MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 72355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_020055	TCC	2	6	667613	667618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13002	NC_020055	TGC	2	6	667668	667673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_020055	CT	3	6	667700	667705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13004	NC_020055	AC	3	6	667783	667788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13005	NC_020055	TCGC	2	8	667808	667815	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13006	NC_020055	GATT	2	8	667834	667841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_020055	TCC	2	6	667847	667852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13008	NC_020055	TTCAC	2	10	667867	667876	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13009	NC_020055	TAA	2	6	668053	668058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_020055	TCTT	2	8	668063	668070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13011	NC_020055	GGA	2	6	668135	668140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_020055	ACA	2	6	668156	668161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_020055	TGG	2	6	668204	668209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_020055	GTG	2	6	668295	668300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436840372
13015	NC_020055	TAGA	2	8	668305	668312	50 %	25 %	25 %	0 %	436840372
13016	NC_020055	AGG	2	6	668451	668456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_020055	GTG	2	6	668577	668582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_020055	GT	3	6	668592	668597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_020055	CA	3	6	668660	668665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13020	NC_020055	CCA	2	6	668746	668751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13021	NC_020055	GTA	2	6	668754	668759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_020055	GT	3	6	668761	668766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_020055	ATG	2	6	668786	668791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_020055	CGT	2	6	668798	668803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_020055	TCC	2	6	668812	668817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13026	NC_020055	CCA	2	6	668848	668853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_020055	GAC	2	6	668926	668931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13028	NC_020055	GCA	2	6	668938	668943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_020055	CTC	2	6	668970	668975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13030	NC_020055	TTC	2	6	669016	669021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_020055	CATC	2	8	669168	669175	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13032	NC_020055	GCC	2	6	669258	669263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13033	NC_020055	TCC	2	6	669278	669283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13034	NC_020055	GCC	2	6	669404	669409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13035	NC_020055	CG	3	6	669412	669417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13036	NC_020055	GCT	2	6	669468	669473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_020055	AG	3	6	669519	669524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_020055	TTC	2	6	669542	669547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_020055	CCT	2	6	669548	669553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13040	NC_020055	CTG	2	6	669637	669642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_020055	TCG	2	6	669712	669717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_020055	TC	3	6	669801	669806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13043	NC_020055	CTA	2	6	669909	669914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_020055	GAA	2	6	669922	669927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_020055	CCA	2	6	669962	669967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13046	NC_020055	TATG	2	8	670036	670043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_020055	GTC	2	6	670045	670050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_020055	AGT	2	6	670125	670130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_020055	CGAAA	2	10	670211	670220	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13050	NC_020055	GCG	2	6	670277	670282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13051	NC_020055	GAT	2	6	670298	670303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_020055	CAA	2	6	670318	670323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_020055	ATTT	2	8	670333	670340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_020055	T	8	8	670427	670434	0 %	100 %	0 %	0 %	436840373
13055	NC_020055	CTT	2	6	670453	670458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840373
13056	NC_020055	AAG	2	6	670461	670466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840373
13057	NC_020055	CCG	2	6	670608	670613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13058	NC_020055	GTCA	2	8	670743	670750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13059	NC_020055	A	7	7	670750	670756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_020055	ATT	2	6	670844	670849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_020055	AT	3	6	670854	670859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_020055	CTA	2	6	670904	670909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840374
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13066	NC_020055	GAA	2	6	671153	671158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840374
13067	NC_020055	GAC	2	6	671168	671173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840374
13068	NC_020055	CAG	2	6	671195	671200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840374
13069	NC_020055	C	6	6	671238	671243	0 %	0 %	0 %	100 %	436840374
13070	NC_020055	AC	3	6	671332	671337	50 %	0 %	0 %	50 %	436840374
13071	NC_020055	CAA	2	6	671399	671404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840374
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13073	NC_020055	TA	3	6	671471	671476	50 %	50 %	0 %	0 %	436840374
13074	NC_020055	TGA	2	6	671501	671506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840374
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13078	NC_020055	CTG	2	6	671607	671612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840374
13079	NC_020055	ATAG	2	8	671622	671629	50 %	25 %	25 %	0 %	436840374
13080	NC_020055	C	6	6	671638	671643	0 %	0 %	0 %	100 %	436840374
13081	NC_020055	A	7	7	671696	671702	100 %	0 %	0 %	0 %	436840374
13082	NC_020055	CT	3	6	671711	671716	0 %	50 %	0 %	50 %	436840374
13083	NC_020055	A	6	6	671730	671735	100 %	0 %	0 %	0 %	436840374
13084	NC_020055	AATTA	2	10	671753	671762	60 %	40 %	0 %	0 %	436840374
13085	NC_020055	ATCCC	2	10	671782	671791	20 %	20 %	0 %	60 %	436840374
13086	NC_020055	AT	3	6	671807	671812	50 %	50 %	0 %	0 %	436840374
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13091	NC_020055	ACC	2	6	672113	672118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13092	NC_020055	GGA	2	6	672148	672153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_020055	AT	3	6	672182	672187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_020055	AGC	2	6	672210	672215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_020055	TAC	2	6	672271	672276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_020055	T	6	6	672279	672284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_020055	CA	3	6	672302	672307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13098	NC_020055	TGCC	2	8	672419	672426	0 %	25 %	25 %	50 %	436840375
13099	NC_020055	CAT	2	6	672504	672509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840375
13100	NC_020055	TGC	2	6	672596	672601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840375
13101	NC_020055	CAG	2	6	672613	672618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840375
13102	NC_020055	TAA	2	6	672702	672707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436840375
13103	NC_020055	GCCT	2	8	672736	672743	0 %	25 %	25 %	50 %	436840375
13104	NC_020055	TGA	2	6	672767	672772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840375
13105	NC_020055	CTG	2	6	672889	672894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840375
13106	NC_020055	CCA	2	6	672932	672937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840375
13107	NC_020055	GAC	2	6	672961	672966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840375
13108	NC_020055	CTG	3	9	672982	672990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840375
13109	NC_020055	CAGACC	2	12	672997	673008	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	436840375
13110	NC_020055	CGCATG	2	12	673027	673038	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	436840375
13111	NC_020055	ACT	3	9	673163	673171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840375
13112	NC_020055	A	6	6	673243	673248	100 %	0 %	0 %	0 %	436840375
13113	NC_020055	TCA	2	6	673367	673372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840375
13114	NC_020055	GCA	2	6	673420	673425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840375
13115	NC_020055	TTG	2	6	673433	673438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840375
13116	NC_020055	AGA	2	6	673555	673560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840375
13117	NC_020055	CAC	2	6	673617	673622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840375
13118	NC_020055	GCAT	2	8	673676	673683	25 %	25 %	25 %	25 %	436840375
13119	NC_020055	GACC	2	8	673692	673699	25 %	0 %	25 %	50 %	436840375
13120	NC_020055	TGA	2	6	673719	673724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840375
13121	NC_020055	A	7	7	673755	673761	100 %	0 %	0 %	0 %	436840375
13122	NC_020055	TGC	2	6	673896	673901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840375
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13124	NC_020055	AAG	2	6	673957	673962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840375
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13126	NC_020055	TGT	2	6	674049	674054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840375
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13247	NC_020055	T	6	6	679680	679685	0 %	100 %	0 %	0 %	436840382
13248	NC_020055	CTG	2	6	679689	679694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840382
13249	NC_020055	GAT	2	6	679899	679904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840382
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13252	NC_020055	CCA	2	6	680116	680121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840382
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13255	NC_020055	GGC	2	6	680178	680183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436840382
13256	NC_020055	ACA	2	6	680242	680247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840382
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13258	NC_020055	A	7	7	680398	680404	100 %	0 %	0 %	0 %	436840383
13259	NC_020055	AACTG	2	10	680437	680446	40 %	20 %	20 %	20 %	436840383
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13263	NC_020055	CTG	3	9	680831	680839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840383
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13267	NC_020055	AGGA	2	8	681024	681031	50 %	0 %	50 %	0 %	436840383
13268	NC_020055	ACC	2	6	681137	681142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840383
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13270	NC_020055	AT	3	6	681279	681284	50 %	50 %	0 %	0 %	436840383
13271	NC_020055	GCCT	2	8	681339	681346	0 %	25 %	25 %	50 %	436840383
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13277	NC_020055	TAC	2	6	681600	681605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840383
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13282	NC_020055	ATC	2	6	681774	681779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840383
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13286	NC_020055	T	6	6	681996	682001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13287	NC_020055	ATA	2	6	682002	682007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13288	NC_020055	AT	3	6	682036	682041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13289	NC_020055	TTA	2	6	682051	682056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13294	NC_020055	CCCTTA	2	12	682344	682355	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
13295	NC_020055	CAT	2	6	682484	682489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13297	NC_020055	CAA	2	6	682571	682576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13298	NC_020055	TAA	2	6	682604	682609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13299	NC_020055	ACC	2	6	682692	682697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840385
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13332	NC_020055	GAT	2	6	684180	684185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840385
13333	NC_020055	TCAA	2	8	684204	684211	50 %	25 %	0 %	25 %	436840385
13334	NC_020055	GCA	2	6	684267	684272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840385
13335	NC_020055	AT	3	6	684356	684361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13336	NC_020055	A	9	9	684386	684394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13337	NC_020055	GCA	2	6	684569	684574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840386
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13344	NC_020055	CTT	2	6	684975	684980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840386
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13352	NC_020055	TCAA	2	8	685520	685527	50 %	25 %	0 %	25 %	436840386
13353	NC_020055	GC	3	6	685586	685591	0 %	0 %	50 %	50 %	436840386
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13357	NC_020055	TTA	2	6	685844	685849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436840386
13358	NC_020055	TTC	2	6	685867	685872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840386
13359	NC_020055	T	6	6	685873	685878	0 %	100 %	0 %	0 %	436840386
13360	NC_020055	TTA	2	6	685915	685920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13361	NC_020055	TA	3	6	685924	685929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13362	NC_020055	TAC	2	6	685950	685955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840387
13363	NC_020055	TTC	2	6	685997	686002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840387
13364	NC_020055	T	6	6	686090	686095	0 %	100 %	0 %	0 %	436840387
13365	NC_020055	ATC	2	6	686252	686257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840387
13366	NC_020055	GTC	2	6	686408	686413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840387
13367	NC_020055	AT	3	6	686417	686422	50 %	50 %	0 %	0 %	436840387
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13492	NC_020055	TCG	2	6	692633	692638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840394
13493	NC_020055	GCCT	2	8	692651	692658	0 %	25 %	25 %	50 %	436840394
13494	NC_020055	TCA	2	6	692660	692665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840394
13495	NC_020055	ATC	2	6	692761	692766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840394
13496	NC_020055	CATT	2	8	692858	692865	25 %	50 %	0 %	25 %	436840394
13497	NC_020055	TCT	2	6	692882	692887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840394
13498	NC_020055	GGCA	2	8	692985	692992	25 %	0 %	50 %	25 %	436840394
13499	NC_020055	ACGA	2	8	693028	693035	50 %	0 %	25 %	25 %	436840394
13500	NC_020055	CTT	2	6	693133	693138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840394

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