MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides mccartyi DCMB5

Total Repeats: 26327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_020386	CTG	3	9	1360519	1360527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204240
25002	NC_020386	CAT	2	6	1360692	1360697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204240
25003	NC_020386	ATA	2	6	1360798	1360803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204240
25004	NC_020386	CCG	2	6	1360818	1360823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204240
25005	NC_020386	CCA	2	6	1360903	1360908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204240
25006	NC_020386	AAC	2	6	1360916	1360921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452204240
25007	NC_020386	CCT	2	6	1360930	1360935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25008	NC_020386	AAT	2	6	1360974	1360979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25009	NC_020386	TAA	3	9	1361035	1361043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25010	NC_020386	ATT	2	6	1361047	1361052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25011	NC_020386	AATTTC	2	12	1361069	1361080	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25012	NC_020386	GTC	2	6	1361102	1361107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25013	NC_020386	CAG	2	6	1361273	1361278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204241
25014	NC_020386	GGC	2	6	1361288	1361293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204241
25015	NC_020386	TTC	2	6	1361306	1361311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204241
25016	NC_020386	CAG	2	6	1361345	1361350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204241
25017	NC_020386	TAAGAT	2	12	1361389	1361400	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452204241
25018	NC_020386	ACC	2	6	1361413	1361418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204241
25019	NC_020386	A	6	6	1361459	1361464	100 %	0 %	0 %	0 %	452204241
25020	NC_020386	AGGC	2	8	1361544	1361551	25 %	0 %	50 %	25 %	452204242
25021	NC_020386	CCA	2	6	1361559	1361564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204242
25022	NC_020386	CAG	2	6	1361713	1361718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204242
25023	NC_020386	GGC	2	6	1361753	1361758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204242
25024	NC_020386	AG	3	6	1361759	1361764	50 %	0 %	50 %	0 %	452204242
25025	NC_020386	TTG	2	6	1361770	1361775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452204242
25026	NC_020386	TA	3	6	1361803	1361808	50 %	50 %	0 %	0 %	452204242
25027	NC_020386	TTCTTT	2	12	1361847	1361858	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452204242
25028	NC_020386	ATGGG	2	10	1361932	1361941	20 %	20 %	60 %	0 %	452204242
25029	NC_020386	GGC	2	6	1361978	1361983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204242
25030	NC_020386	GGC	2	6	1362023	1362028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204242
25031	NC_020386	GAAG	2	8	1362128	1362135	50 %	0 %	50 %	0 %	452204242
25032	NC_020386	AGT	2	6	1362291	1362296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204242
25033	NC_020386	TAG	2	6	1362353	1362358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204242
25034	NC_020386	GTT	2	6	1362375	1362380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452204242
25035	NC_020386	AGA	2	6	1362401	1362406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452204242
25036	NC_020386	GCC	2	6	1362475	1362480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204242
25037	NC_020386	TTC	2	6	1362534	1362539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204242
25038	NC_020386	GTA	2	6	1362723	1362728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204242
25039	NC_020386	CAT	2	6	1362780	1362785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204242
25040	NC_020386	TGG	2	6	1362803	1362808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204242
25041	NC_020386	GTC	2	6	1362810	1362815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204242
25042	NC_020386	CCA	2	6	1362834	1362839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204242
25043	NC_020386	AGC	2	6	1362906	1362911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204242
25044	NC_020386	CGG	2	6	1362961	1362966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204242
25045	NC_020386	TGAA	2	8	1362975	1362982	50 %	25 %	25 %	0 %	452204242
25046	NC_020386	TCC	2	6	1362997	1363002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25047	NC_020386	TTC	2	6	1363025	1363030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25048	NC_020386	TC	3	6	1363046	1363051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25049	NC_020386	CGC	2	6	1363069	1363074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25050	NC_020386	ATTA	2	8	1363116	1363123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25051	NC_020386	TA	3	6	1363122	1363127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25052	NC_020386	GTAA	2	8	1363194	1363201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25053	NC_020386	A	6	6	1363302	1363307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25054	NC_020386	T	6	6	1363333	1363338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25055	NC_020386	GC	3	6	1363469	1363474	0 %	0 %	50 %	50 %	452204243
25056	NC_020386	AGTC	2	8	1363489	1363496	25 %	25 %	25 %	25 %	452204243
25057	NC_020386	TAA	2	6	1363520	1363525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204243
25058	NC_020386	ATA	2	6	1363541	1363546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204243
25059	NC_020386	GTT	2	6	1363621	1363626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452204243
25060	NC_020386	GGA	2	6	1363664	1363669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452204243
25061	NC_020386	GAT	2	6	1363687	1363692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204243
25062	NC_020386	TCATA	2	10	1363746	1363755	40 %	40 %	0 %	20 %	452204243
25063	NC_020386	AGC	3	9	1363783	1363791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204243
25064	NC_020386	CTTTT	2	10	1363804	1363813	0 %	80 %	0 %	20 %	452204243
25065	NC_020386	CGG	2	6	1363830	1363835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204243
25066	NC_020386	GGGT	2	8	1363907	1363914	0 %	25 %	75 %	0 %	452204243
25067	NC_020386	T	6	6	1364092	1364097	0 %	100 %	0 %	0 %	452204243
25068	NC_020386	AAT	2	6	1364134	1364139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204243
25069	NC_020386	GC	3	6	1364164	1364169	0 %	0 %	50 %	50 %	452204243
25070	NC_020386	TGCC	2	8	1364221	1364228	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25071	NC_020386	TAA	2	6	1364251	1364256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25072	NC_020386	CAG	2	6	1364266	1364271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25073	NC_020386	TTGC	2	8	1364360	1364367	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25074	NC_020386	AGG	2	6	1364381	1364386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25075	NC_020386	TGG	2	6	1364453	1364458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25076	NC_020386	TCAC	2	8	1364524	1364531	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25077	NC_020386	T	6	6	1364556	1364561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25078	NC_020386	CGGG	2	8	1364565	1364572	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25079	NC_020386	T	6	6	1364653	1364658	0 %	100 %	0 %	0 %	452204244
25080	NC_020386	CGGG	2	8	1364702	1364709	0 %	0 %	75 %	25 %	452204244
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25084	NC_020386	TA	3	6	1364912	1364917	50 %	50 %	0 %	0 %	452204244
25085	NC_020386	AT	3	6	1364978	1364983	50 %	50 %	0 %	0 %	452204244
25086	NC_020386	GCG	2	6	1365036	1365041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204244
25087	NC_020386	AT	3	6	1365052	1365057	50 %	50 %	0 %	0 %	452204244
25088	NC_020386	CCCG	2	8	1365058	1365065	0 %	0 %	25 %	75 %	452204244
25089	NC_020386	GGT	2	6	1365071	1365076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204244
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25092	NC_020386	CGG	2	6	1365273	1365278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204244
25093	NC_020386	CTA	2	6	1365298	1365303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204244
25094	NC_020386	AATG	2	8	1365310	1365317	50 %	25 %	25 %	0 %	452204244
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25099	NC_020386	AGT	2	6	1365482	1365487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204244
25100	NC_020386	CCT	2	6	1365512	1365517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25101	NC_020386	CAG	2	6	1365548	1365553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204245
25102	NC_020386	ATG	2	6	1365570	1365575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204245
25103	NC_020386	TCT	2	6	1365592	1365597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204245
25104	NC_020386	CTGC	2	8	1365628	1365635	0 %	25 %	25 %	50 %	452204245
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25107	NC_020386	TCCT	2	8	1365742	1365749	0 %	50 %	0 %	50 %	452204246
25108	NC_020386	TCA	2	6	1365810	1365815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204246
25109	NC_020386	CCA	2	6	1365822	1365827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204246
25110	NC_020386	CTT	2	6	1365946	1365951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204246
25111	NC_020386	AAT	2	6	1365955	1365960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204246
25112	NC_020386	CATA	2	8	1365984	1365991	50 %	25 %	0 %	25 %	452204246
25113	NC_020386	ACCAGC	2	12	1366040	1366051	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	452204246
25114	NC_020386	CCG	2	6	1366106	1366111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204246
25115	NC_020386	ATA	2	6	1366118	1366123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204246
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25117	NC_020386	AAT	2	6	1366218	1366223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204246
25118	NC_020386	GAAGC	2	10	1366248	1366257	40 %	0 %	40 %	20 %	452204246
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25120	NC_020386	T	6	6	1366478	1366483	0 %	100 %	0 %	0 %	452204246
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25225	NC_020386	T	6	6	1371823	1371828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25359	NC_020386	TGA	2	6	1379365	1379370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204260
25360	NC_020386	AC	3	6	1379420	1379425	50 %	0 %	0 %	50 %	452204260
25361	NC_020386	CGG	2	6	1379462	1379467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204260
25362	NC_020386	TCC	2	6	1379635	1379640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452204260
25363	NC_020386	GAT	2	6	1379670	1379675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204260
25364	NC_020386	GA	3	6	1379686	1379691	50 %	0 %	50 %	0 %	452204260
25365	NC_020386	C	6	6	1379972	1379977	0 %	0 %	0 %	100 %	452204261
25366	NC_020386	ACC	2	6	1380034	1380039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204261
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25369	NC_020386	TTC	2	6	1380250	1380255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204262
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25372	NC_020386	CAC	2	6	1380661	1380666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204262
25373	NC_020386	TAT	2	6	1380772	1380777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452204262
25374	NC_020386	AAAC	2	8	1380778	1380785	75 %	0 %	0 %	25 %	452204262
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25382	NC_020386	CAA	2	6	1381177	1381182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452204262
25383	NC_020386	ACTT	2	8	1381456	1381463	25 %	50 %	0 %	25 %	452204262
25384	NC_020386	T	6	6	1381462	1381467	0 %	100 %	0 %	0 %	452204262
25385	NC_020386	CTT	2	6	1381470	1381475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204262
25386	NC_020386	AT	3	6	1381487	1381492	50 %	50 %	0 %	0 %	452204262
25387	NC_020386	A	8	8	1381514	1381521	100 %	0 %	0 %	0 %	452204262
25388	NC_020386	GCT	2	6	1381538	1381543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204262
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25390	NC_020386	TTTC	2	8	1381596	1381603	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25391	NC_020386	CTA	2	6	1381650	1381655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204263
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25397	NC_020386	CTG	2	6	1381941	1381946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204263
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25406	NC_020386	TTA	2	6	1382265	1382270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25445	NC_020386	TAC	2	6	1384466	1384471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25449	NC_020386	G	8	8	1384695	1384702	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25450	NC_020386	AGG	2	6	1384760	1384765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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25463	NC_020386	TA	3	6	1385657	1385662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25464	NC_020386	CCA	2	6	1385671	1385676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25465	NC_020386	AT	3	6	1385688	1385693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25466	NC_020386	GCCC	2	8	1385734	1385741	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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25468	NC_020386	TTG	2	6	1385768	1385773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25470	NC_020386	AAG	2	6	1385866	1385871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25471	NC_020386	GAA	2	6	1385882	1385887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25472	NC_020386	T	6	6	1385920	1385925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25473	NC_020386	TCT	2	6	1385970	1385975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25474	NC_020386	GCTT	2	8	1386035	1386042	0 %	50 %	25 %	25 %	452204268
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25477	NC_020386	ACT	2	6	1386153	1386158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204268
25478	NC_020386	TGC	2	6	1386187	1386192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204268
25479	NC_020386	TGCC	2	8	1386203	1386210	0 %	25 %	25 %	50 %	452204268
25480	NC_020386	CCG	2	6	1386218	1386223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204268
25481	NC_020386	A	6	6	1386253	1386258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25482	NC_020386	GCCAT	2	10	1386324	1386333	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25483	NC_020386	TA	3	6	1386419	1386424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25484	NC_020386	GTTTG	2	10	1386520	1386529	0 %	60 %	40 %	0 %	452204269
25485	NC_020386	AGC	2	6	1386588	1386593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204269
25486	NC_020386	GCC	2	6	1386638	1386643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204269
25487	NC_020386	A	7	7	1386652	1386658	100 %	0 %	0 %	0 %	452204269
25488	NC_020386	CTG	2	6	1386679	1386684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204269
25489	NC_020386	T	6	6	1386718	1386723	0 %	100 %	0 %	0 %	452204269
25490	NC_020386	TTA	2	6	1386746	1386751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452204269
25491	NC_020386	CGG	2	6	1386779	1386784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204269
25492	NC_020386	AAG	2	6	1386797	1386802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452204269
25493	NC_020386	TAAA	2	8	1386813	1386820	75 %	25 %	0 %	0 %	452204269
25494	NC_020386	AAT	2	6	1386823	1386828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25495	NC_020386	TAAA	2	8	1386835	1386842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25496	NC_020386	AGG	2	6	1386850	1386855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25497	NC_020386	AGAT	2	8	1386976	1386983	50 %	25 %	25 %	0 %	452204270
25498	NC_020386	CAG	2	6	1387098	1387103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204270
25499	NC_020386	TCT	2	6	1387155	1387160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204270
25500	NC_020386	CTG	2	6	1387173	1387178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204270

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