MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 72355

< Previous12...2829303132333435363738...144145Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_020055	AGG	2	6	819813	819818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436840523
16002	NC_020055	A	6	6	819823	819828	100 %	0 %	0 %	0 %	436840523
16003	NC_020055	CTG	2	6	819847	819852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840523
16004	NC_020055	TA	3	6	819862	819867	50 %	50 %	0 %	0 %	436840523
16005	NC_020055	CAA	2	6	819954	819959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840523
16006	NC_020055	TTC	2	6	819965	819970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840523
16007	NC_020055	GACC	2	8	820059	820066	25 %	0 %	25 %	50 %	436840523
16008	NC_020055	CGC	2	6	820146	820151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436840523
16009	NC_020055	ATG	2	6	820189	820194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840523
16010	NC_020055	T	6	6	820227	820232	0 %	100 %	0 %	0 %	436840523
16011	NC_020055	CT	3	6	820433	820438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16012	NC_020055	TAA	2	6	820514	820519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_020055	T	6	6	820536	820541	0 %	100 %	0 %	0 %	436840524
16014	NC_020055	ATTA	2	8	820572	820579	50 %	50 %	0 %	0 %	436840524
16015	NC_020055	ATA	2	6	820592	820597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436840524
16016	NC_020055	TCAG	2	8	820744	820751	25 %	25 %	25 %	25 %	436840525
16017	NC_020055	CCA	2	6	820832	820837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840525
16018	NC_020055	GGC	2	6	820849	820854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436840525
16019	NC_020055	A	8	8	820905	820912	100 %	0 %	0 %	0 %	436840525
16020	NC_020055	TCA	2	6	821014	821019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840526
16021	NC_020055	GGA	2	6	821131	821136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436840527
16022	NC_020055	GAAT	2	8	821222	821229	50 %	25 %	25 %	0 %	436840527
16023	NC_020055	TCC	2	6	821418	821423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436840527
16024	NC_020055	AGA	2	6	821503	821508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840527
16025	NC_020055	GA	3	6	821507	821512	50 %	0 %	50 %	0 %	436840527
16026	NC_020055	AAAAG	2	10	821526	821535	80 %	0 %	20 %	0 %	436840527
16027	NC_020055	CACTC	2	10	821924	821933	20 %	20 %	0 %	60 %	436840528
16028	NC_020055	GCA	2	6	821936	821941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840528
16029	NC_020055	A	6	6	821952	821957	100 %	0 %	0 %	0 %	436840528
16030	NC_020055	CAA	2	6	821976	821981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840528
16031	NC_020055	CAT	2	6	822006	822011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840528
16032	NC_020055	A	8	8	822023	822030	100 %	0 %	0 %	0 %	436840528
16033	NC_020055	CAAG	2	8	822072	822079	50 %	0 %	25 %	25 %	436840528
16034	NC_020055	CCA	2	6	822132	822137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840528
16035	NC_020055	ACGTT	2	10	822138	822147	20 %	40 %	20 %	20 %	436840528
16036	NC_020055	TCA	2	6	822185	822190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840528
16037	NC_020055	GAC	2	6	822207	822212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840528
16038	NC_020055	GAA	2	6	822342	822347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840528
16039	NC_020055	GCGG	2	8	822373	822380	0 %	0 %	75 %	25 %	436840528
16040	NC_020055	GCA	2	6	822420	822425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840528
16041	NC_020055	TAT	2	6	822444	822449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436840528
16042	NC_020055	GAT	2	6	822547	822552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840528
16043	NC_020055	TATAT	2	10	822580	822589	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_020055	GTT	2	6	822593	822598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_020055	T	9	9	822597	822605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_020055	AATT	2	8	822657	822664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_020055	AT	3	6	822677	822682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_020055	TAC	2	6	822716	822721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16049	NC_020055	TTA	2	6	822746	822751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_020055	T	8	8	822872	822879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_020055	TAT	2	6	822932	822937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_020055	A	6	6	822975	822980	100 %	0 %	0 %	0 %	436840529
16053	NC_020055	AGA	2	6	822994	822999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840529
16054	NC_020055	TTC	2	6	823030	823035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840529
16055	NC_020055	GAA	2	6	823150	823155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840529
16056	NC_020055	GTTTT	2	10	823236	823245	0 %	80 %	20 %	0 %	436840529
16057	NC_020055	GGA	2	6	823279	823284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436840529
16058	NC_020055	A	6	6	823289	823294	100 %	0 %	0 %	0 %	436840529
16059	NC_020055	TGA	2	6	823306	823311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840529
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16061	NC_020055	CGG	2	6	823439	823444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436840529
16062	NC_020055	CAA	2	6	823447	823452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840529
16063	NC_020055	ACTC	2	8	823554	823561	25 %	25 %	0 %	50 %	436840530
16064	NC_020055	GCA	2	6	823607	823612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840530
16065	NC_020055	CA	3	6	823611	823616	50 %	0 %	0 %	50 %	436840530
16066	NC_020055	CAG	2	6	823742	823747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840530
16067	NC_020055	TCA	2	6	823761	823766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840530
16068	NC_020055	CTG	2	6	823831	823836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840530
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16070	NC_020055	TTC	2	6	823976	823981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840530
16071	NC_020055	CTG	2	6	824093	824098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840530
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16073	NC_020055	ACT	2	6	824148	824153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840530
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16078	NC_020055	CTG	2	6	824327	824332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840530
16079	NC_020055	CTTTC	2	10	824338	824347	0 %	60 %	0 %	40 %	436840530
16080	NC_020055	ATGC	2	8	824357	824364	25 %	25 %	25 %	25 %	436840530
16081	NC_020055	TGA	2	6	824581	824586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_020055	TGA	2	6	824616	824621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840531
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16084	NC_020055	TGGA	3	12	824658	824669	25 %	25 %	50 %	0 %	436840531
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16087	NC_020055	GCG	2	6	824882	824887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436840531
16088	NC_020055	GC	3	6	824949	824954	0 %	0 %	50 %	50 %	436840531
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16093	NC_020055	ATG	2	6	825499	825504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840531
16094	NC_020055	CGG	2	6	825564	825569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436840531
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16101	NC_020055	GGC	2	6	825919	825924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436840531
16102	NC_020055	ACT	2	6	826076	826081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840531
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16108	NC_020055	GC	3	6	826359	826364	0 %	0 %	50 %	50 %	436840532
16109	NC_020055	CTT	2	6	826378	826383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840532
16110	NC_020055	GA	3	6	826392	826397	50 %	0 %	50 %	0 %	436840532
16111	NC_020055	TGC	2	6	826524	826529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840532
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16115	NC_020055	CT	3	6	826623	826628	0 %	50 %	0 %	50 %	436840533
16116	NC_020055	GCA	2	6	826629	826634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840533
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16120	NC_020055	TCA	2	6	826802	826807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840533
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16122	NC_020055	ACA	2	6	827011	827016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840533
16123	NC_020055	GCA	2	6	827064	827069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840533
16124	NC_020055	ACA	2	6	827128	827133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840533
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16128	NC_020055	TAC	2	6	827352	827357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840533
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16181	NC_020055	A	7	7	830344	830350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16182	NC_020055	A	6	6	830363	830368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16486	NC_020055	ACA	2	6	846849	846854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840554
16487	NC_020055	CCG	2	6	846948	846953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436840554
16488	NC_020055	ATC	2	6	846962	846967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840554
16489	NC_020055	TGT	2	6	847009	847014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840554
16490	NC_020055	GCG	2	6	847067	847072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436840554
16491	NC_020055	TCA	4	12	847107	847118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840554
16492	NC_020055	TG	3	6	847158	847163	0 %	50 %	50 %	0 %	436840554
16493	NC_020055	CTG	2	6	847270	847275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840554
16494	NC_020055	CGG	2	6	847321	847326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436840554
16495	NC_020055	CTG	2	6	847394	847399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840554
16496	NC_020055	TA	3	6	847426	847431	50 %	50 %	0 %	0 %	436840554
16497	NC_020055	AAC	2	6	847481	847486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840554
16498	NC_020055	TTGC	2	8	847530	847537	0 %	50 %	25 %	25 %	436840554
16499	NC_020055	CTT	3	9	847558	847566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840554
16500	NC_020055	ATC	2	6	847607	847612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840554

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