MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 72355

< Previous12...8283848586878889909192...144145Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_020055	ATC	2	6	2208679	2208684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841831
43002	NC_020055	AAAGTT	2	12	2208697	2208708	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	436841831
43003	NC_020055	TTA	2	6	2208773	2208778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436841831
43004	NC_020055	TCT	2	6	2208811	2208816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436841831
43005	NC_020055	CTT	2	6	2208838	2208843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436841831
43006	NC_020055	TGC	2	6	2209112	2209117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841832
43007	NC_020055	GCG	2	6	2209118	2209123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436841832
43008	NC_020055	TGC	2	6	2209158	2209163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841832
43009	NC_020055	TATTCC	2	12	2209222	2209233	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	436841832
43010	NC_020055	TACA	2	8	2209312	2209319	50 %	25 %	0 %	25 %	436841832
43011	NC_020055	TGA	2	6	2209362	2209367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841832
43012	NC_020055	A	6	6	2209367	2209372	100 %	0 %	0 %	0 %	436841832
43013	NC_020055	GGA	2	6	2209438	2209443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436841832
43014	NC_020055	T	6	6	2209450	2209455	0 %	100 %	0 %	0 %	436841832
43015	NC_020055	ACTT	2	8	2209458	2209465	25 %	50 %	0 %	25 %	436841832
43016	NC_020055	ATT	2	6	2209477	2209482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436841832
43017	NC_020055	GGT	2	6	2209485	2209490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436841832
43018	NC_020055	TTG	2	6	2209502	2209507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436841832
43019	NC_020055	CTGG	2	8	2209515	2209522	0 %	25 %	50 %	25 %	436841832
43020	NC_020055	GAT	2	6	2209623	2209628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841832
43021	NC_020055	ACTT	2	8	2209747	2209754	25 %	50 %	0 %	25 %	436841832
43022	NC_020055	GCTT	2	8	2209770	2209777	0 %	50 %	25 %	25 %	436841832
43023	NC_020055	ATA	2	6	2209874	2209879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436841832
43024	NC_020055	T	7	7	2209895	2209901	0 %	100 %	0 %	0 %	436841832
43025	NC_020055	AAT	2	6	2209992	2209997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436841832
43026	NC_020055	AAAG	2	8	2210001	2210008	75 %	0 %	25 %	0 %	436841832
43027	NC_020055	TTG	2	6	2210183	2210188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436841832
43028	NC_020055	AGG	2	6	2210252	2210257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436841832
43029	NC_020055	CGTTA	2	10	2210265	2210274	20 %	40 %	20 %	20 %	436841832
43030	NC_020055	CTA	2	6	2210382	2210387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841832
43031	NC_020055	TAT	2	6	2210467	2210472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436841833
43032	NC_020055	TCT	2	6	2210536	2210541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436841833
43033	NC_020055	CTT	2	6	2210575	2210580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436841833
43034	NC_020055	ATA	2	6	2210595	2210600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436841833
43035	NC_020055	ATC	2	6	2210616	2210621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841833
43036	NC_020055	GA	3	6	2210669	2210674	50 %	0 %	50 %	0 %	436841833
43037	NC_020055	GGC	2	6	2210716	2210721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436841833
43038	NC_020055	GAT	2	6	2210794	2210799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841833
43039	NC_020055	GCA	2	6	2210849	2210854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841833
43040	NC_020055	GAG	2	6	2210864	2210869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436841833
43041	NC_020055	GAA	2	6	2210888	2210893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436841833
43042	NC_020055	CTCAG	2	10	2210910	2210919	20 %	20 %	20 %	40 %	436841833
43043	NC_020055	TTGA	2	8	2210954	2210961	25 %	50 %	25 %	0 %	436841833
43044	NC_020055	T	7	7	2210989	2210995	0 %	100 %	0 %	0 %	436841833
43045	NC_020055	AT	3	6	2210997	2211002	50 %	50 %	0 %	0 %	436841833
43046	NC_020055	CCAG	2	8	2211024	2211031	25 %	0 %	25 %	50 %	436841833
43047	NC_020055	GCG	2	6	2211036	2211041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436841833
43048	NC_020055	TTGGC	2	10	2211063	2211072	0 %	40 %	40 %	20 %	436841833
43049	NC_020055	CGGTGA	2	12	2211094	2211105	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	436841833
43050	NC_020055	T	6	6	2211118	2211123	0 %	100 %	0 %	0 %	436841833
43051	NC_020055	TGC	2	6	2211157	2211162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841833
43052	NC_020055	ACAA	2	8	2211171	2211178	75 %	0 %	0 %	25 %	436841833
43053	NC_020055	ACC	2	6	2211224	2211229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436841833
43054	NC_020055	AAT	2	6	2211283	2211288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436841833
43055	NC_020055	A	6	6	2211393	2211398	100 %	0 %	0 %	0 %	436841833
43056	NC_020055	CTGC	2	8	2211436	2211443	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43057	NC_020055	GTAA	2	8	2211465	2211472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43058	NC_020055	AT	3	6	2211481	2211486	50 %	50 %	0 %	0 %	436841834
43059	NC_020055	CAA	2	6	2211504	2211509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436841834
43060	NC_020055	A	6	6	2211599	2211604	100 %	0 %	0 %	0 %	436841834
43061	NC_020055	TGGCA	2	10	2211689	2211698	20 %	20 %	40 %	20 %	436841834
43062	NC_020055	T	6	6	2211721	2211726	0 %	100 %	0 %	0 %	436841834
43063	NC_020055	TAAT	2	8	2211783	2211790	50 %	50 %	0 %	0 %	436841834
43064	NC_020055	TTG	2	6	2211846	2211851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436841834
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43066	NC_020055	TTGC	2	8	2212044	2212051	0 %	50 %	25 %	25 %	436841834
43067	NC_020055	T	6	6	2212106	2212111	0 %	100 %	0 %	0 %	436841834
43068	NC_020055	TGG	2	6	2212114	2212119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436841834
43069	NC_020055	AGCTT	2	10	2212166	2212175	20 %	40 %	20 %	20 %	436841834
43070	NC_020055	CAAA	2	8	2212195	2212202	75 %	0 %	0 %	25 %	436841834
43071	NC_020055	ATT	3	9	2212268	2212276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436841834
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43077	NC_020055	TGAT	2	8	2212512	2212519	25 %	50 %	25 %	0 %	436841834
43078	NC_020055	TAT	2	6	2212567	2212572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43079	NC_020055	GA	3	6	2212583	2212588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43080	NC_020055	T	8	8	2212589	2212596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43081	NC_020055	TTA	2	6	2212607	2212612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43082	NC_020055	TTG	2	6	2212615	2212620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43085	NC_020055	AAC	2	6	2212738	2212743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436841835
43086	NC_020055	TCA	2	6	2212779	2212784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841835
43087	NC_020055	GGC	2	6	2212794	2212799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436841835
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43089	NC_020055	AAG	2	6	2212827	2212832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436841835
43090	NC_020055	T	6	6	2212896	2212901	0 %	100 %	0 %	0 %	436841835
43091	NC_020055	A	6	6	2213000	2213005	100 %	0 %	0 %	0 %	436841835
43092	NC_020055	ATA	2	6	2213055	2213060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436841835
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43101	NC_020055	GCAG	2	8	2213845	2213852	25 %	0 %	50 %	25 %	436841835
43102	NC_020055	TGC	2	6	2213920	2213925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841835
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43105	NC_020055	CCA	2	6	2214015	2214020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436841835
43106	NC_020055	AAG	2	6	2214021	2214026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436841835
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43109	NC_020055	GGA	2	6	2214094	2214099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436841835
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43115	NC_020055	A	8	8	2214412	2214419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43116	NC_020055	A	6	6	2214459	2214464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43117	NC_020055	T	7	7	2214476	2214482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43119	NC_020055	ACC	2	6	2214541	2214546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436841836
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43121	NC_020055	GTT	2	6	2214574	2214579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436841836
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43123	NC_020055	TCA	2	6	2214665	2214670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841836
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43152	NC_020055	AAT	2	6	2216589	2216594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43235	NC_020055	TTCT	2	8	2220079	2220086	0 %	75 %	0 %	25 %	436841841
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43237	NC_020055	CTT	2	6	2220180	2220185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436841841
43238	NC_020055	TCT	2	6	2220242	2220247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436841841
43239	NC_020055	TTA	2	6	2220266	2220271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436841841
43240	NC_020055	GGT	2	6	2220274	2220279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436841841
43241	NC_020055	TTC	2	6	2220361	2220366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436841841
43242	NC_020055	AT	3	6	2220429	2220434	50 %	50 %	0 %	0 %	436841841
43243	NC_020055	CCG	2	6	2220501	2220506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43244	NC_020055	G	6	6	2220514	2220519	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43245	NC_020055	AGCC	2	8	2220533	2220540	25 %	0 %	25 %	50 %	436841842
43246	NC_020055	ACT	2	6	2220570	2220575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841842
43247	NC_020055	AACCAG	2	12	2220578	2220589	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	436841842
43248	NC_020055	T	7	7	2220606	2220612	0 %	100 %	0 %	0 %	436841842
43249	NC_020055	GC	3	6	2220633	2220638	0 %	0 %	50 %	50 %	436841842
43250	NC_020055	CTTA	2	8	2220717	2220724	25 %	50 %	0 %	25 %	436841843
43251	NC_020055	AAC	2	6	2220727	2220732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436841843
43252	NC_020055	GCC	2	6	2220793	2220798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436841843
43253	NC_020055	CCG	2	6	2220815	2220820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436841843
43254	NC_020055	T	6	6	2220922	2220927	0 %	100 %	0 %	0 %	436841843
43255	NC_020055	ATG	2	6	2220977	2220982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841843
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43257	NC_020055	GATT	2	8	2221009	2221016	25 %	50 %	25 %	0 %	436841843
43258	NC_020055	AGC	2	6	2221120	2221125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841843
43259	NC_020055	TTC	2	6	2221129	2221134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436841843
43260	NC_020055	GCTG	2	8	2221209	2221216	0 %	25 %	50 %	25 %	436841843
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43262	NC_020055	AAC	2	6	2221330	2221335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436841843
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43264	NC_020055	CGC	2	6	2221683	2221688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436841843
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43266	NC_020055	AAT	2	6	2221739	2221744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436841843
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43268	NC_020055	AAACG	2	10	2221875	2221884	60 %	0 %	20 %	20 %	436841843
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43270	NC_020055	AAC	2	6	2221963	2221968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436841843
43271	NC_020055	ATG	2	6	2222081	2222086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841843
43272	NC_020055	TGT	2	6	2222139	2222144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436841843
43273	NC_020055	CTG	2	6	2222166	2222171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841843
43274	NC_020055	CCG	3	9	2222186	2222194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436841843
43275	NC_020055	CAG	2	6	2222293	2222298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841843
43276	NC_020055	TGA	2	6	2222307	2222312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841843
43277	NC_020055	TCC	2	6	2222364	2222369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43278	NC_020055	TG	4	8	2222409	2222416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43279	NC_020055	GTT	2	6	2222421	2222426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43280	NC_020055	TG	3	6	2222521	2222526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43281	NC_020055	ATG	2	6	2222561	2222566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43282	NC_020055	T	6	6	2222709	2222714	0 %	100 %	0 %	0 %	436841844
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43284	NC_020055	CG	3	6	2222841	2222846	0 %	0 %	50 %	50 %	436841844
43285	NC_020055	TAT	2	6	2222867	2222872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436841844
43286	NC_020055	TCC	2	6	2222886	2222891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436841844
43287	NC_020055	GAT	2	6	2222928	2222933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841844
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43289	NC_020055	AATG	2	8	2222987	2222994	50 %	25 %	25 %	0 %	436841844
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43296	NC_020055	GTAA	2	8	2223138	2223145	50 %	25 %	25 %	0 %	436841844
43297	NC_020055	CTG	2	6	2223162	2223167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841844
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43303	NC_020055	AAG	2	6	2223590	2223595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436841844
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43305	NC_020055	TATG	2	8	2223721	2223728	25 %	50 %	25 %	0 %	436841844
43306	NC_020055	A	7	7	2223829	2223835	100 %	0 %	0 %	0 %	436841844
43307	NC_020055	TCTG	2	8	2223886	2223893	0 %	50 %	25 %	25 %	436841844
43308	NC_020055	CAG	2	6	2223917	2223922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841844
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43310	NC_020055	GCA	2	6	2223953	2223958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841844
43311	NC_020055	CTG	2	6	2223999	2224004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841844
43312	NC_020055	TTG	2	6	2224030	2224035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436841844
43313	NC_020055	ATC	2	6	2224080	2224085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841844
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43315	NC_020055	TCAG	2	8	2224263	2224270	25 %	25 %	25 %	25 %	436841844
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43321	NC_020055	TTA	2	6	2224441	2224446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436841844
43322	NC_020055	GGAC	2	8	2224469	2224476	25 %	0 %	50 %	25 %	436841844
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43324	NC_020055	CTTC	2	8	2224692	2224699	0 %	50 %	0 %	50 %	436841844
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43327	NC_020055	ACT	2	6	2224899	2224904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841844
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43332	NC_020055	AGGG	2	8	2225032	2225039	25 %	0 %	75 %	0 %	436841844
43333	NC_020055	T	7	7	2225123	2225129	0 %	100 %	0 %	0 %	436841845
43334	NC_020055	GAA	2	6	2225136	2225141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436841845
43335	NC_020055	A	6	6	2225187	2225192	100 %	0 %	0 %	0 %	436841845
43336	NC_020055	CTG	2	6	2225202	2225207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841845
43337	NC_020055	ATGG	2	8	2225232	2225239	25 %	25 %	50 %	0 %	436841845
43338	NC_020055	GCT	2	6	2225246	2225251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841845
43339	NC_020055	A	6	6	2225253	2225258	100 %	0 %	0 %	0 %	436841845
43340	NC_020055	TGG	2	6	2225392	2225397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436841845
43341	NC_020055	CAG	2	6	2225438	2225443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841845
43342	NC_020055	A	6	6	2225448	2225453	100 %	0 %	0 %	0 %	436841845
43343	NC_020055	GCGCGG	2	12	2225468	2225479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436841845
43344	NC_020055	CCGGAA	2	12	2225575	2225586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841845
43345	NC_020055	TCA	2	6	2225609	2225614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841845
43346	NC_020055	CAA	2	6	2225759	2225764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436841845
43347	NC_020055	CTG	2	6	2225772	2225777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841845
43348	NC_020055	TGA	2	6	2225780	2225785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841845
43349	NC_020055	GCT	2	6	2225819	2225824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841845
43350	NC_020055	TAA	2	6	2225867	2225872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436841845
43351	NC_020055	CAA	2	6	2225902	2225907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436841845
43352	NC_020055	TAT	2	6	2225958	2225963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436841845
43353	NC_020055	AGG	2	6	2226010	2226015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436841845
43354	NC_020055	T	6	6	2226038	2226043	0 %	100 %	0 %	0 %	436841845
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43472	NC_020055	GAC	2	6	2232393	2232398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841850
43473	NC_020055	ATG	2	6	2232418	2232423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841850
43474	NC_020055	TGC	2	6	2232434	2232439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841850
43475	NC_020055	AT	3	6	2232485	2232490	50 %	50 %	0 %	0 %	436841850
43476	NC_020055	CCG	2	6	2232503	2232508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436841850
43477	NC_020055	GTG	2	6	2232554	2232559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436841850
43478	NC_020055	TGGC	2	8	2232605	2232612	0 %	25 %	50 %	25 %	436841850
43479	NC_020055	A	6	6	2232620	2232625	100 %	0 %	0 %	0 %	436841850
43480	NC_020055	A	6	6	2232750	2232755	100 %	0 %	0 %	0 %	436841850
43481	NC_020055	GCT	2	6	2232801	2232806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841850
43482	NC_020055	G	7	7	2232863	2232869	0 %	0 %	100 %	0 %	436841850
43483	NC_020055	CAG	2	6	2232954	2232959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436841850
43484	NC_020055	CTG	2	6	2232970	2232975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841850
43485	NC_020055	GCT	2	6	2232987	2232992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841850
43486	NC_020055	AGT	2	6	2233013	2233018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841850
43487	NC_020055	CTG	2	6	2233045	2233050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841850
43488	NC_020055	ACATG	2	10	2233052	2233061	40 %	20 %	20 %	20 %	436841850
43489	NC_020055	CCGGAG	2	12	2233246	2233257	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	436841850
43490	NC_020055	CTG	2	6	2233317	2233322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841850
43491	NC_020055	ATG	2	6	2233338	2233343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841850
43492	NC_020055	AAG	2	6	2233405	2233410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436841850
43493	NC_020055	CG	3	6	2233453	2233458	0 %	0 %	50 %	50 %	436841850
43494	NC_020055	A	6	6	2233527	2233532	100 %	0 %	0 %	0 %	436841850
43495	NC_020055	TCA	2	6	2233543	2233548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841850
43496	NC_020055	TCA	2	6	2233597	2233602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436841850
43497	NC_020055	GCT	2	6	2233680	2233685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436841850
43498	NC_020055	AAGA	2	8	2233695	2233702	75 %	0 %	25 %	0 %	436841850
43499	NC_020055	TGTC	2	8	2233735	2233742	0 %	50 %	25 %	25 %	436841850
43500	NC_020055	TGA	2	6	2233748	2233753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436841850

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