MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 72355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_020055	CAAA	2	8	925043	925050	75 %	0 %	0 %	25 %	436840623
18002	NC_020055	TA	3	6	925066	925071	50 %	50 %	0 %	0 %	436840623
18003	NC_020055	GAA	2	6	925111	925116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18004	NC_020055	TTA	2	6	925136	925141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18005	NC_020055	TTG	2	6	925148	925153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_020055	CAC	2	6	925258	925263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840624
18007	NC_020055	CTTT	2	8	925355	925362	0 %	75 %	0 %	25 %	436840624
18008	NC_020055	ATT	2	6	925371	925376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436840624
18009	NC_020055	AAG	2	6	925446	925451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840624
18010	NC_020055	CTG	2	6	925581	925586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840624
18011	NC_020055	TA	3	6	925591	925596	50 %	50 %	0 %	0 %	436840624
18012	NC_020055	TCC	2	6	925600	925605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436840624
18013	NC_020055	T	6	6	925752	925757	0 %	100 %	0 %	0 %	436840624
18014	NC_020055	TCCT	2	8	925764	925771	0 %	50 %	0 %	50 %	436840624
18015	NC_020055	GCA	2	6	925784	925789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840624
18016	NC_020055	GGGT	2	8	925840	925847	0 %	25 %	75 %	0 %	436840624
18017	NC_020055	A	6	6	925963	925968	100 %	0 %	0 %	0 %	436840624
18018	NC_020055	T	7	7	926001	926007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_020055	CTT	2	6	926023	926028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18020	NC_020055	A	7	7	926064	926070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18021	NC_020055	TGC	2	6	926075	926080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18022	NC_020055	AAC	2	6	926103	926108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18023	NC_020055	CCGG	2	8	926185	926192	0 %	0 %	50 %	50 %	436840625
18024	NC_020055	T	6	6	926193	926198	0 %	100 %	0 %	0 %	436840625
18025	NC_020055	CATC	2	8	926219	926226	25 %	25 %	0 %	50 %	436840625
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18029	NC_020055	CTG	2	6	926399	926404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840625
18030	NC_020055	CAA	2	6	926405	926410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840625
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18032	NC_020055	ATTA	2	8	926454	926461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18033	NC_020055	TGA	2	6	926471	926476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840626
18034	NC_020055	CTT	2	6	926490	926495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840626
18035	NC_020055	TCA	2	6	926565	926570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840626
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18037	NC_020055	ATC	2	6	926663	926668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840626
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18039	NC_020055	GGA	2	6	926720	926725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436840626
18040	NC_020055	A	6	6	926734	926739	100 %	0 %	0 %	0 %	436840626
18041	NC_020055	GCT	2	6	926802	926807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840626
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18043	NC_020055	CTG	2	6	926833	926838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840626
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18045	NC_020055	TCT	2	6	926982	926987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840626
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18047	NC_020055	CG	3	6	927072	927077	0 %	0 %	50 %	50 %	436840626
18048	NC_020055	GCA	2	6	927134	927139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840626
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18050	NC_020055	ATC	2	6	927178	927183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840626
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18052	NC_020055	ATA	2	6	927292	927297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436840626
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18055	NC_020055	TGATAG	2	12	927534	927545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840626
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18057	NC_020055	AAAT	2	8	927584	927591	75 %	25 %	0 %	0 %	436840626
18058	NC_020055	CAG	2	6	927598	927603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840626
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18073	NC_020055	CATC	2	8	928605	928612	25 %	25 %	0 %	50 %	436840626
18074	NC_020055	GCAG	2	8	928680	928687	25 %	0 %	50 %	25 %	436840626
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18088	NC_020055	A	7	7	929300	929306	100 %	0 %	0 %	0 %	436840627
18089	NC_020055	TTG	2	6	929313	929318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840627
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18091	NC_020055	TGAAAT	2	12	929356	929367	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18092	NC_020055	TACG	2	8	929424	929431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18093	NC_020055	TTA	2	6	929433	929438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18094	NC_020055	A	7	7	929507	929513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18095	NC_020055	CTA	2	6	929657	929662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18096	NC_020055	CGG	2	6	929676	929681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18103	NC_020055	CTGG	2	8	930138	930145	0 %	25 %	50 %	25 %	436840628
18104	NC_020055	CT	3	6	930183	930188	0 %	50 %	0 %	50 %	436840628
18105	NC_020055	AAAG	2	8	930208	930215	75 %	0 %	25 %	0 %	436840628
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18110	NC_020055	TTC	2	6	930429	930434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840628
18111	NC_020055	GGA	2	6	930469	930474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436840628
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18115	NC_020055	A	6	6	930678	930683	100 %	0 %	0 %	0 %	436840628
18116	NC_020055	TAA	2	6	930701	930706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436840628
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18119	NC_020055	TCC	2	6	931003	931008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18120	NC_020055	ATC	2	6	931131	931136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840630
18121	NC_020055	ACGC	2	8	931229	931236	25 %	0 %	25 %	50 %	436840630
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18123	NC_020055	TGTT	2	8	931257	931264	0 %	75 %	25 %	0 %	436840630
18124	NC_020055	AT	3	6	931395	931400	50 %	50 %	0 %	0 %	436840630
18125	NC_020055	TTC	2	6	931403	931408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840630
18126	NC_020055	ATGA	2	8	931411	931418	50 %	25 %	25 %	0 %	436840630
18127	NC_020055	ACC	2	6	931449	931454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840630
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18129	NC_020055	TTTTA	2	10	931535	931544	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18130	NC_020055	ATGA	2	8	931554	931561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18131	NC_020055	AATTGA	2	12	931562	931573	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18132	NC_020055	TAT	2	6	931578	931583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18133	NC_020055	A	6	6	931803	931808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18148	NC_020055	A	6	6	932529	932534	100 %	0 %	0 %	0 %	436840632
18149	NC_020055	A	6	6	932541	932546	100 %	0 %	0 %	0 %	436840632
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18232	NC_020055	A	7	7	936254	936260	100 %	0 %	0 %	0 %	436840636
18233	NC_020055	TAAGAC	2	12	936298	936309	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	436840636
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18477	NC_020055	CCGC	2	8	949776	949783	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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18479	NC_020055	T	6	6	949788	949793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18480	NC_020055	CTG	2	6	949868	949873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18484	NC_020055	CAT	2	6	950085	950090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840646
18485	NC_020055	ACA	3	9	950147	950155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840646
18486	NC_020055	GC	3	6	950184	950189	0 %	0 %	50 %	50 %	436840646
18487	NC_020055	CGATG	2	10	950208	950217	20 %	20 %	40 %	20 %	436840646
18488	NC_020055	CAT	2	6	950235	950240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840646
18489	NC_020055	GCCCT	2	10	950243	950252	0 %	20 %	20 %	60 %	436840646
18490	NC_020055	AAT	2	6	950325	950330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436840646
18491	NC_020055	GGCC	2	8	950374	950381	0 %	0 %	50 %	50 %	436840646
18492	NC_020055	GCC	2	6	950404	950409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436840646
18493	NC_020055	TGATCA	2	12	950517	950528	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	436840646
18494	NC_020055	CCA	2	6	950545	950550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840646
18495	NC_020055	CCTGA	2	10	950701	950710	20 %	20 %	20 %	40 %	436840646
18496	NC_020055	A	6	6	950724	950729	100 %	0 %	0 %	0 %	436840646
18497	NC_020055	ATA	2	6	950750	950755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436840646
18498	NC_020055	CATA	2	8	950796	950803	50 %	25 %	0 %	25 %	436840646
18499	NC_020055	GTT	2	6	950810	950815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840646
18500	NC_020055	CCA	2	6	950937	950942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840646

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