
3015	NC_020386	TTCTT	2	10	158162	158171	0 %	80 %	0 %	20 %	452202988
3016	NC_020386	CTGCCT	2	12	158181	158192	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	452202988
3017	NC_020386	GGC	2	6	158203	158208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202988
3018	NC_020386	TAACCG	2	12	158216	158227	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	452202988
3019	NC_020386	AC	3	6	158258	158263	50 %	0 %	0 %	50 %	452202988
3020	NC_020386	T	6	6	158350	158355	0 %	100 %	0 %	0 %	452202988
3021	NC_020386	GCA	2	6	158357	158362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202988
3022	NC_020386	T	6	6	158376	158381	0 %	100 %	0 %	0 %	452202988
3023	NC_020386	CCG	2	6	158399	158404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202988
3024	NC_020386	T	6	6	158475	158480	0 %	100 %	0 %	0 %	452202988
3025	NC_020386	CGG	2	6	158556	158561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202988
3026	NC_020386	CGG	2	6	158604	158609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202988
3027	NC_020386	CAGA	2	8	158631	158638	50 %	0 %	25 %	25 %	452202988
3028	NC_020386	GTG	2	6	158672	158677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202988
3029	NC_020386	CGG	2	6	158702	158707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202988
3030	NC_020386	TAT	2	6	158716	158721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202988
3031	NC_020386	CTT	2	6	158868	158873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202988
3032	NC_020386	TGC	2	6	158889	158894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202988
3033	NC_020386	GGC	2	6	158901	158906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202988
3034	NC_020386	GCC	3	9	158974	158982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202988
3035	NC_020386	TCA	2	6	159077	159082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202988
3036	NC_020386	AGG	2	6	159183	159188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202988
3037	NC_020386	TTG	2	6	159230	159235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202988
3038	NC_020386	GCC	2	6	159283	159288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202988
3039	NC_020386	TAG	2	6	159312	159317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202988
3040	NC_020386	CAG	2	6	159328	159333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202988
3041	NC_020386	GGCC	2	8	159357	159364	0 %	0 %	50 %	50 %	452202988
3042	NC_020386	ATA	2	6	159377	159382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202988
3043	NC_020386	T	6	6	159388	159393	0 %	100 %	0 %	0 %	452202988
3044	NC_020386	GTT	2	6	159418	159423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202988
3045	NC_020386	TCA	2	6	159437	159442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202988
3046	NC_020386	TCA	2	6	159485	159490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202988
3047	NC_020386	AAAC	2	8	159527	159534	75 %	0 %	0 %	25 %	452202988
3048	NC_020386	GAAGG	2	10	159548	159557	40 %	0 %	60 %	0 %	452202988
3049	NC_020386	T	6	6	159561	159566	0 %	100 %	0 %	0 %	452202988
3050	NC_020386	CGG	2	6	159576	159581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202988
3051	NC_020386	GGCAG	2	10	159640	159649	20 %	0 %	60 %	20 %	452202988
3052	NC_020386	TGG	2	6	159681	159686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202988
3053	NC_020386	A	7	7	159771	159777	100 %	0 %	0 %	0 %	452202988
3054	NC_020386	T	6	6	159860	159865	0 %	100 %	0 %	0 %	452202988
3055	NC_020386	AT	3	6	159875	159880	50 %	50 %	0 %	0 %	452202988
3056	NC_020386	T	6	6	159886	159891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_020386	CCG	2	6	159964	159969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_020386	ACC	2	6	160000	160005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_020386	TAA	2	6	160088	160093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_020386	CGC	2	6	160184	160189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_020386	TTA	2	6	160226	160231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_020386	T	6	6	160356	160361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_020386	TGG	2	6	160380	160385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_020386	T	7	7	160394	160400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_020386	GGT	2	6	160465	160470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202989
3066	NC_020386	TGC	2	6	160514	160519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202989
3067	NC_020386	CGG	2	6	160550	160555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202989
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3069	NC_020386	CT	3	6	160689	160694	0 %	50 %	0 %	50 %	452202989
3070	NC_020386	GCAGG	2	10	160699	160708	20 %	0 %	60 %	20 %	452202989
3071	NC_020386	AAT	2	6	160732	160737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202989
3072	NC_020386	AT	3	6	160768	160773	50 %	50 %	0 %	0 %	452202989
3073	NC_020386	C	6	6	160780	160785	0 %	0 %	0 %	100 %	452202989
3074	NC_020386	ATA	2	6	160811	160816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202989
3075	NC_020386	CT	3	6	160843	160848	0 %	50 %	0 %	50 %	452202989
3076	NC_020386	CGG	2	6	161098	161103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202989
3077	NC_020386	GGCG	2	8	161177	161184	0 %	0 %	75 %	25 %	452202989
3078	NC_020386	TTA	2	6	161265	161270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202989
3079	NC_020386	CGG	2	6	161292	161297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202989
3080	NC_020386	AGGGA	2	10	161323	161332	40 %	0 %	60 %	0 %	452202989
3081	NC_020386	GAA	2	6	161448	161453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202989
3082	NC_020386	A	6	6	161481	161486	100 %	0 %	0 %	0 %	452202990
3083	NC_020386	GCC	2	6	161504	161509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202990
3084	NC_020386	GAG	2	6	161536	161541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202990
3085	NC_020386	CAG	2	6	161590	161595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202990
3086	NC_020386	TA	3	6	161664	161669	50 %	50 %	0 %	0 %	452202990
3087	NC_020386	AAAC	2	8	161703	161710	75 %	0 %	0 %	25 %	452202990
3088	NC_020386	GGT	2	6	161712	161717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202990
3089	NC_020386	GCT	2	6	161770	161775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202990
3090	NC_020386	GGC	3	9	161784	161792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202990
3091	NC_020386	GGGTG	2	10	161793	161802	0 %	20 %	80 %	0 %	452202990
3092	NC_020386	ACT	2	6	162007	162012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202990
3093	NC_020386	A	6	6	162127	162132	100 %	0 %	0 %	0 %	452202990
3094	NC_020386	CGG	2	6	162159	162164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202990
3095	NC_020386	GGA	2	6	162285	162290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202990
3096	NC_020386	GCT	2	6	162364	162369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202990
3097	NC_020386	GTTT	2	8	162379	162386	0 %	75 %	25 %	0 %	452202990
3098	NC_020386	TAG	2	6	162423	162428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202990
3099	NC_020386	AAT	2	6	162459	162464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202990
3100	NC_020386	CTG	2	6	162553	162558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202990
3101	NC_020386	AT	4	8	162597	162604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_020386	GGT	2	6	162605	162610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_020386	TA	3	6	162662	162667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_020386	CAG	2	6	162702	162707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202991
3105	NC_020386	GTG	2	6	162793	162798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202991
3106	NC_020386	CCT	2	6	162852	162857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202991
3107	NC_020386	TGG	2	6	162858	162863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202991
3108	NC_020386	AAAG	2	8	162865	162872	75 %	0 %	25 %	0 %	452202991
3109	NC_020386	ATT	2	6	162932	162937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202991
3110	NC_020386	GCTG	2	8	162951	162958	0 %	25 %	50 %	25 %	452202991
3111	NC_020386	GGT	2	6	162978	162983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202991
3112	NC_020386	TAA	3	9	163011	163019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202991
3113	NC_020386	CTG	2	6	163033	163038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202991
3114	NC_020386	GAA	2	6	163045	163050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202991
3115	NC_020386	TCAG	2	8	163085	163092	25 %	25 %	25 %	25 %	452202991
3116	NC_020386	ATT	2	6	163102	163107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202991
3117	NC_020386	GGT	2	6	163113	163118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202991
3118	NC_020386	AGG	2	6	163205	163210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202991
3119	NC_020386	TCT	2	6	163262	163267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202991
3120	NC_020386	TTC	2	6	163276	163281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202991
3121	NC_020386	TTCA	2	8	163285	163292	25 %	50 %	0 %	25 %	452202991
3122	NC_020386	CAG	3	9	163294	163302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202991
3123	NC_020386	GTT	2	6	163333	163338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202991
3124	NC_020386	GTCA	2	8	163387	163394	25 %	25 %	25 %	25 %	452202991
3125	NC_020386	GCT	3	9	163401	163409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202991
3126	NC_020386	TAT	3	9	163444	163452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202991
3127	NC_020386	TTCA	2	8	163555	163562	25 %	50 %	0 %	25 %	452202991
3128	NC_020386	AAC	2	6	163720	163725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202991
3129	NC_020386	GTTT	2	8	163793	163800	0 %	75 %	25 %	0 %	452202991
3130	NC_020386	CTG	2	6	163801	163806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202991
3131	NC_020386	GCA	2	6	163908	163913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202991
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3134	NC_020386	GGC	2	6	164113	164118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202991
3135	NC_020386	AGCGGT	2	12	164133	164144	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	452202991
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3140	NC_020386	TGAT	2	8	164228	164235	25 %	50 %	25 %	0 %	452202991
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3145	NC_020386	CAAA	2	8	164529	164536	75 %	0 %	0 %	25 %	452202991
3146	NC_020386	TTC	2	6	164548	164553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202991
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3151	NC_020386	AT	3	6	165009	165014	50 %	50 %	0 %	0 %	452202991
3152	NC_020386	CTT	2	6	165042	165047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202991
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3154	NC_020386	CAG	2	6	165094	165099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202991
3155	NC_020386	ACT	2	6	165194	165199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202991
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3164	NC_020386	TGGCAA	2	12	165672	165683	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452202991
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3170	NC_020386	ATT	2	6	165918	165923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3171	NC_020386	GCT	2	6	166202	166207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202992
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3200	NC_020386	AGTC	2	8	167632	167639	25 %	25 %	25 %	25 %	452202993
3201	NC_020386	AGT	2	6	167644	167649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202993
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3217	NC_020386	ATA	2	6	168179	168184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3218	NC_020386	ATC	2	6	168196	168201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3219	NC_020386	A	9	9	168209	168217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3220	NC_020386	A	6	6	168228	168233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3226	NC_020386	GGAA	2	8	168644	168651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3227	NC_020386	AG	3	6	168723	168728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3228	NC_020386	A	6	6	168752	168757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3229	NC_020386	A	6	6	168764	168769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3230	NC_020386	CTG	2	6	168791	168796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202996
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3233	NC_020386	GGAA	2	8	168861	168868	50 %	0 %	50 %	0 %	452202996
3234	NC_020386	ATA	2	6	168876	168881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202996
3235	NC_020386	AG	3	6	168904	168909	50 %	0 %	50 %	0 %	452202996
3236	NC_020386	TAG	2	6	169031	169036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202996
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3238	NC_020386	ATC	2	6	169101	169106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202996
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3240	NC_020386	GAA	2	6	169271	169276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202996
3241	NC_020386	ATT	2	6	169293	169298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202996
3242	NC_020386	GT	3	6	169375	169380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_020386	TGA	2	6	169437	169442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_020386	TC	3	6	169466	169471	0 %	50 %	0 %	50 %	452202997
3245	NC_020386	GGT	2	6	169505	169510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202997
3246	NC_020386	CCT	2	6	169618	169623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202997
3247	NC_020386	GCC	2	6	169788	169793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202997
3248	NC_020386	GGGGC	2	10	169845	169854	0 %	0 %	80 %	20 %	452202997
3249	NC_020386	GAA	2	6	169992	169997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202997
3250	NC_020386	ACT	2	6	170028	170033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202997
3251	NC_020386	GTG	2	6	170151	170156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202997
3252	NC_020386	GAT	2	6	170160	170165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202997
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3262	NC_020386	TAT	2	6	170630	170635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3263	NC_020386	ACT	2	6	170665	170670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3264	NC_020386	TA	4	8	170809	170816	50 %	50 %	0 %	0 %	452202999
3265	NC_020386	ATA	2	6	170832	170837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202999
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3342	NC_020386	CT	3	6	175296	175301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3343	NC_020386	TCA	2	6	175370	175375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452203004
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3368	NC_020386	GGTA	2	8	176422	176429	25 %	25 %	50 %	0 %	452203005
3369	NC_020386	TA	3	6	176440	176445	50 %	50 %	0 %	0 %	452203005
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3371	NC_020386	GCCT	2	8	176609	176616	0 %	25 %	25 %	50 %	452203005
3372	NC_020386	GCT	2	6	176617	176622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452203005
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3482	NC_020386	TAT	2	6	182032	182037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452203011
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3493	NC_020386	GAA	2	6	182608	182613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452203011
3494	NC_020386	CCA	2	6	182640	182645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452203011
3495	NC_020386	AT	3	6	182665	182670	50 %	50 %	0 %	0 %	452203011
3496	NC_020386	ATA	2	6	182758	182763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3497	NC_020386	GGA	2	6	182776	182781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_020386	AAAT	2	8	182785	182792	75 %	25 %	0 %	0 %	452203012
3499	NC_020386	T	6	6	182838	182843	0 %	100 %	0 %	0 %	452203012
3500	NC_020386	GCC	2	6	182866	182871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452203012

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