MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 72355

< Previous12...8485868788899091929394...144145Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_020055	TTA	2	6	2260595	2260600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436841868
44003	NC_020055	ACC	2	6	2260654	2260659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436841868
44004	NC_020055	AGG	2	6	2260727	2260732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436841868
44005	NC_020055	AAAT	2	8	2260745	2260752	75 %	25 %	0 %	0 %	436841868
44006	NC_020055	CAG	2	6	2260771	2260776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841868
44007	NC_020055	TGA	2	6	2260824	2260829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841868
44008	NC_020055	AGG	2	6	2260832	2260837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436841868
44009	NC_020055	TGC	2	6	2260904	2260909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841868
44010	NC_020055	TAC	2	6	2260935	2260940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841868
44011	NC_020055	AT	3	6	2260954	2260959	50 %	50 %	0 %	0 %	436841868
44012	NC_020055	AG	3	6	2261014	2261019	50 %	0 %	50 %	0 %	436841868
44013	NC_020055	T	6	6	2261028	2261033	0 %	100 %	0 %	0 %	436841868
44014	NC_020055	AGA	2	6	2261088	2261093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436841868
44015	NC_020055	TGC	2	6	2261100	2261105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841868
44016	NC_020055	TGA	2	6	2261331	2261336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841868
44017	NC_020055	TGC	2	6	2261342	2261347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841868
44018	NC_020055	TGA	2	6	2261385	2261390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841868
44019	NC_020055	TAT	2	6	2261407	2261412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436841868
44020	NC_020055	GAG	2	6	2261552	2261557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436841868
44021	NC_020055	CT	3	6	2261558	2261563	0 %	50 %	0 %	50 %	436841868
44022	NC_020055	ATA	2	6	2261570	2261575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436841868
44023	NC_020055	ATG	2	6	2261616	2261621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44024	NC_020055	TAA	2	6	2261660	2261665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436841869
44025	NC_020055	A	6	6	2261664	2261669	100 %	0 %	0 %	0 %	436841869
44026	NC_020055	GAA	2	6	2261682	2261687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436841869
44027	NC_020055	CGG	2	6	2261721	2261726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436841869
44028	NC_020055	GGAA	2	8	2261753	2261760	50 %	0 %	50 %	0 %	436841869
44029	NC_020055	A	7	7	2261759	2261765	100 %	0 %	0 %	0 %	436841869
44030	NC_020055	CTG	2	6	2261827	2261832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841869
44031	NC_020055	AT	3	6	2261850	2261855	50 %	50 %	0 %	0 %	436841869
44032	NC_020055	TTA	2	6	2261966	2261971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436841869
44033	NC_020055	T	6	6	2261994	2261999	0 %	100 %	0 %	0 %	436841869
44034	NC_020055	TGGA	2	8	2262008	2262015	25 %	25 %	50 %	0 %	436841869
44035	NC_020055	A	7	7	2262078	2262084	100 %	0 %	0 %	0 %	436841869
44036	NC_020055	AG	3	6	2262090	2262095	50 %	0 %	50 %	0 %	436841869
44037	NC_020055	TTCC	2	8	2262154	2262161	0 %	50 %	0 %	50 %	436841869
44038	NC_020055	CAG	2	6	2262301	2262306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841869
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44040	NC_020055	TGC	2	6	2262369	2262374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841869
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44042	NC_020055	TGG	2	6	2262485	2262490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436841869
44043	NC_020055	CAA	2	6	2262503	2262508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436841869
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44045	NC_020055	TTA	2	6	2262602	2262607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436841869
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44049	NC_020055	ATAA	2	8	2262757	2262764	75 %	25 %	0 %	0 %	436841869
44050	NC_020055	CTGAAG	2	12	2262797	2262808	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	436841869
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44052	NC_020055	TTA	2	6	2262875	2262880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436841869
44053	NC_020055	ATG	2	6	2262980	2262985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841869
44054	NC_020055	ACT	2	6	2263027	2263032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841869
44055	NC_020055	CAG	2	6	2263054	2263059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841869
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44057	NC_020055	TCT	2	6	2263128	2263133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436841869
44058	NC_020055	TGC	2	6	2263157	2263162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841869
44059	NC_020055	GCT	2	6	2263192	2263197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841869
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44061	NC_020055	GCA	2	6	2263473	2263478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841869
44062	NC_020055	A	6	6	2263543	2263548	100 %	0 %	0 %	0 %	436841869
44063	NC_020055	TTC	2	6	2263554	2263559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436841869
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44065	NC_020055	A	7	7	2263660	2263666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44066	NC_020055	ATTGC	2	10	2263673	2263682	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44067	NC_020055	T	7	7	2263692	2263698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44068	NC_020055	ATC	2	6	2263775	2263780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44069	NC_020055	TCC	2	6	2263801	2263806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44070	NC_020055	TG	3	6	2263831	2263836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44071	NC_020055	TCAA	2	8	2263864	2263871	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44072	NC_020055	ATTTT	2	10	2264019	2264028	20 %	80 %	0 %	0 %	436841870
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44077	NC_020055	ATTTA	2	10	2264197	2264206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44078	NC_020055	GCA	2	6	2264265	2264270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841871
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44089	NC_020055	GCA	2	6	2264649	2264654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841871
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44091	NC_020055	CGG	2	6	2264774	2264779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436841871
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44100	NC_020055	TACT	2	8	2265376	2265383	25 %	50 %	0 %	25 %	436841871
44101	NC_020055	GAA	2	6	2265449	2265454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436841871
44102	NC_020055	AGT	2	6	2265584	2265589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841871
44103	NC_020055	G	6	6	2265623	2265628	0 %	0 %	100 %	0 %	436841871
44104	NC_020055	TCA	2	6	2265640	2265645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841871
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44109	NC_020055	TGT	2	6	2265887	2265892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436841871
44110	NC_020055	G	7	7	2265951	2265957	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44111	NC_020055	C	6	6	2265972	2265977	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44112	NC_020055	TTTTC	2	10	2265992	2266001	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44113	NC_020055	T	6	6	2266225	2266230	0 %	100 %	0 %	0 %	436841872
44114	NC_020055	TTC	2	6	2266272	2266277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436841872
44115	NC_020055	CT	3	6	2266303	2266308	0 %	50 %	0 %	50 %	436841872
44116	NC_020055	ATT	2	6	2266321	2266326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436841872
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44118	NC_020055	TAA	2	6	2266353	2266358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436841872
44119	NC_020055	ATA	2	6	2266466	2266471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436841872
44120	NC_020055	ATC	2	6	2266513	2266518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841872
44121	NC_020055	AGA	2	6	2266530	2266535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436841872
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44123	NC_020055	TTA	2	6	2266644	2266649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44129	NC_020055	TAT	2	6	2266792	2266797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44130	NC_020055	A	8	8	2266799	2266806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44132	NC_020055	GGA	2	6	2266871	2266876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44133	NC_020055	CTT	2	6	2266886	2266891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436841874
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44154	NC_020055	A	7	7	2268158	2268164	100 %	0 %	0 %	0 %	436841874
44155	NC_020055	CCT	2	6	2268181	2268186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436841874
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44158	NC_020055	TCT	2	6	2268253	2268258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436841874
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44200	NC_020055	AT	3	6	2270464	2270469	50 %	50 %	0 %	0 %	436841876
44201	NC_020055	AGC	2	6	2270473	2270478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841876
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44205	NC_020055	AAGA	2	8	2270685	2270692	75 %	0 %	25 %	0 %	436841877
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44213	NC_020055	T	7	7	2271120	2271126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44214	NC_020055	AGC	2	6	2271149	2271154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841878
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44222	NC_020055	CAA	2	6	2271583	2271588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436841879
44223	NC_020055	GCTG	2	8	2271609	2271616	0 %	25 %	50 %	25 %	436841879
44224	NC_020055	ACCGG	2	10	2271658	2271667	20 %	0 %	40 %	40 %	436841879
44225	NC_020055	CGA	2	6	2271738	2271743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841879
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44227	NC_020055	CAAGC	2	10	2271837	2271846	40 %	0 %	20 %	40 %	436841879
44228	NC_020055	ACT	2	6	2271925	2271930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841879
44229	NC_020055	GCGG	2	8	2271981	2271988	0 %	0 %	75 %	25 %	436841879
44230	NC_020055	GCA	2	6	2272084	2272089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841879
44231	NC_020055	G	6	6	2272152	2272157	0 %	0 %	100 %	0 %	436841879
44232	NC_020055	GC	3	6	2272177	2272182	0 %	0 %	50 %	50 %	436841879
44233	NC_020055	T	6	6	2272297	2272302	0 %	100 %	0 %	0 %	436841879
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44235	NC_020055	GTCC	2	8	2272501	2272508	0 %	25 %	25 %	50 %	436841879
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44464	NC_020055	TGC	2	6	2285934	2285939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841887
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44468	NC_020055	ATT	2	6	2286311	2286316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436841888
44469	NC_020055	TGAA	2	8	2286350	2286357	50 %	25 %	25 %	0 %	436841888
44470	NC_020055	TCA	2	6	2286401	2286406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841888
44471	NC_020055	GCC	2	6	2286475	2286480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436841888
44472	NC_020055	GAA	2	6	2286540	2286545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436841888
44473	NC_020055	GCG	2	6	2286597	2286602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436841888
44474	NC_020055	GAG	2	6	2286647	2286652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436841888
44475	NC_020055	GGC	2	6	2286672	2286677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436841888
44476	NC_020055	GCT	2	6	2286683	2286688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841888
44477	NC_020055	TGA	2	6	2286742	2286747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841888
44478	NC_020055	CAGG	2	8	2286780	2286787	25 %	0 %	50 %	25 %	436841888
44479	NC_020055	GGGC	2	8	2286794	2286801	0 %	0 %	75 %	25 %	436841888
44480	NC_020055	TCC	2	6	2286808	2286813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436841888
44481	NC_020055	ATCC	2	8	2286827	2286834	25 %	25 %	0 %	50 %	436841888
44482	NC_020055	AGCA	2	8	2286973	2286980	50 %	0 %	25 %	25 %	436841888
44483	NC_020055	GT	3	6	2287071	2287076	0 %	50 %	50 %	0 %	436841888
44484	NC_020055	TGC	2	6	2287207	2287212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841888
44485	NC_020055	CTGC	2	8	2287319	2287326	0 %	25 %	25 %	50 %	436841888
44486	NC_020055	CTA	2	6	2287341	2287346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841888
44487	NC_020055	TTGGAT	2	12	2287370	2287381	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	436841888
44488	NC_020055	GCC	2	6	2287465	2287470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436841888
44489	NC_020055	T	7	7	2287471	2287477	0 %	100 %	0 %	0 %	436841888
44490	NC_020055	GGC	2	6	2287489	2287494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436841888
44491	NC_020055	TAA	2	6	2287506	2287511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436841888
44492	NC_020055	TGG	2	6	2287675	2287680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436841888
44493	NC_020055	G	6	6	2287733	2287738	0 %	0 %	100 %	0 %	436841888
44494	NC_020055	TTAC	2	8	2287764	2287771	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44495	NC_020055	TAAT	2	8	2287780	2287787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44496	NC_020055	ATTT	2	8	2287871	2287878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44497	NC_020055	GTAAT	2	10	2287928	2287937	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44498	NC_020055	TATT	2	8	2287991	2287998	25 %	75 %	0 %	0 %	436841889
44499	NC_020055	CTA	2	6	2288036	2288041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841889
44500	NC_020055	TCCAG	2	10	2288059	2288068	20 %	20 %	20 %	40 %	436841889

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