MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides mccartyi DCMB5

Total Repeats: 26327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22502	NC_020386	GCT	2	6	1223580	1223585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204094
22503	NC_020386	ACCGAA	2	12	1223586	1223597	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	452204094
22504	NC_020386	GCC	2	6	1223646	1223651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204094
22505	NC_020386	GAA	2	6	1223655	1223660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452204094
22506	NC_020386	CGG	3	9	1223672	1223680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204094
22507	NC_020386	TGCCC	2	10	1223696	1223705	0 %	20 %	20 %	60 %	452204094
22508	NC_020386	CGA	2	6	1223732	1223737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204094
22509	NC_020386	CCA	2	6	1223794	1223799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204094
22510	NC_020386	TTG	2	6	1223824	1223829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452204094
22511	NC_020386	ATG	2	6	1223875	1223880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204094
22512	NC_020386	CCA	2	6	1223917	1223922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204094
22513	NC_020386	TCCGC	2	10	1223929	1223938	0 %	20 %	20 %	60 %	452204094
22514	NC_020386	CGC	2	6	1223948	1223953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204094
22515	NC_020386	TCA	2	6	1223974	1223979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204094
22516	NC_020386	GCC	2	6	1224018	1224023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204094
22517	NC_020386	AGCC	2	8	1224192	1224199	25 %	0 %	25 %	50 %	452204095
22518	NC_020386	GGC	2	6	1224426	1224431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204095
22519	NC_020386	CGG	2	6	1224637	1224642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204095
22520	NC_020386	TCTGC	2	10	1224686	1224695	0 %	40 %	20 %	40 %	452204095
22521	NC_020386	CTGA	2	8	1224789	1224796	25 %	25 %	25 %	25 %	452204095
22522	NC_020386	CCA	2	6	1224839	1224844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204095
22523	NC_020386	AGT	2	6	1224883	1224888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204095
22524	NC_020386	GGC	2	6	1224917	1224922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204095
22525	NC_020386	TCAA	2	8	1224970	1224977	50 %	25 %	0 %	25 %	452204095
22526	NC_020386	CATGCT	2	12	1225005	1225016	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	452204095
22527	NC_020386	TTCT	2	8	1225041	1225048	0 %	75 %	0 %	25 %	452204095
22528	NC_020386	GTA	2	6	1225137	1225142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204095
22529	NC_020386	CGGT	2	8	1225156	1225163	0 %	25 %	50 %	25 %	452204095
22530	NC_020386	ACC	2	6	1225179	1225184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204095
22531	NC_020386	TGGC	2	8	1225264	1225271	0 %	25 %	50 %	25 %	452204095
22532	NC_020386	ACCC	2	8	1225302	1225309	25 %	0 %	0 %	75 %	452204095
22533	NC_020386	TA	4	8	1225311	1225318	50 %	50 %	0 %	0 %	452204095
22534	NC_020386	GGCA	2	8	1225341	1225348	25 %	0 %	50 %	25 %	452204095
22535	NC_020386	TGG	2	6	1225351	1225356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204095
22536	NC_020386	CTT	2	6	1225413	1225418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22537	NC_020386	AAT	2	6	1225423	1225428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22538	NC_020386	GAA	2	6	1225534	1225539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452204096
22539	NC_020386	AGA	2	6	1225566	1225571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452204096
22540	NC_020386	GTG	2	6	1225627	1225632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204096
22541	NC_020386	TCAG	2	8	1225664	1225671	25 %	25 %	25 %	25 %	452204096
22542	NC_020386	GCC	2	6	1225730	1225735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204096
22543	NC_020386	CCTTC	2	10	1225748	1225757	0 %	40 %	0 %	60 %	452204096
22544	NC_020386	T	6	6	1225825	1225830	0 %	100 %	0 %	0 %	452204096
22545	NC_020386	GAT	2	6	1225849	1225854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204096
22546	NC_020386	ATGA	2	8	1225886	1225893	50 %	25 %	25 %	0 %	452204097
22547	NC_020386	ATGTC	2	10	1225950	1225959	20 %	40 %	20 %	20 %	452204097
22548	NC_020386	GCT	2	6	1226005	1226010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204097
22549	NC_020386	ATG	2	6	1226016	1226021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204097
22550	NC_020386	GGGT	2	8	1226025	1226032	0 %	25 %	75 %	0 %	452204097
22551	NC_020386	CCG	2	6	1226151	1226156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204097
22552	NC_020386	CCGG	2	8	1226222	1226229	0 %	0 %	50 %	50 %	452204097
22553	NC_020386	TGA	2	6	1226281	1226286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204097
22554	NC_020386	ACCA	2	8	1226290	1226297	50 %	0 %	0 %	50 %	452204097
22555	NC_020386	AAT	2	6	1226422	1226427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204097
22556	NC_020386	AAAC	2	8	1226519	1226526	75 %	0 %	0 %	25 %	452204098
22557	NC_020386	GGGT	2	8	1226565	1226572	0 %	25 %	75 %	0 %	452204098
22558	NC_020386	GTTT	2	8	1226581	1226588	0 %	75 %	25 %	0 %	452204098
22559	NC_020386	GCC	2	6	1226597	1226602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204098
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22564	NC_020386	GAA	2	6	1226768	1226773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452204098
22565	NC_020386	CCAG	2	8	1226790	1226797	25 %	0 %	25 %	50 %	452204098
22566	NC_020386	C	6	6	1226871	1226876	0 %	0 %	0 %	100 %	452204098
22567	NC_020386	CCG	2	6	1226881	1226886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204098
22568	NC_020386	ATC	2	6	1226936	1226941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204098
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22570	NC_020386	GAA	2	6	1226977	1226982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452204098
22571	NC_020386	CCG	2	6	1227031	1227036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204098
22572	NC_020386	TGCC	2	8	1227055	1227062	0 %	25 %	25 %	50 %	452204098
22573	NC_020386	CTGG	2	8	1227082	1227089	0 %	25 %	50 %	25 %	452204098
22574	NC_020386	CTG	2	6	1227194	1227199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204098
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22577	NC_020386	GAA	2	6	1227293	1227298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452204098
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22579	NC_020386	CCT	2	6	1227337	1227342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452204098
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22582	NC_020386	CT	3	6	1227440	1227445	0 %	50 %	0 %	50 %	452204098
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22585	NC_020386	AAAC	2	8	1227481	1227488	75 %	0 %	0 %	25 %	452204098
22586	NC_020386	ATT	2	6	1227576	1227581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452204098
22587	NC_020386	ATG	2	6	1227615	1227620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204098
22588	NC_020386	CTGC	2	8	1227754	1227761	0 %	25 %	25 %	50 %	452204098
22589	NC_020386	CAGC	2	8	1227784	1227791	25 %	0 %	25 %	50 %	452204098
22590	NC_020386	GAA	2	6	1227833	1227838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452204098
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22600	NC_020386	A	6	6	1228292	1228297	100 %	0 %	0 %	0 %	452204098
22601	NC_020386	GCC	2	6	1228346	1228351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204098
22602	NC_020386	TTAGAC	2	12	1228454	1228465	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452204098
22603	NC_020386	TA	3	6	1228544	1228549	50 %	50 %	0 %	0 %	452204098
22604	NC_020386	ACA	2	6	1228684	1228689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452204098
22605	NC_020386	GCC	2	6	1228775	1228780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204098
22606	NC_020386	AGG	2	6	1228786	1228791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452204098
22607	NC_020386	ATA	2	6	1228822	1228827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204099
22608	NC_020386	CAT	2	6	1228884	1228889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204099
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22610	NC_020386	ATAA	2	8	1229074	1229081	75 %	25 %	0 %	0 %	452204100
22611	NC_020386	CCA	2	6	1229087	1229092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204100
22612	NC_020386	GCT	2	6	1229160	1229165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204100
22613	NC_020386	GCC	2	6	1229166	1229171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204100
22614	NC_020386	CTGTC	2	10	1229199	1229208	0 %	40 %	20 %	40 %	452204100
22615	NC_020386	TCA	2	6	1229267	1229272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204100
22616	NC_020386	GCC	2	6	1229309	1229314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204100
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22618	NC_020386	GCGG	2	8	1229331	1229338	0 %	0 %	75 %	25 %	452204100
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22736	NC_020386	A	6	6	1236324	1236329	100 %	0 %	0 %	0 %	452204110
22737	NC_020386	TAA	2	6	1236336	1236341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204110
22738	NC_020386	GCA	2	6	1236366	1236371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204111
22739	NC_020386	GAAT	2	8	1236424	1236431	50 %	25 %	25 %	0 %	452204111
22740	NC_020386	CCAG	2	8	1236456	1236463	25 %	0 %	25 %	50 %	452204111
22741	NC_020386	CAC	2	6	1236478	1236483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452204111
22742	NC_020386	TGT	2	6	1236516	1236521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452204111
22743	NC_020386	GGT	2	6	1236523	1236528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204111
22744	NC_020386	TCA	2	6	1236536	1236541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204111
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22746	NC_020386	T	7	7	1236635	1236641	0 %	100 %	0 %	0 %	452204111
22747	NC_020386	AT	3	6	1236789	1236794	50 %	50 %	0 %	0 %	452204111
22748	NC_020386	CTG	2	6	1236823	1236828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204111
22749	NC_020386	GGT	2	6	1236865	1236870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204111
22750	NC_020386	CAG	2	6	1236928	1236933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204111
22751	NC_020386	CTA	2	6	1237125	1237130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204111
22752	NC_020386	TTC	2	6	1237132	1237137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204111
22753	NC_020386	TTC	2	6	1237147	1237152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204111
22754	NC_020386	AC	3	6	1237214	1237219	50 %	0 %	0 %	50 %	452204111
22755	NC_020386	ATTC	2	8	1237266	1237273	25 %	50 %	0 %	25 %	452204111
22756	NC_020386	TTC	2	6	1237303	1237308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204111
22757	NC_020386	GCC	2	6	1237310	1237315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204111
22758	NC_020386	TCAT	2	8	1237432	1237439	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22759	NC_020386	AACA	2	8	1237461	1237468	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22760	NC_020386	AGG	2	6	1237688	1237693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452204112
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22762	NC_020386	TGA	2	6	1237835	1237840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204112
22763	NC_020386	CCG	2	6	1237855	1237860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204112
22764	NC_020386	GGAA	2	8	1237950	1237957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22765	NC_020386	CAT	2	6	1237978	1237983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22766	NC_020386	AGG	2	6	1238073	1238078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22767	NC_020386	CAA	2	6	1238129	1238134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452204113
22768	NC_020386	TCA	2	6	1238143	1238148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204113
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22770	NC_020386	A	7	7	1238289	1238295	100 %	0 %	0 %	0 %	452204113
22771	NC_020386	GAAA	2	8	1238378	1238385	75 %	0 %	25 %	0 %	452204113
22772	NC_020386	CGG	2	6	1238392	1238397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204113
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22797	NC_020386	TGTT	2	8	1240109	1240116	0 %	75 %	25 %	0 %	452204115
22798	NC_020386	CCG	2	6	1240134	1240139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204115
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22800	NC_020386	TCAA	2	8	1240211	1240218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22801	NC_020386	CTG	2	6	1240300	1240305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204116
22802	NC_020386	CATC	2	8	1240334	1240341	25 %	25 %	0 %	50 %	452204116
22803	NC_020386	AT	5	10	1240406	1240415	50 %	50 %	0 %	0 %	452204116
22804	NC_020386	CAA	2	6	1240437	1240442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452204116
22805	NC_020386	AATCT	2	10	1240469	1240478	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22806	NC_020386	CTG	2	6	1240528	1240533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204117
22807	NC_020386	CAG	2	6	1240549	1240554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204117
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22809	NC_020386	ATGCC	2	10	1240596	1240605	20 %	20 %	20 %	40 %	452204117
22810	NC_020386	TCA	2	6	1240647	1240652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204117
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22813	NC_020386	CTG	2	6	1240912	1240917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204117
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22829	NC_020386	CGC	2	6	1241699	1241704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204118
22830	NC_020386	ACC	2	6	1241763	1241768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22831	NC_020386	GGTTG	2	10	1241918	1241927	0 %	40 %	60 %	0 %	452204119
22832	NC_020386	GGAA	2	8	1241944	1241951	50 %	0 %	50 %	0 %	452204119
22833	NC_020386	GCC	2	6	1241955	1241960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204119
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22838	NC_020386	TAAC	2	8	1242386	1242393	50 %	25 %	0 %	25 %	452204119
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22840	NC_020386	T	6	6	1242533	1242538	0 %	100 %	0 %	0 %	452204120
22841	NC_020386	AT	3	6	1242546	1242551	50 %	50 %	0 %	0 %	452204120
22842	NC_020386	CTA	2	6	1242611	1242616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204120
22843	NC_020386	ATC	2	6	1242651	1242656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204120
22844	NC_020386	TTC	2	6	1242742	1242747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204120
22845	NC_020386	TA	3	6	1242806	1242811	50 %	50 %	0 %	0 %	452204121
22846	NC_020386	ATA	2	6	1242875	1242880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204121
22847	NC_020386	CGG	3	9	1242882	1242890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204121
22848	NC_020386	GAT	2	6	1242916	1242921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204121
22849	NC_020386	TCA	2	6	1242945	1242950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204121
22850	NC_020386	GCA	2	6	1242956	1242961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204121
22851	NC_020386	GGT	2	6	1243020	1243025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204121
22852	NC_020386	A	6	6	1243116	1243121	100 %	0 %	0 %	0 %	452204121
22853	NC_020386	GCTG	2	8	1243146	1243153	0 %	25 %	50 %	25 %	452204121
22854	NC_020386	T	6	6	1243180	1243185	0 %	100 %	0 %	0 %	452204121
22855	NC_020386	CTG	2	6	1243222	1243227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204121
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22857	NC_020386	CTT	2	6	1243284	1243289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204121
22858	NC_020386	TAA	2	6	1243290	1243295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204121
22859	NC_020386	TTC	2	6	1243345	1243350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204121
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22967	NC_020386	TA	3	6	1249310	1249315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22968	NC_020386	AAAT	2	8	1249383	1249390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22969	NC_020386	GTA	2	6	1249544	1249549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22970	NC_020386	TC	3	6	1249575	1249580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22971	NC_020386	GC	3	6	1249667	1249672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22972	NC_020386	TTTC	2	8	1249677	1249684	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22973	NC_020386	T	6	6	1249762	1249767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22974	NC_020386	AAC	2	6	1249828	1249833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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22977	NC_020386	GA	3	6	1249948	1249953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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